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Heatmap: Cluster_99 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.51 -1.76 -1.87 1.36 0.44 -0.3
-1.6 -1.15 -2.6 1.46 0.6 -0.35
-0.34 -0.55 -0.6 0.69 0.19 0.16
-0.29 -0.07 -0.71 0.85 -0.34 0.03
-0.29 -0.41 -0.02 0.66 -0.12 -0.1
-0.96 -1.14 -0.75 1.37 -0.08 -0.12
-0.07 -0.19 -0.06 0.32 0.05 -0.11
-1.03 -0.1 -0.41 0.89 -0.02 -0.02
-0.24 -0.44 -0.55 0.73 0.09 0.01
-0.57 -0.22 -0.32 0.79 -0.16 0.05
-0.36 -0.12 -0.25 0.58 -0.05 0.0
-0.75 - - 1.63 0.85 -0.98
-0.24 -0.21 -0.04 0.39 0.04 -0.04
-0.11 -0.25 -0.1 0.36 0.09 -0.08
-0.49 -0.06 -0.25 0.67 -0.13 -0.02
-0.95 -0.71 -0.49 1.49 -0.98 -0.26
-1.1 -1.98 -0.96 1.37 0.28 -0.05
-0.1 -0.1 -0.1 0.23 0.04 -0.0
-0.6 -0.08 -0.32 0.54 0.06 0.13
-0.25 -0.24 -0.27 0.75 -0.26 -0.06
-0.23 -0.11 -0.42 0.7 0.14 -0.41
-3.59 -1.07 -1.18 1.86 -0.26 -0.9
-1.26 -1.96 -1.38 1.4 -0.02 0.39
-0.16 -0.14 -0.05 0.33 -0.03 -0.01
-0.06 -0.09 -0.16 0.37 -0.09 -0.02
-0.28 -0.87 -0.36 1.0 0.15 -0.44
-0.04 -0.15 -0.3 0.37 -0.03 0.06
-0.64 -0.53 -0.29 1.12 -0.1 -0.44
-0.14 -0.11 -0.27 0.4 -0.02 0.05
-0.12 -0.17 -0.16 0.3 0.12 -0.04
-0.13 -0.09 -0.07 0.31 -0.08 0.01
-0.05 -0.19 -0.14 0.24 0.01 0.08
-0.12 -0.17 -0.59 0.45 0.08 0.14
-0.75 -0.42 -0.22 0.84 0.22 -0.25
-1.97 -2.81 -1.44 1.61 0.45 -0.31
-0.25 -0.8 -1.04 1.26 -0.13 -0.34
-0.12 -0.12 -0.21 0.35 0.06 -0.03
-0.25 -0.25 -0.19 0.75 -0.03 -0.36
0.02 -0.18 -0.21 0.29 0.04 -0.02
-0.24 -0.36 -0.6 0.9 -0.16 -0.07
-0.23 -0.1 -0.38 0.57 0.09 -0.15
-0.33 -0.12 -0.18 0.45 0.04 0.02
-0.55 -0.22 -0.5 0.75 0.05 0.05
-0.32 -0.08 -0.41 0.55 0.19 -0.15
-0.13 0.01 -0.14 0.19 -0.01 0.06
-0.32 -0.29 -0.33 0.81 0.02 -0.28
-0.37 -0.43 -0.44 0.88 0.06 -0.19
-0.34 -0.82 -0.54 1.04 0.03 -0.18
-0.11 -0.32 -0.33 0.45 0.14 0.0
-0.12 -0.08 -0.2 0.38 0.01 -0.06
-1.17 -0.27 -0.39 1.14 0.08 -0.5
-0.11 -0.21 -0.73 0.53 0.1 0.13
-0.12 -0.43 -0.38 0.66 0.14 -0.17
-0.35 -0.26 -0.2 0.63 -0.05 0.0
-0.35 0.04 -0.21 0.45 -0.14 0.07
-0.41 -0.27 -0.17 0.7 -0.09 -0.05
-0.14 -0.22 -0.37 0.52 0.12 -0.09
-0.42 -0.29 -0.1 0.75 -0.18 -0.09
-0.55 -0.52 -0.5 1.05 0.01 -0.28
-0.42 -0.69 -0.84 0.99 0.02 0.1
-0.4 -0.66 -0.43 0.82 0.24 -0.12
-0.6 -0.86 -0.48 0.95 0.22 -0.04
-0.45 -0.74 -0.32 0.96 0.02 -0.14
-0.14 -0.13 -0.04 0.57 -0.19 -0.25
-0.13 -0.14 -0.31 0.54 -0.17 0.05
0.03 -0.17 -0.15 0.18 0.06 0.02
0.08 -1.22 - 1.47 0.46 -1.39
-0.59 -1.76 -1.3 1.36 -0.15 0.23
-0.07 -0.07 -0.21 0.25 -0.02 0.08
