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Heatmap: Cluster_138 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.83 -2.21 -0.19 -0.37 -0.06 0.48
0.12 -0.09 0.01 -0.04 -0.07 0.06
0.64 -0.07 -0.37 -0.55 -0.24 0.24
0.73 -0.47 -0.39 0.2 -0.49 -0.0
0.96 0.08 -0.63 - -0.24 0.58
0.14 -0.1 0.01 0.01 -0.09 0.02
2.17 - 0.58 - - -
1.07 -0.81 -0.52 - -0.71 1.02
0.44 -1.0 -0.01 0.02 0.07 0.13
0.21 -0.36 0.08 -0.11 0.04 0.06
0.17 -0.63 -0.12 -0.02 0.06 0.36
1.76 - 0.17 -0.02 -1.02 -
0.62 0.07 0.08 -0.35 -0.58 -0.15
0.3 -0.08 0.07 -0.19 -0.2 0.03
0.2 -0.25 0.08 -0.08 0.03 -0.02
0.18 -0.51 0.06 0.06 -0.03 0.14
0.38 -0.52 0.61 -1.02 0.12 -0.17
0.72 - 0.53 -0.07 -2.07 0.79
0.34 -0.33 -0.0 -0.13 -0.08 0.12
0.99 - -0.93 -0.53 0.27 0.67
0.26 -0.38 0.09 -0.11 -0.05 0.1
0.6 - 1.33 -0.58 -0.6 -0.62
0.1 -0.11 0.17 -0.02 0.07 -0.25
0.21 -0.26 0.07 0.04 -0.1 -0.01
0.52 -1.16 0.46 -0.45 -0.27 0.24
0.37 -0.09 -0.04 -0.18 -0.07 -0.06
0.69 -0.65 0.38 -0.65 -1.97 0.64
0.22 -0.05 0.08 0.01 -0.23 -0.07
1.19 -0.11 0.18 - - 0.72
0.28 -0.57 0.3 -0.21 -0.04 0.06
0.81 -1.07 0.08 0.04 -0.98 0.23
1.66 0.36 0.65 - - -
0.89 -1.73 0.29 -0.05 -0.32 -0.23
0.34 -0.51 0.01 0.04 -0.23 0.19
0.99 -0.89 0.71 - -2.22 0.7
0.06 -0.08 0.07 -0.04 -0.21 0.17
0.64 -1.0 0.31 -0.04 -0.26 -0.17
0.4 -0.11 0.14 -0.28 -0.34 0.05
1.21 -0.67 -1.38 0.01 -0.99 0.22
0.17 -0.17 0.0 -0.12 -0.01 0.1
0.26 -0.14 -0.1 -0.09 -0.14 0.15
0.16 -0.25 0.01 -0.08 0.0 0.12
1.57 - 0.97 - - 0.1
2.02 - 0.43 - -0.76 -
1.64 -0.65 0.64 -0.54 - -
0.13 -0.11 -0.18 -0.07 0.02 0.17
0.49 -0.42 0.18 0.09 -1.04 0.23
0.3 -0.29 0.14 -0.15 -0.2 0.11
0.14 -0.15 -0.04 -0.03 -0.01 0.08
0.3 -0.45 -0.08 0.14 -0.16 0.13
0.44 -0.47 -0.12 -0.05 -0.1 0.14
1.12 - 0.39 -0.66 -0.35 0.13
1.29 -0.67 -0.38 -0.63 -0.55 -0.28
0.21 -0.24 -0.08 0.01 -0.06 0.12
0.47 0.03 0.23 -0.22 -1.55 0.29
0.46 -0.45 0.0 -0.29 -0.17 0.24
-0.37 - 0.83 -0.56 -1.58 1.28
0.69 -0.06 0.85 -0.26 -1.84 -0.98
0.97 -0.33 -0.04 - -0.23 0.5
0.6 -0.03 0.01 -0.19 -0.38 -0.23
0.42 -0.05 0.04 -0.18 -0.13 -0.2
0.61 -0.69 1.1 -1.57 -2.59 0.27
0.04 -0.51 0.06 0.08 -0.1 0.31
0.67 -0.44 0.07 0.06 -0.22 -0.46
