Heatmap: Cluster_1 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.04 -0.0 -0.03 -0.02 -0.01 0.02
0.02 -0.0 -0.01 -0.01 -0.03 0.03
0.01 0.02 0.0 -0.01 -0.02 0.0
0.01 0.01 -0.05 0.02 -0.01 0.03
0.04 -0.02 -0.11 0.01 -0.01 0.08
0.02 0.02 -0.04 0.01 -0.0 -0.0
0.07 -0.04 -0.14 0.03 0.0 0.07
0.01 -0.01 -0.03 0.01 0.01 0.01
0.04 -0.02 -0.16 0.0 -0.03 0.15
0.01 0.0 -0.0 0.0 -0.01 0.0
0.05 0.02 -0.09 -0.0 -0.04 0.06
0.06 -0.0 -0.05 -0.04 0.01 0.02
0.04 0.02 -0.0 -0.03 -0.01 -0.02
0.05 -0.02 -0.04 -0.03 -0.0 0.04
0.04 0.04 -0.03 -0.02 -0.03 0.0
0.04 -0.01 -0.03 -0.02 -0.0 0.03
0.07 -0.0 -0.05 -0.04 -0.03 0.04
0.05 -0.02 -0.07 0.01 -0.0 0.04
0.1 -0.05 -0.06 -0.03 -0.03 0.06
0.01 -0.0 -0.02 -0.0 -0.01 0.02
0.03 -0.0 -0.03 -0.02 -0.0 0.02
0.09 -0.04 -0.07 -0.05 0.01 0.05
0.0 0.0 0.0 -0.01 -0.01 0.01
0.05 -0.02 -0.09 -0.02 0.03 0.05
0.0 0.01 -0.01 -0.0 -0.0 0.0
0.04 -0.03 -0.05 -0.0 -0.01 0.04
0.02 0.03 -0.03 -0.01 -0.02 0.01
0.01 -0.0 -0.06 0.04 -0.03 0.04
0.1 -0.0 -0.11 -0.02 -0.03 0.05
0.01 0.04 -0.0 -0.02 -0.02 -0.01
0.02 -0.01 -0.06 0.01 -0.01 0.04
0.03 0.08 -0.02 -0.05 -0.04 -0.01
0.04 -0.03 -0.05 -0.01 0.01 0.03
0.04 0.01 -0.05 0.01 -0.02 0.01
0.02 0.01 -0.03 0.0 -0.01 0.01
0.12 -0.02 -0.09 -0.06 -0.03 0.06
0.07 -0.06 -0.18 0.05 0.01 0.09
0.06 -0.07 -0.06 -0.01 0.0 0.08
0.06 -0.03 -0.05 -0.02 0.0 0.04
0.02 -0.01 -0.07 0.01 0.01 0.03
0.04 -0.01 -0.03 -0.01 -0.01 0.02
0.03 0.01 -0.06 -0.01 -0.01 0.04
0.02 0.01 -0.0 -0.0 -0.02 -0.01
0.08 -0.01 -0.07 -0.05 -0.02 0.06
0.05 -0.04 -0.09 0.02 -0.03 0.08
0.03 -0.03 -0.03 -0.02 0.01 0.03
0.06 0.06 -0.02 -0.03 -0.02 -0.05
0.03 -0.04 -0.04 -0.04 0.03 0.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.