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Heatmap: Cluster_83 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.49 1.18 0.17 -0.35 -0.62 -0.47 -0.98 -1.33 -0.93 -0.67 -0.29 -0.35
1.24 1.09 -0.56 -1.5 -1.91 -0.54 -0.55 -0.61 0.1 0.05 0.08 0.03
0.96 0.92 -0.57 -0.83 -1.05 -0.45 -0.41 -0.2 -0.18 0.02 0.17 0.08
1.07 1.25 -0.04 -0.37 -0.37 -0.04 -0.57 -1.62 -1.17 -0.67 -0.18 0.11
1.85 1.36 -1.24 -2.84 -2.87 -1.04 -0.87 -0.8 -0.57 -0.39 0.06 0.05
1.68 1.85 -0.43 -2.4 -2.62 -0.93 -0.79 -0.93 -0.49 -0.42 -0.54 -1.65
0.84 0.84 -0.33 -0.83 -1.06 -0.41 -0.39 -0.43 0.01 0.06 0.23 0.14
1.13 1.2 -0.31 -0.92 -1.67 -0.71 -0.73 -0.5 -0.8 -0.23 0.16 0.48
1.24 0.95 -0.19 -0.96 -0.89 -0.12 -0.65 -0.75 -0.23 -0.31 -0.05 -0.02
1.4 1.3 0.13 -0.22 -0.52 -0.45 -0.96 -1.59 -1.72 -1.35 -0.31 0.23
0.88 1.16 -0.33 -1.21 -1.4 -0.63 -0.44 -0.53 0.07 0.04 0.19 0.04
1.17 1.02 -0.68 -1.68 -1.25 -0.3 -0.64 -0.22 -0.24 -0.14 0.12 0.27
1.86 1.17 -0.69 -1.15 -1.89 -1.32 -1.25 -0.96 -0.8 -0.17 -0.02 -0.01
1.03 0.85 -0.93 -1.65 -1.68 -0.84 -0.47 0.17 -0.01 0.19 0.37 0.23
0.81 1.0 0.02 -0.8 -0.76 -0.08 -0.26 -0.53 -0.25 -0.14 -0.12 -0.11
1.47 1.01 -0.82 -1.25 -1.5 -0.61 -0.57 -0.42 -0.29 -0.12 0.12 -0.04
0.63 0.89 -0.25 -0.81 -1.01 -0.47 -0.52 -0.08 0.04 0.0 0.22 0.17
1.04 1.23 -0.05 -0.43 -0.7 -0.08 -0.41 -0.8 -0.66 -0.7 -0.26 -0.11
0.87 0.94 -0.02 -0.53 -0.69 -0.25 -0.49 -0.36 -0.3 -0.05 -0.01 -0.24
1.82 1.33 -0.95 -1.41 -1.56 -0.76 -1.05 -1.37 -1.38 -0.81 0.01 0.39
1.28 1.17 -0.11 -0.3 -0.61 -0.23 -0.84 -1.95 -1.32 -0.51 0.14 0.1
1.44 0.94 -1.01 -1.52 -1.48 -0.54 -0.49 0.09 -0.09 -0.13 -0.03 -0.23
1.29 0.91 0.02 -1.2 -1.65 -0.44 -0.7 -0.26 -0.25 -0.52 0.22 0.02
1.43 1.53 -0.32 -1.13 -1.18 -0.43 -0.87 -1.46 -0.82 -0.43 -0.01 -0.4
1.68 1.09 -0.94 -1.95 -2.0 -0.74 -0.63 -0.59 -0.14 -0.17 0.04 -0.15
1.83 1.83 0.32 -1.66 -3.32 -1.76 -1.06 -1.96 -2.37 -1.32 -2.36 0.48
