Heatmap: Cluster_14 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.07 -0.1 -0.16 0.19 0.07 0.04
-0.06 -0.23 -0.16 0.3 0.01 0.08
-0.22 -0.34 -0.24 0.3 0.2 0.17
-0.12 -0.21 -0.19 0.26 0.04 0.15
-0.09 -0.48 -0.48 0.44 0.19 0.18
-0.01 -0.26 -0.12 0.17 0.15 0.03
-0.09 -0.22 -0.21 0.26 0.07 0.11
-0.14 -0.67 -0.93 0.67 0.39 0.05
0.08 -0.52 -0.22 0.27 0.17 0.08
-0.1 -0.16 -0.15 0.21 0.09 0.08
0.03 -0.6 -0.43 0.32 0.23 0.21
-0.17 -0.22 -0.29 0.21 0.13 0.24
-0.54 -1.52 -0.86 0.82 0.58 0.2
-0.03 -0.25 -0.22 0.21 0.18 0.05
-0.03 -0.55 -0.43 0.43 0.14 0.2
-0.12 -0.34 -0.21 0.34 0.09 0.12
-0.01 -0.55 -0.28 0.25 0.29 0.13
-0.21 -0.36 -0.29 0.32 0.26 0.14
-0.0 -0.36 -0.32 0.4 0.03 0.12
-0.26 -1.54 -1.24 0.82 0.6 0.17
-0.1 -0.26 -0.19 0.32 0.07 0.09
-0.13 -0.25 -0.29 0.2 0.15 0.22
-0.14 -0.54 -0.4 0.38 0.24 0.23
-0.04 -0.51 -0.49 0.36 0.36 0.06
-0.17 -0.2 -0.27 0.26 0.13 0.17
-0.15 -0.21 -0.35 0.41 0.06 0.1
-0.05 -0.38 -0.38 0.45 -0.0 0.18
-0.01 -0.32 -0.23 0.21 0.22 0.06
-0.02 -0.13 -0.16 0.18 0.08 0.02
-0.36 -0.51 -0.55 0.37 0.23 0.46
-0.06 -0.19 -0.23 0.19 0.16 0.07
-0.19 -0.22 -0.35 0.42 0.12 0.08
-0.1 -0.26 -0.25 0.31 0.12 0.09
0.01 -0.23 -0.2 0.21 0.11 0.06
-0.28 -1.69 -1.15 0.83 0.61 0.16
-0.07 -0.11 -0.23 0.24 0.09 0.04
0.02 -0.3 -0.28 0.37 -0.03 0.12
-0.02 -0.21 -0.16 0.23 0.05 0.07
-0.09 -0.29 -0.1 0.29 0.08 0.04
-0.35 -1.14 -0.84 0.68 0.49 0.26
-0.11 -0.31 -0.15 0.32 0.11 0.05
-0.33 -1.87 -1.41 0.88 0.72 0.1
-0.19 -0.6 -0.59 0.61 0.12 0.24
0.0 -0.37 -0.22 0.23 0.1 0.16
-0.11 -0.34 -0.28 0.26 0.19 0.16
-0.23 -1.03 -0.77 0.79 0.27 0.18
-0.12 -0.44 -0.35 0.4 0.1 0.22
-0.19 -0.26 -0.26 0.27 0.18 0.15
-0.17 -0.28 -0.29 0.31 0.18 0.12
-0.38 -1.88 -1.75 0.78 0.71 0.39
-0.05 -0.4 -0.33 0.41 0.14 0.07
0.01 -0.44 -0.37 0.46 0.07 0.08
-0.08 -0.27 -0.17 0.18 0.12 0.16
-0.04 -0.29 -0.19 0.25 0.07 0.13
-0.32 -1.57 -1.03 0.91 0.42 0.22
-0.35 -1.5 -1.4 0.86 0.55 0.26
-0.32 -0.54 -0.61 0.41 0.28 0.4
-0.14 -0.28 -0.34 0.25 0.19 0.19
-0.03 -0.42 -0.28 0.3 0.2 0.09
-0.31 -0.1 -0.61 0.5 0.16 0.11
-0.07 -0.27 -0.17 0.3 0.07 0.07
-0.08 -0.32 -0.16 0.19 0.14 0.15
-0.35 -1.89 -1.21 0.96 0.52 0.17
-0.13 -1.51 -1.2 0.72 0.5 0.31
0.01 -0.36 -0.29 0.32 0.05 0.15
-0.42 -1.66 -1.2 0.99 0.58 0.03
-0.15 -0.8 -0.75 0.59 0.35 0.2
