Heatmap: Cluster_101 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.29 1.21 -1.31 -1.5 -0.91 0.66
0.05 0.31 -0.28 0.28 -0.23 -0.27
0.27 0.16 -0.38 -0.0 -0.23 0.08
0.02 0.01 -0.2 0.03 0.02 0.09
0.91 0.47 -1.64 -0.33 -0.38 -0.24
0.39 1.39 - - 0.17 -0.08
0.41 0.12 -0.74 0.04 -0.3 0.19
-0.21 -0.14 -0.41 0.59 -0.61 0.39
0.09 0.06 -0.17 0.13 -0.04 -0.09
-0.02 0.11 -0.23 0.15 0.02 -0.06
0.41 1.01 -1.52 -1.1 0.05 -0.32
0.07 0.23 -0.32 -0.05 -0.09 0.1
0.14 0.02 -0.35 0.1 -0.09 0.11
0.21 0.34 -0.79 0.48 -0.43 -0.23
0.39 0.21 -0.71 0.19 0.05 -0.44
0.05 0.3 -0.41 -0.07 -0.12 0.15
0.11 0.06 0.02 0.07 -0.26 -0.02
-0.12 0.22 -0.32 0.04 0.02 0.1
0.02 0.11 -0.15 0.04 -0.14 0.1
-0.08 0.36 -0.46 0.6 -0.17 -0.66
0.12 0.42 -0.28 -0.03 -0.34 -0.03
0.09 0.08 -0.17 0.08 -0.15 0.05
0.03 -0.04 -0.37 0.19 0.01 0.11
0.16 0.18 -0.64 0.07 0.1 -0.01
-0.05 0.88 - -0.25 -0.26 0.61
0.12 0.3 -0.34 -0.09 -0.12 0.05
0.16 0.21 -0.2 -0.18 -0.1 0.04
0.51 0.42 -2.96 -0.15 -0.16 0.4
1.34 1.26 - - 0.12 -
-0.04 0.14 -0.23 0.08 -0.11 0.14
-0.16 0.22 -0.55 0.66 -0.44 -0.09
0.09 0.23 -0.3 0.27 -0.42 -0.01
0.15 0.14 -0.46 0.07 -0.22 0.21
-0.36 -0.24 - 1.02 0.01 0.41
0.11 0.04 -0.08 0.13 -0.23 0.0
0.52 1.44 - - 0.89 -
0.12 0.26 -0.47 -0.07 -0.03 0.09
0.13 0.58 -1.62 0.77 -0.5 -0.57
0.04 -0.1 -0.6 0.28 0.07 0.15
0.07 0.03 -0.13 0.01 -0.05 0.05
-0.19 0.6 -0.42 0.23 -0.47 -0.05
1.17 0.29 -0.84 0.57 - -1.05
-0.15 0.37 -0.56 0.19 -0.4 0.3
0.25 -0.0 -0.48 0.04 -0.08 0.16
0.1 0.03 -0.03 0.15 -0.34 0.04
-0.27 0.14 -0.87 0.27 -0.12 0.48
-0.07 0.01 -0.53 0.03 0.07 0.35
0.37 0.44 -0.23 -0.3 -0.46 -0.05
0.68 0.49 -1.27 -0.45 -0.62 0.27
0.15 -0.09 -0.11 0.23 -0.32 0.07
1.0 0.99 - 0.22 -1.79 -0.81
0.56 0.04 -1.29 0.04 -0.16 0.22
0.09 0.16 -0.2 0.1 -0.32 0.11
0.42 -0.18 -0.53 0.42 -0.6 0.13
-0.52 0.43 -0.39 -0.11 0.18 0.18
0.26 0.05 -0.8 0.11 -0.02 0.17
0.19 0.01 -0.17 0.05 -0.12 0.01
0.42 0.66 -1.56 -0.39 -0.4 0.29
0.94 1.03 -1.56 -0.15 -0.52 -3.24
-0.09 0.17 -0.27 0.03 0.07 0.06
-0.04 0.27 -0.35 0.12 -0.09 0.02
0.39 -0.04 -0.98 -0.01 -0.11 0.36
0.12 0.25 -0.62 0.23 -0.05 -0.1
0.17 0.08 -0.2 0.04 -0.19 0.06
0.6 0.25 -0.26 0.23 -0.78 -0.52
0.12 0.34 -0.75 0.02 -0.21 0.23
0.04 0.23 -0.11 -0.04 -0.23 0.07
-0.12 0.31 -0.73 0.26 -0.02 0.07
0.12 0.07 -0.33 0.29 -0.4 0.12
0.04 0.04 -0.15 0.14 -0.06 -0.03
0.2 -0.07 0.12 -0.03 -0.4 0.11
