Heatmap: Cluster_57 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.02 -0.29 -0.29 0.18 0.21 0.12
-0.0 -0.31 -0.2 0.1 0.15 0.2
-0.02 -0.81 -0.6 0.1 0.46 0.42
-0.03 -0.43 -0.19 0.14 0.18 0.22
0.11 -0.66 -0.86 0.14 0.2 0.57
-0.09 -0.93 -0.91 0.26 0.46 0.52
-0.08 -0.43 -0.26 0.09 0.27 0.27
0.01 -0.56 -0.21 0.14 0.15 0.32
0.1 -0.63 -0.43 0.06 0.32 0.32
-0.03 -0.5 -0.41 0.21 0.26 0.28
-0.26 -0.58 0.03 0.36 0.24 0.02
0.02 -0.46 -0.29 0.02 0.23 0.33
0.06 -0.39 -0.3 0.01 0.19 0.3
-0.18 -0.68 -0.56 0.24 0.31 0.48
0.44 -0.59 -0.56 0.0 -0.02 0.39
0.02 -0.53 -0.29 0.08 0.3 0.25
0.19 -0.56 -0.47 0.06 0.24 0.3
-0.06 -0.7 -0.54 0.07 0.46 0.39
0.02 -0.58 -0.32 0.09 0.33 0.26
0.16 -0.94 -0.84 0.21 0.33 0.47
0.01 -0.25 -0.17 0.11 0.15 0.1
-0.08 -0.99 -0.49 0.09 0.47 0.47
0.02 -0.38 -0.29 0.05 0.25 0.23
0.34 -0.75 -1.63 0.25 0.23 0.54
0.15 -0.73 -0.51 -0.03 0.34 0.42
-0.02 -0.62 -0.33 0.06 0.24 0.42
0.02 -0.65 -0.8 0.26 0.32 0.4
-0.06 -0.88 -1.34 0.2 0.62 0.5
0.12 -0.97 -0.52 0.09 0.42 0.38
0.03 -0.16 -0.18 0.01 0.11 0.16
-20.74 - - - - 2.58
-0.04 -0.38 -0.33 0.12 0.2 0.3
-0.05 -0.35 -0.19 0.06 0.23 0.21
0.02 -0.33 -0.45 0.07 0.33 0.2
-0.05 -0.62 -0.43 0.2 0.32 0.32
-0.05 -0.57 -0.29 0.03 0.33 0.35
0.09 -0.59 -0.49 0.13 0.34 0.27
0.09 -0.41 -0.34 0.08 0.28 0.17
0.03 -0.65 -0.51 0.01 0.25 0.53
0.26 -0.76 -0.79 0.07 0.36 0.38
0.21 -0.79 -0.86 0.06 0.42 0.41
-0.02 -0.56 -0.74 0.22 0.33 0.4
0.21 -0.32 -0.11 -0.2 0.09 0.24
0.15 -0.78 -1.61 0.35 0.34 0.53
-0.32 -1.04 -0.85 0.36 0.42 0.62
-0.08 -0.96 -0.32 0.15 0.35 0.44
0.21 -1.03 -1.26 0.04 0.52 0.56
-0.08 -0.58 -0.59 0.11 0.39 0.41
-0.3 -2.13 -2.45 0.48 0.7 0.81
0.03 -0.89 -0.47 0.09 0.42 0.39
0.13 -1.48 -1.98 -0.05 0.61 0.85
-29.07 2.58 -14.93 -15.86 -13.37 -14.92
0.06 -0.52 -0.44 0.08 0.43 0.16
-0.01 -0.2 -0.24 0.08 0.12 0.2
0.0 -0.58 -0.27 0.1 0.26 0.3
-0.04 -0.35 -0.35 0.09 0.22 0.29
-0.07 -0.64 -0.56 0.14 0.41 0.38
0.19 -0.75 -0.59 0.0 0.3 0.46
0.08 -1.29 -1.25 0.2 0.44 0.68
0.06 -0.54 -0.43 0.06 0.24 0.38
0.05 -0.17 -0.17 0.02 0.12 0.12
-0.05 -0.34 -0.19 0.1 0.21 0.19
0.05 -0.44 -0.42 0.04 0.3 0.29
-0.18 -0.51 -0.35 0.17 0.35 0.3
0.1 -0.4 -0.68 0.15 0.27 0.3
-0.1 -1.37 -0.68 0.22 0.55 0.51
-0.13 -0.41 -0.28 0.15 0.26 0.27
-0.15 -0.84 -0.39 0.24 0.31 0.43
0.18 -0.75 -0.72 0.17 0.16 0.51
0.03 -0.29 -0.35 0.01 0.3 0.2
-0.06 -0.23 -0.24 0.06 0.17 0.24
0.09 -0.62 -0.57 0.15 0.26 0.39
0.03 -0.65 -0.5 0.06 0.33 0.41
-0.15 -0.85 -0.38 0.29 0.29 0.41
-0.03 -0.23 -0.09 0.03 0.11 0.17
