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Heatmap: Cluster_22 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.09 -0.04 0.02 0.05 0.04 0.01
-0.03 -0.03 0.03 0.03 0.01 0.0
-0.07 -0.01 0.08 0.05 -0.02 -0.03
-0.06 0.0 0.04 0.03 0.02 -0.04
-0.1 -0.0 0.05 0.07 0.01 -0.04
-0.16 -0.02 0.04 0.11 0.02 -0.01
-0.06 -0.04 0.04 0.07 0.03 -0.04
-0.1 -0.05 0.04 0.1 0.02 -0.02
-0.07 -0.05 0.06 0.09 0.02 -0.05
-0.04 -0.0 0.02 0.02 -0.01 0.01
-0.01 -0.04 0.01 0.02 0.02 -0.01
-0.1 -0.14 0.05 0.13 0.06 -0.01
-0.04 -0.04 0.03 0.03 0.03 -0.01
-0.06 -0.01 0.03 0.06 0.01 -0.02
-0.04 -0.07 0.06 0.0 0.04 0.0
-0.03 -0.05 0.02 0.04 0.03 -0.01
-0.18 -0.06 0.1 0.1 0.13 -0.12
-0.07 -0.01 0.02 0.03 0.0 0.03
-0.09 -0.03 0.07 0.05 0.03 -0.03
-0.08 -0.04 0.07 0.03 0.02 -0.0
-0.09 0.0 0.03 0.05 0.04 -0.04
-0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 -0.02
-0.04 -0.02 0.02 0.03 0.03 -0.02
-0.09 -0.02 0.08 0.05 -0.01 -0.02
-0.09 -0.16 0.11 0.09 0.06 -0.03
-0.01 -0.04 0.01 0.01 0.01 0.01
-0.33 -0.38 0.11 0.27 0.19 0.0
-0.06 -0.04 0.03 0.04 0.01 0.02
-0.08 -0.03 0.04 0.04 0.01 0.02
-0.05 -0.05 0.03 0.01 0.02 0.04
-0.05 -0.08 0.08 0.04 0.02 -0.02
-0.03 -0.01 0.02 0.02 0.0 -0.01
-0.12 -0.0 0.04 0.05 0.03 -0.0
-0.07 -0.01 0.02 0.05 0.01 -0.01
-0.1 -0.02 0.05 0.03 0.04 -0.01
-0.04 -0.04 0.06 0.03 0.01 -0.02
-0.04 -0.03 0.04 0.02 0.03 -0.01
-0.03 -0.04 0.03 0.03 0.02 -0.01
-0.08 -0.01 0.03 0.04 0.01 0.0
-0.06 0.0 0.03 0.03 0.03 -0.04
-0.04 0.01 0.01 0.03 0.02 -0.03
-0.05 -0.05 0.04 0.04 0.03 -0.0
-0.06 -0.04 0.09 0.03 0.02 -0.03
-0.05 -0.03 0.06 0.03 0.0 -0.01
-0.05 -0.03 0.05 0.05 0.01 -0.03
-0.07 -0.0 0.05 0.04 0.03 -0.06
-0.08 -0.05 0.07 0.07 0.02 -0.03
-0.07 -0.07 0.06 0.05 0.0 0.02
-0.08 -0.01 0.07 0.05 0.03 -0.06
-0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 -0.01
-0.07 -0.05 0.05 0.04 0.02 0.01
-0.04 -0.03 0.01 0.06 0.04 -0.03
-0.13 -0.15 0.12 0.08 0.06 0.0
-0.03 -0.01 0.04 0.02 -0.01 -0.03
-0.21 -0.1 0.15 0.12 0.1 -0.1
-0.04 -0.06 0.05 0.03 0.01 0.01
-0.04 -0.02 0.06 0.03 0.0 -0.04
-0.02 -0.02 0.06 -0.01 0.01 -0.02
-0.07 -0.04 0.05 0.07 0.04 -0.06