0.17 -0.2 0.19 -0.06 -0.18 0.03
0.64 -2.02 0.37 -0.48 0.36 -0.14
0.93 -0.69 0.47 -0.57 -2.59 0.33
0.07 -0.11 0.12 -0.08 -0.19 0.16
0.25 -0.22 0.09 -0.21 -0.07 0.09
0.22 -0.32 0.05 -0.09 -0.02 0.11
0.27 -0.27 -0.25 -0.13 0.09 0.2
1.72 -0.9 -0.03 -0.8 -2.8 -1.07
0.32 -0.09 0.29 -0.04 -0.53 -0.11
1.15 -0.32 0.77 -0.64 -0.64 -
0.75 -0.12 0.96 -0.45 - -0.47
0.31 -0.78 0.47 -0.61 -0.46 0.49
0.02 -0.1 0.06 0.01 -0.09 0.09
0.38 -0.03 0.5 -1.02 0.04 -0.36
0.27 -0.31 -0.03 -0.1 -0.03 0.12
0.37 -1.19 0.72 -0.49 -0.37 0.18
0.16 -0.16 0.12 -0.05 -0.13 0.03
0.72 -0.45 -0.3 -0.58 -0.09 0.26
0.51 -1.02 0.29 -0.56 -0.66 0.64
0.67 -0.59 -0.17 -0.16 -0.17 0.11
0.19 -0.26 0.48 -0.52 -0.75 0.42
0.68 -0.33 -0.18 0.07 -0.47 -0.08
1.35 - 0.34 - 0.15 0.12
0.11 -0.12 0.02 -0.05 -0.04 0.07
0.29 -0.12 0.13 -0.15 -0.14 -0.07
0.19 -0.28 0.3 -0.07 -0.79 0.36
0.18 -0.07 0.14 -0.44 -0.1 0.18
0.24 -0.36 0.0 -0.21 -0.07 0.29
1.08 -1.45 -0.17 -0.24 -0.41 0.04
1.24 -0.51 0.44 -0.83 -2.43 -0.26
0.25 -0.13 -0.16 -0.14 -0.04 0.17
0.27 -0.11 0.17 0.06 -0.37 -0.11
0.89 -0.2 0.0 -0.18 -1.45 0.03
0.26 -0.18 0.0 -0.2 -0.03 0.09
0.16 -0.42 -0.03 0.12 -0.04 0.13
0.29 -0.22 0.15 -0.14 -0.26 0.09
0.62 -0.26 -0.37 -0.06 -0.63 0.32
0.21 -0.2 -0.15 -0.01 -0.06 0.17
1.14 -1.05 0.55 -1.38 -0.39 -0.52
0.18 -0.49 -0.04 0.0 -0.05 0.28
0.51 -1.02 0.23 0.39 -0.87 0.08
0.09 -0.0 0.21 -0.15 -0.26 0.07
0.17 0.22 0.24 -0.8 -0.27 0.16
0.29 -0.37 0.08 -0.16 0.03 0.03
0.57 -0.33 0.38 -0.46 -0.4 -0.09
1.69 - 0.68 - - 0.22
0.2 -0.04 -0.01 -0.26 -0.16 0.21
1.57 - 0.97 - - 0.1
0.61 -0.88 0.58 -2.05 -0.69 0.65
0.77 -0.92 0.68 -1.24 0.07 -0.52
0.49 -0.21 -0.19 -0.19 -0.02 -0.02
0.2 -0.4 0.03 0.07 -0.08 0.11
0.32 -0.49 0.06 -0.06 -0.13 0.16
0.22 -0.08 0.26 0.04 -0.79 0.11
0.9 -0.05 0.36 -0.76 -0.45 -0.84
0.93 - 0.34 - 0.46 0.55
0.37 -0.65 0.14 -0.58 0.27 0.12
1.11 -0.19 0.5 - - 0.64
1.06 - 0.46 -0.15 - 0.72
0.26 -0.47 -0.18 -0.15 -0.03 0.39
0.94 -0.71 -0.29 -0.25 -1.18 0.46
0.95 - 0.35 -0.25 -1.25 0.61
0.41 -0.4 0.25 -0.68 0.15 -0.02
0.19 -0.35 0.21 0.05 -0.17 0.0

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.