Heatmap: Cluster_9 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
0.09 -0.09 -0.07 -0.08 0.03 0.1
0.03 -0.05 -0.09 -0.06 0.01 0.14
0.13 -0.06 -0.08 -0.1 0.01 0.09
0.13 -0.08 -0.07 -0.1 0.01 0.08
0.19 -0.15 -0.12 -0.24 -0.0 0.26
0.31 -0.04 -0.41 -0.33 0.05 0.27
0.09 -0.06 -0.08 -0.05 0.0 0.09
0.05 -0.02 -0.05 -0.07 0.01 0.07
0.01 -0.0 -0.02 -0.01 -0.0 0.02
0.18 -0.13 -0.15 -0.14 0.01 0.19
0.11 -0.09 -0.22 -0.15 0.06 0.23
0.08 -0.08 -0.09 -0.12 -0.02 0.21
0.07 0.0 -0.05 -0.06 -0.01 0.04
0.11 -0.04 -0.14 -0.11 0.02 0.14
0.03 -0.03 -0.01 -0.03 0.0 0.03
0.04 0.02 -0.03 -0.12 -0.02 0.1
0.02 -0.01 -0.08 -0.07 0.02 0.12
0.06 -0.03 -0.07 -0.02 -0.03 0.09
0.17 -0.02 -0.1 -0.17 -0.03 0.12
0.32 -0.32 -0.34 -0.48 0.08 0.47
0.04 -0.03 -0.05 -0.02 -0.02 0.08
0.19 0.0 -0.15 -0.35 0.04 0.2
0.04 -0.06 -0.04 -0.01 0.02 0.04
0.04 -0.02 -0.08 -0.05 0.01 0.1
0.17 -0.04 -0.11 -0.15 -0.01 0.12
0.22 -0.18 -0.18 -0.27 -0.1 0.39
0.14 -0.02 -0.15 -0.18 0.02 0.15
0.08 -0.21 -0.12 -0.18 0.06 0.29
0.12 0.02 -0.26 -0.21 0.06 0.21
0.03 -0.04 -0.04 -0.05 0.0 0.09
0.07 -0.03 -0.09 -0.07 0.04 0.08
0.07 -0.13 -0.15 -0.15 0.06 0.25
0.21 -0.12 -0.18 -0.16 -0.08 0.27
0.09 -0.12 -0.13 -0.13 -0.1 0.33
0.11 -0.04 -0.08 -0.12 0.02 0.09
0.12 -0.08 -0.14 -0.13 -0.03 0.21
0.07 -0.03 -0.12 -0.04 -0.03 0.13
0.07 -0.03 -0.03 -0.07 -0.03 0.08
0.42 -0.16 -0.28 -0.36 -0.22 0.38
0.05 -0.06 -0.05 -0.04 -0.01 0.1
0.15 -0.19 -0.25 -0.17 0.13 0.25
0.07 -0.06 -0.06 -0.09 -0.01 0.13
0.18 -0.21 -0.13 -0.14 0.08 0.17
0.11 -0.08 -0.1 -0.06 0.01 0.1
0.16 -0.09 -0.16 -0.19 -0.02 0.24
0.04 -0.07 -0.05 -0.05 0.03 0.09
0.29 -0.43 -0.33 -0.42 0.17 0.44
0.06 -0.09 -0.05 -0.03 0.0 0.1
0.04 0.02 -0.03 -0.08 -0.03 0.07
0.15 -0.2 -0.36 -0.24 0.02 0.47
0.22 -0.09 -0.17 -0.4 0.03 0.29
0.04 -0.02 -0.08 -0.05 0.03 0.08
0.09 -0.18 -0.2 -0.22 0.09 0.33
0.15 0.01 -0.23 -0.24 0.05 0.2
0.1 -0.06 -0.12 -0.05 -0.0 0.11
0.21 -0.24 -0.32 -0.38 0.16 0.4
0.05 -0.0 -0.04 -0.05 0.0 0.04
0.07 -0.03 -0.05 -0.07 0.01 0.06
0.05 -0.11 -0.03 -0.1 0.04 0.14
0.04 -0.01 -0.08 -0.07 0.03 0.08
0.13 -0.06 -0.11 -0.1 0.01 0.11
0.0 -0.02 -0.06 -0.04 0.0 0.11
0.1 -0.09 -0.09 -0.08 0.05 0.1
0.13 -0.35 -0.4 -0.22 0.11 0.52
0.1 -0.12 -0.14 -0.09 0.05 0.16
0.09 -0.04 -0.07 -0.09 0.03 0.06
0.32 -0.53 -0.59 -0.6 0.24 0.63
0.08 -0.16 -0.13 -0.12 0.09 0.2
0.19 0.04 -0.14 -0.23 -0.02 0.12
0.29 -0.59 -0.57 -0.48 0.26 0.61
0.03 -0.04 -0.05 -0.05 0.02 0.09
0.09 -0.01 -0.12 -0.02 -0.06 0.11
0.08 -0.02 -0.17 -0.03 -0.05 0.16
0.07 0.01 -0.06 -0.1 0.01 0.07
0.08 -0.0 -0.08 -0.08 0.01 0.06
0.13 -0.07 -0.05 -0.17 -0.02 0.14
0.12 -0.08 -0.05 -0.11 0.0 0.09
0.18 -0.01 -0.11 -0.2 -0.08 0.17
0.48 -0.17 -0.45 -0.46 -0.26 0.5
0.03 -0.0 -0.03 -0.04 -0.02 0.05
0.05 0.02 -0.08 -0.05 -0.03 0.09
0.11 -0.09 -0.09 -0.13 0.02 0.15
0.04 -0.02 -0.17 -0.11 -0.02 0.25
