1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_140 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.24 -0.36 0.07 0.28 0.12 0.03
-0.51 -0.38 0.09 0.43 0.14 0.02
-0.65 -0.54 0.1 0.55 0.11 0.07
-0.31 -0.28 0.07 0.3 0.11 0.02
-0.49 -0.32 0.1 0.36 0.17 0.01
-0.54 -0.42 0.11 0.38 0.24 -0.0
-0.56 -0.42 0.06 0.42 0.12 0.14
-1.12 -0.56 0.05 0.61 0.37 0.01
-0.26 -0.36 0.05 0.29 0.12 0.07
-0.54 -0.51 0.13 0.41 0.14 0.11
-0.35 -0.48 0.01 0.39 0.16 0.09
-0.88 -0.59 0.2 0.56 0.3 -0.1
-0.28 -0.29 0.07 0.28 0.1 0.04
-0.72 -0.7 0.06 0.5 0.3 0.12
-0.85 -0.55 0.16 0.57 0.2 0.01
-0.72 -0.43 0.13 0.49 0.19 0.02
-0.33 -0.29 0.03 0.25 0.12 0.12
-1.04 -0.61 0.16 0.67 0.26 -0.08
-0.63 -0.47 0.08 0.48 0.21 0.03
-0.63 -0.42 0.09 0.48 0.25 -0.06
-0.98 -0.96 0.2 0.69 0.35 -0.09
-0.94 -0.73 0.14 0.63 0.3 -0.0
-0.67 -0.44 0.11 0.44 0.24 0.03
-0.83 -0.39 0.1 0.45 0.28 0.05
-0.5 -0.57 0.1 0.41 0.23 0.06
-0.38 -0.42 0.08 0.35 0.13 0.07
-0.44 -0.3 0.04 0.39 0.13 0.03
-0.88 -0.53 0.08 0.58 0.32 -0.05
-0.66 -0.83 0.22 0.56 0.25 -0.05
-0.5 -0.48 0.04 0.44 0.28 -0.02
-0.46 -0.79 0.1 0.5 0.23 0.04
-0.71 -1.07 0.08 0.66 0.38 -0.02
-0.33 -0.27 0.06 0.27 0.13 0.05
-0.82 -0.82 0.13 0.55 0.38 0.01
-1.04 -0.7 0.12 0.67 0.27 0.03
-0.29 -0.38 0.08 0.27 0.21 -0.01
-0.39 -0.34 0.05 0.31 0.2 0.02
-0.52 -0.35 0.05 0.42 0.15 0.05
-0.51 -0.33 0.02 0.36 0.2 0.07
-0.87 -1.45 0.22 0.83 0.33 -0.17
-0.65 -0.6 0.17 0.51 0.23 -0.03
-0.42 -0.39 0.04 0.35 0.19 0.06
-0.95 -1.59 0.11 0.74 0.45 0.04
-0.52 -0.57 0.11 0.45 0.2 0.04
-0.71 -0.62 0.18 0.53 0.25 -0.04
-0.26 -0.29 0.08 0.26 0.12 0.0
-0.65 -0.87 0.14 0.57 0.32 -0.02
-0.43 -0.24 0.05 0.31 0.11 0.09
-0.66 -0.36 0.04 0.44 0.23 0.04
-1.32 -0.68 0.22 0.65 0.36 -0.07
-0.64 -0.58 0.06 0.47 0.25 0.1
-1.32 -0.66 0.09 0.68 0.28 0.11
-1.01 -0.6 0.12 0.65 0.32 -0.07
-0.6 -0.4 0.06 0.41 0.21 0.08
-0.81 -0.68 0.18 0.58 0.25 -0.01
-1.14 -0.74 0.08 0.63 0.42 0.01
-1.14 -0.88 0.31 0.69 0.26 -0.06
-0.4 -0.35 0.06 0.41 0.13 0.0
-0.55 -0.46 0.04 0.5 0.15 0.05
-0.74 -1.1 0.1 0.63 0.44 -0.05
-0.72 -0.62 0.01 0.57 0.23 0.11
-0.57 -0.33 0.04 0.36 0.26 0.02
-0.31 -0.38 0.11 0.35 0.12 -0.03
-0.46 -0.32 0.1 0.37 0.1 0.05
-0.76 -1.22 0.23 0.61 0.36 -0.0
-1.33 -1.36 0.33 0.75 0.26 0.1
-1.42 -0.81 0.07 0.71 0.44 0.03
-0.54 -0.49 -0.04 0.48 0.19 0.12
-0.31 -0.46 0.1 0.32 0.2 -0.0
-0.47 -0.28 0.03 0.33 0.19 0.06
-1.22 -1.78 0.27 0.84 0.48 -0.18
-0.53 -0.66 0.2 0.51 0.15 -0.02
-0.32 -0.47 0.08 0.33 0.19 0.04
-0.7 -0.9 0.23 0.63 0.27 -0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.