0.01 -0.29 -0.18 0.07 0.16 0.17
-0.01 -0.23 -0.12 0.1 0.09 0.14
0.08 -0.59 -0.57 0.1 0.47 0.21
0.61 -2.7 0.07 -3.04 -0.04 1.12
0.01 -0.14 -0.08 0.03 0.08 0.09
0.12 -0.9 -1.15 0.23 0.25 0.65
-0.05 -0.29 -0.28 0.11 0.21 0.2
0.0 -0.54 -0.34 0.14 0.31 0.24
0.18 -0.61 -1.0 0.06 0.5 0.33
0.04 -0.55 -0.38 0.02 0.23 0.42
-0.02 -0.62 -0.98 0.27 0.26 0.54
-0.06 -0.64 -0.89 0.15 0.36 0.56
0.04 -0.81 -0.47 0.3 0.35 0.24
-0.15 -1.44 -0.8 0.29 0.56 0.54
0.05 -0.34 -0.38 0.01 0.33 0.21
-0.01 -0.31 -0.15 0.05 0.17 0.19
0.13 -0.58 -0.62 0.06 0.4 0.29
-0.24 -1.19 -0.49 0.13 0.5 0.58
-0.18 -0.9 -0.96 0.16 0.52 0.61
-0.07 -0.89 -0.98 0.21 0.56 0.45
0.15 -0.52 -0.62 0.04 0.39 0.26
0.09 -0.29 -0.11 0.03 0.08 0.15
-0.19 -0.59 -0.54 0.22 0.31 0.45
-0.47 -2.07 -1.39 0.5 0.64 0.76
0.07 -0.76 -0.64 0.24 0.35 0.34
0.02 -0.28 -0.16 0.06 0.15 0.16
-0.24 -0.89 -0.4 0.12 0.51 0.43
-0.05 -0.48 -0.29 0.13 0.27 0.26
-0.3 -0.94 -0.59 0.32 0.4 0.51
-0.14 -0.46 -0.38 0.14 0.33 0.32
-0.01 -0.34 -0.28 0.1 0.23 0.2
0.07 -0.68 -0.4 0.01 0.37 0.35
-0.6 -1.64 -0.74 0.43 0.54 0.7
-0.25 -1.16 -0.84 0.35 0.44 0.61
0.19 -0.61 -0.78 0.15 0.25 0.41
0.11 -0.53 -0.6 0.08 0.31 0.35
-0.19 -0.79 -0.31 0.27 0.31 0.38
-0.37 -1.31 -0.72 0.29 0.53 0.64
0.04 -0.37 -0.37 0.01 0.31 0.23
-0.38 -0.88 -0.85 0.38 0.43 0.57
-0.29 -1.31 -0.54 0.25 0.52 0.56
-0.3 -0.58 -1.19 0.25 0.42 0.63
0.01 -0.55 -0.38 0.09 0.35 0.27
0.01 -0.44 -0.32 0.1 0.29 0.22
0.11 -0.9 -0.53 -0.01 0.32 0.53
0.13 -0.75 -0.66 0.11 0.2 0.53
-0.06 -0.8 -0.39 0.01 0.35 0.5
-0.35 -1.4 -0.78 0.48 0.43 0.6
-0.03 -0.6 -0.64 0.2 0.23 0.48
0.09 -0.23 -0.44 0.01 0.19 0.25
0.03 -0.47 -0.32 0.08 0.29 0.23
-0.43 -1.26 -0.93 0.34 0.52 0.69
0.09 -0.55 -0.37 0.05 0.41 0.16
-0.18 -1.17 -1.11 0.47 0.39 0.59
0.03 -1.05 -0.57 0.01 0.39 0.59
-0.11 -0.37 -0.49 0.24 0.26 0.28
-0.05 -0.29 -0.24 0.08 0.23 0.19
0.16 -0.71 -0.37 0.06 0.19 0.39
-0.05 -0.24 -0.41 0.2 0.15 0.23
-0.16 -0.98 -0.53 0.11 0.5 0.5
-0.21 -0.99 -1.09 0.38 0.48 0.55
-0.02 -0.23 -0.1 0.02 0.19 0.1
0.02 -0.48 -0.47 0.1 0.29 0.32
0.09 -1.07 -0.56 0.0 0.45 0.5
0.04 -0.47 -0.37 0.06 0.27 0.29
0.07 -0.78 -0.37 0.03 0.33 0.4
-0.38 -0.94 -1.45 0.28 0.61 0.69
-0.05 -0.26 -0.25 0.11 0.19 0.19
0.24 -0.91 -0.8 0.07 0.22 0.58
-0.07 -0.43 -0.27 0.05 0.3 0.27
0.14 -0.47 -0.58 -0.01 0.32 0.35
-0.02 -0.49 -0.34 0.09 0.34 0.24
-0.03 -0.71 -1.3 0.36 0.45 0.44
0.03 -1.34 -1.01 0.01 0.45 0.78
-0.22 -1.02 -1.63 0.15 0.61 0.75
0.15 -1.01 -1.04 0.13 0.52 0.47
0.18 -0.68 -0.61 0.02 0.34 0.38
