Heatmap: Cluster_110 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.02 -0.33 -0.14 -0.06 0.31 0.12
0.07 -0.24 -0.21 -0.04 0.25 0.09
0.01 -0.68 -0.32 -0.01 0.43 0.3
0.1 -0.27 -0.27 0.02 0.21 0.14
-0.09 -0.56 -0.62 -0.08 0.58 0.37
0.05 -0.59 -0.3 0.03 0.49 0.09
0.03 -0.19 -0.13 -0.07 0.17 0.15
0.02 -0.4 -0.2 -0.14 0.39 0.19
0.04 -0.77 -0.52 -0.12 0.6 0.32
-0.16 -0.6 -0.5 -0.05 0.56 0.38
-0.04 -0.28 -0.21 -0.0 0.32 0.13
-0.02 -0.66 -0.36 -0.06 0.54 0.25
-0.01 -0.41 -0.21 -0.01 0.32 0.19
0.12 -0.78 -0.61 -0.04 0.48 0.38
-25.24 - - - -3.21 2.56
0.08 -0.51 -0.36 -0.06 0.5 0.13
0.04 -0.48 -0.35 0.0 0.5 0.09
-0.02 -0.27 -0.21 -0.13 0.3 0.23
-0.13 -0.29 -0.36 0.04 0.43 0.16
0.0 -0.34 -0.25 -0.03 0.39 0.11
-0.49 -1.01 -0.52 -0.12 0.79 0.53
0.04 -0.32 -0.14 -0.05 0.23 0.16
-0.04 -0.31 -0.3 -0.01 0.25 0.3
-0.04 -0.61 -0.31 0.03 0.5 0.18
-0.01 -0.46 -1.08 0.08 0.5 0.42
-0.2 -0.94 -1.1 0.12 0.57 0.65
0.17 -1.77 -1.25 -0.21 0.8 0.64
0.06 -1.77 -1.19 -0.24 0.88 0.62
0.03 -0.27 -0.2 -0.09 0.31 0.14
-0.06 -0.23 -0.15 0.0 0.31 0.07
-0.02 -0.36 -0.21 0.11 0.18 0.21
0.07 -0.41 -0.4 -0.1 0.42 0.22
0.07 -1.14 -1.21 -0.6 0.85 0.68
-0.12 -1.1 -0.62 -0.31 0.99 0.23
0.1 -0.36 -0.33 -0.09 0.31 0.24
-0.04 -0.44 -0.32 0.05 0.37 0.21
-0.03 -0.39 -0.31 0.03 0.26 0.31
0.02 -0.29 -0.2 0.02 0.27 0.1
-0.19 -0.13 -0.29 0.06 0.36 0.1
-0.03 -0.44 -0.52 -0.08 0.52 0.28
0.09 -0.43 -0.44 -0.21 0.38 0.37
0.1 -0.42 -0.23 -0.07 0.32 0.16
0.08 -0.15 -0.27 -0.16 0.26 0.17
0.0 -0.77 -0.54 -0.09 0.63 0.3
-0.53 -0.7 -0.74 0.16 0.59 0.56
-0.15 -0.2 -0.25 -0.0 0.38 0.12
0.0 -0.45 -0.33 -0.14 0.45 0.25
-0.17 -0.66 -0.61 0.14 0.48 0.41
-0.06 -0.24 -0.18 0.05 0.27 0.1
-0.08 -0.21 -0.18 0.0 0.23 0.17
-0.0 -0.23 -0.35 -0.04 0.34 0.17
0.03 -0.32 -0.34 -0.15 0.35 0.28
-0.23 -0.34 -0.56 0.15 0.33 0.39
-0.01 -0.4 -0.34 -0.02 0.32 0.3
0.08 -1.47 -1.33 -0.38 0.88 0.66
0.0 -0.53 -0.32 0.01 0.41 0.22
0.01 -0.36 -0.18 -0.0 0.29 0.14
0.05 -0.47 -0.46 -0.02 0.34 0.33
-0.12 -0.74 -0.69 -0.24 0.76 0.4
0.07 -0.71 -0.46 -0.07 0.51 0.3
-1.9 -4.31 -4.3 -0.37 1.49 1.04
0.14 -0.42 -0.22 -0.09 0.31 0.15
