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Heatmap: Cluster_58 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.12 -0.21 -0.44 0.12 0.39 0.11
-0.29 -0.31 -0.33 -0.02 0.58 0.14
-0.27 -0.23 -0.43 0.21 0.53 -0.03
-0.16 -0.19 -0.37 0.07 0.48 0.01
-0.26 -0.28 -0.29 0.09 0.52 0.03
0.75 - - 2.11 - -
-0.1 -0.16 -0.27 0.07 0.36 0.01
-0.2 -0.1 -0.19 0.14 0.35 -0.08
-0.05 -0.23 -0.26 0.04 0.36 0.05
-0.23 -0.31 -0.25 0.14 0.43 0.07
-0.12 -0.21 -0.44 0.12 0.39 0.11
-0.24 -0.22 -0.35 0.09 0.5 0.04
-0.3 -0.4 -0.4 0.24 0.59 -0.01
0.31 - -15.24 2.25 -14.16 -
-0.38 -0.37 -0.18 0.23 0.48 0.01
-0.21 -0.33 -0.22 0.13 0.47 0.01
-0.16 -0.13 -0.29 0.08 0.36 0.04
-0.2 -0.31 -0.3 0.07 0.5 0.06
-0.57 -0.83 -0.33 0.44 0.75 -0.1
-0.31 -0.22 -0.29 0.16 0.44 0.06
-0.17 -0.3 -0.33 0.12 0.47 0.04
-0.15 -0.28 -0.32 0.02 0.51 0.05
-0.17 -0.13 -0.29 0.09 0.43 -0.04
-0.51 -0.43 -0.43 0.15 0.66 0.17
-0.15 -0.39 -0.34 0.06 0.49 0.12
-0.2 -0.34 -0.31 0.06 0.51 0.09
-0.18 -0.34 -0.33 0.05 0.53 0.07
-0.16 -0.23 -0.36 0.13 0.42 0.05
-0.26 -0.1 -0.38 0.17 0.49 -0.11
-0.23 -0.37 -0.35 0.11 0.55 0.06
-0.17 -0.37 -0.54 0.16 0.6 0.01
-0.18 -0.33 -0.25 0.14 0.41 0.08
-0.13 -0.34 -0.45 0.1 0.55 0.04
-0.36 -0.27 -0.34 0.18 0.55 0.0
-0.26 -0.45 -0.37 0.18 0.5 0.15
-0.31 -0.23 -0.28 0.23 0.47 -0.06
-0.22 -0.22 -0.43 0.12 0.52 0.03
-0.24 -0.35 -0.28 0.15 0.51 0.01
-0.12 -0.67 -0.52 0.21 0.6 0.11
-0.47 -0.08 -0.2 0.14 0.46 -0.03
-0.22 -0.21 -0.25 0.14 0.44 -0.03
-0.27 -0.21 -0.27 0.16 0.5 -0.07
-0.24 -0.29 -0.18 0.12 0.46 -0.01
-0.27 -0.34 -0.31 0.16 0.48 0.08
-0.22 -0.28 -0.34 0.04 0.53 0.09
-0.3 -0.35 -0.46 0.22 0.5 0.14
-0.21 -0.38 -0.41 0.17 0.59 -0.02
-0.25 -0.18 -0.21 0.1 0.45 -0.04
0.75 - - 2.11 - -
-0.28 -0.25 -0.65 0.1 0.72 -0.03
-0.09 -0.2 -0.25 0.13 0.31 0.02
-0.44 -0.43 -0.29 0.2 0.59 0.08
-0.29 -0.68 -0.47 0.25 0.66 0.09
-0.22 -0.15 -0.19 0.15 0.32 -0.0
-0.14 -0.1 -0.32 0.1 0.35 0.0
-0.32 -0.31 -0.21 0.23 0.46 -0.03
-0.24 -0.28 -0.53 0.1 0.6 0.08
-0.15 -0.26 -0.28 0.04 0.46 0.06
-0.29 -0.31 -0.44 0.19 0.56 0.04
-0.3 -0.2 -0.33 0.07 0.53 0.05
-0.15 -0.32 -0.38 0.09 0.47 0.12
-0.15 -0.33 -0.37 0.14 0.49 0.04
-0.26 -0.39 -0.32 0.22 0.53 -0.0
0.75 - - 2.11 - -
-0.16 -0.31 -0.43 0.05 0.58 0.03
-0.12 -0.23 -0.28 0.06 0.47 -0.05
-0.2 -0.28 -0.42 0.15 0.49 0.07
-0.27 -0.33 -0.42 0.2 0.56 -0.0
-0.27 -0.22 -0.46 0.17 0.52 0.03
-0.31 -0.19 -0.36 0.13 0.53 0.0