0.84 1.05 -0.24 -0.75 -1.13 -0.82 -0.87 -0.42 -0.03 0.22 0.26 0.06
1.51 1.54 -0.09 -0.72 -0.93 -0.53 -1.0 -1.73 -1.31 -0.73 -0.37 -0.15
1.34 1.38 0.01 -1.42 -2.02 -1.04 -1.01 -0.54 -0.05 -0.26 -0.09 -0.28
1.44 1.1 0.1 -0.51 -0.84 -0.43 -0.41 -0.71 -0.75 -0.75 -0.43 -0.36
1.85 1.16 -1.1 -1.77 -1.64 -0.75 -0.94 -0.81 -0.76 -0.45 -0.07 0.16
0.93 1.18 -0.43 -1.71 -2.14 -0.41 -0.25 -0.28 -0.15 -0.06 0.22 0.15
0.91 0.7 -0.48 -0.77 -0.63 -0.09 -0.21 -0.19 -0.16 -0.05 -0.04 0.05
2.13 1.77 0.15 -0.63 -1.9 -2.07 -2.47 -2.28 -1.93 -1.51 -1.11 -1.1
1.15 1.03 -0.73 -1.31 -1.31 -0.17 -0.15 -0.38 -0.18 -0.18 0.01 0.02
1.7 1.14 -0.6 -1.39 -2.17 -1.38 -1.34 -0.77 -0.67 -0.12 0.28 0.21
0.84 1.0 -0.86 -1.72 -1.58 -0.46 -0.26 -0.18 -0.05 0.17 0.32 0.31
1.55 1.18 -0.96 -2.24 -2.04 -1.07 -0.85 -0.56 -0.03 0.04 0.21 -0.05
0.74 0.91 -0.25 -0.89 -1.11 -0.46 -0.44 -0.3 -0.06 0.11 0.22 0.17
2.05 2.23 -0.41 -1.76 -1.95 -1.39 -1.87 -3.32 -3.2 -2.69 -1.5 -1.03
1.71 1.16 -0.88 -1.67 -1.55 -0.78 -0.77 -0.72 -0.4 -0.18 0.13 -0.32
1.23 1.26 -0.17 -0.39 -0.71 -0.54 -0.64 -0.49 -0.27 -0.34 -0.3 -0.95
1.45 1.32 -0.22 -0.41 -0.61 0.07 -0.51 -1.86 -1.19 -0.93 -0.62 -0.2
1.61 1.34 0.01 -0.2 -0.78 -0.62 -0.95 -1.48 -1.11 -0.69 -0.35 -0.82
1.65 1.5 -0.08 -1.21 -1.65 -1.02 -1.09 -1.17 -0.51 -0.43 -0.36 -0.55
1.7 1.31 -0.36 -1.06 -1.22 -0.39 -0.54 -0.8 -1.36 -0.92 -0.39 -0.16
0.71 0.77 -0.21 -0.84 -1.06 -0.59 -0.52 -0.27 -0.02 0.1 0.32 0.33
1.54 1.4 -0.01 -1.23 -2.22 -1.12 -1.17 -0.81 -0.6 -0.31 -0.05 -0.14
1.05 0.86 -0.48 -1.15 -0.96 -0.06 -0.15 -0.28 -0.13 -0.1 -0.05 -0.06
1.78 1.32 -0.98 -3.11 -2.47 -1.58 -1.46 -0.78 -0.43 -0.09 0.39 0.01
1.06 0.88 -0.3 -1.02 -0.86 -0.33 -0.47 -0.43 -0.21 -0.0 0.04 0.09
1.45 1.09 -1.17 -1.76 -2.31 -1.11 -0.77 0.23 -0.34 -0.07 0.22 0.11
1.65 1.0 -0.79 -1.4 -1.87 -1.25 -0.78 -0.27 -0.07 0.05 -0.04 -0.23
1.69 1.23 -0.44 -2.02 -2.0 -1.32 -1.15 -0.66 -0.45 -0.15 0.0 0.12
