Heatmap: Cluster_19 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.16 -0.09 -0.36 0.14 0.18 0.21
0.17 -0.03 -0.73 0.01 0.22 0.17
-0.03 0.09 -0.66 0.11 0.1 0.23
0.19 -0.03 -0.44 0.05 -0.03 0.18
-0.09 -0.1 -0.29 0.18 0.13 0.11
-1.36 -0.44 - 0.44 1.01 0.59
-0.16 -0.04 -0.49 0.21 0.26 0.08
0.17 -0.13 -0.5 0.03 0.17 0.15
0.03 -0.17 -0.22 -0.0 0.2 0.11
0.23 -0.17 -0.67 0.05 0.14 0.23
0.06 -0.08 -0.55 0.1 0.23 0.12
0.1 -0.14 -0.49 0.05 0.18 0.2
0.03 -0.12 -0.33 0.08 0.15 0.13
-0.12 -0.04 -0.28 0.05 0.17 0.17
0.0 -0.14 -0.33 -0.08 0.15 0.3
0.01 -0.1 -0.45 0.03 0.03 0.36
0.09 -0.28 -1.17 -0.03 0.37 0.48
0.11 -0.11 -0.53 0.14 0.1 0.17
0.37 -0.18 -1.35 0.1 0.22 0.26
-0.02 -0.02 -0.28 -0.03 0.14 0.16
0.22 -0.11 -0.57 0.01 0.16 0.15
0.07 -0.21 -0.41 0.02 0.26 0.17
-0.01 -0.03 -0.3 0.06 0.11 0.13
0.06 -0.17 -1.22 0.12 0.41 0.28
0.06 -0.04 -0.29 -0.02 0.06 0.18
0.02 -0.0 -0.3 0.08 0.05 0.12
-0.05 -0.05 -0.48 0.13 0.15 0.2
-0.12 -0.25 -0.85 0.18 0.22 0.47
0.01 -0.04 -0.15 0.08 -0.04 0.13
-0.06 -0.07 -0.8 0.17 0.18 0.32
0.14 0.03 -1.03 0.01 0.01 0.46
-0.03 -0.15 -0.61 -0.01 0.28 0.33
-0.0 -0.2 -0.25 0.02 0.13 0.24
0.0 0.03 -0.44 0.05 0.14 0.14
0.14 -0.22 -0.93 0.03 0.29 0.35
0.04 -0.08 -0.55 0.01 0.16 0.27
0.26 -0.02 -0.62 -0.11 0.1 0.22
-0.06 0.1 -0.78 0.06 0.29 0.17
0.2 -0.17 -0.98 -0.0 0.31 0.28
0.18 -0.22 -0.83 0.0 0.42 0.16
0.05 -0.32 -0.23 -0.09 0.13 0.35
0.42 -0.13 -1.34 0.13 -0.13 0.42
0.12 0.04 -0.79 0.05 0.01 0.33
0.04 -0.08 -0.32 -0.09 0.04 0.33
0.15 -0.07 -0.54 0.0 0.14 0.2
-0.23 -0.03 -1.04 0.25 0.31 0.32
-0.05 -0.12 -0.45 0.15 0.15 0.23
0.09 -0.07 -0.41 0.07 0.06 0.18
0.19 -0.07 -0.49 0.06 -0.03 0.23
0.23 0.02 -0.5 -0.05 0.08 0.11
0.06 -0.01 -0.38 0.02 0.07 0.18
-0.15 -0.06 -0.27 0.15 0.16 0.13
-0.05 -0.28 -0.84 0.14 0.15 0.52
-0.03 0.05 -0.48 0.1 0.11 0.16
-0.05 -0.13 -0.52 0.12 0.23 0.23
0.11 -0.09 -0.33 0.04 0.02 0.2
-0.08 0.02 -0.56 0.12 0.19 0.18
-0.23 0.04 -0.73 0.05 0.3 0.31
-0.01 -0.1 -0.39 0.02 0.14 0.26
-0.35 0.09 -1.14 0.27 0.35 0.28
-0.16 -0.14 -0.52 0.12 0.26 0.28
0.1 -0.14 -0.63 0.04 0.25 0.2
-0.07 0.03 -0.37 0.09 0.17 0.09
-0.06 -0.06 -0.38 0.03 0.18 0.21
0.23 -0.09 -1.0 0.07 0.08 0.35
0.03 0.04 -0.32 0.01 0.06 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.