-0.08 -0.38 -0.3 0.06 0.39 0.16
-0.05 -0.19 -0.2 -0.04 0.25 0.16
0.01 -0.27 -0.31 -0.03 0.34 0.16
-0.04 -0.27 -0.36 0.01 0.41 0.11
-0.1 -0.74 -0.7 0.11 0.54 0.39
0.03 -0.16 -0.28 -0.12 0.29 0.16
0.04 -0.28 -0.22 -0.06 0.25 0.2
0.0 -0.27 -0.13 -0.04 0.27 0.1
0.02 -0.31 -0.42 0.09 0.22 0.27
0.05 -0.6 -0.49 0.14 0.16 0.46
-0.3 -1.22 -0.86 -0.1 0.96 0.4
-0.19 -0.29 -0.81 -0.04 0.57 0.36
0.0 -0.21 -0.3 -0.31 0.39 0.26
0.1 -0.52 -0.76 -0.04 0.41 0.41
-0.02 -0.31 -0.51 -0.1 0.53 0.17
-0.02 -0.16 -0.12 -0.02 0.2 0.09
0.13 -0.72 -0.26 -0.14 0.35 0.36
-0.02 -0.34 -0.26 -0.12 0.37 0.23
0.02 -0.41 -0.31 -0.13 0.41 0.24
-0.02 -0.37 -0.34 0.07 0.27 0.27
0.07 -0.73 -0.38 -0.16 0.52 0.31
-0.87 -2.33 -3.22 0.29 0.96 0.99
-0.15 -1.37 -1.35 0.13 0.77 0.6
0.05 -0.85 0.01 0.06 0.52 -0.11
- - - - 2.58 -
0.0 -0.32 -0.45 0.07 0.27 0.27
-0.05 -0.41 -0.22 0.03 0.43 0.07
0.07 -0.38 -0.63 -0.22 0.44 0.41
0.0 -0.48 -0.87 0.14 0.41 0.38
0.03 -0.23 -0.44 -0.03 0.38 0.15
0.01 -0.18 -0.25 -0.1 0.31 0.14
0.03 -0.45 -0.33 -0.12 0.54 0.1
-0.07 -0.49 -0.42 0.11 0.5 0.13
0.1 -0.31 -0.23 -0.06 0.26 0.16
0.01 -0.22 -0.38 0.01 0.33 0.14
0.07 -0.4 -0.3 -0.1 0.33 0.25
0.24 -0.47 -0.83 -0.4 0.59 0.35
-0.02 -0.28 -0.16 0.01 0.31 0.06
-0.45 -0.52 -0.36 -0.4 0.42 0.76
0.09 -0.84 -0.45 -0.18 0.68 0.21
-0.0 -0.49 -0.36 0.03 0.41 0.21
-0.07 -0.41 -0.31 -0.1 0.48 0.21
-0.12 -0.75 -0.54 0.09 0.46 0.45
0.13 -0.95 -0.5 -0.19 0.6 0.37
-0.23 -0.99 -0.87 0.09 0.84 0.32
-0.14 -2.76 -1.82 0.07 0.92 0.79
0.09 -0.28 -0.31 -0.06 0.29 0.16
-0.02 -0.51 -0.52 -0.08 0.5 0.33
0.14 -0.55 -0.6 0.03 0.4 0.28
0.04 -0.25 -0.28 -0.03 0.23 0.22
-0.04 -0.33 -0.65 0.06 0.37 0.32
-0.2 -0.66 -0.28 -0.1 0.61 0.28
0.08 -0.53 -0.84 0.13 0.34 0.41
0.15 -0.62 -0.32 -0.13 0.45 0.2
0.09 -0.36 -0.34 -0.04 0.33 0.18
0.17 -1.01 -0.41 -0.03 0.57 0.22
-0.01 -0.58 -0.35 0.15 0.22 0.36
-0.04 -0.39 -0.29 0.03 0.29 0.26
0.01 -0.4 -0.82 -0.05 0.53 0.33
-0.03 -0.27 -0.46 0.03 0.41 0.17
-0.24 -0.31 -0.48 0.1 0.38 0.33
-0.05 -0.22 -0.24 -0.02 0.27 0.19
-0.02 -0.58 -0.45 0.14 0.42 0.23
-0.11 -0.96 -0.82 -0.17 0.79 0.46
