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Heatmap: Cluster_113 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.09 -0.36 -0.42 -0.4 0.31 0.5
0.03 -0.1 -0.15 -0.01 0.08 0.13
0.06 -0.05 -0.13 -0.02 0.01 0.11
0.01 -0.05 -0.2 -0.03 0.03 0.21
0.02 -0.03 -0.05 -0.0 0.02 0.04
0.07 -0.09 -0.17 -0.11 0.03 0.23
0.0 -0.04 -0.06 -0.03 0.06 0.07
0.07 -0.1 -0.14 -0.01 0.04 0.12
0.09 -0.09 -0.13 -0.07 0.06 0.12
0.11 -0.11 -0.16 -0.07 0.06 0.14
0.03 -0.03 -0.18 -0.07 0.01 0.21
0.03 -0.1 -0.19 -0.01 0.1 0.14
0.09 -0.06 -0.36 -0.03 0.08 0.23
0.02 -0.05 -0.16 -0.02 0.05 0.13
0.05 -0.13 -0.14 -0.08 0.07 0.2
0.07 -0.09 -0.25 -0.13 0.12 0.22
0.03 -0.01 -0.32 -0.03 0.08 0.2
0.02 -0.04 -0.14 -0.02 0.06 0.11
0.05 -0.19 -0.19 -0.08 0.09 0.26
0.01 -0.11 -0.2 -0.07 0.14 0.19
0.01 -0.3 -0.16 -0.24 0.14 0.42
-0.01 -0.04 -0.03 -0.0 0.03 0.05
-0.01 -0.04 -0.06 -0.02 0.06 0.07
0.08 -0.07 -0.1 -0.03 0.02 0.1
0.0 -0.03 -0.04 -0.01 0.03 0.05
0.17 -0.06 -0.26 -0.12 0.04 0.17
0.06 -0.03 -0.08 -0.03 0.01 0.06
0.01 -0.49 -0.5 -0.31 0.36 0.58
0.09 -0.03 -0.13 -0.08 0.06 0.09
0.15 -0.19 -0.27 -0.1 0.05 0.28
0.01 -0.14 -0.11 -0.05 0.07 0.19
0.06 -0.06 -0.14 -0.1 0.07 0.15
0.06 -0.1 -0.15 -0.03 0.02 0.18
-0.01 -0.04 -0.02 -0.01 0.03 0.05
0.05 -0.11 -0.15 -0.1 0.09 0.18
-0.01 -0.03 -0.16 -0.02 0.02 0.18
-0.14 -0.31 -0.24 -0.18 0.26 0.44
0.08 -0.12 -0.13 -0.04 0.07 0.12
0.02 -0.04 -0.09 -0.02 0.02 0.09
0.05 -0.13 -0.16 -0.06 0.1 0.18
0.09 -0.1 -0.24 -0.06 0.06 0.21
0.03 -0.05 -0.05 -0.03 0.03 0.07
0.02 -0.31 -0.24 -0.14 0.21 0.34
-0.27 -0.54 -0.56 -0.32 0.47 0.69
0.03 -0.15 -0.11 -0.07 0.03 0.23
0.02 -0.06 -0.11 -0.05 0.06 0.12
0.02 -0.03 -0.05 -0.03 0.03 0.06
0.04 -0.29 -0.14 -0.18 0.13 0.34
-0.0 -0.01 -0.02 -0.01 0.01 0.03
0.18 -0.12 -0.38 -0.16 0.13 0.26
0.12 -0.16 -0.14 -0.04 -0.01 0.2
0.04 -0.07 -0.09 -0.04 0.04 0.11
0.03 -0.1 -0.08 -0.03 0.02 0.14
0.0 -0.02 -0.05 -0.02 0.03 0.06
0.04 -0.11 -0.11 -0.03 0.06 0.13
0.2 -0.08 -0.23 -0.09 0.06 0.1
0.07 -0.18 -0.13 -0.07 0.03 0.24

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.