Heatmap: Cluster_116 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	4 h after light	8 h after light	12 h after light	4 h after dark	8 h after dark	12 h after dark
At1g03470	-0.04	0.01	0.02	0.04	-0.02	-0.02
At1g07860	-0.01	-0.0	0.01	-0.01	0.02	0.01
At1g09320	-0.06	0.06	0.02	-0.0	-0.0	-0.02
At1g10910	-0.02	-0.01	0.0	-0.0	0.03	0.0
At1g23750	-0.05	0.03	-0.0	-0.0	0.02	0.01
At1g25380	-0.03	-0.02	-0.0	0.03	0.01	0.01
At1g33320	-0.0	-0.02	0.02	-0.03	0.04	-0.01
At1g35820	0.01	-0.02	0.02	0.0	-0.01	0.0
At1g49390	-0.02	0.0	-0.01	-0.02	0.03	0.01
At1g54080	-0.01	0.01	0.01	-0.01	0.0	0.01
At1g55510	-0.03	0.02	-0.0	-0.01	0.01	0.0
At1g63190	-0.02	-0.01	0.02	0.02	-0.01	-0.01
At1g68160	-0.01	-0.03	-0.01	0.03	0.0	0.01
At1g70920	-0.01	0.01	-0.0	0.02	-0.01	-0.0
At1g76380	-0.03	-0.03	0.06	0.02	0.01	-0.04
At2g03240	0.0	-0.01	0.0	-0.02	0.0	0.02
At2g16620	-0.02	-0.01	0.0	0.01	0.01	0.0
At2g17530	-0.03	0.01	0.01	-0.0	0.01	0.0
At2g17900	-0.0	-0.01	0.02	-0.02	-0.01	0.02
At2g20030	-0.02	-0.01	-0.0	-0.01	0.03	0.0
At2g21030	-0.02	-0.03	0.02	-0.01	0.04	-0.01
At2g22510	-0.05	-0.03	0.02	0.05	0.03	-0.01
At2g22960	0.0	0.0	0.0	-0.01	-0.02	0.02
At2g24340	-0.0	-0.0	0.0	0.01	0.0	-0.01
At2g27010	-0.03	-0.02	0.02	0.01	0.02	-0.01
At2g27240	-0.03	-0.04	0.01	0.05	0.0	0.01
At2g28160	-0.03	0.01	0.04	-0.03	0.02	-0.0
At2g33170	-0.07	-0.03	0.04	0.01	0.02	0.02
At2g39690	-0.04	-0.02	0.03	0.02	0.03	-0.02
At2g45890	-0.01	-0.03	-0.0	-0.0	0.04	0.0
At2g46375	-0.03	0.0	0.02	0.03	-0.0	-0.02
At2g48140	-0.04	0.03	0.02	-0.0	-0.01	0.0
At3g05980	-0.09	0.08	0.03	0.03	-0.02	-0.04
At3g06810	-0.03	-0.03	0.01	0.02	0.03	-0.0
At3g09040	-0.04	0.03	0.0	-0.02	0.03	-0.0
At3g12060	-0.06	-0.0	0.03	0.03	0.02	-0.02
At3g16880	0.0	-0.04	0.01	0.02	0.03	-0.02
At3g17380	0.0	0.01	-0.01	-0.04	0.01	0.03
At3g25060	-0.03	-0.02	0.03	-0.0	0.03	-0.01
At3g26690	-0.06	-0.07	0.01	0.09	0.01	0.01
At3g28120	-0.04	0.0	0.02	0.01	0.01	0.0
At3g29390	-0.01	-0.01	0.01	0.02	0.0	-0.02
At3g45580	-0.02	-0.01	0.02	0.02	0.0	-0.0
At3g51180	-0.03	-0.0	0.01	-0.01	0.03	-0.0
At3g54100	-0.02	0.01	0.02	-0.0	0.01	-0.02
At3g60200	-0.03	0.05	0.02	-0.01	0.02	-0.06
At4g08690	-0.02	-0.0	0.01	0.02	-0.0	-0.01
At4g10730	-0.05	0.01	-0.0	-0.01	0.03	0.02
At4g14290	-0.04	-0.03	0.04	0.01	0.02	-0.0
At4g23440	-0.04	0.0	0.01	-0.0	0.01	0.02
At4g26000	-0.05	-0.03	0.01	-0.01	0.04	0.05
At4g29790	-0.04	-0.0	-0.01	0.01	0.02	0.02
At4g37110	-0.03	0.01	0.02	-0.03	0.02	0.01
At4g37940	-0.02	-0.01	0.01	-0.01	0.04	-0.0
At5g01200	-0.06	-0.0	0.05	-0.0	0.04	-0.03
At5g11350	-0.02	0.03	-0.0	-0.01	0.01	-0.01
At5g15570	-0.01	0.0	0.03	-0.0	-0.0	-0.01
At5g27630	-0.02	-0.01	0.01	-0.01	0.03	0.0
At5g36230	-0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
At5g44650	-0.01	-0.01	0.02	0.0	0.01	-0.02
At5g47800	-0.04	-0.04	0.06	0.0	0.02	-0.0
At5g48500	-0.09	-0.05	0.04	0.04	0.02	0.04
At5g48710	-0.03	-0.03	0.0	0.05	0.01	-0.01
At5g52720	0.01	-0.01	-0.01	-0.01	0.01	0.01
At5g64010	-0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	-0.04
At5g65080	-0.02	-0.01	0.07	0.0	-0.02	-0.02
At5g67050	0.0	0.01	-0.0	-0.04	0.0	0.03

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.