Heatmap: Cluster_4 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.52 0.07 0.13 0.31 -0.07 -0.05
-0.46 0.12 0.24 0.35 -0.19 -0.23
-0.39 0.09 0.24 0.26 -0.11 -0.21
-0.66 0.04 0.21 0.34 0.02 -0.13
-0.38 0.12 0.22 0.48 -0.41 -0.27
-1.24 0.01 0.29 0.45 0.23 -0.32
-0.62 -0.01 0.21 0.48 -0.28 -0.03
-0.91 0.25 0.34 0.53 -0.32 -0.37
-0.88 -0.1 0.29 0.39 -0.03 0.01
-0.56 0.08 0.2 0.29 -0.04 -0.13
-0.32 0.25 0.17 0.25 -0.33 -0.14
-0.76 0.09 0.1 0.35 0.05 -0.05
-0.37 0.21 0.15 0.19 -0.17 -0.11
-1.49 0.22 0.3 0.44 0.2 -0.42
-1.45 -0.13 0.27 0.49 0.12 0.05
-1.23 0.05 0.36 0.39 0.15 -0.24
-0.45 0.16 0.18 0.46 -0.36 -0.2
-0.27 0.04 -0.02 0.21 0.02 -0.02
-1.69 0.26 0.32 0.5 0.3 -0.73
-0.61 0.04 0.2 0.38 -0.02 -0.18
-0.26 -0.05 0.09 0.24 -0.03 -0.03
-0.56 -0.1 0.15 0.33 0.0 0.02
-0.5 0.19 0.28 0.35 -0.39 -0.15
-0.56 0.13 0.25 0.43 -0.12 -0.37
-0.41 0.13 0.08 0.19 -0.03 -0.04
-0.72 0.03 0.17 0.26 0.1 -0.04
-0.6 0.22 0.2 0.47 -0.44 -0.15
-1.03 0.15 0.24 0.37 0.06 -0.17
-0.86 -0.01 0.14 0.54 -0.1 -0.03
-0.36 -0.02 0.14 0.31 -0.08 -0.08
-0.68 0.14 0.25 0.56 -0.28 -0.36
-0.5 0.16 0.14 0.34 -0.12 -0.17
-0.73 0.05 0.31 0.45 -0.17 -0.22
-1.33 0.32 0.45 0.34 -0.18 -0.24
-1.88 0.27 0.79 0.46 -0.44 -0.54
-0.38 0.09 0.08 0.33 -0.18 -0.04
-0.83 0.11 0.32 0.36 0.07 -0.36
-0.57 0.13 0.04 0.37 0.11 -0.27
-0.54 0.28 0.27 0.53 -0.61 -0.35
-0.58 0.15 0.25 0.26 -0.1 -0.16
-0.47 -0.04 0.15 0.29 -0.03 -0.01
-0.31 0.03 0.11 0.3 -0.16 -0.05
-0.44 0.27 0.25 0.31 -0.41 -0.2
-0.66 -0.1 0.29 0.22 0.08 -0.02
-0.2 0.09 0.11 0.14 -0.08 -0.09
-0.41 -0.04 0.19 0.31 -0.11 -0.04
-0.5 0.16 0.24 0.42 -0.28 -0.27
-0.4 0.0 0.22 0.1 0.05 -0.05
-0.77 0.27 0.27 0.29 -0.05 -0.29
-0.36 0.01 0.23 0.18 -0.02 -0.11
-0.59 0.12 0.1 0.32 -0.01 -0.09
-0.38 0.08 0.14 0.23 -0.05 -0.1
-0.94 0.2 0.49 0.67 -0.71 -0.45
-1.31 0.35 0.18 0.68 -0.0 -0.78
-1.58 0.12 0.29 0.57 0.3 -0.63
-1.36 0.29 0.51 0.75 -0.59 -0.71
-0.78 0.25 0.3 0.36 -0.19 -0.25
-0.25 0.0 0.12 0.15 0.03 -0.09
-0.39 -0.06 0.19 0.25 -0.01 -0.08
-0.96 0.21 0.45 0.33 -0.08 -0.41
-0.62 0.17 0.21 0.27 0.05 -0.27
-0.36 0.03 0.29 0.12 -0.04 -0.12
-0.35 0.07 0.14 0.21 0.02 -0.16
-0.49 0.01 0.28 0.49 -0.3 -0.23
-0.52 -0.03 0.34 0.36 -0.25 -0.09
