Heatmap: Cluster_116 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.04 0.01 0.02 0.04 -0.02 -0.02
-0.01 -0.0 0.01 -0.01 0.02 0.01
-0.06 0.06 0.02 -0.0 -0.0 -0.02
-0.02 -0.01 0.0 -0.0 0.03 0.0
-0.05 0.03 -0.0 -0.0 0.02 0.01
-0.03 -0.02 -0.0 0.03 0.01 0.01
-0.0 -0.02 0.02 -0.03 0.04 -0.01
0.01 -0.02 0.02 0.0 -0.01 0.0
-0.02 0.0 -0.01 -0.02 0.03 0.01
-0.01 0.01 0.01 -0.01 0.0 0.01
-0.03 0.02 -0.0 -0.01 0.01 0.0
-0.02 -0.01 0.02 0.02 -0.01 -0.01
-0.01 -0.03 -0.01 0.03 0.0 0.01
-0.01 0.01 -0.0 0.02 -0.01 -0.0
-0.03 -0.03 0.06 0.02 0.01 -0.04
0.0 -0.01 0.0 -0.02 0.0 0.02
-0.02 -0.01 0.0 0.01 0.01 0.0
-0.03 0.01 0.01 -0.0 0.01 0.0
-0.0 -0.01 0.02 -0.02 -0.01 0.02
-0.02 -0.01 -0.0 -0.01 0.03 0.0
-0.02 -0.03 0.02 -0.01 0.04 -0.01
-0.05 -0.03 0.02 0.05 0.03 -0.01
0.0 0.0 0.0 -0.01 -0.02 0.02
-0.0 -0.0 0.0 0.01 0.0 -0.01
-0.03 -0.02 0.02 0.01 0.02 -0.01
-0.03 -0.04 0.01 0.05 0.0 0.01
-0.03 0.01 0.04 -0.03 0.02 -0.0
-0.07 -0.03 0.04 0.01 0.02 0.02
-0.04 -0.02 0.03 0.02 0.03 -0.02
-0.01 -0.03 -0.0 -0.0 0.04 0.0
-0.03 0.0 0.02 0.03 -0.0 -0.02
-0.04 0.03 0.02 -0.0 -0.01 0.0
-0.09 0.08 0.03 0.03 -0.02 -0.04
-0.03 -0.03 0.01 0.02 0.03 -0.0
-0.04 0.03 0.0 -0.02 0.03 -0.0
-0.06 -0.0 0.03 0.03 0.02 -0.02
0.0 -0.04 0.01 0.02 0.03 -0.02
0.0 0.01 -0.01 -0.04 0.01 0.03
-0.03 -0.02 0.03 -0.0 0.03 -0.01
-0.06 -0.07 0.01 0.09 0.01 0.01
-0.04 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0
-0.01 -0.01 0.01 0.02 0.0 -0.02
-0.02 -0.01 0.02 0.02 0.0 -0.0
-0.03 -0.0 0.01 -0.01 0.03 -0.0
-0.02 0.01 0.02 -0.0 0.01 -0.02
-0.03 0.05 0.02 -0.01 0.02 -0.06
-0.02 -0.0 0.01 0.02 -0.0 -0.01
-0.05 0.01 -0.0 -0.01 0.03 0.02
-0.04 -0.03 0.04 0.01 0.02 -0.0
-0.04 0.0 0.01 -0.0 0.01 0.02
-0.05 -0.03 0.01 -0.01 0.04 0.05
-0.04 -0.0 -0.01 0.01 0.02 0.02
-0.03 0.01 0.02 -0.03 0.02 0.01
-0.02 -0.01 0.01 -0.01 0.04 -0.0
-0.06 -0.0 0.05 -0.0 0.04 -0.03
-0.02 0.03 -0.0 -0.01 0.01 -0.01
-0.01 0.0 0.03 -0.0 -0.0 -0.01
-0.02 -0.01 0.01 -0.01 0.03 0.0
-0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01
-0.01 -0.01 0.02 0.0 0.01 -0.02
-0.04 -0.04 0.06 0.0 0.02 -0.0
-0.09 -0.05 0.04 0.04 0.02 0.04
-0.03 -0.03 0.0 0.05 0.01 -0.01
0.01 -0.01 -0.01 -0.01 0.01 0.01
-0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 -0.04
-0.02 -0.01 0.07 0.0 -0.02 -0.02
0.0 0.01 -0.0 -0.04 0.0 0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.