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Heatmap: Cluster_79 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-3.45 -1.44 -0.92 -0.18 -0.46 -0.18 -0.19 -0.87 0.44 1.1 1.07 0.57
-0.39 -0.78 -0.53 0.01 -0.06 -0.25 -0.38 -0.04 0.2 0.3 0.39 0.78
-1.06 -0.65 -0.14 0.15 0.0 0.04 -0.53 -0.35 -0.16 0.28 0.57 0.82
-2.39 -1.25 -0.44 0.26 0.44 0.48 0.16 -0.03 -0.23 0.06 0.4 0.49
-1.01 -0.97 -0.65 -0.1 0.01 0.31 0.05 -0.28 -0.08 0.42 0.5 0.69
-1.14 -1.5 -0.88 0.09 0.04 0.27 0.27 0.04 0.11 0.25 0.43 0.58
-1.66 -1.66 -1.17 -0.59 -0.22 0.17 0.21 0.01 -0.31 0.26 0.59 1.38
-2.9 -1.55 -0.3 0.09 0.15 0.56 0.35 0.03 -0.15 0.14 0.37 0.56
-1.93 -0.68 -0.52 0.11 -0.08 0.21 -0.18 -0.62 -0.72 0.27 1.02 0.9
-3.14 -0.79 -0.43 -0.13 0.04 0.12 0.02 0.22 0.11 0.24 0.59 0.66
-0.98 -1.24 -1.03 -0.48 -0.02 0.09 -0.15 0.16 0.03 0.41 0.58 0.96
-0.48 -0.53 -0.54 -0.13 0.01 0.17 -0.12 -0.43 -0.18 0.26 0.59 0.69
-1.2 -0.98 -0.71 -0.15 0.17 0.14 -0.04 0.08 -0.34 0.2 0.76 0.73
-1.17 -1.2 -1.14 -0.17 0.17 0.28 -0.01 0.24 -0.25 0.25 0.52 0.84
-1.09 -1.53 -1.05 -0.1 0.15 0.58 0.01 -0.18 -0.25 0.3 0.33 0.96
-1.03 -0.73 -0.2 0.22 0.09 0.06 -0.52 -1.12 -0.32 0.31 0.74 0.93
-1.87 -1.38 -0.83 0.09 0.31 0.59 0.34 -0.29 -0.02 0.4 0.26 0.47
-1.86 -1.31 -1.05 -0.37 0.42 0.22 -0.24 0.26 -0.62 -0.1 0.99 0.96
- -5.17 -4.35 -0.88 -0.32 0.36 -0.19 0.63 -0.06 0.32 0.87 1.5
-1.45 -0.82 -0.5 -0.12 -0.2 0.1 0.0 0.01 0.04 0.12 0.59 0.91
-1.84 -4.82 -5.0 -1.35 0.41 0.96 0.57 0.13 -1.85 -0.45 0.74 1.45
-5.03 -1.81 -0.52 0.19 0.27 0.52 0.43 0.05 -0.23 0.28 0.53 0.39
- -3.61 -0.75 -0.63 0.2 0.23 0.77 -0.27 -0.47 0.53 0.73 0.99
-5.43 -2.45 -0.82 0.14 0.16 0.34 0.42 0.32 -0.04 0.19 0.58 0.63
- -2.22 -2.15 -0.83 -0.11 0.3 0.54 0.01 -0.42 0.37 1.1 1.15
-0.56 -0.37 -0.23 0.09 0.2 -0.05 -0.31 -1.31 -0.13 0.4 0.39 0.81
-2.0 -1.9 -1.02 -0.14 0.11 0.28 0.14 0.21 -0.06 0.33 0.55 0.89
-1.02 -0.81 -1.18 -0.36 -0.23 -0.05 -0.15 0.05 0.07 0.47 0.78 0.86
-3.77 -1.9 -1.1 0.22 0.22 0.26 0.27 -0.28 -0.22 0.43 0.66 0.9
-3.55 -2.24 -0.81 -0.16 0.17 0.27 -0.01 -0.14 -0.02 0.46 0.74 0.98
-1.64 -1.2 -0.83 -0.14 -0.08 0.12 -0.04 0.03 -0.05 0.31 0.75 0.9
-3.23 -1.98 -1.66 -0.39 -0.39 0.09 -0.02 0.35 0.01 0.33 0.94 1.2