1.2 1.1 -0.46 -0.87 -1.4 -0.76 -0.82 -0.55 -0.27 0.09 0.16 0.09
1.45 1.19 -0.39 -0.91 -1.03 -0.53 -0.74 -0.83 -1.2 -0.6 0.08 0.26
1.44 0.79 -0.91 -1.39 -1.61 -0.62 -0.71 0.17 -0.29 -0.27 0.24 0.13
1.24 1.22 -0.2 -0.87 -1.22 -0.75 -0.78 -0.75 -0.64 -0.36 0.05 0.3
1.22 1.35 0.23 -0.96 -1.48 -0.65 -0.91 -0.93 -0.3 -0.35 -0.24 -0.11
0.9 0.81 -0.06 -0.66 -0.72 -0.16 -0.26 -0.24 -0.34 -0.09 0.02 -0.21
1.0 0.66 -0.06 -0.39 -0.66 -0.17 -0.5 -0.49 -0.25 -0.09 -0.06 0.02
1.35 1.34 -0.29 -0.88 -0.75 -0.14 -0.43 -0.84 -1.22 -0.87 -0.17 -0.18
2.02 1.91 -0.42 -1.38 -1.16 -0.77 -2.5 -2.0 -2.38 -1.46 -1.82 -0.4
1.26 1.01 -1.16 -2.17 -1.87 -0.72 -0.54 0.1 -0.01 0.07 0.15 0.16
0.76 1.08 -0.32 -1.39 -1.78 -0.87 -0.5 -0.39 0.13 0.07 0.33 0.36
1.32 1.23 -0.28 -0.81 -1.0 -0.47 -0.52 -0.44 -0.74 -0.51 -0.17 -0.13
1.41 1.31 0.03 -0.38 -0.98 -0.78 -1.1 -1.23 -0.74 -0.47 -0.18 -0.18
1.12 1.24 -0.11 -0.53 -0.85 -0.04 -0.38 -0.76 -0.7 -0.55 -0.25 -0.26
1.62 1.33 -0.72 -1.49 -1.56 -0.72 -0.76 -1.18 -0.67 -0.37 0.0 0.1
1.24 1.22 -0.83 -1.95 -1.69 -0.59 -0.42 -0.41 -0.04 -0.08 0.1 0.02
1.7 2.51 -0.14 - - - -1.93 - - - -0.26 0.06
1.79 1.19 -0.28 -0.93 -2.32 -1.79 -1.52 -1.17 -0.45 -0.21 -0.01 0.06
1.2 0.99 -0.43 -1.58 -1.93 -0.86 -1.37 -0.22 0.08 0.47 0.27 -0.09
1.34 0.96 -0.08 -0.67 -0.96 -0.44 -0.37 -0.9 -0.24 -0.2 -0.16 -0.37
1.0 1.06 -0.0 -0.38 -0.45 0.0 -0.6 -1.2 -0.71 -0.35 -0.05 -0.05
1.17 1.29 -0.4 -1.06 -1.46 -0.57 -0.48 -0.53 -0.24 -0.1 0.01 -0.26
1.65 1.06 -0.93 -1.55 -1.41 -0.59 -0.66 -0.75 -0.53 -0.29 0.14 0.06
1.64 1.46 -0.87 -1.81 -1.62 -0.54 -0.83 -0.99 -0.44 -0.36 -0.06 -0.42
1.5 1.27 -0.48 -1.5 -1.23 -0.53 -0.58 -0.48 -1.14 -0.74 0.17 0.01
1.74 1.14 -1.0 -1.24 -1.29 -0.99 -1.24 -1.23 -0.51 -0.25 0.14 0.14
1.96 1.55 0.02 -0.55 -1.32 -1.33 -1.33 -1.81 -1.71 -1.39 -0.67 -0.54
1.08 0.81 -0.73 -0.79 -0.89 0.03 -0.33 -0.52 -0.11 -0.11 -0.03 0.09
