Heatmap: Cluster_94 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.3 -0.48 -0.41 0.46 0.28 0.18
-0.3 -0.29 -0.27 0.43 0.27 -0.02
-0.19 -0.24 -0.18 0.13 0.24 0.18
-0.26 -0.27 -0.27 0.34 0.21 0.11
-0.26 -0.26 -0.26 0.17 0.23 0.26
-0.3 -0.15 -0.35 0.36 0.11 0.19
-0.24 -0.25 -0.3 0.24 0.27 0.15
-0.51 -0.46 -0.47 0.46 0.37 0.24
-0.37 -0.44 -0.21 0.3 0.25 0.26
-0.31 -0.3 -0.36 0.33 0.28 0.17
-0.12 -0.42 -0.32 0.31 0.21 0.18
-0.56 -1.3 -0.73 0.61 0.5 0.46
-0.53 -0.46 -0.28 0.37 0.33 0.27
-0.3 -0.3 -0.3 0.33 0.24 0.18
-0.31 -0.51 -0.22 0.27 0.31 0.26
-0.35 -0.29 -0.23 0.21 0.31 0.19
-0.13 -0.37 -0.23 0.29 0.17 0.15
-0.17 -0.23 -0.1 0.17 0.14 0.13
-0.23 -0.33 -0.27 0.29 0.2 0.2
-0.35 -0.44 -0.38 0.23 0.34 0.34
-0.49 -0.41 -0.42 0.33 0.44 0.24
-0.42 -0.28 -0.46 0.41 0.3 0.2
-0.69 -0.68 -0.6 0.37 0.53 0.44
-0.66 -0.54 -0.4 0.45 0.48 0.22
-0.39 -0.42 -0.33 0.31 0.39 0.19
-0.32 -0.3 -0.43 0.22 0.27 0.36
-3.15 -3.03 -1.43 0.74 1.03 0.75
-0.18 -0.27 -0.35 0.31 0.17 0.19
-0.48 -0.88 -0.51 0.49 0.5 0.29
-0.42 -0.51 -0.17 0.29 0.29 0.28
-0.57 -0.4 -0.58 0.41 0.48 0.23
-0.38 -0.66 -0.28 0.38 0.37 0.25
-0.61 -0.78 -0.51 0.59 0.33 0.37
-0.31 -0.1 -0.57 0.43 0.2 0.13
-0.46 -0.66 -0.61 0.41 0.53 0.28
-0.31 -0.36 -0.22 0.31 0.26 0.16
-0.21 -0.14 -0.36 0.34 0.11 0.15
-0.15 -0.29 -0.37 0.27 0.23 0.17
-0.49 -0.28 -0.28 0.37 0.27 0.2
-0.23 -0.28 -0.18 0.19 0.21 0.19
-0.32 -0.24 -0.21 0.27 0.27 0.11
-0.69 -0.51 -0.36 0.37 0.45 0.31
-0.21 -0.2 -0.12 0.21 0.14 0.12
-0.35 -0.47 -0.25 0.37 0.25 0.23
-0.51 -0.16 -0.48 0.5 0.1 0.26
-0.26 -0.24 -0.22 0.24 0.22 0.16
-0.74 -0.6 -0.3 0.27 0.42 0.47
-0.28 -0.21 -0.32 0.31 0.22 0.15
-0.31 -0.72 -0.5 0.43 0.25 0.42
-0.3 -0.33 -0.44 0.5 0.08 0.25
-0.43 -0.45 -0.2 0.33 0.27 0.26
-0.74 -0.49 -0.65 0.63 0.25 0.39
-0.28 -0.19 -0.3 0.25 0.24 0.16
-0.13 -0.09 -0.12 0.07 0.12 0.13
-0.19 -0.27 -0.18 0.26 0.15 0.14
-0.25 -0.34 -0.16 0.29 0.16 0.18
-0.2 -0.1 -0.22 0.24 0.09 0.13
