Heatmap: Cluster_145 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.38 -0.08 -0.16 -0.23 -0.34 0.19 0.15 0.24 -0.0 0.01 0.09 0.31
-6.17 -4.48 -6.91 -7.45 -3.07 0.3 0.6 0.67 0.81 1.14 1.14 0.39
0.2 -2.02 -4.4 -3.19 -0.74 0.79 0.76 0.5 -0.04 0.14 0.6 0.52
-0.43 -0.22 -1.43 -1.35 -1.31 0.23 0.43 0.62 0.83 0.45 0.0 0.04
- -1.08 -0.79 -0.02 -0.37 -0.17 0.14 0.55 0.7 0.89 0.47 -0.2
-0.38 -0.32 -0.86 -1.22 -0.25 0.65 0.31 0.61 0.12 0.14 0.27 -0.17
-1.34 -0.35 -0.77 -0.58 -0.62 0.21 0.35 0.37 0.27 0.16 0.46 0.59
-0.02 -0.34 -1.59 -1.59 -0.59 0.38 0.58 0.33 0.27 0.22 0.15 0.44
-0.23 -0.44 -1.05 -1.25 -0.8 0.23 0.58 0.35 0.54 0.34 0.12 0.24
-3.8 -3.15 -2.57 -3.02 -1.58 0.39 0.82 0.87 0.52 0.56 0.93 0.57
-0.25 -0.19 -0.52 -0.22 -0.36 0.29 0.2 0.08 -0.17 0.06 0.26 0.48
-0.65 -1.49 -4.96 -3.77 -1.16 0.62 0.87 0.82 -0.11 0.4 0.54 0.7
-0.46 -1.14 -0.91 -0.95 -0.51 0.58 0.55 0.41 -0.03 0.07 0.16 0.7
0.07 -0.5 -1.31 -1.43 -1.06 0.36 0.46 0.18 0.45 0.31 0.32 0.43
0.32 -0.02 -0.84 -0.73 -0.5 0.07 0.22 -0.02 0.3 0.17 0.16 0.28
-0.37 -0.22 -0.68 -0.73 -0.73 -0.0 0.26 0.49 0.32 0.35 0.18 0.35
-0.07 0.13 -0.77 -0.62 -0.54 0.21 0.18 -0.18 0.24 0.23 0.32 0.32
0.12 -0.74 -1.26 -0.78 -0.38 0.35 0.36 -0.09 0.08 0.27 0.46 0.49
0.54 0.2 -0.78 -0.84 -0.45 -0.04 0.18 0.11 0.14 -0.05 0.1 0.25
-0.8 -0.26 -0.7 -0.9 -0.5 -0.08 0.12 0.15 0.31 0.51 0.56 0.54
0.24 -0.06 -0.66 -0.38 -0.03 0.38 0.27 0.1 0.17 -0.15 0.08 -0.3
-0.54 -0.49 -1.31 -1.23 -0.98 0.28 0.72 0.63 0.23 0.17 0.37 0.34
0.01 -0.14 -0.81 -0.54 -0.27 0.49 0.46 0.18 0.2 -0.02 -0.01 -0.07
0.17 -0.24 -0.5 -0.84 -0.89 0.14 0.3 0.44 0.24 0.15 0.26 0.05
-0.93 -0.57 -1.08 -1.21 -0.91 0.18 0.33 0.26 0.47 0.43 0.64 0.57
-0.21 -0.32 -0.88 -0.43 -0.44 0.3 0.47 0.36 0.43 0.13 -0.08 0.04
0.09 -1.62 -1.2 -0.66 -0.39 0.61 0.58 -0.02 0.17 0.13 0.13 0.54
-0.23 -0.26 -0.46 -0.58 -0.34 0.07 0.21 -0.04 0.23 0.3 0.18 0.49
-0.19 -0.57 -0.54 -0.17 -0.19 0.21 0.26 0.06 0.09 0.27 0.17 0.28
-1.13 -2.17 -2.98 -1.86 -1.31 0.74 1.15 0.87 -0.31 0.42 -0.85 1.08
0.02 -0.41 -0.71 -0.19 -0.04 0.6 0.34 0.09 0.02 -0.01 -0.07 -0.04
-0.2 -0.73 -1.04 -0.78 -0.6 0.02 -0.05 0.14 0.36 0.5 0.7 0.48
