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Heatmap: Cluster_200 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.01 -0.23 -0.2 0.35 0.14 -0.14
-0.06 -0.04 -0.13 0.14 -0.03 0.1
0.14 -1.03 -0.31 0.67 0.34 -0.42
-0.03 -0.01 0.01 0.16 -0.1 -0.05
-0.06 -0.25 -0.27 0.4 0.17 -0.12
-0.05 -0.07 -0.15 0.25 0.03 -0.04
-0.25 -0.1 -0.17 0.35 0.04 0.05
-0.12 -0.37 0.12 0.02 0.11 0.17
-0.05 -0.8 -0.32 0.69 -0.17 0.2
-0.33 -0.26 0.07 0.29 0.03 0.11
-0.05 -0.0 -0.0 0.01 -0.01 0.05
-0.89 0.14 -0.61 -0.35 0.27 0.77
-0.57 -0.91 0.03 0.74 0.19 -0.05
-0.13 -0.15 -0.03 0.26 -0.06 0.07
-0.43 0.09 0.06 -0.22 -0.01 0.37
-0.22 -0.12 -0.06 0.29 0.1 -0.05
-0.03 0.01 -0.24 0.19 0.03 0.02
-0.43 1.02 -0.43 0.96 - -0.89
-0.22 -0.33 0.21 0.1 -0.0 0.16
-0.12 -0.1 0.26 0.02 -0.04 -0.06
-0.17 -0.1 0.02 0.19 0.02 0.02
-0.06 -0.17 -0.09 0.31 -0.06 0.02
-0.46 -0.06 -0.26 -0.09 0.12 0.53
0.26 - - 1.05 0.04 0.78
-0.17 -0.1 0.03 0.12 0.04 0.07
-0.32 -0.12 -0.02 0.94 -0.73 -0.37
0.02 -0.19 -0.09 0.24 -0.04 0.03
-0.08 -0.35 -0.14 0.3 0.14 0.04
-0.64 -0.2 0.2 1.09 -0.47 -1.01
-0.47 0.05 0.21 0.45 -0.4 -0.05
-0.25 -0.53 0.05 0.89 -0.4 -0.28
-0.07 -0.1 0.09 0.08 -0.0 -0.0
-0.03 -0.31 -0.14 0.44 0.14 -0.24
-0.06 -0.09 -0.22 0.54 -0.22 -0.1
0.17 -0.24 -0.9 0.8 -0.47 0.04
-0.5 -0.38 -0.82 0.74 0.0 0.37
-0.34 -0.31 0.28 0.27 -0.12 0.09
-0.27 0.05 0.07 0.51 -0.31 -0.21
0.03 -0.03 -0.62 0.44 -0.05 0.04
0.01 -0.22 -0.48 0.8 -0.33 -0.19
-0.91 - -0.34 1.47 -0.54 0.28
0.07 -0.26 -0.2 0.27 -0.02 0.06
0.09 -0.45 -0.39 0.5 -0.03 0.06
-0.74 -0.75 0.36 0.17 0.05 0.44
-0.02 -0.23 -0.05 0.22 0.03 0.01
-0.2 -0.02 -0.06 0.46 -0.33 0.02
-0.55 -0.11 -0.22 0.5 0.1 0.06
-0.04 -0.08 -0.08 0.18 -0.01 0.02
0.09 0.09 -0.27 0.47 -0.46 -0.09
0.07 -0.08 -0.02 -0.03 -0.03 0.1
-0.62 -0.63 -1.22 1.06 0.29 -0.05
-0.22 0.28 0.01 0.5 -0.69 -0.17
0.01 0.1 -0.7 0.64 -0.49 0.06
-0.57 0.22 -0.13 0.67 -0.54 -0.04
-0.09 -0.0 0.04 0.13 -0.14 0.04
0.06 -0.21 -0.24 0.27 0.04 0.02
-0.31 -0.19 -0.11 0.1 -0.21 0.53
-0.26 -0.11 -0.11 0.48 0.0 -0.13
-0.23 -0.32 0.09 0.23 0.09 0.05
-0.05 -0.05 -0.08 0.22 -0.12 0.05
0.09 -0.09 0.0 0.22 -0.25 -0.02
-0.18 -0.05 -0.01 0.12 -0.09 0.18
-0.57 -0.41 0.27 0.87 -0.43 -0.34
0.0 -0.09 -0.03 0.18 -0.1 0.02
-0.33 -0.37 0.34 0.05 0.08 0.1
-0.07 -0.07 -0.07 0.34 -0.11 -0.07
-0.97 0.46 -0.99 1.15 -0.6 -0.45
-0.07 -0.18 -0.04 0.2 -0.02 0.07
-0.19 -0.11 -0.15 0.32 0.12 -0.07
0.27 -0.78 -0.96 0.74 0.04 0.01
-0.25 -0.18 0.17 0.1 0.02 0.09
-0.52 - -0.54 1.27 0.26 -0.0
-0.83 0.45 -0.26 1.28 -0.72 -2.31
-0.73 0.19 0.21 1.01 -1.06 -0.72
0.07 -0.01 -0.36 0.28 -0.14 0.08
-0.08 0.13 0.16 0.41 -0.45 -0.35
-0.03 0.11 -0.17 0.18 -0.18 0.04
-0.12 -0.14 -0.01 0.24 0.02 -0.01
0.0 -0.06 -0.22 0.22 -0.09 0.12
-0.35 -0.59 -0.01 0.52 0.06 0.11
-0.06 -1.13 -1.48 1.27 0.43 -1.1
-0.12 -0.1 -0.06 0.25 -0.0 -0.0
0.03 -0.11 -0.15 0.25 -0.1 0.03
-0.01 -0.18 0.08 0.69 -0.94 -0.1
0.09 -0.79 -0.93 0.46 -0.11 0.61
-0.24 -0.47 -0.43 0.65 0.25 -0.1
-0.41 0.08 -0.01 0.51 -0.23 -0.12
-0.13 -0.08 0.02 0.14 0.01 0.02
-0.0 -0.02 -0.07 0.1 -0.04 0.03
-0.26 -2.57 0.31 1.44 -0.89 -0.98
-0.29 0.14 -0.09 0.58 -0.18 -0.4
-0.23 0.08 -0.28 0.04 -0.07 0.37
-0.71 -0.04 -0.31 0.76 -0.1 -0.02
-0.2 -0.5 0.27 0.1 0.06 0.14
-0.22 -0.08 -0.03 0.24 0.04 0.02
-1.32 0.26 0.13 0.66 -0.29 -0.15
-0.03 -0.06 -0.13 0.17 0.06 -0.02
-0.16 -0.08 -0.14 0.33 0.06 -0.08
-0.21 -0.53 0.02 0.39 0.07 0.1
-0.29 -0.24 -0.18 -0.14 0.15 0.52
0.03 -0.42 -0.45 0.47 0.25 -0.13
-0.36 -0.3 0.04 0.95 -0.92 -0.11
-0.03 -0.51 0.31 0.42 -0.23 -0.17
0.13 -0.07 -0.24 0.17 -0.18 0.14
-0.5 -0.65 -0.1 1.04 0.41 -1.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.