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Heatmap: Cluster_17 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.06 0.07 -0.15 -0.05 0.02 0.04
0.07 0.02 -0.11 -0.05 -0.03 0.09
0.01 0.01 -0.05 -0.02 0.03 0.02
0.05 0.08 -0.18 -0.07 0.01 0.09
0.07 -0.15 -0.1 -0.02 0.11 0.06
0.06 -0.04 -0.22 0.01 0.08 0.08
0.06 -0.01 -0.06 -0.01 0.01 0.01
0.02 -0.01 -0.06 -0.01 0.03 0.03
-0.03 -0.07 -0.04 0.04 0.07 0.02
0.03 -0.06 -0.02 0.0 0.02 0.02
0.01 -0.01 -0.05 -0.02 0.04 0.02
0.08 0.05 -0.18 -0.05 0.04 0.05
-0.02 -0.06 -0.06 0.03 0.08 0.02
-0.02 -0.0 -0.14 0.02 0.04 0.08
0.05 0.01 -0.06 -0.04 0.01 0.02
0.06 -0.01 -0.07 0.01 -0.02 0.02
0.01 -0.01 -0.07 0.01 0.03 0.03
0.02 0.02 -0.09 -0.01 0.01 0.04
-0.0 -0.02 -0.04 0.02 0.02 0.01
0.06 -0.03 -0.24 -0.04 0.11 0.11
0.03 0.03 -0.1 -0.04 0.01 0.06
0.0 -0.01 -0.09 0.01 0.03 0.06
0.03 0.01 -0.07 -0.04 0.03 0.04
0.07 -0.03 -0.44 0.04 0.12 0.15
0.04 0.0 -0.09 0.01 0.01 0.03
0.03 0.0 -0.21 0.0 0.06 0.1
0.09 0.05 -0.36 -0.13 0.08 0.2
0.02 0.01 -0.04 -0.02 0.01 0.02
0.05 0.03 -0.18 -0.03 0.03 0.08
0.01 0.0 -0.02 -0.01 -0.0 0.01
0.14 -0.02 -0.1 -0.05 -0.01 0.04
0.16 0.08 -0.29 -0.11 -0.04 0.16
0.02 -0.02 -0.03 0.0 0.02 0.02
0.05 -0.01 -0.07 -0.01 0.02 0.02
0.06 0.01 -0.06 -0.03 0.0 0.02
0.01 0.01 -0.12 0.04 0.03 0.03
0.06 0.0 -0.11 -0.02 0.02 0.04
0.0 -0.05 -0.06 0.02 0.08 0.02
0.03 -0.01 -0.06 0.01 0.02 0.01
0.07 0.02 -0.09 -0.04 0.01 0.02
0.1 0.03 -0.13 -0.05 0.01 0.03
0.01 0.0 -0.04 0.0 0.0 0.03
0.12 0.05 -0.2 -0.08 0.04 0.04
0.08 -0.03 -0.09 -0.01 0.02 0.02
-0.02 0.02 -0.11 -0.01 0.05 0.06
0.05 -0.01 -0.1 -0.0 0.03 0.03
0.06 0.03 -0.14 0.0 0.01 0.02
-0.03 -0.01 -0.23 0.02 0.12 0.11
-0.01 0.02 -0.1 0.02 0.04 0.03
0.05 0.02 -0.09 -0.01 0.02 0.01
-0.06 0.04 -0.39 0.04 0.1 0.19
0.02 -0.04 -0.02 -0.01 0.04 0.01
0.18 0.06 -0.24 -0.02 -0.0 -0.01
0.1 0.02 -0.13 -0.01 0.01 0.01
0.05 0.02 -0.11 -0.02 0.01 0.05
0.1 -0.08 -0.21 -0.01 0.09 0.08
0.05 -0.08 -0.07 -0.0 0.04 0.05
0.18 0.03 -0.22 -0.01 -0.06 0.06
0.03 -0.02 -0.13 -0.03 0.05 0.08
0.1 0.01 -0.16 -0.06 0.03 0.05
0.01 0.0 -0.05 -0.0 0.0 0.04
0.04 -0.03 -0.07 -0.01 0.04 0.03
0.02 -0.06 -0.04 -0.0 0.03 0.05
0.0 -0.01 -0.04 -0.01 0.03 0.02
0.09 -0.09 -0.16 0.02 0.06 0.06
-0.0 -0.04 -0.05 0.04 0.03 0.02
0.03 0.07 -0.18 -0.04 0.02 0.08
0.09 0.03 -0.14 -0.01 -0.03 0.05
0.01 -0.03 -0.03 0.02 0.02 0.0
0.0 -0.01 -0.04 -0.0 0.04 0.01
-0.01 0.0 -0.05 0.01 0.03 0.02

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.