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Heatmap: Cluster_176 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.81 -0.42 0.0 0.55 0.3 -0.03
-0.68 -0.07 0.02 0.56 0.13 -0.25
-0.85 -0.42 0.12 0.4 0.34 0.04
-0.87 -0.35 0.13 0.64 0.13 -0.13
-2.09 -1.66 -0.17 1.17 0.5 -0.15
-0.67 -0.1 0.05 0.4 0.2 -0.1
-0.86 -0.29 0.02 0.53 0.32 -0.11
-0.92 -0.25 0.09 0.58 0.38 -0.37
-1.32 0.04 0.11 0.46 0.27 -0.13
-1.67 -2.24 0.18 1.16 0.38 -0.3
-1.04 -0.52 -0.16 0.72 0.37 -0.03
-0.77 -0.5 -0.0 0.52 0.36 -0.02
-1.57 -1.72 -0.01 1.08 0.5 -0.24
-0.93 -0.32 -0.05 0.72 0.22 -0.15
-0.29 -0.21 0.08 0.26 0.11 -0.02
-1.59 -0.99 0.35 0.87 0.34 -0.32
-0.93 -0.64 0.12 0.6 0.45 -0.2
-1.02 -0.23 -0.05 0.56 0.3 -0.02
-0.4 -0.22 0.05 0.43 0.02 -0.03
-0.67 -0.54 0.1 0.4 0.37 0.0
-0.62 -0.24 0.06 0.51 0.17 -0.14
-0.55 -0.24 -0.08 0.44 0.26 -0.05
-0.98 -0.22 0.22 0.44 0.24 -0.11
-1.4 -0.45 0.19 0.73 0.35 -0.29
-0.64 -0.32 0.01 0.47 0.26 -0.05
-0.8 -0.09 -0.03 0.44 0.19 0.03
-0.44 -0.32 -0.07 0.44 0.24 -0.05
-2.06 -0.38 0.4 0.83 0.31 -0.6
-1.07 -0.72 0.17 0.83 0.23 -0.24
-0.45 -0.25 0.01 0.44 0.14 -0.05
-1.17 -0.31 0.05 0.72 0.23 -0.17
-1.48 -2.11 -0.13 1.09 0.59 -0.2
-1.24 -1.26 -0.02 0.95 0.39 -0.1
-0.67 -0.12 -0.06 0.5 0.18 -0.07
-1.22 -1.12 0.15 1.0 0.23 -0.29
-0.95 -0.8 -0.02 0.59 0.46 0.05
-0.43 -0.21 0.03 0.43 0.06 -0.02
-1.24 -0.7 -0.15 0.76 0.47 -0.03
-0.56 -0.46 -0.05 0.5 0.32 -0.05
-0.69 -0.18 0.16 0.38 0.23 -0.16
-0.72 -0.34 0.05 0.39 0.33 0.0
-0.46 -0.31 -0.05 0.39 0.24 0.01
-0.89 -0.4 0.06 0.66 0.23 -0.16
-0.77 -0.64 0.1 0.69 0.3 -0.22
-0.82 -0.26 0.07 0.54 0.23 -0.11
-0.54 -0.18 0.19 0.31 0.17 -0.11
-0.81 -0.2 0.06 0.56 0.21 -0.17
-0.76 -0.59 0.02 0.73 0.16 -0.07
-1.52 -2.11 0.25 1.1 0.4 -0.4
-0.58 -0.33 0.09 0.4 0.25 -0.06
-1.3 -0.46 -0.05 0.56 0.47 0.07
-0.86 -0.32 0.14 0.57 0.21 -0.15
-3.01 -1.11 0.21 0.84 0.83 -0.51
-2.73 -1.36 0.28 1.02 0.59 -0.46
-0.42 -0.36 -0.0 0.39 0.23 -0.01
-1.42 -0.58 -0.04 0.85 0.43 -0.26
-1.3 -0.35 0.01 0.62 0.46 -0.17
-1.63 -1.58 0.18 0.88 0.57 -0.18
-1.4 -0.9 0.03 1.02 0.22 -0.2
-0.63 -0.25 0.23 0.44 0.12 -0.15
-1.11 -0.19 -0.0 0.58 0.28 -0.07
-1.57 -0.77 0.26 0.75 0.36 -0.14
-1.02 -0.6 0.05 0.84 0.07 -0.04
-0.41 -0.25 -0.0 0.38 0.13 0.01
-0.62 -0.0 -0.01 0.36 0.1 0.0
-0.91 -0.21 0.03 0.54 0.3 -0.14
-1.57 -1.64 -0.21 1.07 0.48 -0.02
-2.31 -1.63 0.21 0.99 0.53 -0.16
-0.24 -0.36 0.01 0.47 0.09 -0.11
-1.19 -0.76 0.12 0.6 0.39 0.09
-0.97 -0.28 0.31 0.65 0.18 -0.47
-0.57 -0.26 0.12 0.44 0.14 -0.08
