Heatmap: Cluster_349 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-1.11 -0.02 -0.05 0.49 0.41 -0.23
-0.06 0.02 -0.1 -0.06 0.4 -0.28
0.1 -0.01 -0.23 -0.58 0.29 0.26
-0.43 - - 1.03 1.2 -0.12
-0.56 0.44 0.61 0.08 0.19 -2.08
-0.03 -0.04 -0.46 0.22 0.41 -0.26
-0.53 -0.01 0.67 -0.6 -0.0 0.09
0.23 -0.32 -0.28 0.03 0.44 -0.28
-0.9 -0.01 -0.09 0.22 0.13 0.35
-3.55 1.04 0.81 -1.2 -2.83 0.61
0.27 -1.18 -0.38 0.56 0.37 -0.28
0.32 -0.69 -0.71 -0.14 0.58 0.16
- - 2.58 - - -
-0.01 -0.14 0.17 -0.04 0.21 -0.24
0.02 0.08 -0.19 -0.12 0.22 -0.06
0.38 -1.87 0.23 0.43 0.56 -1.22
1.0 -17.78 -3.88 -0.61 0.8 0.63
-0.43 -0.12 0.05 0.5 -0.03 -0.15
-0.01 -0.21 -0.04 0.16 0.26 -0.22
-0.44 -0.01 -0.0 0.29 0.11 -0.05
- 2.58 - - - -
-0.29 -0.02 -1.12 0.15 0.76 -0.1
-0.7 -0.29 0.77 0.32 0.06 -0.8
-0.41 0.57 0.45 0.08 -0.09 -1.33
- - 2.58 - - -
0.01 0.2 0.3 -0.14 0.23 -0.9
-0.06 -0.0 -0.02 0.03 0.15 -0.12
0.1 -0.29 -0.31 0.04 0.01 0.34
-0.29 -0.1 0.09 0.14 0.11 0.0
0.04 -0.15 -0.27 0.01 0.07 0.24
-0.39 -0.19 0.13 0.11 0.43 -0.24
-0.38 -0.01 -0.01 0.17 0.06 0.12
0.24 -0.36 -0.08 0.01 0.14 -0.03
0.08 -0.9 -0.25 0.38 0.69 -0.6
-0.26 -0.06 0.22 0.41 0.31 -1.07
-0.36 -11.94 -7.83 -0.25 -0.4 1.85
-0.48 0.1 0.31 0.1 0.26 -0.5
0.07 -0.13 -0.21 -0.01 0.44 -0.28
-0.41 -0.55 0.41 0.46 0.51 -1.18
-0.16 -0.07 -0.03 0.25 0.18 -0.23
0.09 -0.08 0.22 -0.02 0.37 -0.89
-0.0 0.21 0.37 0.03 -0.05 -0.83
-0.89 -0.13 0.83 -0.2 0.37 -0.74
0.37 0.24 -0.36 -0.32 0.21 -0.33
0.15 -0.43 -0.24 -0.01 -0.28 0.57
-0.51 -1.5 -2.28 -0.01 0.05 1.44
0.37 -0.66 0.13 -0.19 0.37 -0.3
-0.9 0.12 0.17 0.62 0.17 -0.75
-0.29 -0.02 0.11 0.01 0.15 -0.01
0.24 -0.36 -0.08 0.01 0.14 -0.03
-0.29 0.09 0.06 0.06 0.09 -0.06
0.34 -0.67 -0.19 0.04 0.37 -0.14
-0.24 -0.59 -0.41 0.0 0.69 0.16
0.0 -0.19 -0.05 0.23 0.24 -0.31
0.96 1.27 -4.58 -0.8 -0.56 -1.5
0.1 -0.13 -0.14 -0.09 0.27 -0.06
0.08 -0.04 -1.12 0.04 0.1 0.49
0.04 -0.54 -0.3 0.17 -0.38 0.66
-0.21 -0.32 -0.41 -0.08 0.44 0.35
-0.53 - - 0.25 1.41 0.54
0.3 -0.06 0.2 -0.19 0.08 -0.46
-1.33 0.19 0.26 0.68 0.5 -2.02