-0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 -0.01
-0.05 -0.02 0.03 0.02 0.01 0.01
-0.0 -0.04 0.01 0.02 0.01 0.0
-0.05 0.01 -0.0 0.03 0.05 -0.03
-0.05 -0.03 0.06 0.03 0.01 -0.02
-0.09 -0.17 0.07 0.13 0.05 -0.01
-0.05 -0.01 0.03 0.05 -0.01 -0.01
-0.01 -0.01 0.02 0.02 -0.01 -0.02
-0.04 -0.01 0.03 0.02 0.02 -0.02
-0.04 -0.15 0.06 0.05 0.06 0.0
-0.13 -0.03 0.07 0.07 0.02 -0.01
-0.06 -0.05 0.06 0.05 0.02 -0.03
-0.02 -0.01 0.02 0.03 0.01 -0.02
-0.14 -0.08 0.05 0.13 0.06 -0.04
-0.07 -0.02 0.08 0.0 0.03 -0.02
-0.08 -0.11 0.07 0.07 0.01 0.02
-0.04 -0.04 0.02 0.03 0.03 -0.0
-0.05 -0.07 0.07 0.04 0.02 -0.02
-0.08 -0.08 0.04 0.06 0.04 0.01
-0.03 -0.15 0.04 0.07 0.06 -0.01
-0.13 0.0 0.05 0.07 0.03 -0.03
-0.08 0.02 0.03 0.05 0.01 -0.05
-0.07 -0.01 0.02 0.04 0.0 0.01
-0.13 -0.06 0.07 0.05 0.05 0.01
-0.06 -0.0 0.01 0.04 0.02 -0.01
-0.04 -0.06 0.04 0.01 0.01 0.03
-0.02 -0.01 0.06 -0.01 0.01 -0.04
-0.1 -0.06 0.07 0.07 0.02 -0.01
-0.01 -0.0 0.01 0.01 0.0 -0.0
-0.07 -0.05 0.08 0.07 0.03 -0.06
-0.1 -0.11 0.06 0.07 0.06 0.01
-0.07 -0.02 0.04 0.05 0.01 -0.01
-0.01 -0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
-0.05 -0.01 0.06 0.01 0.01 -0.02
-0.03 -0.01 0.01 0.03 0.01 -0.01
-0.06 -0.04 0.02 0.02 0.02 0.04
-0.02 -0.14 0.03 0.09 0.04 0.0
-0.02 -0.14 0.09 -0.01 0.04 0.04
-0.1 -0.12 0.12 0.08 0.03 -0.03
-0.08 -0.08 0.12 0.02 0.02 -0.0
-0.06 -0.03 0.09 0.01 0.03 -0.05
-0.07 0.01 0.03 0.06 0.0 -0.04
-0.05 -0.06 0.06 0.04 0.03 -0.01
-0.12 -0.02 0.1 0.11 0.03 -0.11
-0.09 -0.01 0.04 0.04 0.04 -0.04
-0.13 -0.12 0.08 0.16 0.03 -0.04
-0.05 -0.01 0.02 0.02 0.02 -0.01
-0.05 -0.14 0.08 0.03 0.04 0.03
-0.01 -0.03 0.02 0.01 0.01 -0.0
-0.05 -0.02 0.02 0.03 -0.0 0.01
-0.01 -0.0 0.01 0.02 0.0 -0.02
-0.13 -0.02 0.12 -0.04 0.03 0.03
-0.09 -0.02 0.05 0.05 0.05 -0.05
-0.04 -0.04 0.07 0.02 0.01 -0.01
-0.04 -0.07 0.06 0.01 0.04 0.0
-0.19 -0.1 0.15 0.15 0.04 -0.09
-0.01 -0.01 0.0 0.01 0.01 -0.0
-0.04 -0.05 0.06 -0.0 0.02 0.01
-0.12 -0.07 0.12 0.05 0.02 -0.02
0.0 -0.03 0.01 0.0 0.01 0.0
-0.03 -0.01 0.03 0.03 0.0 -0.02
-0.05 -0.02 0.07 0.02 -0.01 -0.0
-0.03 -0.03 0.02 0.03 0.02 -0.01
-0.05 -0.02 0.06 -0.0 0.01 -0.0