-0.99 -0.41 -0.15 1.0 -0.1 -0.15
- - - 2.17 -0.83 -0.1
-0.66 -0.02 0.08 0.73 -0.12 -0.41
-0.11 -0.13 -0.3 0.58 -0.13 -0.08
-0.11 -0.07 -0.32 0.41 0.03 -0.04
-0.21 - - 2.17 - -0.69
-0.26 -0.36 -0.35 0.64 0.03 0.02
-0.55 -0.94 -1.88 1.18 0.51 -0.27
-0.01 -0.13 0.02 0.27 -0.16 -0.04
-0.15 -0.11 -0.41 0.43 0.03 0.07
-0.48 -0.61 -0.21 1.03 -0.14 -0.3
-0.65 -0.28 -1.25 1.36 -0.34 -0.41
- - - 2.31 - 0.04
-0.04 -0.19 -0.2 0.25 0.13 -0.01
0.1 -0.31 -1.08 0.56 0.27 -0.04
-0.38 -0.34 -0.32 0.64 0.2 -0.11
-0.17 -0.25 -0.31 0.56 -0.1 0.07
-0.18 -0.08 -0.16 0.37 0.11 -0.14
0.04 -1.03 -0.86 1.24 -0.71 -0.06
-0.38 -0.73 -0.93 1.03 0.01 0.06
-0.15 -0.48 -0.31 0.5 0.21 0.01
-0.11 -0.33 -0.22 0.49 0.07 -0.06
-0.14 -0.22 -0.18 0.42 0.04 -0.03
-0.32 -0.08 -0.37 0.7 -0.12 -0.11
-0.33 -0.05 -0.09 0.37 0.11 -0.12
-0.1 -0.38 -0.57 0.54 0.07 0.17
0.0 -0.12 -0.12 0.15 0.05 0.02
-0.15 -0.11 -0.3 0.45 0.09 -0.12
-0.11 -1.03 -0.4 0.64 0.49 -0.22
-0.14 -0.25 -0.26 0.7 -0.27 -0.05
-0.24 -0.72 -0.42 0.83 0.08 -0.05
-0.53 -0.53 -0.54 0.95 0.22 -0.27
-0.1 -0.22 -0.29 0.69 -0.33 -0.04
-0.12 -0.14 -0.04 0.5 -0.07 -0.25
-0.42 -0.58 -0.67 0.96 0.21 -0.24
-0.14 -0.16 -0.27 0.5 -0.13 0.06
-0.22 -0.16 -0.24 0.53 -0.16 0.09
-0.24 -0.01 -0.15 0.34 -0.0 -0.01
-0.22 -0.3 -0.57 0.57 0.15 0.08
-0.4 -0.29 -0.27 0.67 0.05 -0.06
-0.27 -0.04 -0.41 0.51 0.03 0.0
-0.05 -0.31 -0.69 0.48 0.32 -0.04
-0.18 -0.2 -0.2 0.55 -0.03 -0.09
-0.36 -0.4 -0.51 0.71 0.16 0.02
-0.08 -0.14 -0.32 0.32 0.14 -0.02
-0.03 -0.28 -0.34 0.38 0.16 -0.02
-0.32 -0.13 -0.14 0.66 -0.15 -0.16
-0.01 -0.12 -0.14 0.16 0.05 0.03
-0.26 -0.17 -0.03 0.41 0.01 -0.06
0.1 -0.72 -0.82 0.89 -0.08 -0.07
-0.61 -0.41 -0.59 0.95 0.26 -0.34
-0.49 -0.42 -0.28 0.9 -0.26 0.04
-0.12 -0.22 -0.34 0.57 -0.08 0.0
-0.32 -0.49 -0.43 0.64 0.21 0.05
-0.19 -0.28 -0.2 0.5 0.02 -0.0
-0.46 -0.66 -0.63 1.11 -0.06 -0.2
-0.37 -0.22 -0.15 0.49 -0.04 0.11
-0.66 -0.74 - 1.3 0.13 0.28
-0.37 -0.41 -0.55 0.76 0.15 -0.01
-0.13 -0.23 -0.26 0.43 0.0 0.06
-0.02 -0.09 -0.13 0.24 -0.03 -0.0
-0.07 -0.37 -0.26 0.44 0.13 -0.03
- -1.93 -0.63 1.87 -1.25 0.02
-0.25 -0.24 -0.34 0.53 0.12 -0.02
-1.36 -0.92 -0.25 1.61 -1.57 -0.24
-0.17 0.04 -0.12 0.15 0.04 0.04
-0.99 -0.76 -0.44 1.2 0.01 -0.22
-0.32 -0.04 -0.36 0.55 0.12 -0.16
-0.21 -0.01 -0.14 0.3 0.02 -0.02
-0.47 -0.27 -0.35 0.75 0.17 -0.22
-0.39 -0.53 -0.11 0.81 0.13 -0.37
- -0.99 - 2.01 -0.32 -0.59
-0.46 -0.42 -0.53 1.03 -0.03 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.