- - - - - -
0.56 -0.57 -2.12 -0.41 0.88 0.04
0.19 -0.12 -0.28 -0.0 0.04 0.13
0.18 -0.2 -0.11 -0.17 0.39 -0.2
-0.04 -0.03 0.38 0.17 0.13 -0.91
0.84 -1.17 -1.27 -0.8 0.21 0.7
-0.45 -0.31 -0.06 0.42 0.39 -0.22
0.02 -0.18 -0.19 -0.01 0.1 0.21
-0.07 -0.25 -0.18 0.32 0.31 -0.24
0.11 -0.04 0.13 -0.04 0.27 -0.57
-0.05 -0.07 0.12 0.16 0.35 -0.75
-0.04 -0.02 -0.39 0.12 0.26 -0.02
-0.47 -0.61 0.32 -0.02 0.7 -0.38
- -0.61 -1.23 0.29 - 1.89
-0.05 -0.44 -0.81 0.05 0.39 0.47
0.19 -0.22 -0.35 0.05 0.65 -0.73
-0.39 -0.6 -0.63 0.15 0.41 0.58
-0.13 -0.22 -0.1 0.03 0.4 -0.07
-0.38 -0.56 -0.08 0.46 0.16 0.15
-0.16 -0.46 0.16 0.1 0.58 -0.52
0.05 0.07 -0.1 -0.55 0.26 0.14
0.26 - - 1.02 0.75 0.14
0.64 - 0.52 0.66 0.31 -2.37
-0.96 -1.21 0.36 0.58 0.26 0.1
-0.39 0.74 0.41 -0.06 0.35 -
-0.01 -0.08 0.22 -0.02 0.05 -0.19
0.11 -0.48 -0.43 0.31 0.68 -0.68
-0.77 -0.22 0.23 0.02 0.31 0.17
0.66 0.02 0.13 -0.74 0.21 -0.84
-0.02 -0.36 0.69 -0.4 0.35 -0.76
-0.39 -0.08 0.13 0.21 0.22 -0.2
0.14 -0.06 -0.04 -0.24 0.22 -0.08
0.27 -0.0 -0.65 0.77 -0.13 -0.87
-0.79 1.0 0.14 -0.94 -2.2 0.66
0.35 -0.36 -0.31 0.16 0.43 -0.57
-1.52 - 0.24 0.75 0.48 0.48
-1.02 1.4 -2.76 -11.11 0.07 0.73
0.73 0.12 -0.01 -0.64 -0.55 -0.09
0.09 -0.43 -0.56 -0.07 0.37 0.35
-0.03 0.49 0.26 -0.11 0.21 -1.59
-0.14 -0.12 -0.68 0.04 -0.28 0.76
0.02 -0.03 -0.06 -0.05 0.18 -0.08
0.07 -0.23 -0.22 0.16 0.25 -0.1
0.06 0.06 -0.14 -0.22 0.09 0.12
0.42 0.49 0.33 -0.38 -0.46 -0.99
-0.43 0.06 -0.19 0.29 0.13 0.04
-0.15 -0.55 0.33 0.24 0.36 -0.53
-0.17 -0.35 -0.25 0.31 0.56 -0.37
0.93 -2.1 -0.76 -1.07 -1.38 1.27
0.01 -0.28 0.18 0.02 0.29 -0.33
0.48 -0.14 -0.8 -0.48 0.47 0.03
-1.0 -0.78 0.18 0.39 0.57 -0.01
-0.63 -0.29 -0.23 0.46 0.58 -0.3
-0.85 -1.82 -1.13 0.68 - 1.63
-0.64 -0.28 -0.3 0.64 0.46 -0.34
-0.33 -0.09 -0.03 0.14 0.2 0.05
-0.25 -0.04 0.05 0.19 0.2 -0.22
0.16 -0.08 -0.19 0.1 0.15 -0.18
0.27 -0.54 -0.23 -0.48 0.67 -0.08
-0.23 -0.01 0.33 0.27 0.08 -0.68
-0.1 -0.11 0.08 -0.04 0.18 -0.04
0.2 -0.25 -0.35 -0.09 0.53 -0.24
-0.5 0.07 -0.42 0.4 0.57 -0.54
