Heatmap: Cluster_13 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.22 -0.21 -0.17 0.33 0.1 0.08
- - - 2.01 - 0.99
-0.4 0.02 -0.49 0.27 0.19 0.23
-0.13 -0.28 -0.67 0.45 0.04 0.3
-0.19 -0.61 -0.19 0.37 0.05 0.33
-0.06 -0.1 -0.1 0.29 -0.09 0.0
-1.4 -0.89 -0.54 1.17 -0.05 0.24
-0.43 -0.26 -0.14 0.35 0.19 0.13
-0.28 -0.84 -0.47 0.44 0.23 0.45
-0.14 -0.07 -0.08 0.27 -0.07 0.04
-0.4 -0.31 -0.28 0.43 0.24 0.13
-0.1 -0.26 -0.16 0.26 -0.0 0.2
-0.46 -0.31 -0.14 0.36 0.22 0.15
-0.32 -0.24 -0.69 0.65 0.11 0.11
0.02 -0.55 -0.84 0.74 0.12 -0.01
-0.48 -0.17 -0.54 0.4 0.26 0.26
0.03 -0.23 -0.35 0.3 -0.11 0.25
-0.42 -0.2 -0.18 0.42 0.1 0.13
-0.75 -0.86 -0.19 0.74 0.13 0.28
-0.04 -0.17 -0.12 0.13 -0.06 0.23
-0.06 -0.15 -0.09 0.21 0.0 0.07
-0.3 -0.19 -0.51 0.43 0.24 0.12
-0.04 -0.2 -0.14 0.12 0.01 0.21
- - - 2.01 -0.58 0.4
-0.44 -0.1 -0.24 0.48 0.06 0.07
-0.51 -2.49 -2.41 1.32 -0.12 0.61
-0.11 -0.85 -0.91 0.67 0.29 0.23
-0.47 -0.35 -0.19 0.47 -0.03 0.33
-0.04 -0.29 -0.19 0.16 0.05 0.23
- -0.34 - 1.34 0.33 0.51
-0.19 -0.23 -0.09 0.31 -0.01 0.13
-0.23 -0.08 -0.15 0.21 0.06 0.15
-0.71 -0.16 -0.29 0.57 -0.0 0.27
-0.27 -0.12 -0.11 0.21 0.11 0.12
-0.4 -0.32 -0.24 0.32 0.01 0.42
-0.18 -0.06 -0.44 0.31 0.02 0.21
- -1.24 - 1.19 0.66 0.78
-0.46 -0.23 -0.13 0.34 0.14 0.18
-0.15 -0.24 -0.16 0.19 0.13 0.17
-0.07 -0.14 -0.17 0.28 -0.08 0.13
-1.2 - -2.79 1.27 0.1 0.95
-0.28 -0.36 -0.18 0.47 0.11 0.06
-0.36 -0.07 -0.13 0.34 0.03 0.1
-0.61 -0.68 -0.22 0.65 0.23 0.15
-0.25 -0.32 -0.45 0.47 0.1 0.22
-0.32 -0.17 -0.3 0.36 0.23 0.06
-0.16 -0.41 -0.15 0.22 0.11 0.27
-0.17 -0.35 -0.11 0.49 -0.13 0.11
-0.4 -0.14 -0.11 0.24 0.19 0.12
-0.21 -0.63 -0.13 0.3 0.11 0.33
-0.11 -0.21 -0.21 0.27 0.01 0.17
-0.04 -1.64 -1.57 1.09 0.37 -0.08
-0.54 -1.44 -0.19 0.91 0.1 0.16
-0.28 -0.29 -0.14 0.31 0.12 0.16
-0.22 -0.65 -0.16 0.48 0.04 0.25
-0.21 -0.33 -0.2 0.33 0.02 0.26
-2.1 -0.17 -2.11 0.88 0.15 0.77
-0.87 -0.48 -0.41 0.64 0.21 0.34
-0.19 -0.19 -0.12 0.26 0.02 0.15
-0.09 -0.16 -0.06 0.23 0.01 0.04
-0.63 -0.07 -0.17 0.46 -0.04 0.23
-0.18 -0.39 -0.09 0.33 0.05 0.17
0.06 -0.3 -0.28 0.33 -0.15 0.22
-0.44 -0.34 -0.4 0.57 -0.03 0.33