-1.78 -2.32 -2.96 -1.15 0.89 1.01 0.48 -2.17 -2.06 -0.75 0.17 1.8
-0.14 -0.23 -0.09 0.19 0.04 0.05 -0.46 -0.93 -0.29 0.06 0.39 0.74
-0.99 -1.25 -1.19 -0.65 -0.36 0.21 0.02 0.11 -0.26 0.1 0.83 1.19
-1.33 -0.76 -0.91 -0.34 -0.32 0.02 0.11 0.0 -0.08 0.36 0.71 0.94
- -1.37 -1.23 -1.42 0.19 -0.53 -0.03 0.78 0.46 0.05 0.63 1.21
-3.86 -2.24 -1.18 -0.52 -0.17 0.25 -0.05 0.08 -0.02 0.45 0.91 1.17
-0.89 -1.07 -1.02 -0.4 -0.35 -0.09 -0.1 0.16 -0.02 0.4 0.78 0.95
-2.72 -1.68 -2.56 -1.37 0.12 0.47 0.25 -0.05 0.08 0.56 0.88 0.99
-3.94 -1.55 -0.34 0.36 0.27 0.48 0.26 -0.21 0.04 0.21 0.3 0.53
-0.85 -0.5 -0.49 -0.14 0.0 0.15 -0.08 -0.07 -0.36 0.2 0.62 0.72
-1.39 -0.82 -0.85 0.03 0.38 0.26 -0.47 -0.12 -0.53 0.35 0.81 0.71
-2.71 -1.93 -0.93 0.09 0.5 0.43 0.04 -0.21 -0.34 0.33 0.52 0.89
-6.48 -1.87 -0.6 0.23 0.19 0.35 -0.05 -0.36 0.21 0.4 0.55 0.84
-0.9 -0.55 -0.28 0.02 -0.0 0.47 0.07 -0.35 -0.02 0.18 0.24 0.5
-2.66 -1.94 -0.3 0.03 -0.12 0.04 -0.29 -0.27 0.22 0.72 0.65 0.82
-1.77 -2.57 -1.83 -0.66 -0.18 0.03 -0.17 0.26 -0.09 0.43 0.9 1.32
-3.94 -2.28 -2.11 -0.37 0.03 0.25 0.37 0.33 0.11 0.48 0.72 0.89
-0.84 -0.67 -0.47 0.08 0.13 0.23 -0.24 -0.13 -0.27 0.12 0.54 0.71
-1.25 -2.61 -0.54 0.19 0.07 0.06 -0.34 -0.22 -0.13 0.44 0.68 0.97
-0.82 -2.24 -1.35 -0.3 -0.02 0.21 0.21 -0.16 -0.55 -0.18 0.57 1.47
- -2.48 -0.98 0.23 0.58 0.81 0.72 -0.08 -0.81 0.09 0.11 0.67
-4.98 -4.12 -2.37 -1.41 -0.56 0.1 0.09 0.11 -0.26 0.22 0.92 1.83
-3.47 -2.71 -1.06 0.17 -0.05 -0.24 -0.37 -0.0 -0.23 0.69 0.75 1.28
-1.96 -0.76 -0.4 0.35 0.15 0.15 -0.06 -0.01 0.02 0.29 0.44 0.43
-1.66 -1.39 -0.74 0.15 0.37 0.43 0.03 -0.16 -0.28 0.11 0.47 0.8
- -1.2 -0.25 0.34 0.18 0.23 0.06 -0.02 0.15 0.21 0.45 0.58
-6.27 -6.47 -5.04 -1.63 -0.44 0.14 0.24 0.27 0.02 0.6 1.12 1.43
-1.0 -0.94 -0.63 -0.09 -0.06 0.21 0.06 -0.04 -0.1 0.28 0.53 0.73
-0.59 -0.24 -0.36 -0.06 0.06 0.43 0.08 -0.23 -0.22 0.03 0.19 0.51
-0.2 -0.17 -0.63 -0.13 -0.18 -0.28 -0.28 -0.8 -0.56 0.36 0.93 0.77
-2.36 -3.5 -1.26 -0.39 0.05 0.26 -0.06 -0.25 0.15 0.82 0.82 0.9
-1.0 -0.73 -0.6 0.01 -0.02 0.2 -0.17 -0.05 -0.55 0.21 0.73 0.81
-0.64 -0.9 -0.49 -0.0 -0.0 0.13 -0.19 -0.51 0.02 0.23 0.56 0.83
- -4.93 -3.25 -0.87 -0.29 0.15 -0.02 0.29 -0.12 0.2 0.86 1.72
-2.18 -1.41 -0.74 -0.23 -0.15 -0.1 -0.12 -0.18 0.13 0.34 0.79 1.16
