Heatmap: Cluster_2 (HCCA clusters)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	4 h after light	8 h after light	12 h after light	4 h after dark	8 h after dark	12 h after dark
At1g01740	0.06	0.02	-0.03	0.0	-0.04	-0.02
At1g02940	0.0	0.01	-0.03	0.03	-0.01	0.0
At1g06620	-0.04	0.0	-0.0	0.05	0.0	-0.01
At1g06640	-0.03	-0.02	0.0	0.02	0.03	-0.01
At1g07300	0.0	-0.04	0.02	0.0	-0.0	0.01
At1g08090	-0.02	-0.0	-0.03	-0.01	0.03	0.03
At1g09640	0.0	0.0	-0.0	-0.0	-0.01	0.0
At1g10140	-0.02	0.05	-0.06	0.0	-0.02	0.04
At1g10530	0.02	0.02	0.01	-0.02	-0.01	-0.02
At1g10585	-0.01	-0.02	-0.04	0.09	0.0	-0.03
At1g11440	0.02	0.01	-0.0	-0.03	0.0	0.01
At1g11580	0.05	-0.06	-0.0	0.0	0.0	0.01
At1g13340	0.05	-0.04	-0.06	0.01	0.02	0.02
At1g13670	-0.02	-0.0	-0.01	-0.0	0.01	0.03
At1g14250	0.11	0.11	0.06	-0.06	-0.08	-0.16
At1g14890	0.01	-0.01	-0.03	0.01	-0.01	0.03
At1g16080	0.01	-0.03	-0.0	0.01	0.02	-0.01
At1g20350	0.01	0.01	0.01	-0.01	-0.02	-0.0
At1g20760	-0.01	-0.0	-0.02	0.0	0.01	0.02
At1g22340	0.03	0.03	-0.02	-0.02	-0.02	0.01
At1g23850	0.02	-0.0	-0.04	0.01	-0.02	0.03
At1g24575	0.01	0.02	0.02	0.02	-0.03	-0.05
At1g26730	0.02	0.04	0.01	0.01	-0.02	-0.06
At1g27130	-0.01	0.02	-0.0	-0.01	0.0	0.0
At1g28200	-0.0	0.01	-0.01	0.01	-0.02	0.01
At1g30160	-0.0	-0.02	0.0	0.03	-0.04	0.02
At1g31820	0.04	-0.06	-0.04	0.02	-0.01	0.05
At1g43160	-0.0	0.02	-0.01	0.07	-0.0	-0.09
At1g44350	0.03	0.0	-0.01	-0.04	-0.02	0.04
At1g45616	0.01	-0.02	0.0	0.01	-0.02	0.02
At1g52040	-0.03	0.03	0.08	0.04	-0.02	-0.11
At1g54020	-0.0	0.03	0.02	0.07	-0.04	-0.08
At1g61700	-0.0	0.02	0.01	-0.01	-0.03	0.01
At1g62660	-0.02	-0.05	-0.02	0.01	0.06	0.02
At1g64200	0.06	0.02	0.05	-0.05	-0.05	-0.03
At1g64770	0.01	-0.03	0.01	0.02	0.01	-0.02
At1g65450	0.03	0.02	-0.01	-0.01	-0.01	-0.01
At1g65720	0.0	0.0	0.0	-0.0	-0.01	0.01
At1g67865	-0.01	-0.0	-0.0	0.01	0.01	-0.0
At1g69410	0.02	0.0	0.0	0.0	-0.01	-0.01
At1g69450	0.03	0.03	-0.02	-0.01	-0.02	-0.01
At1g70140	-0.01	-0.02	-0.05	0.03	0.02	0.03
At1g70360	-0.03	0.03	-0.01	0.01	-0.01	0.01
At1g70670	0.02	-0.0	0.0	-0.01	-0.02	0.01
At1g70700	0.02	-0.12	0.01	-0.04	0.06	0.06
