Heatmap: Cluster_249 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.26 -0.98 -1.26 1.03 -0.28 0.01
0.12 -0.2 -0.22 0.13 0.1 0.02
-0.11 - - 1.69 -1.32 0.54
0.19 -0.16 -0.24 0.1 -0.08 0.13
0.19 -0.32 -0.35 0.24 0.08 0.05
-0.07 -1.08 -2.26 1.31 -0.55 0.27
0.09 -0.17 -0.43 0.24 0.04 0.14
0.08 -0.3 -0.28 0.27 -0.03 0.16
0.04 -0.29 -0.73 0.37 0.21 0.14
0.22 -0.07 -0.63 0.2 -0.05 0.16
0.15 -0.09 -0.43 0.28 -0.02 0.01
0.05 -0.79 -0.53 0.73 -0.16 0.18
0.05 -0.38 -0.27 0.33 0.07 0.08
0.08 -0.25 -0.17 0.28 -0.16 0.14
0.14 -0.13 -0.25 0.17 -0.09 0.11
0.19 -0.33 -0.25 0.13 -0.14 0.29
0.05 -0.19 -0.2 0.21 -0.07 0.16
0.31 -0.32 -0.85 0.8 -0.57 -0.01
-0.12 -0.98 -1.38 0.71 0.38 0.31
0.22 -0.28 -1.1 0.25 0.1 0.36
0.07 -0.12 -0.23 0.17 -0.05 0.11
0.24 -0.39 -0.81 0.36 0.07 0.21
0.06 -0.33 -0.55 0.34 0.05 0.24
0.49 -1.67 -1.11 0.6 0.06 0.33
0.16 -0.23 -0.52 0.29 -0.06 0.21
0.21 -0.35 -0.41 0.24 -0.04 0.19
0.22 -0.24 -0.57 0.21 -0.11 0.31
0.02 0.01 -0.21 0.13 -0.05 0.07
0.11 -0.03 -0.86 0.54 -0.02 -0.07
0.12 -0.15 -0.15 0.09 0.01 0.06
-0.07 -0.17 -0.11 0.35 -0.12 0.06
0.21 -0.7 -0.54 0.48 -0.11 0.29
0.1 -0.52 -0.19 0.27 -0.03 0.23
0.01 -0.27 -0.36 0.31 0.09 0.11
0.13 -0.28 -0.23 0.17 0.05 0.11
0.15 -0.22 -0.36 0.26 -0.01 0.09
0.53 -1.77 - 1.5 -1.69 0.18
0.25 -0.32 -0.43 0.02 -0.03 0.35
0.18 -0.51 -0.58 0.36 0.03 0.25
-0.03 -0.42 -0.3 0.47 -0.02 0.12
0.11 -0.08 -0.36 0.16 0.01 0.1
0.06 0.0 -0.38 0.18 -0.03 0.1
-0.11 -0.3 -0.49 0.56 -0.06 0.15
-0.03 -0.26 -0.42 0.29 0.14 0.15
0.12 -0.06 -0.34 0.18 -0.03 0.07
0.1 -0.32 -0.18 0.22 -0.06 0.17
0.27 -0.43 -0.33 0.26 -0.21 0.26
0.3 -0.45 -0.72 0.56 -0.12 0.05
0.03 -0.4 -0.0 0.19 -0.07 0.17
-0.06 -0.11 -0.22 0.23 0.02 0.09
0.04 -0.06 -0.31 0.3 -0.15 0.1
0.19 -0.12 -0.22 0.05 -0.03 0.09
0.09 -0.21 -0.16 0.12 -0.0 0.12
0.06 -0.23 -0.25 0.14 0.06 0.16
0.12 -0.3 -0.35 0.32 -0.23 0.28
0.03 -0.27 -0.46 0.3 0.15 0.12
0.72 - - 0.52 0.25 0.79
0.03 -0.37 -0.55 0.72 -0.47 0.21
0.18 -0.3 -0.24 0.16 -0.1 0.21
0.28 -0.33 -0.44 0.32 -0.07 0.08
0.28 -0.42 -0.47 0.3 -0.17 0.26
0.17 -0.23 -0.22 0.09 -0.07 0.19
0.18 -0.19 -0.47 0.26 -0.03 0.12
-0.03 -0.33 -0.43 0.5 -0.2 0.26
0.37 -0.28 -0.6 0.31 -0.11 0.08
0.33 -1.31 -0.63 0.66 -0.14 0.27
0.44 -0.93 -0.75 0.52 0.04 0.09
0.07 -0.34 -0.4 0.3 0.0 0.23
0.13 -0.42 -0.37 0.25 -0.12 0.35
0.17 -0.55 -0.59 0.52 0.02 0.1
0.23 -0.37 -0.28 -0.07 -0.07 0.4
0.05 -0.25 -0.33 0.31 -0.05 0.17
0.1 -0.11 -0.2 0.12 -0.02 0.08
0.14 -0.13 -0.38 0.16 0.01 0.12
0.19 -0.19 -0.31 0.09 -0.06 0.21
0.23 -0.27 -0.37 0.16 0.04 0.12
0.07 -0.22 -0.27 0.22 -0.02 0.15
-0.01 -0.17 -0.16 0.25 -0.11 0.14
-0.03 -0.4 -0.03 0.23 -0.1 0.23
0.17 -0.38 -0.25 0.12 -0.04 0.27
0.24 -0.31 -0.27 0.1 -0.05 0.19
-0.02 -0.12 -0.22 0.24 0.02 0.07
0.12 -0.58 -0.57 0.48 -0.06 0.27
0.1 -0.25 -0.22 -0.04 0.03 0.29
0.07 -0.26 -0.27 0.33 -0.09 0.12

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.