-0.22 -0.07 -0.18 0.38 -0.04 0.06
0.04 0.14 -0.11 -0.05 -0.09 0.06
0.1 0.1 -0.63 0.34 -0.36 0.22
-0.09 0.32 -0.53 0.42 -0.18 -0.14
0.66 0.77 - 0.45 0.44 -
0.13 0.42 -0.39 -0.17 -0.15 0.02
0.54 0.08 - 0.34 -0.67 0.67
-0.14 -0.12 -0.35 0.65 -0.44 0.11
0.51 0.41 -1.01 0.12 -0.7 0.08
0.11 0.34 -0.51 0.1 -0.29 0.08
0.26 0.11 -0.43 0.08 -0.27 0.13
0.66 0.77 - 0.45 0.44 -
0.33 -0.08 -0.06 0.07 -0.64 0.2
0.06 0.0 -0.3 0.08 -0.06 0.18
0.62 0.03 -0.93 -0.49 -0.45 0.56
0.04 0.23 -0.39 -0.03 0.12 -0.04
0.06 0.33 -0.46 -0.23 0.09 0.07
-0.03 0.41 -1.44 0.42 -0.79 0.49
0.03 0.12 -0.23 0.1 -0.17 0.12
0.29 0.18 -0.73 0.18 -0.27 0.1
0.15 -0.02 -0.18 0.07 -0.2 0.14
0.13 1.05 - -0.08 0.92 -
0.19 0.13 -0.29 0.03 -0.13 0.02
-0.06 0.24 -0.18 0.04 -0.09 0.02
-0.14 1.07 - -0.35 -0.35 0.52
-0.6 0.46 -1.95 0.55 -0.29 0.52
0.16 0.4 -0.35 0.22 -0.44 -0.2
0.38 0.15 -0.29 0.04 -0.2 -0.2
0.79 0.09 -0.89 0.47 -0.85 -0.45
-0.16 0.31 -0.06 0.19 -0.26 -0.11
0.22 0.59 -0.78 0.2 -0.8 0.03
-0.01 0.53 -0.38 -0.28 -0.33 0.23
0.49 0.6 -1.11 0.69 -0.73 -1.33
0.38 1.3 - - 1.16 -
-0.22 0.26 -0.18 -0.0 -0.07 0.15
0.06 0.5 -0.55 0.44 0.17 -1.41
0.04 0.4 -0.4 -0.1 -0.07 0.02
0.8 0.63 - -0.53 -1.6 0.76
0.05 0.54 -0.3 -0.4 -0.46 0.27
0.19 -0.03 -0.27 0.12 -0.05 -0.0
0.27 0.15 -0.61 -0.14 -0.08 0.23
0.41 0.73 -0.92 0.69 -2.13 -0.63
0.04 0.1 -0.34 0.07 0.02 0.07
0.36 0.81 -1.65 -1.84 0.16 0.32
0.2 -0.01 -0.21 0.25 -0.54 0.15
0.1 0.26 -0.22 0.15 -0.24 -0.13
1.19 0.32 - -0.01 -1.01 -0.03
0.07 0.06 -0.17 0.12 -0.08 -0.03
0.16 0.37 -0.5 -0.38 -0.1 0.24
0.22 0.12 -0.52 -0.1 0.04 0.11
0.21 0.35 -0.53 -0.22 -0.24 0.24
0.18 0.13 -0.43 0.16 -0.15 0.01
0.12 0.38 -0.24 0.09 -0.44 -0.05
-0.58 0.32 -0.54 -0.08 0.26 0.32
-0.02 0.15 -0.35 0.29 -0.31 0.13
0.25 0.39 -0.92 0.32 -0.15 -0.27
0.37 1.29 - 1.17 - -
-0.06 0.17 -0.15 0.05 -0.08 0.06
0.31 0.39 -1.14 0.1 -0.37 0.2
-0.0 0.39 -0.77 0.52 -0.36 -0.15
0.28 0.2 -0.7 -0.32 -0.04 0.32
0.2 0.33 -0.28 -0.23 -0.16 0.03
0.03 0.06 -0.16 0.07 0.04 -0.05
0.06 0.11 -0.07 0.16 -0.07 -0.23
0.18 0.18 -0.26 0.01 -0.45 0.22
0.5 0.62 - 1.29 -0.71 -
0.05 0.27 -0.66 0.01 -0.16 0.29
-0.5 0.62 -0.51 0.3 -0.7 0.27
0.38 -0.03 -0.07 0.22 -0.72 -0.0
-0.45 0.28 -0.3 0.25 0.07 0.0
0.26 0.32 -0.86 0.12 -0.3 0.14
0.19 -0.01 -0.26 0.06 -0.1 0.07
1.05 1.39 - - -1.73 -0.01
0.09 0.16 -0.23 0.17 -0.38 0.11