-0.29 -0.23 -0.61 -0.21 -0.1 0.12 -0.29 -0.05 -0.34 0.11 0.62 0.68
-2.97 -1.46 -0.33 0.33 0.2 0.36 0.31 -0.09 0.03 0.12 0.39 0.51
- -1.4 -0.76 -0.42 0.22 0.37 0.38 0.06 0.03 0.43 0.6 0.67
-2.82 -2.64 -0.77 0.44 0.47 0.43 -0.07 0.06 -0.32 0.19 0.43 0.79
-5.1 -3.75 -2.01 -0.98 -0.24 0.29 0.35 -0.1 0.04 0.56 0.98 1.26
-4.07 -2.35 -1.43 -0.4 0.02 0.16 0.31 0.6 0.04 0.23 0.58 1.03
-1.37 -0.82 -0.44 -0.15 0.03 0.3 -0.15 -0.05 0.04 0.2 0.62 0.66
-4.99 -4.61 -2.05 -0.21 0.31 0.65 0.07 -0.57 -0.06 0.27 0.8 1.26
-1.78 -1.19 -0.47 0.06 0.45 0.51 0.27 0.28 -0.37 -0.21 0.22 0.56
- -1.67 -0.96 -0.8 -1.4 0.33 -0.03 -0.03 0.54 0.63 0.63 1.29
-1.47 -1.91 -0.66 -0.12 0.12 0.37 0.11 -0.2 -0.53 0.15 0.61 1.11
-1.44 -1.16 -0.6 0.1 0.24 0.52 0.18 0.1 -0.2 0.01 0.33 0.6
- -4.3 -1.46 -0.38 0.09 0.35 0.27 -0.0 -0.07 0.28 0.72 1.3
-3.95 -1.77 -1.0 -0.3 -0.13 0.19 0.1 -0.09 -0.16 0.26 0.74 1.33
-0.18 -0.52 -0.29 0.1 -0.21 0.05 0.03 -0.15 -0.37 0.0 0.39 0.7
-1.36 -0.6 -0.27 0.01 -0.2 -0.01 -0.14 -0.14 0.03 0.41 0.49 0.75
-1.98 -1.16 -0.61 0.13 0.1 0.2 -0.23 -0.51 -0.0 0.32 0.66 0.96
-0.79 -0.63 -0.74 -0.02 -0.06 0.11 0.12 -0.05 -0.3 0.18 0.42 0.85
-5.83 -3.45 -1.58 -0.19 0.03 0.12 0.22 0.29 -0.03 0.35 0.83 1.11
-2.71 -0.91 -0.3 -0.16 0.03 0.23 0.14 0.06 -0.11 0.41 0.62 0.55
-4.31 -0.95 -0.2 0.12 0.11 0.33 -0.19 -0.29 0.04 0.37 0.59 0.7
-1.93 -1.53 -1.04 -0.43 -0.3 0.07 -0.12 -0.22 -0.02 0.41 0.96 1.18
-2.59 -2.2 -1.35 -0.23 0.02 -0.29 -0.31 0.36 -0.38 0.56 0.95 1.18
- -3.54 -1.2 0.26 0.6 0.45 0.4 0.42 -0.21 0.1 0.33 0.64
-3.04 -2.19 -0.61 0.22 0.35 0.61 0.27 0.22 -0.55 0.05 0.46 0.66
-1.38 -0.28 -0.47 -0.7 -0.29 -0.97 -0.61 0.61 -0.12 0.43 0.95 0.8
-2.21 -0.72 -0.69 -0.6 0.09 0.23 -0.17 0.16 -0.1 0.58 0.56 0.81
- -3.55 -2.41 -1.18 -0.24 0.8 0.74 0.12 0.0 0.57 0.7 0.87
-1.92 -0.63 -0.12 0.31 0.11 0.3 -0.13 -0.53 0.02 0.16 0.42 0.63
-1.49 -0.84 -0.26 0.24 0.24 0.49 -0.08 -0.32 -0.46 0.15 0.38 0.67
-0.72 -0.39 -0.53 -0.03 -0.02 0.24 -0.03 -0.38 0.07 0.38 0.42 0.44
- -1.98 -0.71 -0.25 -0.26 0.16 -0.28 -0.09 0.3 0.86 0.71 0.92
-1.98 -1.88 -1.5 -0.48 0.23 0.47 0.29 0.06 -0.23 0.47 0.75 0.74
- -1.41 - 0.18 -1.26 - 0.19 -0.9 0.63 1.4 1.56 0.35
-0.39 -1.42 -0.98 -0.09 -0.23 0.11 -0.25 -0.4 0.25 0.5 0.57 0.85