-0.07 -0.04 0.09 0.02 0.02 -0.03
-0.08 -0.12 0.04 0.1 0.05 -0.0
-0.09 -0.11 0.05 0.06 0.07 0.01
-0.12 -0.03 0.08 0.06 0.02 -0.01
-0.05 0.0 0.02 0.03 0.02 -0.02
-0.07 -0.02 0.05 0.06 0.04 -0.06
-0.07 -0.04 0.12 0.02 0.0 -0.04
-0.16 -0.17 0.1 0.07 0.06 0.07
-0.06 -0.05 0.02 0.03 0.04 0.01
-0.06 -0.02 0.03 0.03 0.03 -0.02
-0.03 -0.03 0.03 0.01 0.0 0.02
-0.04 0.0 0.06 0.02 -0.0 -0.04
-0.11 -0.04 0.07 0.08 0.01 -0.02
-0.03 -0.04 0.04 0.0 0.02 0.0
-0.12 -0.14 0.11 0.09 0.06 -0.02
-0.07 0.02 0.02 0.04 0.02 -0.03
-0.06 -0.03 0.02 0.06 0.01 -0.0
-0.07 -0.01 0.06 0.04 0.01 -0.02
-0.03 -0.02 0.04 0.01 0.0 -0.01
-0.09 0.04 0.0 0.06 0.02 -0.05
-0.05 -0.06 0.07 0.07 0.01 -0.04
-0.05 -0.02 0.03 0.07 0.0 -0.05
-0.05 -0.01 0.11 -0.03 0.01 -0.03
-0.03 -0.04 0.03 0.02 0.02 -0.01
-0.06 -0.04 0.04 0.02 0.03 0.02
-0.05 -0.04 0.03 0.03 0.01 0.01
-0.18 -0.14 0.05 0.15 0.1 -0.02
-0.09 -0.03 0.05 0.05 0.01 0.0
-0.05 -0.02 0.06 0.01 0.02 -0.01
-0.02 -0.23 0.11 0.04 0.06 0.02
-0.03 -0.03 0.0 0.03 0.03 -0.0
-0.09 0.02 0.09 -0.01 -0.01 -0.02
-0.03 0.01 0.02 0.03 0.01 -0.04
-0.01 -0.05 0.02 0.02 0.01 0.01
-0.02 -0.06 0.02 0.0 0.04 0.02
-0.04 -0.01 0.1 0.02 0.0 -0.07
-0.04 -0.05 0.07 0.03 0.01 -0.02
-0.17 -0.16 0.06 0.14 0.1 0.01
-0.06 -0.04 0.08 0.04 0.01 -0.04
-0.04 -0.02 0.02 -0.0 0.02 0.02
-0.04 -0.05 0.03 0.03 0.02 0.0
-0.05 -0.03 -0.0 0.04 0.04 0.0
-0.08 -0.03 0.08 0.01 0.01 0.0
-0.05 -0.0 0.07 0.0 -0.0 -0.02
-0.04 -0.03 0.03 0.03 0.02 -0.01
-0.05 -0.01 0.03 0.04 0.01 -0.04
-0.09 -0.11 0.08 0.04 0.06 0.01
-0.1 -0.06 0.11 0.0 0.04 0.01
-0.05 -0.05 0.07 0.01 0.01 0.0
-0.03 -0.09 0.05 0.05 0.04 -0.02
-0.04 -0.01 0.02 0.02 0.01 0.01
-0.03 -0.0 0.01 0.03 0.02 -0.03
-0.07 -0.04 0.04 0.05 0.04 -0.02
-0.1 -0.06 0.03 0.18 0.05 -0.13
-0.07 -0.01 0.03 0.03 0.0 0.02
-0.12 0.0 0.01 0.13 0.07 -0.12
-0.02 -0.05 0.04 0.04 -0.01 -0.01
-0.13 -0.08 0.08 0.13 0.03 -0.05
-0.04 -0.04 0.04 -0.01 0.03 0.01
-0.06 -0.05 0.04 0.04 0.02 0.0
-0.04 -0.03 0.04 0.04 0.01 -0.02
-0.05 -0.03 0.03 0.06 0.02 -0.04
-0.02 -0.02 0.01 0.02 0.02 -0.0
-0.05 -0.0 0.04 0.03 0.02 -0.04

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.