0.14 -0.61 -0.53 -0.44 0.6 0.37
0.04 -0.36 -0.2 -0.12 0.33 0.2
-0.02 -0.33 -0.21 0.0 0.28 0.18
-0.02 -0.33 -0.41 -0.22 0.49 0.26
0.04 -0.3 -0.36 0.02 0.32 0.16
-0.06 -0.17 -0.14 0.03 0.22 0.08
0.02 -0.45 -0.28 -0.01 0.3 0.27
-0.03 -0.52 -0.43 0.02 0.48 0.23
0.12 -0.32 -0.32 0.02 0.25 0.14
-0.04 -1.47 -1.03 -0.22 0.78 0.68
-0.02 -0.45 -0.46 -0.03 0.39 0.34
0.02 -0.33 -0.3 -0.01 0.39 0.1
-0.03 -0.47 -0.5 0.01 0.45 0.29
0.03 -0.27 -0.22 0.03 0.19 0.17
0.05 -0.5 -0.32 -0.09 0.39 0.27
0.06 -0.16 -0.24 -0.03 0.19 0.14
0.06 -0.22 -0.2 -0.14 0.23 0.2
-0.11 -0.3 -0.21 0.01 0.38 0.12
-0.05 -0.58 -0.41 0.12 0.47 0.18
-0.08 -0.58 -0.44 0.02 0.45 0.34
-0.23 -1.11 -0.77 0.01 0.86 0.35
0.13 -0.31 -0.49 -0.06 0.33 0.23
0.2 -1.04 -0.64 -0.18 0.62 0.38
0.05 -0.48 -0.53 -0.13 0.59 0.18
0.11 -0.26 -0.34 -0.09 0.3 0.18
-0.02 -0.25 -0.33 -0.01 0.39 0.09
-0.03 -0.31 -0.28 -0.05 0.33 0.23
-0.14 -0.15 -0.32 0.1 0.26 0.17
-0.03 -0.65 -0.21 -0.23 0.57 0.24
-0.11 -0.34 -0.32 0.0 0.41 0.21
0.17 -0.64 -0.38 -0.1 0.48 0.18
-0.07 -0.43 -0.6 0.02 0.45 0.34
0.05 -0.38 -0.54 -0.07 0.38 0.33
0.19 -1.27 -0.61 -0.13 0.6 0.45
-0.06 -0.44 -0.4 0.06 0.34 0.31
0.11 -1.01 -0.79 -0.3 0.82 0.34
-0.03 -0.3 -0.54 -0.01 0.43 0.24
-0.22 -0.73 -1.61 0.28 0.56 0.6
0.1 -1.94 -1.59 0.07 0.96 0.43
-0.04 -0.31 -0.41 -0.09 0.47 0.2
0.1 -0.35 -0.24 -0.07 0.26 0.2
0.02 -0.42 -0.24 0.01 0.36 0.14
0.07 -0.77 -0.51 -0.1 0.58 0.3
0.06 -0.48 -0.59 0.01 0.51 0.2
0.15 -0.36 -1.54 -0.03 0.48 0.48
0.13 -0.78 -0.6 -0.24 0.59 0.39
-0.11 -0.37 -0.38 0.02 0.43 0.22
-0.05 -0.33 -0.22 -0.03 0.37 0.13
-10.69 -3.11 -9.13 2.34 -0.29 -
0.04 -0.27 -0.25 -0.07 0.29 0.19
0.0 -0.31 -0.18 -0.04 0.25 0.2
0.0 -0.35 -0.34 -0.09 0.35 0.28
-0.1 -0.67 -0.27 0.0 0.63 0.09
-0.34 -0.44 -1.13 0.15 0.54 0.53
-0.05 -0.54 -0.52 0.0 0.49 0.31
0.07 -0.38 -0.32 -0.06 0.4 0.14
-0.08 -0.27 -0.31 -0.04 0.38 0.19
0.01 -0.3 -0.27 0.04 0.28 0.15
-0.01 -0.42 -0.59 -0.0 0.38 0.37
0.05 -0.16 -0.49 0.01 0.34 0.12
-0.02 -0.2 -0.34 -0.02 0.34 0.13
0.0 -0.29 -0.29 -0.08 0.43 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.