-0.63 -0.28 -0.11 0.44 0.32 0.0
-0.61 -0.42 -0.05 0.5 0.3 -0.01
-0.81 -0.42 0.16 0.51 0.21 -0.03
-0.86 -0.35 -0.02 0.66 0.17 -0.04
-0.94 -0.28 0.17 0.54 0.17 -0.08
-2.22 -1.29 0.24 0.84 0.7 -0.35
-1.18 -0.79 0.04 0.73 0.37 -0.0
-1.08 -0.4 0.11 0.57 0.31 -0.05
-1.74 -0.51 0.32 0.77 0.27 -0.26
-1.34 -0.56 0.18 0.73 0.36 -0.23
-0.32 -0.21 0.07 0.29 0.18 -0.1
-0.91 -0.54 0.04 0.51 0.43 -0.03
-0.85 -0.53 0.1 0.74 0.07 -0.06
-0.66 -0.25 0.07 0.44 0.15 0.01
-1.53 -0.73 0.1 0.96 0.32 -0.36
-1.02 -0.45 0.14 0.88 0.03 -0.29
-0.51 -0.61 -0.03 0.55 0.26 0.01
-0.62 -0.71 0.15 0.7 0.13 -0.13
-1.05 -0.44 0.15 0.65 0.24 -0.12
-1.26 -0.44 0.18 0.65 0.29 -0.12
-2.18 -1.51 0.02 1.18 0.51 -0.45
-1.19 -0.32 -0.02 0.7 0.3 -0.12
-1.17 -0.4 -0.21 0.67 0.48 -0.08
-0.93 -0.25 0.14 0.5 0.26 -0.13
-0.77 0.01 0.06 0.33 0.22 -0.09
-1.7 -0.6 0.32 0.72 0.31 -0.14
-0.73 -0.47 0.11 0.41 0.32 0.03
-0.5 -0.27 0.09 0.37 0.19 -0.05
-1.58 -0.33 0.3 0.66 0.33 -0.32
-1.23 -0.46 0.25 0.66 0.3 -0.23
-0.43 -0.28 -0.03 0.41 0.2 -0.04
-2.22 -1.36 -0.01 1.07 0.56 -0.25
-0.95 -0.51 0.13 0.77 0.16 -0.21
-1.48 -1.8 0.32 0.97 0.48 -0.42
-0.73 -0.4 0.03 0.37 0.34 0.08
-1.21 -0.45 -0.12 0.67 0.38 0.03
-0.77 -0.3 0.18 0.5 0.14 -0.08
-0.93 -0.27 0.18 0.52 0.2 -0.1
-2.23 -0.45 -0.06 0.89 0.44 -0.2
-0.58 -0.35 -0.08 0.4 0.35 0.01
-0.67 -0.51 0.09 0.61 0.16 -0.06
-1.36 -0.54 0.3 0.82 0.2 -0.36
-0.98 -0.42 0.1 0.59 0.23 -0.0
-0.48 -0.26 -0.1 0.42 0.23 0.01
-0.42 -0.47 0.01 0.38 0.28 0.02
-1.6 -0.79 0.09 0.97 0.34 -0.33
-3.27 -1.33 0.27 0.89 0.72 -0.34
-1.18 -0.54 0.11 0.77 0.29 -0.21
-0.48 -0.25 -0.0 0.3 0.31 -0.03
-0.69 -0.02 0.01 0.38 0.26 -0.17
-0.57 -0.2 -0.03 0.54 0.13 -0.09
-1.71 -1.1 0.0 1.04 0.28 -0.07
-2.42 -1.25 -0.05 0.96 0.61 -0.07
-0.52 -0.16 0.12 0.46 0.14 -0.25
-1.32 -0.53 0.12 0.86 0.14 -0.14
-0.53 -0.19 -0.06 0.36 0.26 -0.02
-0.84 -0.31 0.11 0.61 0.27 -0.29
-1.54 -0.42 0.26 0.66 0.32 -0.19
-0.53 -0.43 0.08 0.37 0.32 -0.06
-1.2 -0.82 0.27 0.95 -0.03 -0.17
-1.85 -0.39 0.2 0.66 0.46 -0.22
-0.58 -0.13 -0.0 0.42 0.15 -0.04
-1.49 -0.83 -0.0 0.68 0.52 0.08
-0.47 -0.24 -0.01 0.38 0.22 -0.04
-0.4 -0.31 0.08 0.51 0.01 -0.06
-0.7 -0.44 0.07 0.45 0.34 -0.05
-0.82 -0.62 0.21 0.65 0.2 -0.13
-0.51 -0.37 0.06 0.38 0.24 -0.01
-0.74 -0.02 0.08 0.33 0.12 0.03
-1.37 -0.55 0.23 0.72 0.38 -0.31
-0.86 -0.63 -0.01 0.68 0.33 -0.06
-0.61 -0.45 0.02 0.42 0.31 0.02
-1.02 -0.77 0.08 0.6 0.49 -0.09
-0.66 -0.53 -0.03 0.5 0.39 -0.03
-0.58 -0.3 0.2 0.49 0.03 -0.09
-0.78 -0.3 -0.09 0.54 0.3 -0.03