-0.31 -0.28 -0.36 0.28 0.33 0.17
-0.21 -0.19 -0.21 0.34 0.17 -0.0
-0.69 -0.81 -0.35 0.41 0.51 0.34
-0.97 -0.49 -0.3 0.42 0.48 0.3
-0.33 -0.23 -0.48 0.41 0.32 0.08
-0.55 -0.59 -0.42 0.25 0.56 0.31
-0.47 -0.36 -0.25 0.27 0.37 0.21
-0.34 -0.59 -0.3 0.45 0.28 0.2
-0.45 -0.51 -0.15 0.3 0.3 0.26
-0.25 -0.36 -0.28 0.24 0.3 0.2
-0.32 -0.35 -0.19 0.29 0.2 0.23
-0.29 -0.2 -0.15 0.17 0.2 0.19
-0.16 -0.35 -0.23 0.29 0.13 0.2
-1.24 -1.13 -1.22 0.58 0.68 0.67
-0.41 -0.45 -0.32 0.4 0.39 0.12
-0.2 -0.35 -0.2 0.25 0.24 0.15
-0.35 -0.37 -0.18 0.26 0.33 0.14
-0.21 -0.18 -0.3 0.2 0.23 0.15
-0.28 -0.43 -0.21 0.27 0.22 0.26
-0.61 -0.45 -0.46 0.58 0.4 0.11
-0.4 -0.25 -0.31 0.31 0.28 0.2
-0.92 -0.69 -0.68 0.72 0.48 0.25
-0.27 -0.33 -0.48 0.4 0.23 0.22
-0.32 -0.25 -0.27 0.35 0.17 0.18
-0.21 -0.29 -0.14 0.24 0.18 0.13
-0.27 -0.18 -0.12 0.2 0.22 0.07
-0.18 -0.2 -0.14 0.2 0.14 0.12
-0.39 -0.55 -0.53 0.4 0.39 0.29
-0.25 -0.16 -0.2 0.22 0.14 0.17
-0.29 -0.17 -0.32 0.29 0.13 0.23
-0.17 -0.31 -0.33 0.34 0.18 0.15
-0.26 -0.28 -0.09 0.25 0.15 0.15
-0.31 -0.29 -0.43 0.33 0.27 0.22
-0.44 -0.65 -0.63 0.49 0.39 0.34
-0.68 -1.21 -0.81 0.57 0.6 0.46
-0.33 -0.26 -0.37 0.19 0.27 0.32
-0.22 -0.53 -0.27 0.28 0.27 0.27
-0.26 -0.48 -0.65 0.3 0.39 0.34
-0.2 -0.37 -0.24 0.24 0.27 0.17
-0.54 -0.46 -0.43 0.26 0.45 0.36
-0.29 -1.17 -1.81 0.9 0.52 0.22
-0.55 -0.38 -0.49 0.45 0.38 0.22
-0.38 -0.33 -0.43 0.47 0.3 0.1
-0.39 -0.52 -0.44 0.34 0.35 0.33
-0.58 -0.39 -0.19 0.3 0.33 0.27
-0.63 -1.09 -0.68 0.62 0.53 0.36
-0.49 -0.65 -0.3 0.38 0.39 0.3
-0.7 -0.61 -0.61 0.48 0.57 0.25
-0.17 -0.24 -0.27 0.33 0.04 0.21
-0.22 -0.18 -0.21 0.19 0.19 0.15
-1.1 -1.71 -1.36 0.79 0.58 0.69
-0.35 -0.27 -0.25 0.32 0.21 0.19
-0.3 -0.28 -0.17 0.16 0.18 0.29
-0.62 -0.5 -0.66 0.63 0.37 0.23
-1.05 -0.67 -0.41 0.53 0.44 0.42
-0.47 -0.36 -0.27 0.34 0.39 0.12
-0.67 -0.23 -0.26 0.37 0.44 0.04
-1.09 -1.5 -1.86 0.75 0.68 0.69
-0.25 -0.34 -0.1 0.26 0.14 0.19
-0.45 -0.38 -0.26 0.33 0.36 0.17
