Heatmap: Cluster_116 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.12 -0.32 -0.33 0.1 0.13 0.19
0.54 -0.23 -0.18 -0.09 -0.33 0.11
0.09 -0.11 -0.31 0.1 0.03 0.15
0.58 -0.48 -0.56 0.02 -0.72 0.58
1.37 0.33 -0.56 -1.14 -2.16 -0.3
0.25 -0.31 -0.1 0.05 -0.08 0.13
0.23 -0.24 -0.14 0.07 -0.05 0.08
0.17 -0.14 -0.15 -0.05 -0.1 0.22
0.47 -0.57 -0.45 0.23 -0.04 0.09
0.23 -0.35 -0.47 0.15 0.1 0.19
0.38 -0.56 -0.5 0.08 0.11 0.24
0.15 -0.31 -0.17 0.04 0.04 0.19
0.26 -0.25 -0.11 -0.02 -0.07 0.13
0.05 -0.23 -0.2 0.1 0.07 0.17
0.02 -0.25 -0.17 0.05 0.13 0.18
0.01 -0.3 -0.23 0.14 0.09 0.22
1.17 -0.71 -0.77 -0.7 -0.29 0.16
0.34 -0.42 -0.7 0.17 0.06 0.26
0.17 -0.21 -0.29 0.22 0.02 0.02
0.44 -0.49 -0.86 -0.02 0.06 0.44
0.12 -0.28 -0.14 -0.02 0.05 0.21
0.41 -0.1 -0.25 -0.08 -0.4 0.26
0.53 -0.66 -0.67 0.06 0.17 0.17
0.1 -0.44 -0.22 0.25 0.04 0.16
0.13 -0.23 -0.34 0.11 0.09 0.15
0.33 -0.4 -0.42 0.03 0.09 0.2
0.18 -0.3 -0.15 0.09 -0.02 0.14
0.22 -0.19 -0.19 0.01 0.06 0.04
0.22 -0.89 -0.31 0.09 0.17 0.38
0.05 -0.24 -0.12 0.05 0.07 0.15
0.14 -0.46 -0.37 0.14 0.11 0.28
0.67 -2.08 -1.8 0.79 -0.11 0.3
0.18 -0.31 -0.17 0.1 0.0 0.14
0.2 -0.62 -0.41 0.17 0.11 0.32
0.39 -0.76 -1.05 0.19 0.27 0.34
0.36 -0.85 -0.72 0.23 0.11 0.38
0.17 -0.24 -0.39 0.08 0.04 0.24
0.06 -0.45 -0.16 0.08 0.14 0.23
0.28 -0.19 -0.12 -0.06 0.02 0.01
0.08 -0.1 -0.17 0.05 0.05 0.06
0.07 -0.17 -0.11 0.04 0.05 0.11
0.06 -0.27 -0.16 0.06 0.05 0.2
0.09 -0.43 -0.47 -0.05 0.26 0.39
0.07 -0.09 -0.16 0.04 0.03 0.09
0.1 -0.38 -0.15 0.07 0.06 0.23
0.14 -0.38 -0.11 0.1 0.01 0.17
0.58 -0.42 -0.47 -0.16 -0.46 0.49
0.16 -0.33 -0.27 0.18 0.03 0.13
0.32 -0.45 -0.39 0.07 0.03 0.25
0.24 -0.15 -0.32 0.07 0.05 0.04
0.22 -0.76 -0.37 0.06 0.16 0.39
0.59 -0.87 -0.78 0.14 0.13 0.23
0.21 -1.36 -1.08 0.33 0.11 0.72
0.21 -0.15 -0.19 0.06 -0.16 0.17
0.28 -0.38 -0.26 0.08 -0.01 0.18
0.17 -0.26 -0.13 0.04 -0.09 0.21
1.12 -1.6 -1.53 -0.13 -0.03 0.32
0.21 -0.42 -0.27 0.23 0.09 0.05
0.28 -0.18 -0.26 0.02 -0.01 0.08
0.08 -0.19 -0.33 0.11 0.08 0.17
0.17 -0.44 -0.22 0.01 0.09 0.28
1.49 -0.83 -0.22 -0.62 -0.84 -0.85
0.19 -0.6 -0.31 0.1 0.02 0.38
0.53 -0.42 -0.22 0.09 -0.1 -0.07
0.36 -0.15 -0.07 -0.02 -0.26 0.05
0.28 -0.25 -0.22 0.06 -0.12 0.17
0.2 -0.26 -0.13 0.05 -0.0 0.1
0.22 -0.36 -0.17 0.08 -0.05 0.19
0.31 -0.5 -0.6 0.14 0.13 0.25
1.53 -1.39 -1.95 -0.42 -0.08 -0.37
0.22 -0.22 -0.21 0.05 -0.02 0.13
0.21 -0.43 -0.57 0.22 0.11 0.24
0.22 -0.31 -0.25 0.18 0.1 -0.03
0.12 -0.49 -0.37 0.21 0.14 0.23
0.27 -0.24 -0.14 -0.06 -0.03 0.13
0.11 -0.22 -0.35 0.07 0.09 0.21
0.37 -0.68 -0.34 0.2 0.13 0.06
0.09 -0.41 -0.12 0.18 -0.01 0.18
0.26 -0.24 -0.32 0.0 0.09 0.12
0.21 -0.24 -0.14 0.06 -0.15 0.2
0.47 -0.34 -0.13 -0.06 -0.15 0.06
0.4 -0.41 -0.24 0.0 -0.0 0.11
0.13 -0.18 -0.3 0.13 0.02 0.14
0.08 -0.32 -0.19 0.02 0.14 0.2
0.26 -0.3 -0.29 0.07 0.14 0.03
0.42 -0.53 -0.45 0.06 0.07 0.19
1.16 -0.94 -1.25 0.16 -0.53 0.01
0.47 -0.4 -0.97 -0.13 0.2 0.36
0.72 -0.72 -1.5 0.04 0.25 0.24
0.39 -0.3 -0.19 -0.04 0.07 -0.03
0.5 -0.56 -0.79 -0.01 0.25 0.19
0.18 -0.54 -0.18 0.1 0.08 0.23
0.19 -0.23 -0.42 0.11 0.02 0.22
0.3 -0.53 -0.82 0.09 0.16 0.41
0.39 -0.39 -0.83 0.11 0.03 0.33
0.14 -0.18 -0.36 0.05 0.13 0.14
0.76 -1.22 -1.01 0.01 0.09 0.38
0.48 -0.3 -0.26 -0.02 -0.41 0.28
0.11 -0.15 -0.14 0.13 -0.01 0.04
0.19 -0.7 -0.22 0.31 0.16 0.04
0.21 -0.27 -0.42 0.14 0.08 0.15

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.