-1.42 -0.4 0.05 0.81 0.36 -0.34
-2.21 -0.59 0.16 1.04 0.39 -0.67
-0.53 -0.13 -0.04 0.37 0.17 -0.0
-0.82 -0.37 0.11 0.49 0.26 -0.02
-1.35 -0.6 0.24 1.06 0.08 -0.68
-0.87 -0.52 -0.04 0.58 0.44 -0.1
-0.74 -0.37 0.1 0.35 0.35 0.02
-0.42 -0.28 -0.05 0.39 0.23 -0.02
-0.87 -0.51 0.0 0.66 0.33 -0.15
-0.7 -0.38 0.04 0.52 0.35 -0.18
-0.7 -0.47 0.03 0.49 0.36 -0.08
-0.95 -0.4 0.1 0.75 0.18 -0.25
-1.84 -1.67 0.21 0.94 0.63 -0.34
-1.32 -0.78 0.25 0.65 0.64 -0.51
-1.41 -0.72 0.21 0.83 0.32 -0.26
-1.52 -0.7 0.17 0.73 0.48 -0.23
-0.59 -0.3 0.12 0.57 0.07 -0.15
-1.06 -0.76 0.13 0.62 0.32 0.07
-1.42 -0.98 0.26 0.93 0.3 -0.37
-1.02 -0.18 0.07 0.46 0.26 0.0
-0.64 -0.46 0.11 0.46 0.35 -0.14
-0.34 -0.26 0.07 0.39 0.09 -0.07
-2.73 -1.43 0.02 1.29 0.23 -0.23
-1.84 -2.13 0.3 1.17 0.35 -0.45
-1.83 -0.51 0.37 0.72 0.37 -0.35
-0.89 -0.33 0.32 0.54 0.1 -0.16
-0.85 -0.11 0.07 0.4 0.21 -0.02
-0.6 -0.19 0.18 0.45 0.12 -0.18
-1.31 -0.73 -0.08 1.03 0.3 -0.36
-0.5 -0.36 0.07 0.58 0.06 -0.12
-0.92 -0.7 0.23 0.53 0.44 -0.19
-0.59 -0.33 -0.02 0.47 0.29 -0.08
-1.25 -0.61 0.17 0.68 0.36 -0.13
-0.96 -0.13 -0.03 0.56 0.31 -0.17
-0.55 -0.21 -0.01 0.52 0.2 -0.2
-1.56 -1.55 0.12 1.07 0.5 -0.48
-0.76 -0.44 0.12 0.54 0.31 -0.16
-0.67 -0.34 0.01 0.39 0.36 -0.03
-1.72 -0.88 0.15 0.89 0.44 -0.26
-0.59 -0.47 0.19 0.56 0.12 -0.14
-1.01 -0.38 -0.09 0.66 0.41 -0.19
-0.59 -0.41 -0.02 0.5 0.26 -0.02
-0.44 -0.16 0.06 0.3 0.12 0.0
-1.15 -0.81 -0.07 0.77 0.39 0.01
-1.09 -0.02 0.1 0.38 0.36 -0.19
-0.65 -0.22 0.04 0.52 0.18 -0.13
-1.46 -0.41 0.33 0.76 0.16 -0.28
-1.19 -0.5 0.02 0.63 0.45 -0.11
-1.12 -0.53 0.01 0.55 0.55 -0.13
-1.41 -0.45 0.2 0.83 0.4 -0.64
-1.32 -0.74 0.26 0.65 0.45 -0.22
-0.83 -0.6 0.22 0.77 0.1 -0.26
-0.84 -0.3 -0.01 0.62 0.23 -0.12
-0.96 -1.1 -0.13 0.9 0.4 -0.12
-4.55 -4.22 0.43 1.21 0.77 -0.9
-1.42 -0.09 0.14 0.61 0.18 -0.12
-0.62 -0.71 0.13 0.62 0.29 -0.18
-1.14 -0.95 0.15 0.85 0.23 -0.09
-0.57 -0.18 -0.05 0.41 0.22 -0.01
-1.37 -0.75 0.25 0.96 0.14 -0.36
-2.77 -1.26 0.28 0.92 0.59 -0.26
-1.16 -0.71 -0.05 0.66 0.54 -0.08
-1.54 -0.7 0.23 0.84 0.36 -0.34
-0.4 -0.48 -0.01 0.57 0.21 -0.16
-0.47 -0.24 0.03 0.44 0.06 0.01
-0.54 -0.43 0.05 0.4 0.32 -0.05
-0.45 -0.3 0.08 0.35 0.2 -0.04
-2.25 -0.84 0.09 0.97 0.69 -0.73
-0.75 -0.04 0.05 0.4 0.17 -0.07
-0.78 -0.3 0.05 0.64 0.17 -0.17
-1.66 -0.56 0.11 1.02 0.15 -0.33
-0.4 -0.11 0.03 0.29 0.15 -0.06
-0.51 -0.19 0.02 0.44 0.12 -0.06
-1.09 -0.56 0.17 0.54 0.39 -0.06

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.