-0.44 -0.23 -0.43 0.39 0.36 0.11
-0.11 -0.17 -0.22 0.21 0.13 0.09
-0.23 -0.21 -0.33 0.26 0.19 0.2
-0.76 -1.43 -0.63 0.61 0.56 0.48
-0.8 -1.09 -0.82 0.63 0.68 0.31
-1.0 -1.17 -0.97 0.65 0.63 0.52
-0.59 -0.74 -0.8 0.39 0.6 0.42
-0.13 -0.17 -0.16 0.14 0.14 0.14
-0.21 -0.09 -0.14 0.18 0.15 0.06
-0.31 -0.32 -0.13 0.27 0.19 0.18
-0.32 -0.68 -0.42 0.44 0.31 0.3
-0.16 -0.28 -0.29 0.2 0.24 0.19
-0.78 -1.03 -0.48 0.49 0.59 0.37
-0.32 -0.53 -0.4 0.39 0.34 0.22
-0.66 -0.65 -0.34 0.49 0.46 0.22
-0.28 -0.17 -0.19 0.29 0.2 0.06
-0.43 -0.26 -0.39 0.42 0.29 0.13
-0.27 -0.35 -0.31 0.25 0.27 0.24
-0.44 -0.31 -0.29 0.34 0.28 0.21
-0.22 -0.24 -0.23 0.26 0.2 0.13
-0.23 -0.69 -0.51 0.48 0.27 0.29
-0.29 -0.09 -0.18 0.16 0.22 0.12
-0.47 -0.29 -0.38 0.4 0.27 0.22
-0.27 -0.33 -0.3 0.35 0.19 0.19
-0.36 -0.44 -0.46 0.37 0.33 0.27
-0.68 -0.5 -0.27 0.54 0.19 0.32
-1.08 -1.41 -1.8 0.64 0.79 0.66
-0.41 -0.46 -0.23 0.36 0.29 0.21
-0.48 -0.4 -0.48 0.42 0.34 0.27
-0.38 -0.21 -0.43 0.39 0.27 0.15
-1.07 -1.96 -1.81 0.74 0.72 0.74
-0.14 -0.19 -0.23 0.25 0.09 0.15
-0.76 -0.88 -0.43 0.64 0.3 0.42
-0.23 -0.49 -0.53 0.4 0.29 0.26
-0.57 -1.08 -0.8 0.68 0.49 0.35
-0.32 -0.29 -0.15 0.16 0.3 0.19
-1.3 -1.16 -0.45 0.39 0.66 0.61
-0.34 -0.51 -0.27 0.36 0.31 0.2
-0.54 -0.42 -0.29 0.31 0.4 0.25
-0.5 -0.41 -0.31 0.27 0.41 0.27
-0.28 -0.13 -0.33 0.33 0.2 0.08
-0.44 -0.45 -0.34 0.44 0.23 0.28
-1.99 -2.0 -0.96 0.63 0.85 0.72
-0.78 -1.02 -0.56 0.62 0.53 0.33
-0.52 -0.57 -0.36 0.3 0.44 0.34
-0.38 -0.48 -0.3 0.31 0.23 0.37
-0.17 -0.18 -0.19 0.21 0.19 0.08
-0.17 -0.21 -0.08 0.19 0.1 0.13
-0.29 -0.2 -0.36 0.31 0.25 0.14
-0.48 -0.43 -0.8 0.56 0.45 0.17
-0.27 -0.31 -0.43 0.26 0.31 0.24
-0.37 -0.3 -0.3 0.17 0.25 0.37
-0.38 -0.63 -0.43 0.4 0.39 0.28
-0.22 -0.22 -0.17 0.15 0.19 0.2
-0.39 -0.24 -0.18 0.23 0.21 0.24
-0.13 -0.2 -0.12 0.15 0.14 0.11
-0.33 -0.42 -0.26 0.33 0.3 0.18
-0.15 -0.13 -0.16 0.21 0.1 0.09
-0.19 -0.36 -0.46 0.4 0.23 0.16