-0.28 -0.54 -0.96 -0.24 -0.42 0.17 0.16 0.09 0.25 0.24 0.44 0.44
0.23 0.32 -3.62 -1.5 -0.98 0.1 0.26 0.2 0.74 0.2 0.37 0.14
0.06 -0.05 -0.69 -0.67 -0.31 0.22 0.14 0.15 0.13 0.25 0.2 0.17
-0.48 -0.67 -0.97 -0.63 -0.63 -0.05 0.3 0.66 0.3 0.44 0.28 0.35
- -0.91 - -0.38 -1.13 0.99 1.05 0.77 0.57 -0.01 0.2 -0.21
0.18 -0.2 -0.95 -0.6 -0.43 0.17 0.19 0.44 0.17 0.17 0.19 0.09
-0.71 -0.76 -1.4 -1.12 -1.11 0.14 0.34 0.73 0.23 0.31 0.47 0.74
-0.24 -0.15 -0.72 -0.62 -0.2 0.57 0.33 0.15 -0.03 -0.05 0.11 0.32
0.19 -0.54 -1.29 -0.72 -0.24 0.67 0.49 0.21 0.01 -0.05 0.15 0.11
-0.61 -1.04 -0.72 -0.48 -0.19 0.22 0.0 -0.15 0.12 0.49 0.54 0.72
-0.59 -0.38 -0.93 -0.69 -0.5 0.13 0.38 0.32 0.29 0.31 0.4 0.36
-1.49 -0.53 -1.13 -1.14 -0.6 0.23 0.58 0.6 0.38 0.37 0.44 0.33
-0.82 -0.38 -0.63 -0.64 -0.19 0.5 0.35 0.59 0.07 0.21 0.16 -0.04
-6.41 -6.58 -5.1 -5.55 -3.7 -0.32 -0.22 0.53 0.98 1.38 1.41 0.6
-0.13 -0.21 -0.52 -0.45 -0.48 0.09 0.14 0.26 0.2 0.28 0.24 0.23
-0.67 -0.76 -1.4 -0.46 -0.35 0.46 0.04 0.47 0.02 0.44 0.61 0.26
0.54 0.07 -0.81 -0.96 -0.77 0.22 0.28 0.48 0.17 -0.09 -0.14 0.11
-2.23 -2.4 -4.07 -1.21 -0.1 0.1 0.38 0.85 0.48 1.17 0.76 -0.63
-0.14 -1.28 -1.0 -0.68 -0.68 0.18 0.09 0.19 0.09 0.44 0.57 0.75
-1.35 -1.86 -1.31 -1.22 -1.6 -0.2 -0.01 0.31 0.71 1.09 0.92 0.5
-1.6 -1.16 -2.2 -2.56 -2.24 0.03 0.57 0.74 0.54 0.68 0.74 0.78
-0.39 -1.2 -1.39 -0.68 -0.46 0.38 0.3 -0.09 0.08 0.37 0.6 0.79
0.04 -0.81 -0.99 -0.58 -0.44 0.32 0.1 -0.01 0.09 0.32 0.43 0.6
-0.74 -2.06 -1.64 -1.01 -0.41 0.3 0.13 0.1 0.08 0.45 0.72 1.09
0.2 -0.14 -0.81 -0.23 -0.31 0.14 -0.13 0.23 -0.2 -0.14 0.41 0.5
0.17 -0.52 -1.75 -1.21 -1.25 0.43 0.6 0.44 0.37 0.15 0.23 0.31
-0.71 -0.33 -0.52 -0.97 -0.74 0.15 0.27 0.08 0.21 0.33 0.53 0.64
-0.17 -0.13 -0.39 -0.25 -0.64 0.31 0.09 0.41 -0.18 0.03 0.15 0.38
-0.2 -0.33 -0.76 -0.78 -0.32 0.18 0.31 0.1 0.17 0.29 0.31 0.41
-0.43 -0.38 -0.77 -0.55 -0.15 0.16 0.41 0.23 0.07 0.11 0.4 0.33
0.22 -0.82 -1.73 -1.39 -0.89 0.26 0.35 0.35 0.6 0.53 0.24 0.2
-0.72 -1.42 -1.85 -1.0 -0.69 0.59 0.75 0.5 -0.1 0.38 0.55 0.41
-0.59 -1.13 -1.93 -1.85 -1.07 0.67 0.61 0.32 0.33 0.56 0.47 0.48
0.02 -0.1 -0.71 -0.49 -0.34 0.22 0.24 0.48 0.14 0.2 0.09 -0.18
