Heatmap: Cluster_53 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.14 -0.49 -0.26 0.15 0.05 0.27
0.04 -0.37 0.18 -0.01 0.05 0.05
0.01 -0.56 0.19 0.07 0.04 0.14
0.12 -0.77 -0.04 0.05 0.28 0.14
0.13 -0.68 -0.09 0.13 0.2 0.14
-0.3 -0.84 -0.03 0.09 0.4 0.33
0.07 -0.36 -0.05 0.08 0.08 0.13
0.35 -0.78 -0.37 -0.01 0.25 0.25
-0.05 -0.45 0.04 -0.03 0.27 0.12
0.06 -0.57 0.04 0.1 0.04 0.2
0.13 -0.36 -0.11 0.07 0.17 0.04
0.01 -0.32 -0.17 0.16 0.05 0.21
0.07 -0.4 0.08 0.03 0.04 0.1
0.03 -0.55 -0.08 0.17 0.07 0.23
-0.07 -1.53 0.24 0.44 0.38 -0.22
0.03 -0.32 -0.03 0.06 0.1 0.12
0.07 -0.77 -0.03 0.0 0.25 0.25
-0.04 -1.15 0.22 -0.01 0.38 0.16
-0.09 -0.64 -0.04 0.1 0.24 0.25
-0.16 -1.16 -0.04 -0.03 0.48 0.38
0.02 -0.37 -0.35 0.17 0.13 0.26
0.01 -0.76 0.11 0.14 0.2 0.11
0.09 -0.42 -0.25 0.13 0.12 0.22
-0.2 -0.79 0.09 0.28 0.26 0.12
-0.09 -0.55 0.1 0.08 0.17 0.17
0.02 -0.54 -0.01 0.01 0.19 0.21
0.08 -0.72 -0.06 0.1 0.14 0.27
0.01 -0.46 0.17 0.06 -0.01 0.15
0.05 -0.35 -0.19 0.12 0.08 0.2
0.03 -0.32 -0.1 0.11 0.11 0.12
0.04 -0.65 -0.11 0.21 0.19 0.15
-0.07 -0.85 -0.39 0.38 -0.05 0.55
-0.03 -0.2 0.01 0.05 0.05 0.1
-0.18 -0.73 -0.08 0.12 0.37 0.25
-0.14 -0.71 -0.03 0.05 0.41 0.19
-0.05 -0.5 0.01 -0.04 0.29 0.18
0.05 -0.23 -0.07 -0.01 0.1 0.13
-0.01 -0.7 0.01 0.08 0.06 0.36
-0.13 -0.43 0.08 0.08 0.14 0.17
0.03 -0.2 -0.05 0.04 0.0 0.16
-0.01 -0.36 0.07 0.01 0.06 0.18
-0.03 -0.54 0.16 0.17 -0.01 0.13
-0.03 -0.5 0.06 0.07 0.12 0.18
0.08 -2.08 -0.2 0.23 0.45 0.37
-0.2 -0.84 0.08 0.15 0.25 0.28
0.09 -0.79 0.19 0.11 0.19 -0.0
0.12 -0.23 -0.02 0.02 0.06 0.03
0.12 -0.35 -0.08 -0.0 0.1 0.16
0.06 -0.3 0.07 0.07 -0.07 0.13
-0.15 -0.66 0.22 0.1 0.24 0.06
-0.02 -0.27 0.15 0.01 -0.03 0.12
0.0 -0.37 0.15 0.04 0.01 0.11
-0.01 -0.65 -0.01 0.05 0.07 0.36
-0.39 -0.94 -0.04 0.49 0.45 -0.04
0.19 -0.89 -0.36 0.28 0.07 0.35
0.15 -0.39 -0.05 0.08 0.11 0.03
-0.25 -0.78 -0.75 0.41 0.2 0.59
-0.09 -0.48 0.27 0.04 0.07 0.09
-0.09 -0.61 0.04 0.07 0.21 0.22
-0.26 -0.79 0.03 0.07 0.39 0.26
-0.12 -0.79 0.3 0.18 0.1 0.09
-0.17 -1.03 0.12 0.26 0.22 0.24
-0.06 -0.18 0.08 0.1 0.01 0.02
0.71 -3.68 -0.98 0.01 0.58 0.36
0.08 -0.44 -0.14 -0.05 0.27 0.17
0.03 -0.76 -0.03 0.09 0.2 0.27
0.08 -0.44 -0.18 0.09 0.09 0.25
-0.19 -0.68 -0.01 0.1 0.34 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.