-1.01 -0.21 0.46 0.43 -0.08 -0.04
-0.26 0.04 0.18 0.28 -0.21 -0.1
-0.52 0.02 0.24 0.41 -0.31 -0.05
-0.67 -0.02 0.19 0.27 0.05 0.01
-1.02 0.04 0.23 0.42 0.01 -0.05
-0.43 0.06 0.26 0.39 -0.22 -0.22
-0.37 -0.06 0.07 0.28 0.13 -0.14
-0.45 -0.06 0.13 0.28 -0.08 0.07
-0.65 0.02 0.2 0.24 0.15 -0.13
-1.13 -0.4 0.24 0.7 0.39 -0.56
-0.76 0.17 0.41 0.27 -0.09 -0.3
-0.69 0.33 0.39 0.46 -0.42 -0.55
-0.82 -0.1 0.25 0.55 -0.2 -0.03
-0.45 0.04 0.03 0.24 0.05 0.01
-0.26 0.01 0.04 0.2 -0.03 -0.0
-1.11 0.32 0.38 0.69 -0.7 -0.41
-0.38 -0.06 0.2 0.25 -0.14 0.02
-1.01 0.16 0.29 0.24 0.12 -0.16
-0.65 0.1 0.06 0.38 0.03 -0.12
-0.67 0.08 0.31 0.22 0.06 -0.21
-1.27 0.1 0.57 0.66 -0.21 -0.78
-0.47 0.18 0.31 0.24 -0.24 -0.18
-0.81 0.15 0.34 0.34 0.06 -0.43
-1.51 0.07 0.51 0.61 -0.31 -0.25
-0.41 0.19 0.17 0.39 -0.37 -0.15
-0.85 -0.1 0.29 0.28 0.08 0.03
-0.75 0.03 0.16 0.37 -0.08 0.04
-1.27 0.19 0.63 0.35 -0.25 -0.35
-1.1 0.22 0.5 0.38 -0.12 -0.46
-0.54 -0.07 0.22 0.34 -0.05 -0.06
-1.03 0.22 0.44 0.61 -0.68 -0.25
-0.82 0.13 0.35 0.33 -0.06 -0.24
-0.44 -0.16 0.3 0.34 -0.14 -0.06
-0.61 0.19 0.23 0.37 -0.14 -0.27
-0.62 0.28 0.28 0.31 -0.05 -0.5
-0.57 0.03 0.01 0.32 -0.02 0.09
-0.88 0.14 0.27 0.39 -0.02 -0.24
-0.29 0.02 0.05 0.15 0.04 -0.01
-1.09 0.36 0.35 0.54 -0.34 -0.46
-0.85 0.01 0.25 0.4 0.05 -0.15
-1.0 0.34 0.36 0.45 -0.33 -0.34
-0.73 0.39 0.36 0.49 -0.65 -0.39
-0.46 0.0 0.25 0.28 -0.1 -0.09
-0.64 -0.09 0.22 0.62 -0.47 -0.0
-0.33 -0.07 0.21 0.21 -0.11 0.02
-0.69 0.06 0.28 0.28 -0.08 -0.06
-0.28 0.05 0.02 0.18 -0.01 -0.0
-1.16 0.05 0.17 0.46 0.06 -0.04
-0.51 0.06 0.28 0.36 -0.08 -0.31
-1.14 -0.15 0.46 0.69 -0.3 -0.24
-0.36 -0.02 0.26 0.4 -0.25 -0.17
-0.82 0.11 0.22 0.45 0.11 -0.42
-0.35 -0.05 0.26 0.22 -0.03 -0.14
-0.52 -0.03 0.28 0.29 -0.16 -0.02
-0.68 0.28 0.17 0.51 -0.25 -0.38
-0.51 0.12 0.22 0.11 0.11 -0.18
-0.71 0.32 0.27 0.34 -0.22 -0.3
-1.11 0.11 0.37 0.55 -0.09 -0.39
-0.5 0.05 0.14 0.28 0.03 -0.13
-0.91 0.28 0.28 0.44 -0.19 -0.32
-0.99 0.05 0.22 0.42 -0.01 -0.05
-1.79 0.38 0.47 0.86 -0.69 -0.76
-0.84 -0.06 0.26 0.31 0.07 -0.0
-1.52 -0.04 0.4 0.59 0.05 -0.3
-0.63 0.18 0.24 0.43 -0.4 -0.1
-0.28 0.08 0.22 0.28 -0.25 -0.14
-1.31 0.05 0.38 0.59 -0.04 -0.34
-0.63 0.09 0.34 0.28 -0.06 -0.24
