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Heatmap: Cluster_3 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
4 h after light
8 h after light
12 h after light
4 h after dark
8 h after dark
12 h after dark
-0.03 0.09 0.06 0.02 -0.03 -0.12
-0.0 0.06 0.07 0.03 -0.02 -0.15
-0.07 0.15 0.13 -0.0 -0.06 -0.18
0.0 0.09 0.07 -0.03 -0.05 -0.08
-0.07 0.19 0.14 -0.03 -0.09 -0.16
-0.03 0.07 0.12 0.03 -0.03 -0.18
0.03 0.15 0.15 0.01 -0.1 -0.29
-0.02 0.08 0.06 0.02 -0.03 -0.11
-0.04 0.11 0.05 -0.01 -0.01 -0.11
-0.03 0.28 0.24 -0.05 -0.22 -0.32
-0.01 0.04 0.04 0.02 -0.01 -0.08
-0.16 0.14 0.24 0.03 -0.05 -0.27
-0.03 0.04 0.06 0.01 -0.01 -0.07
-0.04 0.16 0.09 0.01 -0.04 -0.21
-0.03 0.09 0.08 -0.01 -0.03 -0.12
0.01 0.07 0.05 -0.01 -0.04 -0.09
-0.03 0.25 0.11 -0.02 -0.1 -0.26
-0.17 0.51 0.34 -0.04 -0.38 -0.55
0.0 0.15 0.06 -0.01 -0.03 -0.19
-0.01 0.08 0.06 0.01 -0.04 -0.11
-0.02 0.18 0.13 0.01 -0.06 -0.29
-0.03 0.06 0.06 0.02 -0.02 -0.1
-0.03 0.07 0.09 -0.01 -0.03 -0.1
-0.09 0.14 0.11 0.01 -0.03 -0.15
-0.19 0.31 0.17 0.04 -0.14 -0.29
-0.16 0.33 0.23 0.01 -0.11 -0.44
-0.06 0.15 0.08 0.02 -0.04 -0.17
-0.01 0.07 0.07 0.01 -0.04 -0.1
-0.09 0.23 0.16 -0.02 -0.08 -0.26
-0.03 0.2 0.18 -0.01 -0.14 -0.25
0.0 0.05 0.05 0.0 -0.03 -0.08
-0.11 0.11 0.14 0.02 -0.01 -0.17
-0.01 0.04 0.05 0.0 -0.01 -0.09
-0.04 0.04 0.06 0.02 -0.01 -0.09
0.01 0.15 0.02 0.0 -0.04 -0.16
-0.07 0.14 0.09 0.01 -0.04 -0.14
-0.05 0.16 0.1 0.03 -0.07 -0.19
-0.03 0.07 0.08 0.01 -0.05 -0.09
-0.02 0.08 0.08 -0.0 -0.04 -0.11
0.03 0.08 0.11 -0.01 -0.04 -0.2
-0.08 0.17 0.09 0.01 -0.04 -0.18
-0.1 0.4 0.21 0.04 -0.06 -0.73
-0.41 0.38 0.42 -0.01 -0.19 -0.46
0.07 0.13 0.14 -0.04 -0.08 -0.26
-0.04 0.33 0.3 0.02 -0.29 -0.51
0.08 0.27 0.28 0.05 -0.29 -0.56
-0.0 0.17 0.12 -0.04 -0.07 -0.19
-0.03 0.13 0.17 -0.01 -0.05 -0.25
0.02 0.09 0.02 0.0 -0.03 -0.11
-0.0 0.06 0.06 0.01 -0.03 -0.11
-0.0 0.14 0.04 0.02 -0.04 -0.18
-0.02 0.06 0.06 0.01 -0.02 -0.09
-0.03 0.1 0.09 -0.01 -0.04 -0.12
0.01 0.06 0.11 -0.0 -0.05 -0.14
-0.03 0.07 0.05 0.01 0.0 -0.1
0.01 0.2 0.18 -0.05 -0.12 -0.27
-0.01 0.07 0.05 -0.0 -0.04 -0.07
-0.09 0.14 0.14 0.11 0.01 -0.38
0.0 0.18 0.17 0.0 -0.08 -0.34
-0.05 0.07 0.09 0.03 -0.04 -0.12
-0.02 0.14 0.17 0.01 -0.09 -0.25
-0.01 0.22 0.07 0.03 -0.05 -0.3
-0.11 0.24 0.15 0.14 -0.02 -0.51
0.01 0.09 0.07 -0.02 -0.04 -0.12
-0.16 0.22 0.22 0.08 -0.1 -0.35
-0.06 0.13 0.08 -0.02 -0.03 -0.12
-0.01 0.07 0.06 -0.02 -0.03 -0.06
-0.0 0.1 0.11 0.05 -0.06 -0.23
-0.0 0.06 0.03 0.01 -0.03 -0.06
-0.04 0.12 0.06 0.02 -0.05 -0.13
-0.11 0.09 0.12 0.01 -0.01 -0.13
0.01 0.21 0.12 -0.01 -0.07 -0.33
-0.11 0.23 0.14 0.01 -0.05 -0.27
-0.01 0.04 0.05 -0.01 -0.02 -0.05
-0.31 0.35 0.33 0.19 -0.09 -0.77
-0.03 0.04 0.05 0.02 0.0 -0.08
0.02 0.05 0.06 -0.0 -0.05 -0.09
0.01 0.16 0.11 -0.03 -0.07 -0.21
-0.06 0.18 0.08 0.02 -0.08 -0.15
-0.01 0.11 0.13 -0.01 -0.08 -0.16
-0.02 0.09 0.14 -0.0 -0.04 -0.21
-0.11 0.26 0.22 0.05 -0.13 -0.38
0.08 0.29 0.24 -0.01 -0.22 -0.53
-0.12 0.19 0.17 0.01 -0.07 -0.23
-0.12 0.25 0.2 0.03 -0.14 -0.28
-0.12 0.17 0.15 0.0 -0.07 -0.16
-0.04 0.13 0.13 0.05 0.0 -0.32
-0.04 0.15 0.11 0.01 -0.06 -0.2
0.01 0.06 0.04 -0.02 -0.01 -0.08
-0.01 0.05 0.04 0.02 -0.02 -0.08
-0.04 0.11 0.09 0.05 -0.07 -0.17
-0.06 0.14 0.09 0.02 -0.05 -0.16
0.0 0.04 0.03 0.02 -0.01 -0.07
-0.02 0.08 0.08 0.02 -0.04 -0.13
-0.03 0.06 0.05 0.02 -0.01 -0.09
0.0 0.05 0.06 -0.02 -0.04 -0.06
-0.0 0.05 0.05 0.02 0.0 -0.13
-0.04 0.07 0.1 -0.0 -0.01 -0.12
-0.06 0.14 0.08 0.03 -0.03 -0.18
-0.12 0.24 0.18 -0.0 -0.04 -0.34
0.01 0.08 0.07 0.01 -0.03 -0.15
-0.01 0.07 0.07 0.03 -0.02 -0.15
0.01 0.12 0.1 -0.02 -0.09 -0.15
-0.05 0.07 0.09 0.03 -0.02 -0.14
-0.02 0.05 0.03 0.0 -0.0 -0.06
0.0 0.1 0.06 0.04 -0.03 -0.2
-0.0 0.03 0.03 0.01 -0.02 -0.05
0.0 0.11 0.1 0.01 -0.07 -0.18
-0.12 0.15 0.15 0.02 -0.04 -0.2
-0.03 0.15 0.08 0.04 -0.05 -0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.