Heatmap: Cluster_118 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.34 -0.4 0.1 0.23 0.14 0.15
-0.57 -0.63 0.14 0.1 0.46 0.17
-1.05 -0.62 0.24 0.34 0.38 0.15
-0.23 -0.16 0.03 0.19 -0.04 0.16
-1.3 -0.53 0.02 0.27 0.6 0.22
-0.6 -0.41 0.09 0.16 0.37 0.16
-0.82 -0.94 0.13 0.21 0.56 0.24
-0.24 -0.52 -0.0 0.18 0.2 0.24
-0.69 -0.22 -0.07 0.29 0.27 0.19
-0.4 -0.62 0.04 0.28 0.11 0.35
-0.51 -0.42 0.24 0.45 0.03 -0.03
-0.29 -0.69 0.07 0.24 0.27 0.17
-0.74 -1.49 0.1 0.07 0.71 0.37
-0.38 -0.31 0.03 0.24 0.16 0.14
-0.44 -0.39 0.15 0.21 0.12 0.2
-0.46 -0.28 0.06 0.15 0.08 0.32
-0.24 -0.35 0.03 0.12 0.19 0.16
-0.77 -1.11 0.2 0.42 0.18 0.42
-0.39 -0.26 -0.06 0.22 -0.0 0.35
-0.34 -0.4 0.07 0.3 0.04 0.19
-0.4 -0.36 0.03 0.15 0.09 0.35
-0.31 -0.5 0.09 0.25 0.2 0.12
-0.57 -0.13 -0.13 0.14 0.1 0.4
-0.24 -0.34 0.04 0.16 0.15 0.15
-0.23 -0.33 0.04 0.19 0.11 0.14
-0.18 -0.14 -0.0 0.13 0.04 0.13
-0.32 -0.15 0.02 0.19 0.01 0.2
-0.32 -0.18 0.0 0.15 0.09 0.19
-0.25 -0.21 0.05 0.12 0.1 0.15
-0.24 -0.55 -0.01 0.21 0.23 0.19
-0.35 -0.64 -0.05 0.19 0.36 0.23
-0.18 -0.32 0.05 0.15 0.09 0.15
-0.34 -0.53 0.04 0.13 0.31 0.2
-0.34 -0.5 0.07 0.24 0.2 0.17
-0.2 -0.36 0.01 0.22 0.1 0.15
-0.22 -0.23 0.03 0.17 0.09 0.11
-1.61 -0.91 0.14 0.73 0.22 0.29
-0.5 -0.34 0.13 0.22 0.15 0.18
-0.4 -0.39 0.09 0.25 0.15 0.16
-0.56 -0.46 0.11 0.22 0.25 0.22
-0.63 -0.31 0.14 0.33 0.15 0.11
-0.21 -0.31 0.03 0.12 0.16 0.15
-0.19 -0.39 -0.13 0.17 0.27 0.16
-0.32 -0.41 0.1 0.13 0.19 0.19
-0.57 -0.45 0.16 0.24 0.25 0.15
-0.55 -0.23 0.14 0.25 0.13 0.11
-0.62 -1.13 0.17 0.53 0.04 0.37
-0.62 -0.75 0.14 0.16 0.47 0.21
-0.38 -0.1 -0.08 0.07 0.1 0.3
-0.32 -0.17 0.07 0.16 0.09 0.09
-0.2 -0.43 0.04 0.19 0.17 0.14
-0.15 -0.26 0.05 0.08 0.11 0.12
-0.45 -0.26 0.1 0.2 0.18 0.11
-1.21 -0.58 0.08 0.52 0.23 0.31
-0.73 -0.4 0.2 0.43 0.1 0.1
-0.53 -0.44 0.05 0.28 0.14 0.28
-0.52 -0.33 0.01 0.28 0.24 0.14
-0.38 -0.23 0.08 0.22 0.1 0.12
-0.29 -0.24 0.07 0.24 0.1 0.05
-0.57 -0.82 0.15 0.17 0.44 0.22
-0.25 -0.35 0.05 0.19 0.17 0.11
-0.5 -0.85 0.03 0.18 0.47 0.26
-0.42 -0.82 0.07 0.22 0.33 0.28
-0.63 -1.11 -0.05 0.16 0.68 0.27
-0.36 -0.4 0.04 0.23 0.21 0.15
-0.79 -0.38 0.13 0.55 -0.01 0.14
-0.49 -0.44 0.06 0.32 0.05 0.29
-0.37 -0.21 0.01 0.19 0.12 0.18
-0.26 -0.15 -0.02 0.13 0.1 0.15
-0.27 -0.25 0.08 0.15 0.09 0.13
-0.32 -0.24 0.14 0.18 0.12 0.04
-0.29 -0.43 -0.01 0.08 0.34 0.17
-1.04 -0.84 0.18 0.44 0.32 0.29
-0.39 -0.55 0.03 0.11 0.35 0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.