-0.16 0.12 0.13 0.16 -0.2 -0.09
-1.46 0.21 0.39 0.5 0.1 -0.54
-0.96 0.05 0.39 0.45 -0.01 -0.36
-0.5 0.06 0.09 0.19 0.03 0.03
-1.02 0.06 0.33 0.24 0.09 -0.06
-0.53 0.01 0.24 0.31 -0.09 -0.08
-0.41 -0.01 0.18 0.29 -0.15 -0.02
-1.1 0.23 0.46 0.71 -0.68 -0.47
-0.68 0.05 0.22 0.33 -0.12 0.0
-0.51 0.04 0.12 0.29 -0.02 -0.04
-0.39 0.17 0.14 0.28 -0.15 -0.16
-0.95 0.37 0.37 0.45 -0.31 -0.47
-0.36 -0.01 -0.02 0.22 0.08 0.03
-1.04 0.3 0.52 0.47 -0.24 -0.71
-0.43 0.02 0.07 0.19 0.05 0.03
-0.28 0.07 0.21 0.19 -0.06 -0.2
-1.2 0.14 0.31 0.57 0.05 -0.52
-0.65 0.21 0.26 0.4 -0.31 -0.18
-0.53 -0.03 0.16 0.26 0.04 -0.02
-2.1 0.08 0.68 0.47 -0.16 -0.28
-0.94 0.08 0.4 0.42 0.04 -0.45
-0.6 0.05 0.29 0.22 -0.03 -0.09
-0.86 -0.03 0.3 0.28 0.08 -0.05
-1.09 0.08 0.5 0.55 -0.41 -0.26
-0.38 0.15 0.31 0.35 -0.46 -0.18
-0.82 0.12 0.24 0.37 -0.06 -0.12
-0.64 0.14 0.14 0.39 0.02 -0.28
-0.59 0.1 0.16 0.36 -0.14 -0.06
-0.94 0.26 0.22 0.49 -0.15 -0.29
-0.97 0.06 0.58 0.59 -0.48 -0.46
-1.13 0.15 0.34 0.52 -0.21 -0.2
-2.69 0.6 0.47 0.72 -0.21 -1.21
-0.23 0.03 0.19 0.19 -0.16 -0.06
-0.46 0.21 0.21 0.45 -0.49 -0.19
-1.18 0.36 0.28 0.3 0.16 -0.51
-0.98 0.21 0.37 0.27 0.03 -0.28
-0.63 0.06 0.35 0.52 -0.17 -0.5
-1.33 -0.03 0.59 0.64 -0.62 -0.14
-0.66 -0.05 0.18 0.31 0.04 -0.0
-0.46 0.03 0.07 0.34 0.03 -0.12
-0.54 0.07 0.07 0.37 0.05 -0.18
-1.08 0.23 0.5 0.44 -0.31 -0.39
-1.01 0.35 0.09 0.59 -0.13 -0.43
-0.93 0.02 0.28 0.32 0.08 -0.08
-0.64 0.05 0.36 0.36 -0.21 -0.17
-0.73 0.26 0.41 0.33 -0.31 -0.29
-0.21 -0.01 0.14 0.13 -0.03 -0.04
-0.95 0.27 0.32 0.33 -0.17 -0.18
-0.97 0.07 0.35 0.34 0.04 -0.2
-0.7 0.18 0.46 0.47 -0.43 -0.43
-0.41 0.04 0.2 0.26 -0.12 -0.07
-1.09 0.25 0.56 0.44 -0.3 -0.51
-0.47 0.03 0.24 0.33 -0.16 -0.12
-0.97 0.03 0.4 0.59 -0.42 -0.17
-1.08 0.07 0.37 0.37 0.11 -0.3
-0.82 0.16 0.37 0.2 -0.01 -0.17
-0.92 0.07 0.3 0.34 0.02 -0.14
-0.41 -0.03 0.16 0.3 -0.08 -0.04
-0.76 -0.05 0.34 0.37 -0.01 -0.16
-0.81 -0.04 -0.03 0.47 -0.0 0.13
-0.48 0.05 0.33 0.28 -0.08 -0.25
-2.02 0.06 0.08 0.56 0.07 0.17
-0.78 0.3 0.33 0.64 -0.82 -0.31
-1.9 0.05 0.76 0.71 -0.22 -0.98
-0.52 -0.03 0.16 0.39 -0.09 -0.06
-0.64 0.14 0.2 0.24 0.01 -0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.