-0.01 -0.6 -0.56 0.18 0.39 0.29
-0.08 -0.57 -0.37 0.16 0.31 0.32
-0.24 -0.62 -0.63 0.18 0.49 0.4
-1.3 -23.03 -22.14 2.48 -12.97 -8.87
-0.13 -0.29 -0.29 0.09 0.23 0.28
0.01 -0.55 -0.43 0.15 0.28 0.31
-0.08 -0.37 -0.28 0.1 0.27 0.24
-0.21 -1.04 -0.42 0.18 0.46 0.48
0.09 -0.46 -0.54 -0.02 0.32 0.36
0.24 -0.86 -0.75 0.05 0.33 0.46
-0.05 -0.54 -0.32 0.16 0.31 0.24
0.0 -0.59 -0.66 0.26 0.01 0.58
0.08 -0.49 -0.55 -0.01 0.43 0.28
0.16 -0.06 -0.05 -0.59 -0.01 0.38
- - - - - -
0.02 -0.75 -0.56 0.12 0.4 0.38
0.16 -0.47 -0.47 0.11 0.19 0.28
-0.38 -0.94 -1.14 0.5 0.37 0.63
-0.03 -0.81 -0.32 0.05 0.37 0.41
-0.19 -0.77 -1.09 0.36 0.38 0.57
-0.12 -0.97 -0.7 0.28 0.45 0.45
-0.06 -0.27 -0.13 0.03 0.17 0.2
0.09 -0.52 -0.43 0.12 0.28 0.26
-0.04 -0.87 -0.8 0.34 0.4 0.4
0.08 -1.12 -1.4 0.25 0.48 0.61
0.13 -0.32 -0.26 -0.66 0.35 0.45
0.05 -0.98 -0.7 0.2 0.43 0.43
0.03 -0.76 -0.34 0.23 0.32 0.23
-0.03 -0.31 -0.33 0.05 0.17 0.34
-0.02 -0.65 -0.59 0.22 0.35 0.35
0.11 -0.63 -0.31 0.05 0.18 0.38
-0.25 -1.13 -0.73 0.3 0.42 0.62
-0.02 -0.47 -0.25 0.12 0.25 0.23
0.04 -0.73 -0.57 0.09 0.37 0.43
-0.03 -0.25 -0.25 0.08 0.16 0.22
0.03 -0.65 -0.29 0.13 0.22 0.35
0.18 -0.62 -0.76 0.07 0.31 0.42
0.11 -0.45 -0.46 0.07 0.34 0.2
-0.32 -1.49 -1.3 0.46 0.61 0.62
-0.21 -0.62 -0.38 0.2 0.38 0.34
0.13 -0.51 -0.66 0.02 0.46 0.25
-0.06 -0.33 -0.14 0.12 0.19 0.15
-0.18 -1.04 -0.42 0.19 0.51 0.41
-0.3 -0.89 -0.78 0.24 0.49 0.56
-0.22 -0.71 -0.82 0.41 0.36 0.43
- - - - - -
0.05 -0.41 -0.24 0.05 0.25 0.19
-0.24 -0.95 -0.53 0.19 0.54 0.43
-0.03 -0.4 -0.32 0.12 0.29 0.2
-0.02 -0.18 -0.19 0.07 0.14 0.14
0.08 -0.31 -0.43 -0.01 0.31 0.22
-0.05 -0.44 -0.28 0.08 0.23 0.31
0.12 -0.74 -0.53 0.12 0.29 0.39
0.1 -0.51 -0.39 0.08 0.27 0.26
-0.06 -0.67 -0.56 0.22 0.34 0.38
-0.18 -1.42 -0.69 0.28 0.55 0.53
0.01 -0.71 -0.48 0.22 0.32 0.33
0.02 -0.26 -0.19 -0.01 0.23 0.15
-0.1 -0.8 -0.67 0.28 0.46 0.35
-0.05 -0.52 -0.28 0.06 0.33 0.28
-0.13 -0.76 -0.45 0.25 0.34 0.39
0.43 -2.11 0.08 -0.81 0.27 0.67
-0.16 -0.64 -0.46 0.19 0.39 0.37
0.22 -0.87 -0.86 0.17 0.2 0.55
0.32 -0.38 -1.14 0.02 0.2 0.45
0.2 -0.93 -0.74 0.33 0.34 0.28
-0.38 -0.54 -0.54 0.5 0.17 0.4
-0.02 -0.83 -0.63 0.21 0.36 0.45
-0.0 -1.29 -1.06 0.16 0.53 0.64
-0.19 -1.28 -0.69 0.42 0.46 0.47
-0.04 -0.93 -1.25 0.32 0.39 0.61
0.04 -0.54 -0.5 0.02 0.49 0.21
-0.11 -0.41 -0.34 0.2 0.21 0.29
0.15 -0.55 -1.05 0.07 0.47 0.36
-0.05 -0.41 -0.41 0.17 0.22 0.3
0.06 -0.35 -0.25 0.01 0.15 0.28

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.