-0.04 -0.02 0.1 0.03 0.09 -0.18
0.08 -0.41 0.13 0.32 0.5 -1.22
-3.03 - - 1.43 - 1.67
-1.17 -0.08 0.15 0.7 -0.04 -0.16
1.13 -1.36 -19.92 -1.81 0.93 0.3
0.2 -0.49 -0.24 0.42 0.3 -0.46
-0.26 -0.4 0.19 0.25 0.4 -0.42
0.01 -0.16 -0.97 0.6 0.38 -0.38
-1.02 -0.17 0.04 0.65 0.13 -0.13
-0.3 -0.03 -0.04 0.22 0.16 -0.07
-0.21 -0.26 0.28 -0.05 0.24 -0.09
0.02 -0.0 -0.04 -0.07 0.16 -0.08
0.19 -0.07 -0.32 0.08 0.26 -0.23
0.43 -1.87 -0.65 0.15 0.6 0.16
-1.01 -0.87 -0.0 0.51 1.19 -1.99
-9.09 -1.3 -23.28 0.67 -10.22 2.0
0.07 -0.04 -0.09 -0.07 0.11 0.02
-0.14 0.01 -0.02 -0.18 0.13 0.17
-1.85 0.7 -0.05 0.16 0.64 -1.13
-0.33 -0.12 -0.31 0.26 0.35 0.01
-0.57 -1.05 -0.07 0.66 0.19 0.22
-0.29 0.0 -0.17 0.12 0.42 -0.21
-0.0 -0.61 0.04 -0.0 0.52 -0.18
-0.13 -0.18 0.41 0.22 0.38 -1.29
-0.12 0.44 0.07 -0.24 0.38 -0.93
0.17 0.05 -0.1 -0.42 1.11 -
-0.09 -0.07 -1.07 0.31 0.54 -0.08
0.18 -0.51 -0.29 0.32 0.29 -0.2
-0.15 0.15 -0.56 -1.57 0.68 0.47
-0.51 -0.99 0.25 0.67 0.39 -0.51
-0.06 -0.02 -0.04 0.1 0.05 -0.04
-0.42 -0.86 0.27 0.37 0.54 -0.41
-0.08 -0.52 -0.0 0.17 0.18 0.13
-0.37 -0.48 0.25 0.38 0.29 -0.32
0.34 -0.03 -0.79 0.1 -0.46 0.47
-0.3 -0.11 0.29 0.2 -0.03 -0.14
0.21 -0.11 0.37 -0.22 0.33 -0.96
-0.06 -0.18 -0.04 0.17 0.23 -0.17
0.06 -0.16 -0.22 0.35 0.36 -0.65
-0.43 -0.27 0.03 0.25 0.3 0.0
-0.03 -0.02 -0.06 0.1 0.14 -0.16
-0.28 0.0 0.05 0.15 0.26 -0.25
-0.07 -0.15 -0.1 0.12 0.16 0.02
-0.04 -0.02 -0.14 0.07 0.12 -0.01
-0.07 -0.06 0.13 0.02 0.06 -0.09
-0.22 -0.27 -0.28 0.33 0.57 -0.43
-0.36 -0.43 -0.7 0.64 0.28 0.13
-0.67 -1.08 -0.11 0.28 0.76 0.08
-0.13 -0.6 -0.21 -0.08 0.79 -0.17
-1.27 -1.37 -0.46 0.18 1.01 0.41
-0.51 -0.13 -0.15 0.32 0.35 -0.06
1.07 0.0 0.08 -0.52 -1.26 -0.46
-2.75 - - -0.12 2.22 -1.87
-1.04 0.14 -0.31 -0.08 0.53 0.28
-0.11 -28.66 -0.48 0.33 -1.76 1.49
-0.88 -0.12 -0.04 0.23 0.3 0.2
0.18 -0.29 -0.59 0.01 0.64 -0.29
0.06 -0.08 0.13 -0.09 0.25 -0.33
0.15 -0.0 -0.56 0.06 0.15 0.09
0.09 -0.09 -0.2 0.06 0.26 -0.19
0.14 -0.19 -0.25 -0.01 -0.04 0.29
0.3 -0.0 -0.14 0.0 0.34 -0.74
-0.15 -1.15 -0.64 0.56 0.82 -0.39
