Heatmap: Cluster_26 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-1.16 -0.06 -0.3 0.68 0.47 -0.32
-0.71 -0.0 -0.39 0.6 0.17 -0.03
-0.34 -0.01 -0.26 0.3 0.14 0.07
-0.7 -0.06 -0.28 0.49 0.3 -0.05
-0.18 -0.05 -0.42 0.36 0.12 0.04
-0.52 -0.13 -0.29 0.42 0.29 0.01
-0.22 -0.05 -0.2 0.25 0.1 0.06
-0.66 -0.02 -0.25 0.51 0.27 -0.14
-0.38 -0.02 -0.3 0.36 0.18 0.02
-0.28 -0.0 -0.53 0.33 0.2 0.11
-0.72 0.12 -0.19 0.46 0.15 -0.09
-0.53 -0.16 -0.39 0.58 0.23 -0.03
-0.26 -0.03 -0.18 0.21 0.19 0.02
-1.33 0.1 -0.21 0.61 0.38 -0.26
-1.27 0.02 -0.17 0.59 0.31 -0.1
-1.14 0.11 -0.17 0.61 0.27 -0.24
-0.76 0.19 -0.6 0.51 0.38 -0.17
-0.3 -0.12 -0.45 0.35 0.24 0.11
-0.54 0.02 -0.34 0.46 0.16 0.01
-0.87 -0.08 -0.46 0.72 0.26 -0.1
-0.49 0.03 -0.23 0.41 0.14 -0.02
-0.35 -0.03 -0.26 0.31 0.15 0.07
-0.75 -0.08 -0.5 0.51 0.36 0.08
-0.27 0.07 -0.14 0.21 0.04 0.03
-0.86 0.26 -0.55 0.51 0.34 -0.19
-0.51 -0.01 -0.56 0.51 0.26 0.02
-0.2 0.06 -0.18 0.18 0.09 0.01
-1.02 -0.07 -0.19 0.66 0.22 -0.1
-0.87 -0.08 -0.31 0.46 0.45 -0.06
-0.18 -0.07 -0.5 0.36 0.18 0.07
-1.12 0.18 -0.27 0.64 0.22 -0.24
-1.04 -0.25 -0.25 0.61 0.41 -0.03
-0.15 -0.03 -0.29 0.23 0.14 0.03
-0.31 -0.01 -0.38 0.35 0.14 0.08
-0.8 0.12 -0.06 0.38 0.25 -0.17
-0.28 0.01 -0.28 0.2 0.19 0.07
-0.47 0.06 -0.5 0.46 0.17 0.04
-0.71 -0.11 -0.23 0.5 0.27 -0.02
-1.33 0.19 -0.39 0.57 0.38 -0.13
-1.26 -0.1 -0.28 0.76 0.27 -0.11
-0.8 0.23 -0.55 0.6 0.25 -0.19
-0.43 -0.09 -0.37 0.51 0.26 -0.12
-0.26 -0.03 -0.29 0.31 0.16 0.01
-0.49 0.12 -0.28 0.41 0.18 -0.12
-1.19 -0.07 -0.41 0.68 0.4 -0.1
-0.73 -0.09 -0.28 0.48 0.28 0.04
-1.04 -0.22 -0.37 0.65 0.46 -0.09
-0.71 0.11 -0.29 0.43 0.18 0.02
-0.84 -0.13 -0.63 0.72 0.33 -0.02
-1.0 0.21 -0.3 0.55 0.23 -0.16
-0.5 -0.1 -0.34 0.53 0.18 0.0
-0.89 -0.14 -0.23 0.51 0.34 0.01
-0.15 -0.07 -0.48 0.32 0.16 0.09
-1.14 0.21 -0.46 0.59 0.36 -0.2
-1.02 -0.04 -0.36 0.54 0.42 -0.05
-0.34 -0.02 -0.29 0.32 0.13 0.09
-0.22 0.03 -0.38 0.29 0.11 0.07
-1.14 -0.09 -0.39 0.72 0.28 -0.02
-1.05 -0.1 -0.28 0.68 0.34 -0.15
-0.5 0.14 -0.46 0.31 0.25 0.04
