Heatmap: Cluster_118 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.02 -0.05 0.0 0.01 0.03 0.02
-0.12 -0.12 0.03 0.15 0.05 -0.0
-0.05 -0.05 0.01 0.01 0.01 0.07
-0.09 -0.1 -0.02 0.02 0.08 0.1
-0.09 -0.15 -0.02 0.1 0.07 0.06
-0.17 -0.02 0.03 0.06 0.05 0.04
-0.03 -0.02 -0.01 0.02 0.03 0.0
-0.02 -0.02 -0.05 0.03 0.01 0.05
-0.04 -0.04 0.01 0.01 0.04 0.01
-0.01 -0.04 -0.01 0.03 0.03 0.0
-0.06 -0.05 0.0 0.01 0.04 0.05
-0.03 -0.03 0.0 0.04 0.03 -0.02
-0.09 -0.03 -0.01 0.04 0.05 0.03
-0.16 -0.08 0.02 0.09 0.12 0.0
-0.02 -0.05 0.01 0.02 0.03 0.01
-0.04 -0.07 -0.02 -0.0 0.07 0.05
-0.02 -0.03 0.02 0.03 0.02 -0.03
-0.01 -0.04 -0.0 0.02 0.02 0.0
-0.01 -0.04 0.0 0.01 0.03 0.0
-0.02 -0.04 0.0 0.03 0.03 0.0
-0.02 -0.02 -0.01 0.0 0.03 0.02
-0.04 -0.08 0.02 0.02 0.06 0.02
-0.02 -0.03 0.02 0.02 0.02 -0.01
-0.14 -0.11 0.02 0.06 0.06 0.1
-0.06 -0.1 0.03 0.04 0.06 0.02
-0.24 -0.11 0.09 0.11 0.07 0.05
-0.07 -0.07 0.01 0.01 0.07 0.05
-0.04 -0.11 0.02 0.06 0.04 0.03
-0.03 -0.07 -0.01 0.03 0.09 -0.01
0.0 -0.04 -0.01 0.02 0.02 0.0
-0.05 -0.05 -0.01 0.03 0.03 0.04
-0.05 -0.08 -0.03 0.07 0.07 0.02
-0.02 -0.05 0.01 0.03 0.02 0.01
-0.02 -0.05 0.02 0.02 0.04 -0.0
-0.04 -0.05 0.01 0.05 0.02 0.02
-0.01 -0.07 0.03 0.03 0.01 0.0
-0.02 -0.11 0.01 0.03 0.04 0.05
-0.04 -0.06 0.01 0.02 0.05 0.02
-0.03 -0.05 -0.0 0.01 0.05 0.01
-0.09 -0.12 -0.01 0.08 0.07 0.06
-0.2 -0.1 0.0 0.14 0.13 0.0
-0.06 -0.08 -0.02 0.1 0.06 -0.0
-0.02 -0.04 0.0 0.04 0.02 -0.01
-0.16 -0.12 0.06 0.08 0.08 0.04
-0.03 -0.04 -0.0 0.02 0.03 0.02
-0.03 -0.05 0.02 0.02 0.03 0.01
-0.02 -0.03 0.0 0.01 -0.0 0.04
-0.12 -0.09 -0.0 0.03 0.07 0.1
-0.08 -0.04 0.02 0.04 0.04 0.02
0.0 -0.04 0.0 0.0 0.02 0.02
-0.05 -0.05 0.02 0.04 0.03 0.01
-0.03 -0.03 -0.0 -0.0 0.03 0.03
-0.02 -0.02 0.01 0.01 0.01 -0.0
-0.04 -0.06 -0.0 0.03 0.03 0.04
-0.06 -0.08 -0.01 0.05 0.03 0.07
-0.04 -0.14 0.03 0.04 0.06 0.03
-0.05 -0.05 0.02 0.05 0.03 0.01
-0.03 -0.05 0.02 0.08 0.02 -0.03
-0.04 -0.05 0.01 0.03 0.01 0.03
-0.02 -0.08 -0.03 0.07 0.04 0.02
-0.04 -0.04 0.0 0.02 0.05 0.0
-0.05 -0.03 -0.02 0.02 0.05 0.04
-0.02 -0.05 -0.0 0.02 0.03 0.02
-0.06 -0.05 -0.04 0.04 0.06 0.05
-0.0 -0.02 0.0 -0.0 0.01 0.01