-0.71 -0.39 -0.57 0.54 0.35 0.29
-0.65 -0.62 -0.27 0.47 0.25 0.39
-0.19 -0.19 -0.14 0.18 0.19 0.09
-0.58 -0.65 -0.36 0.49 0.36 0.3
-1.66 -1.72 -1.55 0.45 0.86 0.89
-0.34 -0.35 -0.13 0.22 0.31 0.14
-1.25 -1.51 -0.7 0.49 0.7 0.66
-0.37 -0.52 -0.28 0.31 0.34 0.26
-0.21 -0.38 -0.3 0.27 0.25 0.2
-0.41 -0.42 -0.35 0.44 0.15 0.32
-0.29 -0.33 -0.21 0.16 0.26 0.27
-0.16 -0.27 -0.2 0.25 0.16 0.13
-0.21 -0.14 -0.29 0.27 0.18 0.1
-1.39 -1.04 -1.14 0.89 0.63 0.35
-0.39 -0.54 -0.29 0.38 0.34 0.22
-0.28 -0.14 -0.29 0.28 0.2 0.12
-0.37 -0.41 -0.41 0.32 0.43 0.16
-0.42 -0.42 -0.21 0.34 0.3 0.19
-0.27 -0.25 -0.35 0.26 0.27 0.2
-0.17 -0.29 -0.17 0.23 0.16 0.16
-0.84 -0.92 -0.78 0.67 0.51 0.4
-0.66 -0.74 -0.66 0.45 0.59 0.34
-0.58 -0.41 -0.33 0.38 0.42 0.19
-0.84 -0.56 -0.46 0.26 0.64 0.35
-0.27 -0.25 -0.44 0.35 0.29 0.13
-0.38 -0.3 -0.3 0.43 0.24 0.12
-0.51 -0.53 -0.26 0.45 0.25 0.27
-0.9 -1.17 -0.64 0.33 0.68 0.6
-0.23 -0.39 -0.27 0.33 0.23 0.16
-0.21 -0.23 -0.17 0.13 0.19 0.21
-0.18 -0.29 -0.25 0.26 0.23 0.14
-0.21 -0.29 -0.34 0.36 0.16 0.17
-0.26 -0.12 -0.3 0.16 0.21 0.21
-0.54 -0.6 -0.31 0.39 0.38 0.31
-0.61 -0.39 -0.42 0.47 0.37 0.21
-0.25 -0.27 -0.19 0.24 0.23 0.14
-0.39 -0.57 -0.39 0.39 0.22 0.41
-0.15 -0.21 -0.11 0.17 0.12 0.13
-0.2 -0.24 -0.18 0.28 0.15 0.12
-0.19 -0.31 -0.3 0.25 0.25 0.18
-1.85 -3.04 -2.14 0.8 1.06 0.63
-0.46 -0.21 -0.4 0.34 0.34 0.16
-0.26 -0.25 -0.14 0.25 0.15 0.16
-0.53 -0.65 -0.31 0.51 0.2 0.37
-0.43 -0.18 -0.42 0.39 0.28 0.14
-0.28 -0.25 -0.56 0.39 0.24 0.22
-0.49 -0.57 -0.33 0.29 0.44 0.31
-0.42 -0.64 -0.36 0.34 0.49 0.22
-0.29 -0.44 -0.21 0.31 0.28 0.18
-0.79 -0.72 -0.72 0.69 0.5 0.23
-0.34 -0.61 -0.29 0.38 0.33 0.24
-0.24 -0.28 -0.32 0.24 0.27 0.19
-1.97 -2.63 -1.16 0.83 0.73 0.77
-0.56 -0.68 -0.15 0.45 0.23 0.33
-0.4 -0.36 -0.28 0.26 0.28 0.29
-0.36 -0.36 -0.18 0.29 0.25 0.2
-0.39 -0.25 -0.39 0.47 0.28 0.05
-0.22 -0.32 -0.4 0.33 0.24 0.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.