At1g71140	0.08	0.03	-0.04	-0.03	-0.02	-0.03
At1g72260	0.03	-0.0	-0.05	0.0	0.02	0.01
At1g72940	0.03	-0.1	-0.01	-0.01	0.02	0.06
At1g73830	0.11	-0.07	-0.24	0.03	-0.04	0.18
At1g74420	-0.01	-0.02	-0.02	0.02	0.02	0.01
At1g75950	-0.0	0.0	0.0	0.01	-0.01	-0.0
At1g76370	-0.01	0.01	0.01	-0.0	-0.0	-0.0
At1g76670	0.0	-0.02	-0.01	0.03	0.0	0.01
At1g77370	-0.01	-0.01	0.0	-0.0	-0.01	0.02
At1g78980	0.02	-0.01	-0.02	0.01	0.01	-0.02
At2g02120	-0.02	0.04	-0.02	0.02	-0.03	0.0
At2g02990	0.05	0.03	0.02	0.04	-0.06	-0.09
At2g03980	-0.02	-0.04	0.01	-0.02	0.03	0.04
At2g04040	0.02	-0.01	-0.0	-0.0	-0.01	0.0
At2g18690	0.01	-0.0	-0.04	0.03	0.0	-0.01
At2g19970	-0.02	0.01	-0.0	-0.01	0.0	0.02
At2g19990	-0.01	0.02	-0.0	-0.0	-0.04	0.03
At2g22860	0.01	0.05	0.03	0.02	-0.05	-0.05
At2g22930	0.05	0.03	0.01	-0.03	-0.02	-0.04
At2g23830	0.01	-0.02	-0.02	-0.0	0.01	0.03
At2g23960	0.03	0.0	0.01	-0.02	-0.01	-0.03
At2g26020	0.0	0.04	-0.09	0.01	-0.01	0.04
At2g26530	-0.04	0.03	-0.08	0.05	0.01	0.02
At2g28190	-0.01	-0.02	0.01	-0.01	0.02	0.01
At2g28510	0.05	0.0	-0.01	0.01	-0.02	-0.03
At2g29350	0.05	0.04	-0.07	0.02	-0.02	-0.02
At2g29420	-0.01	-0.03	0.02	-0.01	0.01	0.02
At2g30550	0.01	-0.03	0.01	-0.0	0.01	0.0
At2g31370	0.02	-0.01	-0.01	-0.02	0.01	0.01
At2g31450	-0.0	-0.04	-0.02	0.02	0.02	0.02
At2g31590	0.0	0.01	-0.0	-0.01	0.01	-0.0
At2g33010	0.03	-0.0	-0.02	0.01	0.0	-0.03
At2g33710	0.02	-0.01	-0.01	-0.02	0.0	0.01
At2g34360	-0.0	-0.03	-0.01	0.01	0.02	0.01
At2g34810	0.04	0.05	0.09	-0.02	-0.08	-0.08
At2g37760	0.05	-0.09	0.05	0.0	-0.05	0.03
At2g38400	-0.0	0.04	0.01	-0.02	-0.03	0.01
At2g39030	0.07	0.12	0.03	-0.04	-0.09	-0.1
At2g39050	0.02	0.04	0.08	-0.05	-0.05	-0.05
At2g39330	0.07	0.04	0.02	0.02	-0.02	-0.14
At2g39420	0.02	-0.0	0.04	0.02	-0.0	-0.07
At2g42610	-0.03	0.0	0.0	-0.0	0.01	0.01
At2g43510	-0.01	0.05	0.03	-0.02	-0.01	-0.04
At2g44080	0.06	-0.06	-0.15	0.06	-0.02	0.11
At2g46600	0.02	0.0	0.0	0.05	-0.02	-0.05
At3g02050	0.03	0.01	-0.01	-0.02	-0.01	0.0
At3g02550	-0.02	-0.0	-0.0	-0.03	0.01	0.04
At3g04720	-0.02	0.02	0.01	0.01	-0.01	0.0
At3g05890	0.02	0.01	-0.05	-0.02	0.02	0.02
At3g08690	0.01	0.01	0.01	-0.0	-0.01	-0.0