-0.16 -0.26 -0.22 0.22 0.13 0.19
-0.02 -0.21 -0.37 0.26 0.18 0.06
-0.12 -0.54 -0.38 0.49 0.07 0.22
-0.38 -1.2 -0.94 0.58 0.42 0.53
-0.32 -0.7 -1.16 0.68 0.28 0.4
-0.53 -0.99 -1.23 0.76 0.56 0.28
-0.34 -0.64 -0.43 0.45 0.39 0.2
-0.5 -1.45 -0.84 0.98 -0.03 0.5
-0.15 -0.96 -0.49 0.6 0.25 0.23
0.0 -0.17 -0.26 0.24 0.03 0.11
-0.12 -0.97 -0.74 0.63 0.28 0.28
-0.06 -0.2 -0.2 0.27 0.08 0.05
-0.21 -0.18 -0.44 0.39 0.13 0.15
-0.0 -0.14 -0.12 0.18 -0.02 0.08
-0.36 -0.84 -0.71 0.52 0.46 0.3
0.02 -0.29 -0.32 0.27 0.06 0.17
-0.12 -0.39 -0.32 0.28 0.22 0.19
-0.06 -0.25 -0.21 0.29 0.08 0.08
-0.15 -0.09 -0.47 0.36 0.12 0.1
-0.08 -0.31 -0.42 0.39 0.15 0.11
-0.27 -0.72 -0.63 0.52 0.39 0.23
-0.44 -1.76 -1.11 0.95 0.53 0.17
-0.56 -1.9 -1.67 0.99 0.67 0.22
0.03 -0.37 -0.29 0.25 0.01 0.25
0.01 -0.34 -0.28 0.25 0.15 0.12
-0.06 -0.1 -0.12 0.18 0.03 0.05
-0.14 -0.57 -0.52 0.38 0.18 0.36
-0.22 -0.53 -0.53 0.46 0.15 0.35
-0.03 -0.76 -0.66 0.42 0.22 0.37
-0.37 -0.32 -0.9 0.59 0.28 0.22
-0.5 -1.64 -1.1 0.91 0.55 0.23
-0.16 -0.28 -0.29 0.26 0.19 0.17
-0.14 -0.89 -0.31 0.38 0.32 0.26
-0.16 -0.5 -0.44 0.41 0.21 0.25
-0.02 -0.37 -0.29 0.29 0.05 0.22
-0.29 -1.04 -1.04 0.61 0.33 0.52
-0.23 -0.89 -0.9 0.59 0.37 0.35
-0.06 -0.5 -0.31 0.29 0.2 0.21
-0.15 -1.09 -0.83 0.52 0.47 0.32
-0.12 -0.43 -0.23 0.24 0.12 0.28
-0.07 -0.4 -0.44 0.54 -0.04 0.18
-0.14 -0.49 -0.48 0.46 0.22 0.16
-0.07 -0.43 -0.34 0.38 0.18 0.11
-0.67 -2.01 -1.37 1.1 0.57 0.15
-0.33 -1.22 -1.03 0.84 0.48 0.14
-0.17 -0.29 -0.13 0.34 0.09 0.06
-0.08 -0.12 -0.15 0.17 0.07 0.07
-0.06 -1.59 -1.54 0.7 0.57 0.32
-0.23 -0.61 -0.5 0.6 0.17 0.19
-0.11 -0.36 -0.3 0.41 0.06 0.15
-0.03 -0.2 -0.29 0.23 0.09 0.13
-0.09 -0.5 -0.26 0.42 0.1 0.15
-0.03 -0.47 -0.19 0.37 0.15 0.03
-0.34 -0.68 -0.54 0.5 0.41 0.21
-0.19 -0.66 -0.37 0.39 0.23 0.3
-0.36 -0.81 -0.61 0.63 0.33 0.25
-0.03 -0.19 -0.08 0.19 0.04 0.05
-0.1 -0.16 -0.24 0.26 0.08 0.09
-0.36 -0.96 -0.74 0.51 0.5 0.35
-0.44 -1.27 -0.94 0.82 0.51 0.19
-0.31 -1.24 -1.14 0.6 0.47 0.49
0.07 -0.7 -0.47 0.54 0.05 0.18
-0.08 -1.39 -1.37 0.73 0.56 0.2
-0.03 -0.72 -0.58 0.71 0.01 0.14
-0.1 -0.27 -0.24 0.38 -0.01 0.13
-0.17 -0.78 -0.51 0.54 0.33 0.16
-0.15 -0.2 -0.29 0.32 0.1 0.13
-0.11 -0.47 -0.23 0.4 0.13 0.12
-0.37 -1.54 -1.06 0.8 0.66 0.11
-0.48 -2.0 -1.47 1.07 0.46 0.27