0.13 -0.05 -0.11 -0.08 0.02 0.08
0.08 -0.0 -0.11 -0.08 0.02 0.09
0.02 0.01 -0.08 -0.03 -0.02 0.09
0.01 -0.04 -0.12 -0.05 0.04 0.15
0.1 -0.16 -0.09 -0.08 0.05 0.15
0.11 -0.13 -0.13 -0.12 0.07 0.16
0.08 -0.31 -0.35 -0.24 0.14 0.49
0.14 -0.33 -0.15 -0.33 0.08 0.43
0.05 -0.06 -0.08 -0.05 0.01 0.12
0.22 0.01 -0.28 -0.24 -0.04 0.25
0.04 0.03 -0.04 -0.06 -0.04 0.06
0.13 -0.1 -0.14 -0.05 0.02 0.12
0.11 -0.04 -0.06 -0.15 -0.03 0.14
0.17 -0.09 -0.13 -0.1 0.01 0.1
0.08 -0.02 -0.06 -0.09 -0.01 0.09
0.05 0.03 -0.02 -0.11 -0.02 0.07
0.38 -0.14 -0.49 -0.5 -0.12 0.54
0.04 -0.0 -0.04 -0.04 0.0 0.04
0.06 0.02 -0.08 -0.08 0.03 0.05
0.14 -0.11 -0.16 -0.2 0.02 0.26
0.0 -0.05 -0.04 -0.04 0.03 0.08
0.11 -0.18 -0.09 -0.17 0.02 0.26
0.04 -0.02 -0.06 -0.08 0.03 0.08
0.07 -0.03 -0.07 -0.08 0.02 0.08
0.11 -0.07 -0.09 -0.06 -0.02 0.12
0.1 -0.06 -0.07 -0.09 -0.01 0.13
0.05 -0.02 -0.07 -0.05 0.01 0.07
0.2 -0.0 -0.2 -0.14 0.01 0.08
0.15 -0.14 -0.05 -0.12 -0.04 0.17
0.05 -0.02 -0.06 -0.05 0.03 0.04
0.08 -0.1 -0.08 -0.08 0.05 0.12
0.03 -0.04 -0.02 -0.03 -0.02 0.07
0.01 -0.01 -0.04 -0.02 0.01 0.04
0.03 -0.05 -0.04 -0.04 0.02 0.09
0.06 -0.09 -0.03 -0.06 0.01 0.11
0.11 -0.05 -0.0 -0.21 -0.04 0.17
0.09 -0.01 -0.13 -0.09 0.03 0.09
0.06 -0.01 -0.07 -0.1 0.03 0.08
0.03 -0.03 -0.08 -0.05 -0.0 0.13
0.13 -0.06 -0.12 -0.18 0.03 0.16
0.23 0.01 -0.21 -0.21 -0.09 0.19
0.06 -0.17 -0.18 -0.16 0.07 0.32
0.02 -0.05 -0.02 -0.01 -0.0 0.06
0.18 -0.06 -0.13 -0.22 -0.04 0.21
0.02 -0.06 -0.01 -0.03 0.0 0.07
0.11 0.0 -0.07 -0.12 -0.04 0.11
0.04 -0.11 -0.13 -0.11 -0.03 0.29
0.4 -0.05 -0.35 -0.41 -0.36 0.49
0.12 -0.13 -0.11 -0.08 -0.01 0.18
0.2 -0.02 -0.19 -0.13 -0.15 0.23
0.07 -0.04 -0.04 -0.09 -0.01 0.1
0.06 -0.07 -0.13 -0.06 0.04 0.14
0.09 -0.13 -0.15 -0.1 0.06 0.19
0.09 -0.04 -0.03 -0.1 -0.01 0.08
0.16 -0.16 -0.01 -0.26 0.02 0.2
0.05 -0.04 -0.13 -0.06 -0.02 0.18
0.08 -0.13 -0.06 -0.08 0.05 0.13
0.04 -0.1 -0.11 -0.09 -0.01 0.23
0.08 -0.21 -0.16 -0.16 0.07 0.3
0.34 -0.27 -0.24 -0.41 -0.02 0.39
0.09 -0.04 -0.16 -0.02 -0.02 0.13
0.1 -0.02 -0.11 -0.12 0.01 0.12
0.25 0.04 -0.27 -0.3 0.04 0.16
0.04 -0.09 -0.05 -0.09 0.04 0.14
0.18 -0.01 -0.13 -0.23 -0.03 0.17
0.2 -0.04 -0.17 -0.2 0.03 0.13
0.06 -0.13 -0.02 -0.04 0.01 0.12
0.04 -0.02 -0.03 -0.03 0.01 0.03
0.16 -0.07 -0.14 -0.15 0.0 0.16
0.06 -0.0 -0.06 -0.12 0.02 0.09
0.26 -0.22 -0.24 -0.28 -0.03 0.37
0.03 0.0 -0.04 -0.02 0.0 0.03
0.07 -0.08 -0.08 -0.06 0.03 0.11
0.08 -0.07 -0.07 -0.06 0.03 0.08
0.09 -0.0 -0.11 -0.12 0.02 0.1
0.06 -0.05 -0.08 -0.06 -0.01 0.13
0.07 -0.04 -0.08 -0.08 0.03 0.1
0.21 -0.03 -0.11 -0.12 -0.11 0.13
0.21 -0.09 -0.11 -0.31 0.01 0.23
0.15 -0.07 -0.16 -0.18 0.05 0.17
0.12 -0.06 -0.17 -0.12 0.07 0.12
0.04 0.03 -0.09 -0.08 -0.02 0.1
0.19 0.03 -0.14 -0.24 -0.03 0.13
0.02 -0.07 -0.09 -0.06 0.05 0.14

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.