Heatmap: Cluster_68 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.23 0.01 -0.03 0.28 0.12 -0.22
-0.22 0.06 0.13 0.17 -0.03 -0.14
-0.23 0.18 0.16 0.04 0.06 -0.29
-1.16 0.56 0.61 0.2 -0.24 -0.84
-0.55 0.03 0.17 0.2 0.19 -0.19
0.71 2.12 - - - -
0.38 2.23 - - - -
-0.17 0.09 0.1 0.11 0.0 -0.16
0.66 1.78 - - - -0.03
-0.13 0.23 0.19 0.07 -0.17 -0.26
-0.58 0.15 0.32 0.25 -0.02 -0.33
-0.6 0.37 0.34 0.11 -0.2 -0.26
-0.16 0.0 0.3 -0.04 -0.01 -0.14
-0.54 0.11 0.6 0.09 -0.06 -0.53
-0.67 0.06 0.59 0.15 0.22 -0.86
-0.46 0.15 0.17 0.05 0.17 -0.2
-0.54 0.18 0.57 -0.01 0.19 -0.87
-0.4 0.29 0.19 0.14 0.02 -0.38
-0.28 0.15 -0.15 0.36 0.06 -0.24
-0.76 0.25 0.52 0.11 0.03 -0.54
-1.73 1.53 -0.59 0.41 -0.83 -1.91
-0.54 0.24 0.11 0.2 0.07 -0.24
-0.51 0.31 0.49 -0.11 -0.03 -0.41
-0.79 0.61 0.79 -0.03 -0.47 -1.13
-0.22 0.43 0.29 -0.25 0.0 -0.47
-0.14 0.41 -0.23 0.19 -0.24 -0.12
-0.9 0.22 0.25 0.17 0.21 -0.27
-0.45 0.14 0.17 0.18 0.14 -0.32
-0.56 0.56 0.56 -0.26 -0.12 -0.69
-1.0 0.22 0.25 0.22 0.22 -0.3
-1.04 0.32 0.51 0.39 -0.0 -0.92
-0.16 0.05 0.28 0.13 -0.09 -0.28
1.19 1.9 - - - -
1.2 1.76 - - -1.65 -
-0.59 0.11 0.74 0.11 -0.04 -0.89
-0.41 -0.04 0.32 0.16 0.07 -0.22
1.45 1.71 - - - -
-0.24 0.32 0.15 0.12 -0.27 -0.2
0.16 2.29 - - - -
-0.33 0.02 0.25 0.05 0.13 -0.2
-0.77 0.58 0.2 0.18 -0.13 -0.48
-2.27 2.12 -1.77 0.2 - -
-0.72 0.27 0.3 0.34 0.13 -0.75
-1.06 0.01 0.45 0.3 0.18 -0.35
-0.59 0.04 0.49 0.18 0.21 -0.71
-0.96 0.57 0.51 -0.05 -0.26 -0.37
-0.41 0.06 -0.01 0.32 0.08 -0.14
-0.37 0.11 0.35 0.08 -0.07 -0.21
-0.14 0.27 0.22 0.08 -0.3 -0.24
-0.48 0.09 0.34 0.27 -0.01 -0.4
-0.47 0.14 0.43 0.29 0.06 -0.82
-0.85 0.29 0.42 0.36 0.02 -0.78
-0.54 0.41 0.07 0.04 0.09 -0.25
0.66 1.78 - - - -0.03
0.91 2.04 - - - -
-1.25 -0.07 0.06 0.56 0.51 -0.54
-0.44 0.26 0.21 0.25 0.16 -0.75
-0.21 0.17 0.07 0.16 -0.08 -0.16
-0.69 0.48 0.42 0.07 -0.12 -0.55
-0.36 0.24 0.04 0.12 0.08 -0.19
-0.48 0.66 -0.12 -0.22 0.08 -0.2
0.91 2.04 - - - -
-0.85 0.32 0.27 0.12 0.09 -0.26