-0.21 -0.61 -0.55 0.56 0.27 0.15
-0.53 -1.73 -1.05 0.94 0.59 0.12
-0.27 -0.68 -0.62 0.37 0.27 0.49
-0.4 -1.7 -1.21 0.86 0.57 0.27
-0.02 -0.48 -0.39 0.33 0.12 0.25
-0.1 -0.57 -0.3 0.53 0.03 0.16
-0.05 -0.39 -0.3 0.41 0.09 0.09
-0.2 -0.51 -0.43 0.42 0.22 0.25
-0.04 -2.81 -1.6 1.15 -0.08 0.47
-0.12 -0.35 -0.13 0.22 0.15 0.14
-0.09 -0.95 -0.84 0.53 0.23 0.45
-0.03 -0.2 -0.16 0.18 0.07 0.1
-0.02 -0.61 -0.41 0.37 0.28 0.14
-0.38 -0.88 -0.92 0.68 0.23 0.47
-0.12 -0.21 -0.29 0.2 0.13 0.21
-0.07 -0.93 -1.16 0.69 0.35 0.25
-0.03 -1.14 -0.78 0.7 0.04 0.41
-0.09 -0.43 -0.24 0.33 0.14 0.15
-0.31 -0.91 -0.6 0.47 0.31 0.45
-0.14 -0.15 -0.29 0.29 0.1 0.11
-0.09 -0.22 -0.3 0.34 0.02 0.15
-0.14 -0.66 -0.8 0.52 0.11 0.47
-0.17 -0.36 -0.46 0.31 0.19 0.3
-0.03 -0.12 -0.12 0.16 -0.01 0.1
-0.08 -1.13 -0.92 0.61 0.36 0.35
-0.28 -0.68 -0.82 0.68 0.16 0.35
0.04 -0.42 -0.16 0.22 0.21 0.02
-0.08 -0.19 -0.25 0.32 0.04 0.08
-0.07 -0.73 -0.34 0.41 0.16 0.28
-0.49 -0.98 -0.91 0.58 0.48 0.45
-0.19 -0.67 -0.66 0.48 0.31 0.29
-0.27 -0.52 -0.76 0.58 0.23 0.29
-0.25 -0.54 -0.41 0.36 0.32 0.24
-0.18 -1.59 -1.4 0.79 0.52 0.32
-0.37 -1.01 -0.74 0.64 0.46 0.26
-0.31 -1.22 -1.0 0.81 0.44 0.2
-0.08 -0.16 -0.28 0.24 0.09 0.13
-0.14 -0.11 -0.29 0.32 0.05 0.09
-0.49 -1.48 -1.33 0.84 0.7 0.16
-1.55 -4.27 -1.97 1.3 0.89 0.04
-0.06 -0.28 -0.13 0.22 0.1 0.08
-0.19 -0.77 -0.3 0.39 0.26 0.27
-0.02 -0.61 -0.32 0.34 0.15 0.24
-0.01 -0.3 -0.23 0.24 0.04 0.18
-0.25 -0.38 -0.4 0.32 0.22 0.28
-0.44 -0.74 -0.68 0.58 0.36 0.33
-0.19 -1.24 -0.91 0.59 0.53 0.29
-0.05 -0.2 -0.12 0.18 0.04 0.12
-0.11 -0.46 -0.26 0.26 0.2 0.22
-0.05 -0.17 -0.12 0.13 0.07 0.12
-0.12 -0.61 -0.38 0.41 0.22 0.22
-0.12 -0.42 -0.18 0.31 0.1 0.2
-0.11 -0.19 -0.17 0.23 0.1 0.1
-0.06 -0.59 -0.31 0.34 0.2 0.21
-0.06 -0.68 -0.32 0.38 0.18 0.23
-0.08 -0.42 -0.23 0.27 0.16 0.18
-0.01 -0.33 -0.3 0.36 0.1 0.05
-0.1 -0.37 -0.32 0.29 0.15 0.21
-0.15 -0.34 -0.27 0.34 0.17 0.12
-0.41 -0.94 -0.87 0.7 0.51 0.18
-0.12 -0.48 -0.25 0.31 0.18 0.19
-0.09 -0.25 -0.37 0.27 0.25 0.07
0.01 -0.44 -0.27 0.24 0.13 0.19
0.01 -0.51 -0.73 0.43 0.38 0.05
-0.09 -0.86 -0.68 0.43 0.49 0.19
-0.22 -0.36 -0.3 0.32 0.28 0.12
-0.13 -0.6 -0.32 0.33 0.25 0.24
-0.18 -0.11 -0.35 0.27 0.18 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.