Heatmap: Cluster_209 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.54 -0.58 0.28 0.28 0.23 0.06
-0.84 -0.23 0.21 0.39 0.25 -0.11
-0.33 -0.34 0.08 0.26 0.13 0.1
-0.11 -0.37 0.07 0.16 0.15 0.03
-0.49 -0.52 0.11 0.34 0.2 0.13
-1.97 -1.44 0.39 1.02 0.51 -0.69
-0.5 -0.89 0.31 0.36 0.21 0.11
0.19 -0.28 -0.11 -0.41 0.19 0.28
-1.55 -1.06 0.15 0.64 0.49 0.14
-0.38 -0.79 0.14 0.26 0.33 0.14
-0.49 -0.45 -0.04 0.32 0.24 0.2
-1.59 -1.06 0.05 0.59 0.43 0.38
-0.25 -0.64 0.15 0.24 0.2 0.12
-0.72 -0.16 0.06 0.34 0.37 -0.15
-0.82 -0.76 0.33 0.55 0.21 -0.04
-0.2 -0.31 0.12 0.22 0.12 -0.02
-1.11 -0.76 0.33 0.48 0.23 0.16
-0.74 -0.48 0.22 0.34 0.28 0.07
-0.14 -0.44 0.03 0.17 0.19 0.09
- - - - 2.52 -2.0
-0.31 -0.23 0.12 0.26 0.11 -0.03
-0.62 -0.31 0.13 0.42 0.3 -0.19
-0.59 -0.51 0.35 0.24 0.24 -0.0
-0.78 -0.21 0.15 0.3 0.33 -0.06
-0.52 0.37 0.18 0.64 0.2 -2.56
-0.83 0.19 -0.07 0.1 0.2 0.16
0.23 -0.36 -0.17 -0.16 0.15 0.21
-0.57 -0.24 0.08 0.41 0.23 -0.12
-1.04 -0.63 0.32 0.35 0.35 0.1
-0.84 -0.01 0.31 -0.03 0.17 0.15
-0.52 -0.77 -0.0 0.28 0.39 0.25
-0.1 -0.17 -0.07 -0.04 -0.03 0.34
-0.19 -0.34 0.16 0.18 0.13 -0.02
-0.13 -0.57 0.15 0.2 0.08 0.13
-0.46 -1.06 0.05 0.36 0.44 0.17
-1.05 -0.67 0.35 0.42 0.25 0.13
0.09 -0.2 0.05 -0.24 0.09 0.16
-0.47 -0.39 -0.12 0.24 0.36 0.18
-0.45 -0.5 0.23 0.4 0.19 -0.12
-1.44 -1.26 0.17 0.52 0.38 0.44
-1.28 -1.15 0.36 0.53 0.44 0.08
-0.59 -1.1 0.07 0.09 0.61 0.29
-0.1 -0.03 -0.04 0.05 -0.01 0.12
-0.51 -0.41 0.22 0.18 0.24 0.1
-0.51 -0.53 0.08 0.57 0.21 -0.15
-1.06 -0.34 0.14 0.58 0.38 -0.27
-0.45 -0.56 0.15 0.35 0.23 0.04
-0.51 -0.56 0.04 0.18 0.44 0.14
-0.62 -0.71 0.24 0.31 0.24 0.18
-0.39 -0.26 0.23 0.12 0.11 0.1
-0.27 -0.48 0.18 0.22 0.19 0.02
-0.33 -0.19 0.03 0.27 0.14 -0.0
-0.09 -0.49 -0.01 0.18 0.16 0.14
-0.46 -0.44 0.03 0.2 0.28 0.21
0.65 -0.55 -0.77 -0.16 0.08 0.27
-0.72 -0.52 0.14 0.46 0.26 0.03
-0.96 -0.69 0.18 -0.06 0.65 0.26
-0.31 -0.49 0.17 0.31 0.12 0.05
-0.21 -0.39 -0.11 -0.12 0.51 0.13
-0.33 -0.31 0.19 0.43 0.15 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.