At3g09520	0.0	-0.04	-0.0	-0.03	0.04	0.03
At3g10250	0.0	0.0	-0.04	-0.02	-0.0	0.06
At3g12500	0.03	-0.04	-0.01	-0.01	0.02	0.01
At3g15351	0.0	-0.03	-0.03	0.02	0.02	0.02
At3g15580	-0.01	-0.0	-0.01	0.02	0.02	-0.01
At3g16390	0.01	0.02	-0.01	-0.0	-0.01	-0.01
At3g16450	0.01	-0.0	-0.06	-0.01	0.0	0.06
At3g16460	0.01	0.03	0.0	0.01	-0.06	0.02
At3g16770	-0.01	-0.03	-0.06	-0.02	0.01	0.1
At3g18280	0.02	-0.02	0.0	0.01	-0.01	-0.0
At3g19690	0.02	0.02	-0.02	-0.01	-0.03	0.02
At3g20390	-0.01	-0.0	-0.0	0.02	0.0	-0.01
At3g21080	-0.0	0.02	-0.04	0.03	-0.01	0.0
At3g22260	0.01	-0.02	-0.02	0.02	-0.01	0.02
At3g23570	0.04	0.02	0.0	-0.02	-0.01	-0.03
At3g24330	0.02	0.0	-0.01	-0.01	-0.01	0.01
At3g28500	0.01	-0.01	-0.01	0.01	-0.0	0.0
At3g29035	-0.01	0.02	-0.06	-0.02	0.02	0.04
At3g29810	0.01	-0.04	-0.03	0.05	-0.01	0.01
At3g43270	0.0	-0.0	0.01	0.02	-0.01	-0.02
At3g44320	0.02	-0.01	0.01	0.01	-0.03	-0.0
At3g48520	0.02	-0.04	0.06	0.03	-0.02	-0.05
At3g50350	0.03	-0.0	-0.02	-0.0	-0.01	0.01
At3g51860	0.04	-0.09	-0.05	0.05	0.0	0.04
At3g51960	-0.01	0.04	0.01	-0.04	-0.03	0.03
At3g52160	0.02	0.0	-0.0	0.0	-0.0	-0.02
At3g54000	0.02	0.0	-0.02	0.02	-0.01	-0.02
At3g55310	0.02	0.01	0.02	-0.02	-0.01	-0.03
At3g57920	0.02	-0.01	0.01	0.0	-0.02	-0.01
At3g62560	0.0	-0.01	-0.01	0.0	0.01	0.01
At4g01010	0.02	-0.04	-0.01	0.02	-0.0	0.01
At4g01510	0.03	0.04	-0.02	0.01	-0.05	-0.01
At4g02075	0.02	-0.06	-0.04	0.01	0.01	0.06
At4g02080	-0.01	-0.02	0.01	-0.0	0.02	0.02
At4g03500	0.05	0.01	-0.03	-0.0	-0.01	-0.02
At4g04830	-0.0	-0.03	-0.04	0.05	0.02	0.0
At4g11960	0.01	-0.01	-0.0	-0.03	0.03	0.0
At4g12470	-0.03	0.09	-0.02	-0.04	-0.05	0.04
At4g12480	-0.01	0.05	-0.0	0.03	-0.06	-0.02
At4g12490	0.01	0.04	-0.0	0.01	-0.04	-0.02
At4g12500	0.01	0.04	0.02	-0.01	-0.04	-0.02
At4g13070	0.0	0.01	0.04	0.0	-0.05	-0.01
At4g13195	0.0	0.0	0.0	-0.03	0.04	-0.02
At4g13230	0.02	0.01	0.01	-0.03	-0.0	-0.01
At4g15210	0.19	0.1	0.23	-0.09	-0.19	-0.32
At4g16260	0.02	0.06	-0.01	-0.01	-0.04	-0.02
At4g17470	-0.09	0.12	0.1	0.01	0.0	-0.17
At4g18010	0.05	-0.03	-0.07	-0.02	0.05	0.01
At4g20860	0.05	-0.07	-0.06	-0.02	-0.01	0.1
At4g22270	-0.02	0.03	0.01	-0.05	0.03	-0.0