-0.75 0.13 -0.1 0.41 0.16 -0.12
-1.16 -0.01 -0.27 0.62 0.42 -0.21
-1.06 0.14 -0.42 0.56 0.43 -0.24
-0.22 0.01 -0.41 0.35 0.1 0.05
-1.02 -0.0 -0.25 0.55 0.3 -0.04
-0.17 -0.08 -0.36 0.29 0.1 0.12
-0.65 -0.22 -0.71 0.78 0.38 -0.18
-0.24 -0.05 -0.53 0.33 0.2 0.14
-1.12 -0.09 -0.42 0.76 0.28 -0.07
-0.8 0.16 -0.49 0.52 0.27 -0.07
-0.87 -0.2 -0.25 0.55 0.33 0.03
-0.4 -0.02 -0.24 0.33 0.15 0.06
-0.52 0.09 -0.3 0.35 0.2 -0.01
-0.18 0.01 -0.26 0.24 0.18 -0.06
-0.5 -0.01 -0.38 0.37 0.25 0.07
-0.9 -0.13 -0.3 0.6 0.31 -0.04
-0.46 0.08 -0.08 0.28 0.12 -0.05
-0.96 0.02 -0.22 0.58 0.29 -0.14
-0.59 0.07 -0.43 0.42 0.26 0.01
-0.49 -0.03 -0.32 0.32 0.37 -0.06
-0.9 0.02 -0.24 0.48 0.37 -0.13
-0.22 0.03 -0.08 0.21 0.01 0.02
-0.36 -0.02 -0.27 0.35 0.19 -0.01
-0.53 0.04 -0.19 0.36 0.13 0.04
-0.11 -0.03 -0.3 0.22 0.09 0.08
-0.29 -0.15 -0.63 0.43 0.25 0.14
-0.98 -0.03 -0.75 0.74 0.29 0.04
-0.25 0.05 -0.29 0.29 0.05 0.06
-0.46 0.04 -0.29 0.44 0.11 -0.02
-0.4 -0.02 -0.37 0.39 0.1 0.14
-0.4 -0.08 -0.48 0.44 0.27 0.03
-0.41 0.07 -0.57 0.36 0.29 0.03
-0.75 -0.08 -0.26 0.59 0.2 -0.05
-1.2 0.2 -0.28 0.49 0.29 -0.05
-0.21 -0.1 -0.47 0.39 0.14 0.1
-0.28 -0.02 -0.3 0.38 0.13 -0.02
-0.39 -0.05 -0.34 0.32 0.23 0.09
-0.57 0.06 -0.32 0.44 0.21 -0.04
-0.39 0.08 -0.34 0.39 0.1 0.02
-0.38 -0.1 -0.64 0.42 0.25 0.17
-0.33 -0.09 -0.14 0.37 -0.01 0.11
-0.42 -0.05 -0.41 0.47 0.28 -0.1
-1.74 -0.17 -0.44 0.75 0.5 -0.03
-0.31 -0.26 -0.18 0.39 0.26 -0.05
-0.92 -0.08 -0.31 0.57 0.37 -0.09
-0.4 -0.1 -0.36 0.41 0.18 0.1
-0.84 -0.16 -0.6 0.76 0.3 -0.06
-0.3 -0.01 -0.31 0.35 0.14 0.01
-0.65 -0.12 -0.26 0.48 0.26 0.03
-1.23 0.35 -0.36 0.55 0.28 -0.24
-0.46 0.06 -0.49 0.32 0.27 0.1
-1.24 -0.01 -0.27 0.73 0.33 -0.26
-0.41 0.04 -0.36 0.37 0.28 -0.1
-0.31 -0.06 -0.29 0.39 0.12 0.03
-0.86 -0.08 -0.28 0.59 0.32 -0.11
-0.49 0.08 -0.45 0.47 0.12 0.04
-0.26 -0.04 -0.34 0.32 0.16 0.06
-0.15 -0.1 -0.35 0.31 0.1 0.1
-0.28 -0.02 -0.29 0.3 0.13 0.06
-0.34 -0.09 -0.65 0.51 0.26 0.02
-0.29 0.05 -0.36 0.33 0.13 0.02
-0.28 -0.08 -0.49 0.35 0.15 0.17