-0.16 0.17 0.08 0.03 0.09 -0.26
-0.96 0.15 0.31 0.37 0.27 -0.62
-0.32 0.19 0.23 0.11 0.04 -0.36
-0.5 0.05 0.26 0.17 0.12 -0.24
-0.65 0.27 0.51 -0.11 0.08 -0.43
-0.29 0.46 0.47 0.15 -0.26 -1.05
-0.79 0.49 0.5 -0.05 0.0 -0.67
-0.52 0.84 -0.19 0.05 -0.37 -0.29
0.91 2.04 - - - -
-0.4 0.4 0.32 0.03 -0.11 -0.46
-0.36 0.08 0.33 0.33 0.04 -0.69
0.91 2.04 - - - -
- - - - 2.58 -
0.94 2.03 - - - -
-0.44 0.32 0.52 -0.05 0.01 -0.73
-1.71 -0.04 0.79 0.66 0.13 -1.63
-0.25 0.06 0.1 0.2 0.11 -0.28
-0.25 0.32 0.33 -0.09 -0.12 -0.32
-0.85 0.26 0.31 0.34 0.08 -0.55
-0.49 -0.48 0.16 0.36 0.36 -0.19
-0.32 0.23 0.38 0.0 0.09 -0.61
-0.71 0.43 0.37 0.05 0.08 -0.58
-0.33 0.36 0.09 0.05 0.03 -0.3
-0.98 0.86 0.18 0.44 -0.98 -0.54
-1.03 0.35 0.51 0.51 0.08 -1.6
-0.27 0.59 0.46 -0.06 -0.19 -1.17
-1.11 0.08 0.59 0.37 0.29 -1.11
1.49 1.68 - - - -
- - - - - -
-0.14 0.12 0.35 0.02 0.03 -0.51
-0.2 0.0 0.3 0.03 0.05 -0.25
-0.26 0.36 0.2 -0.01 -0.05 -0.36
-0.66 0.18 0.26 0.13 0.17 -0.29
-0.28 -1.34 0.65 0.45 0.04 -0.3
-1.02 0.0 0.66 0.16 0.21 -0.63
-0.38 0.57 -0.1 0.19 -0.06 -0.5
0.11 2.3 - - - -
-0.23 0.19 0.3 0.09 0.14 -0.72
0.62 1.75 0.13 - - -
-0.23 0.11 0.29 0.04 0.01 -0.31
-0.41 0.41 0.75 -0.68 -0.01 -0.67
0.91 2.04 - - - -
-0.26 0.08 0.32 0.06 -0.11 -0.17
-0.26 0.24 -0.03 0.27 -0.14 -0.18
-0.48 0.19 0.15 0.21 0.09 -0.31
-0.38 0.42 -0.01 0.14 -0.09 -0.21
-0.64 -0.0 0.23 0.19 0.24 -0.22
-0.82 0.62 0.39 0.13 -0.28 -0.58
-0.79 0.27 0.29 0.47 0.03 -0.77
-0.49 0.18 0.18 0.25 0.08 -0.36
-0.86 0.73 -0.2 0.55 -0.22 -0.75
-0.4 0.41 0.41 0.04 -0.02 -0.8
-0.45 0.11 0.21 0.12 0.07 -0.16
-0.63 0.39 0.03 0.22 0.0 -0.22
-0.51 0.32 0.58 0.07 0.13 -1.26
-1.79 0.33 0.19 0.59 -0.0 -0.3
0.74 1.76 - - - -0.07
-1.07 0.1 1.04 0.05 -0.06 -1.35
-0.48 -0.01 0.23 0.27 0.12 -0.28
0.34 2.24 - - - -
-0.69 0.82 0.3 -0.25 0.04 -0.98
-0.38 0.24 0.37 0.28 -0.05 -0.8
0.91 2.04 - - - -
-1.56 0.45 0.72 0.0 -0.04 -0.58
-0.71 0.08 0.25 0.5 -0.1 -0.33
-0.76 0.13 0.48 0.32 -0.02 -0.55
