Heatmap: Cluster_118 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.12 -0.64 -0.51 0.04 0.35 0.52
0.37 -0.48 -1.29 -0.43 0.14 0.8
0.24 -0.69 -0.67 -0.07 0.16 0.58
-0.39 -1.31 -2.01 0.05 0.61 1.02
0.06 -1.42 -2.09 -0.02 0.3 1.09
-0.26 -1.98 -2.43 -0.23 0.58 1.25
-0.49 -1.78 -2.19 -0.01 0.7 1.12
0.09 -0.09 -0.29 -0.13 0.06 0.29
0.12 -0.87 -1.02 -0.05 0.45 0.62
0.36 -1.12 -1.89 -0.28 0.37 0.9
0.25 -0.44 -0.58 -0.05 0.19 0.38
0.28 -0.81 -1.19 -0.01 0.27 0.66
0.03 -0.48 -0.73 0.02 0.32 0.48
0.1 -0.83 -1.17 0.04 0.34 0.71
0.02 -0.83 -0.39 -0.01 0.38 0.45
-0.18 -0.61 -0.43 0.08 0.34 0.49
0.2 -0.7 -1.22 0.04 0.32 0.61
0.1 -0.65 -0.76 0.12 0.31 0.45
0.19 -0.56 -0.58 -0.02 0.21 0.45
-0.12 -0.46 -0.78 -0.26 0.24 0.81
0.22 -0.34 -0.83 -0.01 0.11 0.5
0.02 -0.59 -1.21 0.08 0.33 0.65
-0.5 -1.26 -1.58 0.08 0.7 0.89
0.08 -0.43 -0.58 0.02 0.29 0.39
-0.21 -0.78 -0.43 0.05 0.41 0.54
0.06 -0.38 -0.59 -0.04 0.18 0.5
-0.27 -0.6 -1.29 0.08 0.41 0.78
-0.05 -0.34 -0.49 -0.29 0.09 0.72
-0.07 -0.73 -0.66 0.06 0.23 0.68
0.09 -0.37 -0.74 0.07 0.23 0.42
0.04 -0.41 -0.6 -0.02 0.26 0.46
0.47 -1.81 -1.35 -0.46 0.31 0.97
0.18 -0.46 -0.61 0.04 0.18 0.4
-0.31 -1.65 -2.45 0.26 0.64 0.96
0.22 -0.45 -0.63 0.02 0.18 0.39
0.02 -0.2 -0.12 -0.02 0.1 0.18
0.3 -0.49 -1.1 -0.27 0.1 0.76
-0.03 -0.32 -1.35 -0.11 0.38 0.68
-0.03 -0.12 -0.16 0.03 0.21 0.04
0.14 -0.6 -0.53 0.03 0.25 0.42
-0.05 -0.19 -0.35 -0.27 0.2 0.48
0.28 -0.8 -1.4 -0.07 0.33 0.7
-0.48 -3.16 -4.25 0.18 0.73 1.22
-0.73 -2.87 -4.55 0.21 0.77 1.24
-0.06 -0.32 -0.36 -0.27 0.22 0.54
0.15 -0.45 -0.83 -0.0 0.2 0.53
-0.05 -0.65 -0.67 0.16 0.28 0.52
-0.07 -0.48 -0.82 -0.24 0.33 0.73
-0.04 -0.24 -0.52 -0.01 0.08 0.52
0.28 -1.23 -1.96 -0.47 0.5 0.98
-0.03 -0.25 -0.3 0.09 0.09 0.31
-0.09 -1.78 -1.48 -0.07 0.69 0.88
0.13 -0.32 -0.34 -0.07 0.16 0.32
-0.08 -0.09 -0.64 -0.14 0.13 0.56
-0.18 -0.31 -0.32 0.03 0.21 0.42
0.31 -0.49 -0.59 0.01 0.17 0.31