-0.12 -0.53 -0.51 0.54 0.49 -0.28
0.16 -0.56 0.45 -0.22 0.21 -0.28
0.39 0.04 -12.83 0.75 -1.02 0.58
0.18 -0.03 -0.13 -0.34 0.15 0.11
0.02 -0.26 -0.16 -0.17 0.48 -0.04
0.3 -0.51 0.19 0.43 0.05 -0.9
-1.1 -0.7 0.41 0.41 0.42 -0.11
-0.14 -0.34 0.49 0.12 -0.0 -0.31
-0.18 -0.34 0.19 0.15 0.23 -0.13
-0.56 -0.63 -0.09 0.52 -0.01 0.38
-0.38 -0.05 0.12 0.29 0.58 -1.12
-0.12 -0.53 -0.05 -0.25 0.68 -0.03
0.12 -0.2 -0.32 -0.04 0.14 0.22
-0.52 0.0 -0.13 0.38 0.27 -0.19
0.13 -0.0 -0.31 0.07 0.17 -0.11
-0.19 -0.05 -0.01 0.09 0.18 -0.05
0.1 0.08 0.01 -0.44 0.58 -0.65
0.16 -0.46 0.18 0.13 0.29 -0.51
-0.66 1.02 0.13 - -0.81 0.74
0.25 0.03 0.03 -0.17 0.08 -0.28
- - 0.69 - - 2.13
0.25 -0.29 -0.11 -0.25 0.55 -0.4
-1.23 0.17 0.26 0.28 0.35 -0.4
-0.23 -0.45 0.27 0.12 0.37 -0.26
-0.23 -0.31 -1.11 0.06 -0.07 0.91
0.2 0.0 -1.23 -0.54 0.81 -0.02
-0.97 -0.14 -0.12 -0.3 0.67 0.33
0.53 0.05 -0.36 -0.01 0.23 -0.79
-0.31 -0.4 -0.11 -0.03 0.27 0.4
- - 1.32 - - 1.81
-0.2 -2.39 -1.0 0.1 -3.1 1.7
-0.87 -0.23 -0.37 0.59 0.53 -0.2
- -0.56 -0.1 0.51 0.77 0.33
-1.12 -0.99 0.39 0.74 0.81 -1.7
-0.83 -0.05 0.09 0.34 0.36 -0.23
-3.07 1.39 -2.61 0.59 -2.39 0.48
0.01 -0.07 0.34 -0.15 0.18 -0.42
-0.34 -0.55 -0.13 0.44 0.28 0.07
-0.27 -0.05 0.01 0.29 0.02 -0.06
-0.13 - 0.22 -1.45 1.32 0.08
-0.58 -0.09 0.36 0.45 0.36 -1.13
-0.05 -0.55 0.0 0.32 0.41 -0.38
-0.33 -0.1 -0.28 0.18 0.35 0.06
-0.4 -0.36 0.02 0.17 0.71 -0.54
-0.07 -0.1 0.18 0.05 0.16 -0.29
-0.14 -0.12 0.1 0.24 0.1 -0.26
-0.03 -0.23 -0.5 0.3 0.3 -0.0
0.36 - -0.66 0.77 0.82 -0.72
-0.43 -0.49 -0.12 0.37 0.15 0.29
-0.84 -0.19 0.32 0.55 0.58 -1.49
-0.32 - - 0.94 1.17 0.04
-0.72 - -0.07 0.77 1.16 -1.01
-0.01 -0.46 0.06 0.1 0.48 -0.37
- -0.07 0.08 1.1 0.32 -0.74
-0.1 0.69 -0.01 -0.13 -0.03 -0.8
-1.59 -0.56 0.44 1.15 -0.36 -0.65
-0.95 -2.35 0.6 0.15 0.63 0.14
0.06 -0.02 0.03 -0.05 0.08 -0.11
-0.21 -0.05 0.37 0.09 0.01 -0.31
0.2 -0.57 -0.74 0.07 0.72 -0.17
-0.08 -0.23 0.07 0.09 0.31 -0.23
0.06 0.38 0.22 -0.31 0.08 -0.67

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.