Heatmap: Cluster_6 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
25.17 30.73 40.03 39.25 39.64 31.25
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.0 0.0 0.3 0.26 0.26 0.0
1.11 1.05 2.02 2.43 3.6 3.02
0.0 0.0 0.23 0.0 0.1 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0
0.13 0.27 1.78 1.04 0.76 0.38
0.0 0.0 0.1 0.06 0.19 0.11
0.0 0.0 0.0 2.37 1.17 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.11 0.0
0.0 0.0 0.19 0.0 0.08 0.0
0.01 0.01 0.04 0.01 0.04 0.01
1.38 1.72 2.07 2.48 2.71 1.72
0.0 0.96 0.0 2.08 2.06 0.0
0.1 0.12 0.2 0.17 0.34 0.16
14.25 14.48 14.62 15.18 15.37 14.88
0.0 0.34 0.42 1.47 1.83 0.72
0.0 0.0 0.0 0.28 0.14 0.27
0.04 0.14 0.49 0.54 0.34 0.11
0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0
1.47 1.72 1.26 3.04 2.61 1.44
0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
1.74 1.29 1.58 1.8 2.22 1.84
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.24 0.15 0.4 0.55 0.82 0.51
3.72 4.54 6.28 6.23 6.02 4.53
0.0 0.0 0.0 0.08 0.02 0.0
0.33 0.31 0.51 0.51 0.8 0.7
0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0
0.0 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0
0.15 0.28 0.38 0.47 0.31 0.2
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.09 0.0 0.21 0.07 0.0
0.11 0.23 0.33 0.23 0.86 0.3
0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.18 0.0
0.23 0.24 0.57 0.54 0.57 0.29
0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.09 0.0
28.29 28.18 29.89 34.75 34.35 41.65
0.0 0.0 0.0 1.29 1.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.04
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
3.01 3.12 2.94 3.75 3.42 3.86
0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.09 0.0
1.22 0.41 0.79 1.32 1.2 0.77
0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.05 0.09
7.62 6.85 13.77 11.25 13.23 6.98
0.0 0.0 0.07 0.03 0.05 0.0
10.9 14.81 18.0 22.87 14.81 12.74
0.0 0.0 0.13 0.01 0.06 0.0
0.05 0.04 0.18 0.21 0.31 0.27
0.57 0.44 0.53 0.56 0.67 0.48
0.01 0.01 0.04 0.04 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0
0.03 0.08 0.09 0.11 0.14 0.08
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0
0.03 0.07 0.04 0.16 0.07 0.05
0.0 0.0 0.3 0.27 0.0 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.12 0.07 0.06 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.0
0.0 0.02 0.0 0.05 0.02 0.0
0.21 0.16 0.26 0.26 0.28 0.2
0.05 0.0 0.05 0.05 0.09 0.05
0.0 0.0 0.14 0.06 0.03 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0
0.01 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0
0.0 0.06 0.0 0.18 0.02 0.0
0.0 0.06 0.0 0.13 0.13 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.0 0.0 0.06 0.05 0.05 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.07 0.0
0.0 0.0 0.05 0.04 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0
0.06 0.0 0.73 0.7 1.4 0.8
0.0 0.0 0.05 0.06 0.04 0.01
0.0 0.0 0.0 1.66 0.82 0.0
6.53 6.75 7.33 7.05 8.1 7.83
0.0 0.0 0.0 1.05 0.34 0.0
0.0 0.0 0.78 0.0 1.02 0.0
0.0 0.03 0.24 0.07 0.16 0.06
0.22 0.44 0.85 0.62 1.12 0.51
0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.0
0.14 0.23 0.28 0.35 0.23 0.15
0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03
0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0
0.21 0.0 0.21 0.45 0.54 0.27
0.0 0.0 1.42 0.0 0.62 0.0
0.0 0.0 0.04 0.01 0.02 0.01
0.0 0.0 0.67 0.0 0.59 0.0
3.5 3.31 5.01 4.86 6.76 6.1
5.31 5.26 5.95 6.07 6.48 6.22
0.0 0.05 0.33 0.16 0.1 0.11
0.0 0.06 0.08 0.0 0.27 0.0
0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.42 0.37 0.18 0.0
0.44 0.31 0.52 0.41 0.67 0.32
0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0
0.03 0.01 0.04 0.05 0.05 0.04
0.55 0.49 0.9 0.84 0.79 0.51
0.0 0.0 0.2 0.0 0.03 0.0
0.06 0.01 0.3 0.22 0.11 0.05
0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 1.26 0.62 1.22
0.0 0.0 1.88 1.11 0.0 0.0
4.94 2.83 5.25 8.6 10.44 6.27
0.03 0.03 0.07 0.09 0.15 0.06
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0
0.03 0.04 0.24 0.27 0.2 0.08
0.0 0.02 0.09 0.04 0.02 0.03
0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0
1.37 1.0 1.38 1.4 1.61 1.57
0.0 0.0 0.0 0.06 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.06 0.0
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0
0.0 0.03 0.06 0.0 0.16 0.0
0.0 0.03 0.0 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.03 0.03 0.06 0.02
1.31 1.36 8.61 2.53 13.36 4.88
0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.0
0.31 0.2 0.62 0.46 0.66 0.37
0.0 0.42 0.51 0.9 0.67 1.24
12.54 15.83 22.94 25.07 23.5 18.47
2.51 2.43 2.73 3.24 4.18 3.75
0.0 0.0 0.04 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.15 0.03 0.17 0.03
0.21 0.12 0.19 0.16 0.23 0.16
0.01 0.01 0.01 0.05 0.03 0.01
0.0 0.0 0.0 0.31 0.15 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0
0.04 0.0 0.04 0.03 0.08 0.0
0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.0
5.23 5.41 6.84 5.54 8.19 5.4
0.0 0.0 0.12 0.05 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)