0.16 0.17 -0.37 0.16 -0.2 -0.0
-0.96 1.02 -1.56 -1.16 0.2 0.6
0.23 0.24 -1.37 0.34 -0.13 0.11
0.13 0.16 -1.08 -0.34 0.26 0.42
-0.39 0.0 -0.32 0.53 -0.48 0.35
-0.26 0.67 -0.64 0.54 -1.46 0.16
0.01 0.37 -0.48 -0.05 -0.13 0.14
0.34 0.02 -0.66 0.16 -0.21 0.15
-0.15 0.05 -0.24 -0.17 0.13 0.29
0.15 0.15 -0.16 0.22 -0.38 -0.08
0.72 0.65 -1.87 0.26 -0.49 -0.75
-0.05 0.07 -0.35 0.16 -0.19 0.28
-0.04 0.1 -0.24 0.05 -0.02 0.12
-0.06 0.57 - 0.48 -0.85 0.68
0.05 1.13 -0.12 -2.03 -1.46 0.32
0.27 0.39 - 0.06 0.64 -0.2
0.28 0.2 - 0.07 -0.94 1.05
-0.09 0.46 -0.13 0.28 -0.09 -0.68
0.09 -0.04 -0.19 0.29 -0.42 0.16
0.08 0.36 -0.48 0.15 -0.34 0.07
0.16 0.13 -0.19 0.12 -0.31 0.02
0.3 -0.27 0.05 0.2 -0.37 -0.03
0.2 -0.03 -0.04 0.05 -0.41 0.15
0.4 -0.02 -0.05 0.14 -0.44 -0.17
-0.1 0.45 -0.3 0.04 -0.25 0.02
0.03 0.07 -1.09 0.31 -0.5 0.6
0.1 0.05 -0.15 0.08 -0.17 0.06
-0.19 0.02 -0.98 -0.39 0.6 0.4
0.34 0.59 -1.0 -0.61 0.39 -0.39
0.66 0.78 - 0.45 - 0.43
0.04 0.05 -0.18 0.12 -0.03 -0.02
-0.06 0.03 -0.1 0.03 0.02 0.06
0.72 0.63 -2.46 -2.63 -0.19 0.66
0.44 1.88 - - - -0.04
0.04 0.16 -0.6 0.07 0.0 0.19
-0.01 0.1 -0.26 0.12 -0.07 0.09
1.13 1.05 - -0.08 - -0.35
0.1 0.03 -0.19 0.04 -0.04 0.04
0.14 0.13 -0.17 -0.19 -0.06 0.11
0.12 0.08 -0.53 0.4 -0.24 0.0
-0.44 0.58 -0.72 -0.05 0.52 -0.4
0.16 0.23 -0.23 0.02 -0.26 -0.01
-0.02 0.91 -0.62 0.36 -1.23 -0.36
0.22 0.22 -0.88 -0.36 0.09 0.36
0.0 0.49 -0.25 -0.38 -0.23 0.18
0.18 0.33 -0.82 0.37 -0.29 -0.11
-0.01 0.6 -0.58 0.39 -0.67 -0.18
-0.44 -0.32 -0.45 0.95 -0.64 0.22
1.33 1.25 - 0.14 - -
1.1 1.22 - - - 0.62
0.14 0.02 -0.72 0.11 0.07 0.2
-0.05 0.19 -0.17 0.0 -0.23 0.19
0.22 0.05 -0.08 0.11 -0.31 -0.04
0.1 0.5 -0.57 0.08 -0.07 -0.27
0.04 0.03 -0.31 0.1 0.01 0.1
-0.02 0.29 -0.26 -0.1 -0.15 0.16
0.62 1.46 - - -0.65 0.11
-0.17 -0.37 -0.63 0.47 0.3 0.1
-0.02 0.2 -0.56 -0.31 0.26 0.24
0.06 1.18 - -0.15 -0.15 -0.17
0.43 -0.01 -1.36 0.04 -0.37 0.56
0.42 0.3 -0.52 -0.39 -0.25 0.17
-0.02 0.05 -0.44 -0.18 0.11 0.36
0.16 0.05 -0.31 0.0 -0.14 0.17
-0.32 1.43 - 1.33 - -
0.4 1.83 - - - 0.17
1.0 0.38 -1.31 0.37 -1.41 -0.68
1.29 0.63 - -0.5 -0.51 -0.77
0.3 0.23 -0.33 -0.07 -0.22 -0.02
0.05 0.36 -0.26 0.15 -0.31 -0.11
0.07 0.1 -0.36 0.13 -0.18 0.17
-0.01 0.15 -0.15 0.59 -0.31 -0.56
0.11 0.07 -0.29 0.1 -0.07 0.06
0.04 0.09 -0.16 0.13 -0.28 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.