-0.06 -0.02 -0.02 0.05 0.02 0.02
-0.04 -0.05 0.01 0.05 0.02 0.01
-0.02 -0.02 0.0 0.02 0.01 0.0
-0.02 -0.17 0.03 0.04 0.08 0.04
-0.05 -0.04 0.02 0.05 0.06 -0.04
-0.02 -0.03 -0.02 0.01 0.02 0.04
-0.08 -0.07 0.0 0.03 0.05 0.06
-0.01 -0.02 -0.01 0.02 0.02 0.01
-0.02 -0.05 0.01 0.01 0.03 0.01
-0.01 -0.05 0.01 0.02 0.03 -0.0
-0.03 -0.08 -0.02 0.06 0.02 0.04
-0.03 -0.04 -0.02 0.02 0.02 0.04
-0.1 -0.01 -0.06 0.07 0.07 0.03
0.0 -0.05 -0.01 0.03 0.02 0.01
-0.06 -0.04 -0.03 0.04 0.04 0.04
-0.08 -0.06 -0.03 0.07 0.05 0.05
-0.13 -0.13 0.03 0.09 0.08 0.05
-0.01 -0.11 -0.01 0.03 0.05 0.05
-0.03 -0.02 0.0 0.02 0.01 0.01
-0.04 -0.03 0.01 0.01 0.03 0.01
-0.09 -0.1 0.01 0.14 0.06 -0.04
-0.06 -0.06 0.01 0.04 0.03 0.03
-0.03 -0.05 0.02 0.04 0.03 -0.0
-0.02 -0.01 0.0 0.01 0.02 -0.0
-0.01 -0.03 -0.01 0.01 0.02 0.01
-0.03 -0.01 0.01 0.02 0.02 -0.0
-0.01 -0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
-0.1 -0.12 -0.08 0.11 0.09 0.07
-0.08 -0.05 -0.06 0.1 0.04 0.04
-0.06 -0.06 -0.02 0.02 0.07 0.05
-0.05 -0.02 0.01 0.03 0.03 0.01
-0.07 -0.08 0.02 0.04 0.05 0.03
-0.03 -0.03 -0.02 -0.0 0.05 0.03
-0.0 -0.09 -0.02 0.03 0.06 0.02
-0.01 -0.03 -0.0 0.02 0.01 0.01
-0.04 -0.04 -0.02 0.03 0.05 0.03
-0.01 -0.04 -0.01 0.02 0.02 0.01
-0.02 -0.04 -0.02 -0.0 0.05 0.03
-0.02 -0.06 -0.02 0.04 0.03 0.03
-0.04 -0.07 0.01 0.04 0.06 -0.0
-0.13 -0.11 0.04 0.05 0.09 0.03
-0.04 -0.03 0.0 0.02 0.03 0.02
-0.07 -0.11 -0.03 0.05 0.07 0.08
-0.04 -0.06 -0.01 0.02 0.04 0.04
-0.03 -0.03 0.01 0.01 0.02 0.01
-0.04 -0.04 -0.0 0.02 0.03 0.02
-0.1 -0.1 -0.01 0.07 0.06 0.06
-0.04 -0.09 -0.01 0.05 0.04 0.05
-0.04 -0.04 -0.01 0.04 0.02 0.03
-0.09 -0.07 0.0 0.05 0.06 0.04
-0.01 -0.01 -0.01 -0.0 0.02 0.01
-0.04 -0.1 -0.01 0.04 0.05 0.06
-0.05 -0.07 -0.0 0.02 0.05 0.04
-0.1 -0.06 0.04 0.05 0.05 0.02
-0.0 -0.23 -0.01 0.09 0.11 0.02
-0.02 -0.05 -0.01 0.02 0.04 0.02
-0.03 -0.0 0.02 0.02 -0.0 -0.0
-0.03 -0.03 0.0 0.02 0.02 0.03
-0.07 -0.08 0.03 0.03 0.03 0.05
-0.07 -0.03 -0.0 0.0 0.03 0.06
-0.0 -0.07 -0.02 0.01 0.03 0.05
-0.06 -0.04 0.02 0.05 0.02 0.01
-0.02 -0.04 -0.01 0.02 0.03 0.02
-0.01 -0.05 0.01 0.02 0.03 0.01
-0.04 -0.03 -0.01 0.02 0.03 0.03
-0.3 -0.34 0.13 0.15 0.15 0.12