At4g22710	0.03	0.03	-0.03	0.03	-0.02	-0.04
At4g22790	-0.02	-0.0	0.01	-0.02	0.02	0.0
At4g22950	0.01	-0.03	0.01	-0.0	-0.0	0.02
At4g23930	-0.04	-0.01	0.02	0.01	0.03	-0.01
At4g24950	-0.01	0.02	-0.03	0.03	-0.01	0.0
At4g25020	-0.0	-0.06	0.01	0.01	0.0	0.03
At4g29350	0.01	-0.01	-0.01	-0.0	0.01	0.01
At4g31030	-0.01	0.01	-0.02	0.02	-0.0	0.0
At4g31930	-0.0	-0.02	-0.01	0.02	-0.0	0.01
At4g32650	-0.03	-0.01	-0.0	-0.01	0.03	0.02
At4g32940	0.0	0.09	0.01	-0.06	-0.02	-0.03
At4g33560	0.0	-0.02	-0.02	0.01	-0.02	0.05
At4g34230	0.01	0.01	0.01	-0.03	-0.01	-0.0
At4g35970	-0.0	0.0	-0.02	-0.02	0.0	0.04
At4g37410	-0.02	0.04	0.03	0.06	-0.0	-0.11
At4g37430	0.04	-0.07	-0.05	0.06	-0.02	0.03
At5g01470	-0.01	0.01	-0.01	-0.03	0.02	0.02
At5g01940	-0.02	0.03	-0.02	0.03	-0.02	-0.01
At5g02540	0.06	-0.04	-0.05	0.01	-0.04	0.05
At5g03170	-0.01	-0.01	0.01	-0.02	0.02	0.01
At5g05600	0.04	0.03	0.02	0.0	-0.04	-0.05
At5g06330	0.0	-0.02	0.01	0.01	-0.03	0.02
At5g06870	0.01	0.06	-0.09	0.02	0.01	-0.02
At5g07010	0.04	0.07	-0.01	0.01	-0.07	-0.05
At5g07100	0.0	0.05	-0.04	-0.04	-0.02	0.05
At5g07250	0.02	0.0	-0.01	-0.01	-0.02	0.01
At5g07390	0.01	0.01	-0.01	0.01	-0.01	-0.01
At5g10430	0.02	0.01	-0.02	-0.02	-0.01	0.04
At5g11840	0.02	0.01	-0.02	-0.01	-0.01	0.0
At5g12060	0.02	0.03	0.01	-0.02	-0.01	-0.02
At5g13190	0.0	-0.03	-0.03	0.03	0.01	0.02
At5g13220	0.03	0.01	0.04	-0.02	0.0	-0.06
At5g13380	-0.0	-0.02	-0.01	-0.01	0.02	0.02
At5g13550	-0.03	-0.09	-0.02	0.11	0.02	-0.0
At5g14860	0.0	0.01	-0.02	0.02	-0.0	-0.01
At5g16010	0.01	0.01	0.0	-0.01	-0.01	-0.0
At5g16580	0.04	-0.0	-0.0	0.0	0.0	-0.04
At5g17040	-0.0	-0.05	0.02	-0.02	0.01	0.03
At5g20230	0.0	0.04	-0.03	0.08	-0.05	-0.05
At5g20820	0.02	-0.01	-0.04	-0.02	0.01	0.05
At5g21105	0.01	-0.03	-0.01	-0.01	-0.01	0.04
At5g23820	-0.01	0.04	0.01	-0.02	-0.01	-0.02
At5g23830	0.02	0.0	-0.02	0.0	0.01	-0.02
At5g24160	0.07	0.02	0.1	-0.07	-0.07	-0.05
At5g24420	0.08	0.06	-0.07	-0.04	-0.04	0.01
At5g24780	0.08	0.14	0.12	-0.01	-0.07	-0.31
At5g35480	0.03	0.0	-0.15	-0.07	0.07	0.1
At5g38130	0.04	0.01	0.01	-0.02	-0.02	-0.02
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.