0.66 1.78 - - - -0.03
0.91 2.04 - - - -
-0.88 0.48 0.61 0.33 -0.27 -1.15
-0.41 0.31 0.42 0.18 -0.08 -0.76
-0.48 0.38 0.02 0.19 0.11 -0.43
-0.81 0.37 0.68 -0.02 -0.08 -0.71
-0.31 0.62 0.09 -0.07 -0.08 -0.51
-0.35 0.35 0.1 0.14 -0.12 -0.23
-0.56 0.56 0.21 -0.17 0.14 -0.5
-0.6 0.93 -0.04 -0.03 -0.46 -0.4
-0.6 0.93 -0.04 -0.03 -0.46 -0.4
-0.34 0.09 0.48 0.24 -0.03 -0.74
-0.46 0.57 -0.16 0.13 0.01 -0.34
-1.88 0.67 0.23 0.41 -0.05 -0.58
- 1.89 -0.15 0.03 - -1.42
-0.4 2.34 -3.94 -3.48 - -5.08
-0.51 0.29 0.39 0.29 0.0 -0.87
-0.68 0.07 0.19 0.13 0.26 -0.17
-0.21 0.05 0.15 0.06 0.1 -0.2
-0.42 0.33 0.33 -0.03 0.0 -0.41
-0.46 0.11 0.07 0.12 0.21 -0.15
1.52 1.65 - - - -
-0.22 0.15 0.05 0.14 0.06 -0.24
-0.05 0.15 -0.03 0.04 -0.06 -0.06
-0.77 1.06 -0.13 -0.18 -0.29 -0.5
-0.39 0.26 0.57 -0.19 0.16 -0.82
-0.53 0.2 0.11 0.36 -0.05 -0.26
0.66 1.78 - - - -0.03
-1.26 0.34 0.1 0.52 -0.1 -0.2
-0.2 0.25 0.05 0.13 -0.14 -0.14
-0.24 0.34 0.38 -0.07 -0.22 -0.37
-0.8 0.56 0.21 0.14 -0.04 -0.46
-0.67 0.36 0.38 0.06 0.28 -0.92
-0.36 0.31 0.15 0.14 -0.22 -0.14
-0.47 -0.0 0.49 0.16 0.15 -0.63
-0.37 0.12 0.28 0.2 0.02 -0.4
-0.76 0.7 0.37 0.07 -0.23 -0.77
-0.33 0.18 0.47 -0.17 0.03 -0.37
1.69 1.47 - - - -
0.84 -1.62 1.15 -1.57 -0.43 -0.77
-2.38 0.6 0.67 0.27 -0.11 -0.81
-0.43 0.19 0.19 0.08 0.12 -0.26
-0.31 0.13 0.38 -0.15 0.04 -0.2
-0.26 0.08 0.26 0.16 0.11 -0.48
-0.92 0.1 0.58 0.15 0.17 -0.57
-0.73 0.61 0.12 0.14 -0.17 -0.33
-0.23 0.29 0.04 0.08 0.01 -0.26
-0.52 0.39 0.25 0.34 -0.03 -0.84
-0.35 -0.02 0.23 0.13 0.12 -0.19
-0.29 0.19 0.23 0.05 0.03 -0.32
-1.03 0.29 0.66 0.19 -0.05 -0.72
-1.46 0.69 0.16 0.14 0.35 -0.9
-0.52 0.52 -0.11 0.23 -0.13 -0.24
-0.3 0.2 0.19 0.28 -0.25 -0.25
-0.13 0.25 0.11 0.05 -0.07 -0.27
1.1 1.65 -0.78 - - -2.97
-1.31 0.22 0.46 0.37 0.16 -0.62
-1.86 0.61 0.93 -0.44 0.12 -1.07
0.91 2.04 - - - -
-0.2 0.11 -0.01 0.04 0.14 -0.11
-0.53 0.35 -0.02 0.42 -0.04 -0.45
-0.32 0.26 0.22 0.12 -0.08 -0.3

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.