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Heatmap: Cluster_258 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.69 -0.32 0.07 0.54 0.24 -0.15
-0.56 -0.41 -0.02 0.53 0.18 0.0
-0.4 -0.05 -0.01 0.33 0.1 -0.07
-0.56 -0.25 -0.11 0.41 0.24 0.07
-0.51 -0.29 -0.0 0.36 0.2 0.07
-0.44 -0.21 -0.06 0.44 0.12 -0.01
-0.92 -0.34 -0.04 0.56 0.27 0.04
-0.54 -0.16 -0.01 0.36 0.22 -0.04
-0.32 -0.2 -0.01 0.29 0.2 -0.05
-0.59 -0.21 -0.02 0.44 0.18 -0.0
-0.51 -0.24 0.08 0.4 0.22 -0.12
-0.38 -0.15 -0.01 0.33 0.14 -0.03
-0.5 -0.31 -0.01 0.41 0.27 -0.06
-0.62 -0.35 -0.03 0.42 0.27 0.05
-0.6 -0.23 0.0 0.44 0.15 0.04
-0.64 -0.24 -0.0 0.4 0.23 0.02
-0.48 -0.34 -0.05 0.43 0.29 -0.07
-0.52 -0.25 0.01 0.37 0.27 -0.06
-0.52 -0.18 -0.04 0.34 0.24 0.01
-0.77 -0.16 -0.13 0.39 0.32 0.06
-0.79 -0.3 0.01 0.52 0.22 0.01
-0.38 -0.16 -0.09 0.34 0.12 0.07
-0.2 -0.14 -0.02 0.23 0.1 -0.02
-0.56 -0.2 -0.0 0.42 0.13 0.03
-0.93 -0.44 -0.14 0.56 0.29 0.19
-0.34 -0.43 -0.2 0.36 0.35 0.05
-0.58 -0.14 -0.02 0.37 0.14 0.06
-0.3 -0.33 -0.1 0.3 0.2 0.11
-0.63 -0.23 0.03 0.41 0.16 0.05
-0.53 -0.3 -0.02 0.39 0.24 0.03
-0.31 -0.2 -0.05 0.3 0.13 0.06
-0.39 -0.14 -0.05 0.28 0.14 0.07
-0.33 -0.14 -0.06 0.3 0.17 -0.03
-0.33 -0.16 -0.04 0.29 0.11 0.05
-0.67 -0.24 -0.02 0.4 0.21 0.09
-0.47 -0.18 -0.11 0.47 0.09 0.03
-1.07 -0.25 0.01 0.6 0.29 -0.09
-0.99 -0.43 0.03 0.64 0.33 -0.13
-0.8 -0.41 -0.01 0.61 0.16 0.06
-0.51 -0.32 0.07 0.36 0.24 -0.02
-0.49 -0.15 0.04 0.31 0.2 -0.05
-0.62 -0.34 -0.2 0.44 0.44 -0.03
-0.66 -0.3 -0.05 0.35 0.3 0.12
-1.39 -0.71 -0.09 1.01 0.04 0.03
-0.32 -0.21 0.01 0.31 0.14 -0.01
-0.52 -0.17 0.09 0.39 0.07 -0.01
-0.75 -0.18 0.03 0.51 0.22 -0.13
-0.39 -0.23 -0.05 0.31 0.14 0.11
-1.05 -0.41 0.06 0.61 0.31 -0.06
-0.94 -0.48 -0.25 0.61 0.42 0.07
-0.42 -0.24 -0.03 0.41 0.2 -0.07
-0.4 -0.23 -0.02 0.29 0.19 0.06
-0.61 -0.29 0.0 0.41 0.18 0.09
-0.67 -0.16 -0.18 0.57 0.06 0.1
-0.78 -0.4 0.0 0.39 0.35 0.1
-0.61 -0.24 -0.01 0.38 0.25 0.02
-0.54 -0.61 -0.12 0.34 0.34 0.27
-0.35 -0.26 -0.0 0.27 0.2 0.04
-0.74 -0.33 -0.07 0.62 0.17 -0.03
-0.72 -0.32 -0.0 0.51 0.23 -0.01
-0.3 -0.16 -0.07 0.24 0.14 0.07
-0.61 -0.21 -0.05 0.47 0.15 0.03
-0.69 -0.32 -0.03 0.57 0.25 -0.11
-0.57 -0.26 -0.1 0.36 0.32 0.03
-0.79 -0.52 0.04 0.61 0.17 0.06
-0.24 -0.11 0.03 0.17 0.12 -0.0
-0.32 -0.09 -0.06 0.28 0.07 0.04
-0.29 -0.16 -0.05 0.16 0.19 0.08
-0.83 -0.55 -0.08 0.51 0.42 0.05
-0.36 -0.17 0.04 0.29 0.11 0.01
-1.07 -0.66 0.0 0.77 0.35 -0.15
-0.29 -0.2 -0.12 0.29 0.24 -0.02
-0.38 -0.18 -0.02 0.27 0.12 0.1
-0.43 -0.19 -0.04 0.3 0.18 0.06
-0.53 -0.19 0.01 0.34 0.17 0.03
-0.39 -0.19 -0.01 0.27 0.22 -0.01
-0.97 -0.52 -0.12 0.57 0.37 0.13
-0.52 -0.34 -0.01 0.42 0.16 0.08
-0.91 -0.55 -0.15 0.59 0.37 0.11
-0.84 -0.24 -0.08 0.63 0.26 -0.14
-1.0 -0.26 -0.1 0.56 0.3 0.03
-0.32 -0.16 -0.07 0.31 0.2 -0.07
-0.37 -0.19 -0.08 0.32 0.17 0.04
-0.66 -0.37 -0.05 0.42 0.29 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.