-0.97 0.15 -0.34 0.7 0.32 -0.48
-0.29 0.05 -0.37 0.23 0.25 0.01
-0.98 -0.13 -0.27 0.7 0.22 -0.06
-0.74 0.02 -0.29 0.46 0.19 0.09
-0.24 -0.01 -0.13 0.24 0.07 0.02
-0.34 -0.15 -0.38 0.47 0.25 -0.06
-0.17 -0.04 -0.59 0.4 0.16 0.04
-0.38 0.1 -0.24 0.3 0.1 0.01
-0.27 -0.25 -0.74 0.51 0.31 0.1
-0.51 -0.0 -0.32 0.54 0.12 -0.07
-0.26 0.02 -0.38 0.25 0.2 0.06
-0.62 0.16 -0.35 0.36 0.28 -0.09
-0.2 -0.08 -0.47 0.35 0.16 0.1
-0.45 -0.1 -0.09 0.4 0.06 0.04
-0.26 -0.02 -0.55 0.39 0.17 0.08
-0.72 -0.08 -0.23 0.53 0.25 -0.06
-0.15 -0.04 -0.25 0.2 0.15 0.05
-0.88 0.07 -0.55 0.59 0.31 -0.03
-0.2 -0.07 -0.34 0.28 0.16 0.07
-1.06 -0.04 -0.3 0.72 0.26 -0.18
-0.64 -0.1 -0.39 0.58 0.22 0.01
-0.79 -0.14 -0.45 0.69 0.33 -0.14
-1.09 -0.23 -0.38 0.68 0.4 -0.02
-1.51 -0.28 -0.67 0.77 0.68 -0.15
-0.32 -0.05 -0.38 0.47 0.14 -0.04
-0.34 -0.02 -0.18 0.33 0.14 -0.02
-0.16 -0.05 -0.39 0.31 0.1 0.09
-0.73 -0.05 -0.26 0.54 0.24 -0.05
-0.49 0.08 -0.15 0.29 0.21 -0.08
-1.0 -0.09 -0.51 0.8 0.22 -0.07
-0.81 -0.04 -0.39 0.62 0.25 -0.05
-0.31 0.04 -0.51 0.34 0.2 0.07
-0.26 -0.0 -0.11 0.22 0.14 -0.03
-0.51 -0.1 -0.37 0.49 0.18 0.07
-0.77 0.0 -0.42 0.53 0.28 0.01
-0.29 0.01 -0.3 0.34 0.1 0.05
-0.85 -0.14 -0.39 0.55 0.42 -0.05
-0.8 -0.3 -0.66 0.81 0.4 -0.15
-0.3 0.04 -0.33 0.33 0.11 0.04
-0.59 0.08 -0.45 0.55 0.23 -0.14
-0.78 0.14 -0.31 0.53 0.24 -0.19
-0.81 0.01 0.01 0.35 0.35 -0.21
-0.31 -0.02 -0.47 0.23 0.29 0.12
-0.41 -0.01 -0.21 0.25 0.25 0.01
-0.37 -0.06 -0.29 0.31 0.27 0.02
-0.52 -0.03 -0.22 0.49 0.12 -0.05
-0.79 -0.16 -0.48 0.53 0.44 0.02
-0.19 -0.05 -0.3 0.22 0.17 0.08
-0.77 0.19 -0.48 0.44 0.24 0.03
-0.79 0.01 -0.25 0.5 0.32 -0.13
-0.4 -0.12 -0.36 0.45 0.26 -0.03
-0.24 -0.1 -0.59 0.35 0.18 0.19
-0.73 -0.2 -0.54 0.68 0.26 0.06
-0.45 -0.16 -0.47 0.58 0.23 -0.01
-0.22 -0.05 -0.4 0.34 0.17 0.04
-0.24 0.01 -0.16 0.26 0.07 0.0
-0.99 -0.13 -0.22 0.65 0.26 -0.06
-0.24 -0.03 -0.13 0.24 0.06 0.05
-0.32 -0.03 -0.71 0.49 0.04 0.24
-0.39 -0.11 -0.46 0.3 0.34 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.