1.4 1.11 -0.33 -1.16 -1.8 -0.86 -1.08 -0.65 -0.61 -0.21 0.23 0.41
1.17 1.05 -0.49 -0.86 -1.03 -0.38 -0.33 -0.55 -0.54 -0.33 0.09 0.19
0.87 1.08 0.01 -0.7 -0.94 -0.42 -0.42 -0.52 -0.4 -0.18 0.14 -0.03
0.95 1.02 -0.45 -1.29 -1.28 -0.76 -0.68 -0.12 -0.06 0.04 0.36 0.1
1.76 1.25 -1.02 -1.72 -1.67 -0.85 -0.76 -0.83 -0.82 -0.48 0.13 0.04
1.68 1.12 -0.97 -1.99 -1.97 -0.91 -0.73 -0.62 -0.57 -0.26 0.27 0.14
1.8 1.65 -0.0 -2.05 -2.78 -2.73 -1.64 -1.29 -1.07 -0.92 -0.15 0.27
1.12 1.14 -0.39 -0.7 -0.79 -0.13 -0.29 -0.55 -0.58 -0.28 -0.12 -0.27
1.67 1.12 -0.55 -0.92 -1.58 -1.07 -1.18 -1.17 -1.15 -0.39 0.24 0.42
1.78 1.26 0.01 -0.9 -1.45 -1.14 -1.3 -1.13 -0.71 -0.6 -0.38 -0.16
1.7 1.24 -0.24 -0.62 -0.97 -0.35 -1.04 -1.51 -1.32 -0.66 -0.2 -0.25
1.04 0.93 -0.15 -0.56 -0.68 -0.27 -0.4 -0.22 -0.65 -0.35 0.03 -0.06
1.24 0.87 -0.71 -1.2 -1.2 -0.23 -0.16 -0.09 -0.11 -0.18 -0.13 -0.11
1.1 1.08 -0.5 -1.23 -1.34 -0.71 -0.42 -0.2 -0.04 0.01 0.04 -0.02
1.58 1.36 -0.06 -0.95 -1.21 -0.51 -0.73 -1.22 -0.91 -0.43 -0.35 -0.4
1.69 1.21 -1.24 -1.86 -1.67 -0.84 -1.04 -0.69 -0.52 -0.22 0.29 0.01
1.83 1.77 -0.05 -0.82 -1.64 -1.36 -1.27 -1.36 -1.3 -1.3 -0.57 -1.03
1.19 0.74 -0.1 -0.24 -0.46 -0.48 -0.83 -0.49 -0.39 -0.16 -0.03 -0.14
0.81 1.22 -0.04 -1.25 -1.65 -0.76 -0.71 -0.47 0.01 0.13 0.21 0.05
1.21 0.82 -0.7 -1.03 -1.07 -0.3 -0.37 -0.24 -0.05 -0.11 -0.02 0.04
1.53 1.19 -1.2 -2.44 -1.85 -0.38 -0.41 -0.47 -0.36 -0.23 0.08 0.01
1.64 1.39 -0.59 -1.79 -1.96 -0.94 -1.09 -0.61 -0.37 -0.24 -0.06 -0.29
1.23 1.13 -0.59 -0.72 -0.87 -0.27 -0.49 -0.67 -0.46 -0.39 -0.03 0.02
1.61 1.04 -0.27 -0.36 -0.95 -0.83 -1.38 -1.48 -0.82 -0.33 -0.02 0.14
0.73 0.99 0.09 -0.52 -0.51 -0.08 -0.31 -0.69 -0.36 -0.26 -0.06 -0.08
1.6 1.03 -0.86 -1.44 -1.88 -0.86 -0.54 -0.43 -0.63 -0.36 0.19 0.25
0.97 1.03 -0.06 -0.81 -1.22 -0.73 -0.42 -0.05 -0.13 -0.03 -0.01 -0.25

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.