-0.54 -0.64 -1.15 -1.49 -0.48 0.16 0.27 0.13 0.58 0.49 0.38 0.61
-0.65 -0.49 -1.52 -1.19 -0.81 0.21 0.12 0.22 0.56 0.51 0.72 0.42
-0.02 -0.07 -0.86 -0.99 -0.52 0.35 0.38 0.35 0.15 0.13 0.15 0.19
-1.57 -0.77 -1.9 -1.41 -0.67 0.34 0.94 0.53 0.38 0.65 0.13 0.27
0.07 -0.49 -1.0 -0.45 -0.22 0.26 0.11 0.02 0.07 0.33 0.36 0.35
-0.35 -0.44 -1.52 -1.15 -0.18 0.47 0.45 0.63 0.17 0.23 0.28 -0.01
0.07 -0.31 -0.66 -0.24 -0.25 0.24 0.12 0.16 -0.15 -0.13 0.33 0.44
-0.68 -0.6 -1.36 -0.9 -0.84 0.37 0.42 0.53 0.3 0.26 0.34 0.55
0.0 -0.34 -1.54 -1.81 -0.62 0.36 0.49 0.46 0.27 0.45 0.43 -0.08
0.27 -0.18 -0.88 -0.45 -0.44 0.14 0.31 0.08 0.1 0.25 0.08 0.25
-0.64 -1.3 -1.69 -0.96 -0.64 0.29 0.44 0.34 0.17 0.4 0.75 0.6
-0.4 -1.06 -1.16 -0.51 -0.11 0.37 0.32 0.03 0.26 0.22 0.36 0.57
-0.63 -2.8 -2.39 -1.97 -0.91 0.59 0.47 0.42 0.49 0.33 0.57 0.9
-0.66 -0.57 -0.84 -0.87 -0.66 0.24 0.31 0.43 0.13 0.47 0.51 0.35
-1.44 -0.15 -0.96 -1.38 -1.71 -0.07 0.29 0.67 0.42 0.49 0.62 0.57
-0.19 -0.46 -1.26 -0.85 -0.85 -0.01 0.15 0.35 0.25 0.52 0.49 0.54
-0.18 -0.33 -1.56 -1.38 -0.93 0.84 0.74 0.51 -0.03 -0.06 0.13 0.22
-0.07 -0.17 -0.62 -0.6 -0.34 0.38 0.33 -0.14 0.03 0.01 0.19 0.5
0.1 -0.11 -0.32 -0.08 -0.13 0.39 0.29 0.09 -0.11 -0.13 -0.06 -0.09
0.03 -0.02 -0.38 -0.12 -0.12 0.19 0.13 0.21 0.05 0.05 0.02 -0.15
0.02 -0.16 -0.8 -0.63 -0.25 0.23 0.0 0.07 0.23 0.19 0.19 0.43
-0.32 -0.22 -0.81 -1.01 -0.84 0.24 0.48 0.63 0.42 0.3 -0.01 0.05
-0.39 -0.38 -2.12 -1.41 -1.82 0.3 0.33 0.25 0.69 0.71 0.57 0.22
-0.81 -0.68 -0.96 -0.37 -0.18 0.54 0.22 0.59 -0.42 0.24 0.47 0.27
-0.08 -0.61 -0.91 -0.65 -0.45 0.5 0.55 0.08 0.3 0.25 0.08 0.11
0.46 0.12 -0.74 -1.02 -0.69 0.38 0.14 0.28 0.43 0.12 -0.01 -0.35
-1.15 -0.48 -1.56 -2.61 -1.82 -0.3 0.4 0.9 0.48 0.55 0.67 0.69
0.26 -0.28 -0.84 -0.94 -0.61 0.44 0.49 0.31 -0.19 -0.19 0.14 0.46
-0.37 -0.16 -0.34 -0.44 -0.28 0.27 0.33 0.02 0.07 0.06 0.19 0.35
-0.33 -0.13 -1.49 -0.86 -0.52 0.08 -0.01 -0.04 0.25 0.36 0.43 0.88
-0.23 -0.32 -0.58 -0.28 -0.06 0.21 0.23 0.5 0.05 -0.03 0.07 0.12
0.33 -0.0 -0.87 -0.8 -0.52 0.19 0.23 0.17 0.34 0.16 0.06 0.09

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.