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Heatmap: Cluster_199 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.32 -0.27 -0.05 0.19 0.39 -0.07
0.05 -0.61 -0.26 0.12 0.39 0.12
-0.04 -0.22 -0.15 0.05 0.21 0.11
-0.01 -0.24 -0.05 -0.01 0.17 0.1
-0.08 -0.59 -0.15 0.08 0.49 0.04
-0.41 -0.79 -0.24 0.22 0.85 -0.21
-0.25 -0.35 -0.13 0.19 0.36 0.05
0.02 -0.41 -0.12 0.05 0.35 0.0
-0.02 -0.41 -0.12 0.08 0.38 -0.02
0.02 -0.67 -0.2 0.06 0.42 0.14
-0.01 -0.3 -0.01 0.01 0.26 -0.01
-0.13 -0.34 -0.36 0.1 0.53 0.01
-0.13 -0.26 -0.04 0.03 0.24 0.1
0.03 -0.46 -0.11 0.1 0.36 -0.04
0.01 -0.37 -0.13 0.04 0.36 0.0
0.18 -0.44 -0.03 0.91 -0.36 -1.01
-17.99 -22.38 -25.34 2.58 -17.45 -18.22
-0.05 -0.26 -0.03 -0.05 0.27 0.07
-0.2 -0.77 -0.2 0.24 0.55 0.03
-0.09 -0.68 -0.25 0.11 0.46 0.2
-1.18 -0.53 0.11 0.35 0.52 0.11
-0.03 -0.41 -0.18 0.11 0.27 0.15
-0.03 -0.31 -0.12 0.06 0.3 0.02
-0.09 -0.21 -0.4 0.03 0.44 0.09
-0.19 -0.21 0.06 0.06 0.22 0.02
-0.07 -0.48 -0.37 0.26 0.47 -0.04
-0.05 -0.21 -0.03 0.03 0.22 0.01
-0.28 -0.74 -0.3 0.23 0.76 -0.16
-0.15 -0.23 -0.1 0.04 0.29 0.08
-0.12 -0.58 -0.25 0.13 0.58 -0.03
-0.02 -0.33 -0.13 0.04 0.29 0.08
0.02 -0.6 -0.16 0.02 0.33 0.21
-0.12 -0.5 -0.3 0.09 0.55 0.05
-0.2 -0.35 0.01 0.1 0.28 0.06
-0.32 -0.22 -0.01 0.11 0.29 0.05
-0.24 -0.43 -0.12 0.18 0.38 0.08
-0.08 -0.39 -0.31 0.13 0.38 0.12
-0.07 -0.26 0.05 0.0 0.27 -0.04
-0.18 -0.25 -0.05 0.12 0.32 -0.03
-0.07 -0.29 -0.03 -0.0 0.34 -0.02
-0.03 -0.77 0.01 0.03 0.42 0.09
-0.12 -1.3 -0.69 0.48 0.72 0.01
-0.07 -0.69 -0.31 0.13 0.54 0.1
-0.11 -0.31 0.0 -0.0 0.33 0.01
0.12 -0.54 -0.29 0.05 0.52 -0.09
-0.3 -0.38 0.0 0.15 0.37 0.02
-0.11 -0.16 -0.13 0.06 0.32 -0.03
-0.05 -0.34 -0.07 0.04 0.34 0.0
0.03 -0.22 -0.3 0.05 0.31 0.05
-0.17 -0.37 -0.13 0.11 0.37 0.07
-0.13 -0.99 -0.22 -0.02 0.59 0.31
-0.22 -0.48 -0.29 0.15 0.63 -0.06
-0.06 -0.44 -0.14 0.06 0.32 0.15
-0.03 -0.17 -0.23 0.06 0.27 0.05
0.01 -0.58 -0.31 0.09 0.22 0.36
-0.03 -1.02 -0.45 0.32 0.49 0.2
-0.21 -0.61 -0.06 0.18 0.5 -0.04
-0.25 -0.42 0.01 0.12 0.4 0.0
-0.13 -0.46 0.03 0.03 0.37 0.03
-0.33 -0.81 -0.34 0.27 0.73 -0.03
-0.04 -0.4 -0.31 0.07 0.43 0.08
-0.04 -0.57 -0.27 0.12 0.38 0.18
-0.03 -0.4 -0.05 0.02 0.27 0.11
-0.09 -0.37 -0.16 0.09 0.42 -0.01
-0.19 -0.45 -0.21 0.12 0.46 0.08
-0.24 -0.43 0.02 -0.01 0.44 0.07
-0.32 -0.31 -0.33 0.15 0.63 -0.08
-0.04 -0.3 -0.02 0.05 0.19 0.08
0.02 -0.34 -0.12 -0.03 0.26 0.14
-0.1 -0.43 -0.09 0.03 0.39 0.08
-0.08 -0.82 -0.26 0.16 0.66 -0.06
-0.02 -0.54 -0.17 0.14 0.33 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.