Heatmap: Cluster_96 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.54 -0.2 -0.04 0.51 0.14 -0.09
-1.22 -0.22 -0.3 0.73 0.31 -0.01
-0.89 -0.34 -0.25 0.8 0.28 -0.2
-0.45 -0.07 -0.11 0.36 0.16 -0.02
-0.93 -0.42 -0.38 0.8 0.31 -0.03
-0.27 -0.07 -0.17 0.32 0.12 -0.02
-1.34 -0.25 -0.25 0.84 0.34 -0.2
-0.68 -0.32 -0.13 0.61 0.2 -0.02
-0.89 -0.15 -0.22 0.69 0.16 -0.03
-0.21 -0.13 -0.16 0.36 0.08 -0.01
-0.33 -0.09 -0.19 0.38 0.11 0.01
-0.82 -0.61 -0.45 0.84 0.27 0.07
-0.6 -0.0 -0.2 0.61 0.11 -0.21
-0.86 -0.17 -0.08 0.66 0.19 -0.15
-0.31 -0.18 -0.13 0.44 0.09 -0.04
-0.78 -0.29 -0.14 0.7 0.23 -0.17
-1.57 -0.64 -0.3 0.95 0.42 -0.1
-0.31 -0.17 -0.16 0.42 0.12 -0.02
-0.58 -0.21 -0.11 0.49 0.16 0.03
-0.78 -0.45 -0.32 0.77 0.29 -0.05
-0.9 -0.13 -0.1 0.7 0.12 -0.14
-0.94 -0.65 -0.17 0.78 0.33 -0.04
-0.96 -0.48 -0.18 0.71 0.3 0.04
-0.5 -0.17 -0.07 0.52 0.11 -0.09
-0.35 -0.05 -0.12 0.37 0.09 -0.05
-0.75 -0.37 -0.19 0.72 0.15 -0.01
-0.37 -0.07 -0.16 0.38 0.12 -0.02
-0.73 -0.13 -0.18 0.64 0.17 -0.14
-0.15 -0.17 -0.1 0.32 0.09 -0.06
-0.18 -0.15 -0.15 0.34 0.05 0.02
-0.55 -0.39 -0.2 0.59 0.26 -0.02
-1.5 -1.32 -0.36 1.17 0.53 -0.37
-1.3 -0.2 -0.04 0.86 0.21 -0.35
-0.3 -0.08 -0.08 0.3 0.06 0.03
-2.24 -0.62 -0.46 1.1 0.49 -0.21
-0.62 -0.32 -0.23 0.6 0.32 -0.1
-0.49 -0.09 -0.28 0.59 0.22 -0.22
-1.05 -0.31 -0.24 0.89 0.23 -0.25
-1.91 -1.76 -0.81 1.42 0.49 -0.36
-0.55 -0.25 -0.0 0.47 0.18 -0.05
-0.62 -0.2 -0.17 0.56 0.2 -0.04
-1.33 -0.32 -0.33 0.8 0.39 -0.07
-0.73 -0.31 -0.17 0.53 0.31 0.02
-0.64 -0.01 -0.32 0.68 0.14 -0.21
-0.57 -0.35 -0.0 0.59 0.06 -0.0
-0.58 -0.17 -0.21 0.59 0.07 0.04
-0.25 -0.15 -0.06 0.32 0.08 -0.01
-0.66 -0.28 -0.13 0.75 0.02 -0.1
-0.45 -1.02 -1.0 0.94 0.45 -0.01
-0.92 -0.48 -0.35 0.9 0.27 -0.16
-1.08 -0.47 -0.22 0.82 0.34 -0.12
-0.68 -0.33 -0.33 0.63 0.26 0.06
-0.48 -0.49 -0.28 0.71 0.12 0.03
-1.24 -1.2 -0.32 1.22 0.44 -0.58
-1.14 -0.54 -0.51 0.89 0.3 0.09
-1.33 -0.82 -0.46 1.08 0.43 -0.24
-0.95 -0.61 -0.29 0.99 0.28 -0.31
-0.49 -0.13 -0.08 0.48 0.17 -0.12
-0.36 -0.29 -0.2 0.56 0.13 -0.05
-0.53 -0.11 -0.22 0.65 0.1 -0.18
-0.41 -0.35 -0.13 0.51 0.15 0.03
-1.34 -1.07 -0.41 1.11 0.52 -0.35
-0.6 -0.26 -0.26 0.58 0.27 -0.06
-0.86 -0.04 -0.25 0.69 0.09 -0.05
-0.8 -0.23 -0.16 0.66 0.19 -0.06
-0.45 -0.57 -0.2 0.67 0.19 -0.01
-0.92 -0.29 -0.62 0.84 0.2 0.09
-0.49 -0.22 -0.1 0.41 0.21 0.01
-1.33 -0.55 -0.09 0.84 0.41 -0.21
-0.83 -0.54 -0.47 0.84 0.38 -0.1
-0.76 -0.51 -0.21 0.85 0.12 -0.06
-0.41 -0.22 -0.09 0.59 0.02 -0.1