-0.04 -0.6 -0.49 0.02 0.37 0.43
0.21 -0.38 -1.42 -0.01 0.01 0.76
0.43 -0.92 -2.22 -0.49 0.21 1.03
-0.48 -1.87 -1.72 -0.18 0.62 1.19
-0.35 -1.41 -1.43 -0.01 0.61 0.96
0.12 -0.31 -0.41 0.03 0.13 0.31
0.12 -0.45 -0.25 -0.05 0.18 0.31
-0.37 -1.17 -1.18 0.04 0.56 0.88
-0.02 -0.5 -0.42 0.11 0.26 0.37
0.18 -0.36 -1.05 -0.17 0.18 0.66
0.13 -0.61 -0.68 0.01 0.36 0.42
0.03 -0.54 -1.62 -0.41 0.34 0.96
0.41 -0.57 -1.77 -0.48 0.24 0.85
-0.17 - -1.08 -0.39 1.47 0.15
-0.06 -0.46 -0.96 -0.02 0.36 0.61
-0.07 -0.53 -0.35 0.09 0.17 0.47
0.13 -0.29 -0.5 -0.1 0.11 0.46
-0.04 -0.25 -0.32 -0.26 0.12 0.55
-0.71 -2.15 -2.23 0.07 0.83 1.08
0.26 -0.25 -1.22 -0.28 0.18 0.66
0.04 -0.34 -0.41 0.08 0.13 0.36
-0.0 -0.16 -0.43 -0.22 0.07 0.55
0.08 -0.31 -0.4 -0.49 0.21 0.59
-0.19 -0.16 -0.36 -0.26 0.32 0.45
0.11 -0.38 -0.54 0.03 0.18 0.39
0.18 -0.44 -1.13 -0.07 0.3 0.57
-0.32 -0.57 -1.03 0.11 0.28 0.8
0.37 -1.67 -3.43 -0.42 0.18 1.28
0.31 -1.05 -1.24 -0.07 0.27 0.76
0.29 -0.83 -1.03 0.05 0.27 0.57
0.0 -0.54 -0.7 0.05 0.36 0.46
0.08 -0.37 -0.32 0.01 0.1 0.37
0.05 -0.25 -0.43 0.03 0.18 0.29
0.34 -0.69 -0.87 0.02 0.2 0.49
-0.02 -0.55 -0.62 0.06 0.3 0.49
-0.08 -1.01 -0.79 0.08 0.46 0.63
0.01 -0.7 -0.76 0.16 0.28 0.55
0.2 -0.85 -1.23 0.06 0.37 0.62
0.11 -0.36 -0.37 0.01 0.16 0.32
0.02 -0.75 -1.13 0.11 0.29 0.7
0.12 -0.63 -0.55 -0.09 0.2 0.58
-0.11 -0.35 -0.23 0.13 0.29 0.17
-0.04 -0.32 -0.33 0.06 0.21 0.3
0.1 -0.29 -0.45 -0.04 0.17 0.36
0.24 -0.56 -0.86 -0.0 0.25 0.49
0.02 -0.1 -0.13 0.0 0.09 0.1
0.2 -0.21 -0.51 -0.16 0.06 0.43
0.14 -0.58 -0.72 -0.02 0.27 0.51
-0.22 -0.4 -0.62 0.08 0.22 0.6
0.15 -0.59 -0.93 0.02 0.25 0.59
-0.82 -1.2 - -1.02 0.75 1.5
0.06 -0.34 -0.34 -0.16 0.2 0.41
0.14 -0.47 -0.54 -0.38 0.72 0.1
-0.09 -0.23 -0.29 0.06 0.16 0.29
0.59 -1.09 -2.44 -0.0 0.23 0.75
-0.03 -0.38 -0.28 0.03 0.18 0.35
-0.19 -0.74 -0.4 -0.12 0.35 0.65
0.14 -0.45 -0.45 -0.18 0.2 0.48

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.