-0.31 -0.21 -0.33 0.27 0.51 -0.13
-0.32 -0.34 -0.38 0.17 0.58 0.04
-0.25 -0.24 -0.24 0.07 0.48 0.04
-0.31 -0.42 -0.38 0.19 0.58 0.06
-0.52 -0.35 -0.41 0.28 0.67 -0.05
-0.09 -0.26 -0.3 0.03 0.48 0.01
-0.27 -0.4 -0.38 0.19 0.54 0.07
-0.18 -0.31 -0.37 0.08 0.53 0.05
-0.36 -0.22 -0.18 0.21 0.48 -0.1
-0.14 -0.28 -0.43 0.13 0.45 0.1
-0.26 -0.22 -0.24 0.11 0.47 0.0
-0.22 -0.3 -0.37 0.12 0.5 0.08
0.92 - - 2.04 - -
-0.23 -0.3 -0.56 0.2 0.57 0.03
-0.15 -0.25 -0.3 0.07 0.47 0.02
-0.35 -0.16 -0.41 0.32 0.53 -0.2
-0.32 -0.19 -0.11 0.14 0.39 -0.04
-0.16 -0.34 -0.44 0.16 0.52 0.04
-0.07 -0.16 -0.32 0.03 0.42 -0.01
-0.49 -0.27 -0.5 0.23 0.58 0.11
-0.23 -0.29 -0.4 0.13 0.52 0.05
-0.12 -0.32 -0.32 0.16 0.43 0.02
-0.57 -0.2 -0.33 0.3 0.59 -0.1
-0.2 -0.19 -0.36 0.05 0.44 0.1
0.75 - - 2.11 - -
-0.16 -0.26 -0.29 0.16 0.4 0.01
-0.7 -0.86 -0.56 0.21 0.91 0.16
-0.18 -0.08 -0.24 0.1 0.3 0.02
-0.23 -1.14 -1.02 0.36 0.89 0.1
-0.21 -0.28 -0.37 0.13 0.52 0.02
-0.28 -0.34 -0.38 0.18 0.52 0.06
-0.21 -0.23 -0.36 0.09 0.46 0.09
-0.27 -0.27 -0.43 0.11 0.55 0.08
-0.33 -0.24 -0.23 0.21 0.47 -0.06
-0.27 -0.2 -0.28 0.14 0.5 -0.06
-0.26 -0.32 -0.36 0.15 0.57 -0.01
-0.2 -0.37 -0.27 0.16 0.46 0.06
-0.42 -0.13 -0.36 0.17 0.53 -0.01
-0.16 -0.31 -0.33 0.0 0.56 0.04
-0.33 0.01 -0.21 0.11 0.38 -0.07
-0.24 -0.26 -0.24 0.12 0.42 0.07
-0.2 -0.31 -0.34 0.07 0.55 0.03
-0.24 -0.24 -0.29 0.17 0.49 -0.05
-0.12 -0.23 -0.28 0.15 0.35 0.02
-0.22 -0.22 -0.46 0.19 0.5 -0.01
-0.14 -0.24 -0.31 0.03 0.45 0.08
-0.39 -0.49 -0.46 0.12 0.75 0.04
-0.43 -0.23 -0.38 0.24 0.62 -0.12
-0.23 -0.15 -0.39 0.21 0.45 -0.05
-0.27 -0.12 -0.27 0.11 0.45 -0.05
-0.21 -0.23 -0.35 0.08 0.44 0.11
-0.22 -0.19 -0.39 0.05 0.49 0.08
-0.08 -0.17 -0.43 0.05 0.49 -0.01
0.84 - - 2.07 - -
-0.29 -0.26 -0.15 0.12 0.43 0.01
0.75 - - 2.11 - -
-0.28 -0.25 -0.36 0.15 0.53 0.0
-0.17 -0.27 -0.32 0.14 0.44 0.04
-0.36 -0.1 -0.17 0.17 0.4 -0.07
-0.31 -0.2 -0.29 0.14 0.48 0.01
-0.17 -0.28 -0.29 0.14 0.43 0.02
-0.21 -0.21 -0.33 0.06 0.48 0.06
-0.22 -0.32 -0.45 0.07 0.58 0.09
-0.23 -0.37 -0.35 0.11 0.56 0.05
-0.64 -0.24 -0.24 0.3 0.63 -0.17
-0.37 -0.27 -0.34 0.14 0.57 0.03
-0.22 -0.35 -0.24 0.17 0.45 0.03
-0.12 -0.23 -0.34 0.14 0.37 0.06
-0.52 -0.14 -0.46 0.31 0.6 -0.14
-0.16 -0.25 -0.24 0.11 0.43 -0.02
-0.31 -0.19 -0.32 0.17 0.5 -0.04
-0.4 -0.25 -0.34 0.13 0.6 -0.01
-0.4 -0.28 -0.44 0.28 0.62 -0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.