-0.18 -0.08 -0.17 0.32 0.07 -0.02
-0.7 -0.57 -0.1 0.69 0.31 -0.11
-0.24 -0.13 -0.19 0.35 0.12 0.0
-0.41 -0.24 -0.23 0.54 0.16 -0.04
-0.18 -0.21 -0.14 0.34 0.14 -0.05
-0.48 -0.42 -0.12 0.5 0.24 0.03
-1.46 -0.44 -0.27 1.07 0.18 -0.26
-1.5 -0.89 -0.8 1.21 0.42 -0.18
-0.41 -0.12 -0.18 0.42 0.12 0.02
-0.99 -0.33 -0.86 0.94 0.35 -0.05
-0.73 -1.84 -0.87 1.18 0.44 -0.07
-1.43 -0.43 -0.23 0.83 0.32 0.0
-0.14 -0.23 -0.25 0.44 0.04 0.02
-0.66 -0.67 -0.34 0.85 0.34 -0.2
-0.77 -0.2 -0.18 0.53 0.27 0.03
-0.97 -0.58 -0.3 0.87 0.29 -0.05
-0.63 -0.16 -0.09 0.57 0.14 -0.1
-0.38 -0.18 -0.3 0.54 0.19 -0.08
-0.52 -0.25 -0.08 0.54 0.11 -0.03
-0.41 -0.68 -0.83 0.81 0.37 0.02
-0.95 -0.28 0.0 0.68 0.3 -0.28
-1.28 -0.29 -0.19 0.84 0.2 -0.07
-1.2 -1.37 -0.41 1.1 0.39 -0.05
-0.9 -0.24 -0.16 0.66 0.26 -0.06
-0.65 -0.3 -0.23 0.56 0.32 -0.03
- -2.04 -1.35 1.65 0.37 -0.09
-0.4 -0.13 -0.2 0.42 0.19 -0.03
-0.58 -0.38 -0.21 0.56 0.24 0.07
-0.28 -0.26 0.02 0.4 0.08 -0.07
-0.44 -0.28 -0.37 0.56 0.22 0.04
-0.81 -0.13 -0.21 0.66 0.26 -0.18
-0.62 -1.03 -0.56 0.9 0.36 0.05
-0.34 -0.39 -0.32 0.6 0.19 -0.01
-1.04 -0.61 -0.45 0.97 0.31 -0.11
-1.34 -0.26 -0.74 1.14 0.34 -0.51
-0.23 -0.07 -0.27 0.43 0.09 -0.06
-1.0 -0.31 -0.26 0.79 0.21 -0.04
-2.47 -2.0 -0.56 1.39 0.56 -0.34
-1.41 -0.38 -0.38 0.96 0.3 -0.13
-0.4 -0.22 -0.12 0.48 0.15 -0.05
- -2.36 -1.08 1.54 0.9 -0.86
-1.7 -0.64 -0.3 0.98 0.4 -0.09
-0.38 -0.09 -0.22 0.44 0.16 -0.07
-1.11 -0.57 -0.05 0.92 0.24 -0.28
-0.84 -0.55 -0.1 0.72 0.25 -0.03
-0.61 -0.15 -0.24 0.58 0.2 -0.08
-0.5 -0.25 -0.25 0.7 0.08 -0.1
-0.69 -0.23 -0.2 0.58 0.21 -0.01
-0.42 -0.19 -0.2 0.54 0.11 -0.04
-0.48 -0.13 -0.28 0.54 0.12 0.01
-0.93 -0.38 -0.31 0.74 0.32 -0.02
-0.74 -0.41 -0.03 0.75 0.13 -0.16
-0.87 -0.38 0.0 0.69 0.21 -0.14
-0.39 -0.13 -0.07 0.47 0.06 -0.09
-1.6 -0.64 -0.27 1.13 0.26 -0.29
-0.34 -0.11 -0.08 0.4 0.04 -0.01
-0.63 -0.32 -0.44 0.8 0.28 -0.21
-0.91 -0.12 -0.18 0.67 0.25 -0.18
-0.43 -0.2 -0.12 0.5 0.16 -0.1
-0.19 -0.14 -0.06 0.31 0.06 -0.04
-1.11 -0.46 -0.24 0.91 0.32 -0.26
-0.37 -0.11 -0.14 0.36 0.16 -0.02
-0.81 -0.29 -0.06 0.69 0.16 -0.13
-0.56 -0.44 -0.63 0.83 0.15 0.09
-0.38 -0.05 -0.21 0.5 0.1 -0.11
-0.32 -0.18 -0.08 0.51 0.01 -0.09
-0.56 -0.26 -0.1 0.52 0.17 -0.01
-1.04 -0.33 -0.32 0.91 0.18 -0.14
-1.1 -0.15 -0.56 0.81 0.31 -0.05
-0.6 -0.25 -0.14 0.51 0.14 0.09
-0.47 -0.13 -0.09 0.37 0.18 -0.0
-0.46 -0.19 -0.3 0.72 0.07 -0.17
-1.36 -1.32 -0.94 1.2 0.49 -0.01
-0.34 -0.2 -0.05 0.54 0.05 -0.17
-0.57 -0.35 -0.17 0.54 0.28 -0.02