-0.01 -0.01 0.0 0.0 0.01 0.0
-0.11 -0.03 0.02 0.04 0.07 0.01
-0.04 -0.07 0.03 0.02 0.04 0.01
-0.18 -0.19 -0.01 0.0 0.11 0.22
-0.06 -0.12 0.0 0.02 0.06 0.09
-0.08 -0.06 0.02 0.08 0.04 -0.0
-0.07 -0.08 0.0 0.05 0.06 0.04
-0.04 -0.04 -0.0 0.02 0.04 0.01
-0.04 -0.03 -0.01 0.03 0.02 0.03
-0.07 -0.05 0.0 0.05 0.04 0.03
-0.02 -0.19 -0.02 0.07 0.1 0.04
-0.06 -0.03 0.02 0.03 0.02 0.01
-0.08 -0.03 0.03 0.04 0.03 0.0
-0.06 -0.04 -0.02 0.03 0.06 0.03
-0.09 -0.14 0.03 0.11 0.05 0.02
-0.05 -0.05 0.02 0.02 0.07 -0.01
-0.05 -0.08 -0.01 0.03 0.05 0.06
-0.15 -0.15 0.05 0.06 0.18 -0.01
-0.02 -0.02 -0.01 0.02 0.02 0.01
-0.06 -0.11 -0.03 0.04 0.07 0.07
-0.34 -0.14 0.08 0.14 0.13 0.07
-0.36 -0.08 0.1 0.15 0.13 0.01
-0.04 -0.02 0.01 0.04 0.0 0.01
-0.03 -0.07 0.0 0.04 0.03 0.02
-0.05 -0.04 0.02 0.03 0.03 0.02
-0.09 -0.11 -0.0 0.04 0.08 0.06
-0.04 -0.09 0.01 0.06 0.06 -0.01
-0.01 -0.03 -0.0 0.02 0.02 0.0
-0.03 -0.02 -0.01 0.03 0.01 0.03
-0.8 -0.62 0.07 0.28 0.42 0.23
-0.09 -0.05 0.02 0.03 0.04 0.05
-0.07 -0.11 -0.0 0.04 0.05 0.08
-0.05 -0.06 0.02 0.02 0.02 0.05
-0.02 -0.03 -0.02 0.03 0.02 0.01
-0.1 -0.03 -0.04 0.08 0.05 0.03
-0.05 -0.03 -0.0 0.02 0.02 0.03
-0.08 -0.03 -0.01 0.02 0.04 0.05
-0.06 -0.14 -0.06 0.08 0.07 0.08
-0.02 -0.05 -0.02 0.02 0.04 0.03
-0.04 -0.01 -0.01 0.03 0.01 0.01
-0.15 -0.07 -0.05 0.09 0.09 0.07
-0.06 -0.1 -0.06 0.07 0.08 0.05
-0.08 -0.13 0.01 0.05 0.05 0.08
-0.07 -0.03 0.02 0.02 0.03 0.03
-0.02 -0.07 0.0 0.03 0.04 0.01
-0.09 -0.09 0.01 0.04 0.06 0.05
-0.08 -0.04 0.02 0.07 0.04 -0.01
-0.06 -0.04 0.01 0.02 0.02 0.04
-0.05 -0.05 0.0 0.03 0.02 0.04
-0.08 -0.05 -0.01 0.02 0.06 0.04
-0.03 -0.01 -0.01 0.0 0.04 0.01
-0.12 -0.01 -0.11 0.09 0.06 0.06
-0.06 -0.01 -0.03 0.01 0.06 0.02
-0.01 -0.04 0.0 0.02 0.02 0.0
-0.03 -0.05 -0.02 0.02 0.03 0.05
-0.1 -0.1 -0.01 0.03 0.07 0.09
-0.06 -0.03 0.0 0.04 0.02 0.02
-0.11 -0.08 0.02 0.09 0.07 -0.0
-0.01 -0.02 -0.02 0.01 0.01 0.03
-0.08 -0.04 0.0 0.05 0.04 0.02
-0.11 -0.08 0.0 0.06 0.07 0.05
-0.01 -0.02 0.0 0.0 0.02 0.01
-0.09 -0.03 0.03 0.07 0.03 -0.0
-0.04 -0.02 -0.01 0.02 0.02 0.03
-0.08 -0.01 0.0 0.03 0.04 0.01

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.