-0.21 -0.14 -0.29 0.38 0.04 0.11
-0.22 -0.22 -0.07 0.22 0.03 0.2
0.01 -0.32 -0.03 0.17 0.06 0.06
- - - 1.91 - 1.17
-0.46 -1.05 -0.42 1.08 -0.13 0.01
-0.34 -0.55 -0.26 0.4 0.08 0.39
-0.34 -0.42 -0.02 0.5 0.08 0.01
0.02 -0.92 -0.83 0.45 -0.33 0.79
-0.1 -0.22 -0.03 0.16 0.02 0.13
-0.12 -0.38 -0.07 0.25 0.11 0.13
-0.17 -0.3 -0.08 0.2 0.05 0.22
-0.07 -0.41 -0.07 0.17 0.13 0.17
-0.11 -0.41 -0.2 0.27 0.15 0.18
-0.43 -0.35 0.08 0.42 0.12 -0.01
-0.05 -0.55 -0.56 0.62 -0.02 0.19
-0.05 -0.21 -0.3 0.29 0.0 0.17
-0.19 -0.63 -0.17 0.56 -0.09 0.23
-0.27 -0.6 -0.28 0.4 0.34 0.15
-0.29 -0.19 -0.24 0.43 0.02 0.13
- - - 1.43 1.0 0.4
-0.2 -0.22 0.0 0.29 -0.1 0.15
-0.24 -0.52 -0.22 0.32 0.06 0.38
-0.31 -0.09 -0.06 0.21 0.14 0.06
-0.01 -0.3 -0.27 0.3 0.1 0.09
-0.42 -0.4 -0.35 0.58 0.18 0.11
-0.1 -0.29 -0.66 0.53 0.05 0.2
-2.58 -0.59 -0.86 0.95 0.67 0.14
-0.17 -0.19 -0.08 0.3 -0.0 0.08
-0.15 -0.09 -0.09 0.19 0.06 0.05
0.02 -0.45 -0.66 0.67 0.03 0.02
-0.7 -0.28 -0.6 0.54 0.4 0.19
-0.23 -0.21 -0.2 0.39 0.03 0.11
-1.04 -1.91 -1.05 1.09 0.34 0.45
-0.37 -2.26 - 1.17 -0.16 0.91
-0.64 -0.75 -0.47 0.65 -0.26 0.71
-0.17 -0.42 -0.73 0.82 -0.25 0.21
-0.14 -0.18 -0.18 0.24 0.04 0.16
-0.21 -0.33 -0.25 0.45 -0.02 0.19
-0.26 -0.02 -0.17 0.16 0.11 0.13
-1.32 -0.29 -1.11 0.95 0.17 0.34
-0.1 -0.1 -0.2 0.18 0.01 0.17
-0.38 -0.24 -0.3 0.51 0.12 0.09
- -0.27 - 0.93 0.6 0.81
-0.28 -0.39 -0.08 0.31 0.12 0.19
-0.32 -0.6 -0.05 0.64 -0.41 0.34
-2.18 -1.06 -2.19 1.79 -0.58 -0.08
-0.18 -0.36 -0.16 0.26 0.12 0.21
-1.1 -0.75 -0.59 0.88 0.13 0.42
-0.21 -0.32 -0.25 0.34 0.1 0.21
-0.12 -0.34 -0.07 0.34 -0.0 0.11
-0.02 -0.24 -0.25 0.17 0.09 0.18
-0.07 -0.29 -0.25 0.19 0.11 0.23
-0.1 -0.89 -0.21 0.66 -0.0 0.12
-0.4 0.03 -0.14 0.34 0.06 0.02
-0.4 -0.38 -0.38 0.35 0.29 0.28
-0.11 -0.49 -0.19 0.28 0.0 0.34
-0.18 -0.23 -0.17 0.34 0.0 0.15
-0.47 -0.31 -0.25 0.47 0.14 0.2
0.03 -0.52 -0.58 0.56 0.15 0.04
0.02 -0.35 -0.25 0.29 -0.03 0.21
- - - 2.01 - 0.98
-0.91 -0.79 -0.12 0.8 0.21 0.09
-1.13 -0.83 -0.92 1.21 -0.16 0.32
-0.07 -0.44 -0.14 0.19 0.18 0.17
- - - 1.87 -0.51 0.71

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.