-0.55 -0.17 -0.19 0.49 0.2 -0.01
-0.69 -0.56 -0.22 0.88 0.1 -0.1
-0.38 -0.26 -0.06 0.43 0.12 0.01
-0.83 -0.52 -0.18 0.75 0.22 0.0
-1.02 -0.28 -0.09 0.76 0.2 -0.14
-1.17 -0.31 -0.2 0.78 0.36 -0.17
-0.2 -0.18 -0.37 0.46 0.15 -0.0
-1.95 -2.16 -0.61 1.54 0.07 -0.14
-0.98 -0.49 -0.19 0.71 0.29 0.06
-0.7 -0.47 -0.43 0.83 0.19 -0.0
-1.73 -1.96 -0.78 1.24 0.65 -0.12
-1.07 -0.53 -0.36 0.92 0.34 -0.16
-0.6 -0.23 -0.23 0.68 0.11 -0.06
-0.58 -0.73 -0.76 0.87 0.24 0.18
-0.79 -0.21 -0.24 0.76 0.14 -0.12
-0.99 -0.81 -0.45 0.98 0.32 -0.03
-0.37 -0.07 -0.09 0.44 0.06 -0.11
-1.41 -0.36 -0.18 0.94 0.28 -0.27
-0.86 -0.94 -0.46 0.85 0.48 0.01
-0.52 -0.41 -0.28 0.68 0.16 0.02
-1.24 -0.08 -0.21 0.81 0.26 -0.31
-0.35 -0.28 -0.03 0.4 0.14 -0.01
-0.82 -1.16 -1.15 1.11 0.43 0.03
-0.43 -0.16 -0.19 0.56 0.1 -0.08
-0.8 -0.31 -0.47 0.77 0.32 -0.08
-1.44 -0.51 -0.38 0.89 0.42 -0.04
-0.32 -0.43 -0.15 0.55 0.15 -0.02
-0.31 -0.28 -0.14 0.43 0.18 -0.02
-0.6 -0.18 -0.19 0.61 0.06 0.01
-0.42 -0.35 -0.48 0.63 0.21 0.06
-1.81 -2.23 -0.32 1.36 0.23 -0.05
-1.66 -2.26 -0.62 1.28 0.61 -0.21
-0.23 -0.21 -0.3 0.43 0.12 0.05
-0.53 -0.16 -0.12 0.51 0.11 -0.02
-0.29 -0.2 -0.07 0.36 0.04 0.06
-1.13 -0.15 -0.16 0.69 0.25 -0.08
-0.68 -0.4 -0.4 0.83 0.16 -0.06
-0.57 -0.14 -0.1 0.49 0.18 -0.06
-1.16 -0.36 -0.19 0.89 0.24 -0.22
-0.42 -0.16 -0.13 0.35 0.23 0.0
-0.51 -0.15 -0.1 0.48 0.14 -0.05
-0.77 -0.49 -0.4 0.84 0.24 -0.04
-1.24 -0.17 -0.34 0.94 0.2 -0.27
-1.47 -1.29 -0.17 1.17 0.28 -0.18
-0.55 -0.26 -0.15 0.54 0.17 0.01
-0.46 -0.21 -0.01 0.44 0.16 -0.07
-1.2 -0.44 -0.53 0.87 0.39 -0.01
-0.8 -0.36 -0.13 0.68 0.29 -0.14
-0.89 -0.45 -0.22 0.76 0.36 -0.16
-0.63 -0.2 -0.29 0.59 0.19 0.03
-0.88 -0.54 -0.54 0.83 0.37 -0.0
-1.3 -0.17 -0.2 0.75 0.36 -0.21
-0.64 -0.54 -0.22 0.69 0.24 0.04
-0.88 -0.96 -0.72 0.98 0.49 -0.05
-0.79 -1.44 -0.47 1.16 0.27 -0.17
-0.27 -0.02 -0.24 0.41 0.1 -0.1
-0.96 -0.61 -0.29 0.87 0.3 -0.07
-0.39 -0.18 -0.12 0.49 0.09 -0.05
-0.83 -0.16 -0.17 0.57 0.25 -0.02
-0.76 -0.28 -0.22 0.67 0.21 -0.02
-0.57 -0.26 -0.22 0.51 0.23 0.05
-0.78 -0.19 -0.15 0.64 0.21 -0.11
-1.3 -0.33 -0.42 0.91 0.27 -0.05
-0.78 -0.17 -0.41 0.81 0.23 -0.23
-1.28 -0.63 -0.73 1.03 0.28 0.12
-0.54 -0.35 -0.05 0.53 0.18 -0.02
-1.3 -1.26 -1.48 1.34 0.33 0.05
-0.61 -0.25 -0.13 0.48 0.19 0.08
-0.37 -0.07 -0.2 0.44 0.11 -0.07
-0.06 -0.16 -0.16 0.24 0.07 0.03
-0.92 -0.4 -0.14 0.71 0.3 -0.09
-0.86 -0.57 -0.28 0.75 0.35 -0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.