-4.41 -1.37 -0.58 -0.11 0.28 0.3 0.0 -0.47 -0.2 0.54 0.76 0.83
-1.71 -0.91 -0.11 0.2 0.17 0.23 0.1 0.08 0.13 0.22 0.19 0.33
-1.83 -0.45 -0.45 -0.28 -0.51 0.05 -0.05 0.24 -0.22 0.27 0.77 0.83
-2.6 -1.75 -0.59 -0.0 0.19 0.26 -0.15 -0.39 -0.21 0.19 0.58 1.25
-1.65 -1.06 0.12 -0.31 0.16 0.31 -0.31 -0.75 -0.42 0.01 0.76 1.07
-4.25 -2.47 -1.52 -0.67 -0.1 0.13 0.06 0.13 -0.03 0.42 0.84 1.33
-0.51 -0.32 -0.3 0.01 -0.23 0.07 -0.04 -0.0 -0.13 0.11 0.41 0.58
-6.23 -2.21 -0.71 0.09 0.07 0.01 0.03 0.47 0.05 0.19 0.64 0.93
-1.34 -1.52 -1.28 -0.56 -0.19 0.13 0.03 -0.1 -0.09 0.41 0.78 1.18
-1.61 -1.97 -1.49 -0.04 0.35 0.48 0.15 0.14 -0.22 0.21 0.44 0.87
-2.43 -1.77 -0.63 0.05 -0.05 0.2 0.33 0.17 0.1 0.32 0.45 0.73
-1.22 -1.5 -1.17 -0.89 -0.43 0.14 0.06 -0.19 -0.22 0.31 0.8 1.4
-1.61 -1.1 -0.72 -0.1 0.23 0.16 -0.01 0.18 -0.46 0.15 0.64 0.9
-5.99 -3.23 -1.04 -0.1 0.16 0.74 0.39 0.19 -0.11 0.34 0.52 0.68
-1.94 -1.79 -0.62 -0.14 0.16 0.64 0.19 0.23 -0.24 0.31 0.39 0.58
-2.92 -1.63 -0.7 0.01 0.69 0.41 0.16 -0.64 -0.2 0.5 0.41 0.69
-1.44 -1.46 -1.56 -0.74 -0.28 -0.01 0.12 0.13 -0.15 0.26 0.8 1.32
-2.31 -2.25 -1.74 -0.69 -0.28 0.23 0.19 0.04 -0.34 0.23 0.93 1.4
-4.55 -1.85 -0.74 -0.48 -0.04 0.48 0.42 0.28 -0.3 0.54 0.49 0.82
-5.23 -1.63 -0.69 -0.21 0.35 0.6 0.24 -0.31 0.11 0.48 0.34 0.73
-1.15 -0.55 -0.29 0.14 -0.14 -0.08 -0.33 0.21 -0.3 0.15 0.54 0.82
-0.6 -0.99 -0.35 0.16 0.02 0.19 -0.25 -0.09 -0.54 0.09 0.49 0.88
-1.55 -1.77 -1.58 -0.6 -0.2 0.19 0.16 0.03 -0.06 0.35 0.69 1.25
-2.33 -1.27 -0.61 -0.27 -0.45 -0.08 0.02 -0.08 0.05 0.3 0.7 1.24
-3.51 -1.85 -0.5 0.02 0.44 0.54 0.26 0.07 -0.19 -0.04 0.24 0.88
-1.64 -1.07 -0.79 -0.3 -0.07 0.41 -0.3 -0.3 -0.23 0.65 0.63 0.95
-3.5 -1.3 -0.59 0.18 0.2 0.69 0.11 -0.21 -0.51 0.31 0.18 0.94
-0.76 -1.23 -0.89 -0.14 -0.05 0.26 -0.18 -0.16 -0.05 0.55 0.55 0.77
-4.64 -2.45 -0.85 0.33 0.53 0.63 -0.09 -0.39 -0.47 -0.02 0.48 1.12
-0.91 -1.67 -1.22 -0.17 0.21 0.62 0.12 0.09 -0.03 0.21 0.24 0.75
-2.53 -0.98 -0.32 0.23 -0.08 0.09 -0.21 -0.09 0.04 0.51 0.64 0.6
-1.21 -0.82 -0.6 -0.1 -0.45 0.07 -0.14 0.16 0.2 0.32 0.62 0.74
-0.59 -0.34 -0.25 -0.01 -0.2 0.16 -0.06 -0.06 -0.28 0.06 0.49 0.61
-0.57 -0.48 -0.23 -0.28 -0.55 0.2 -0.07 -0.08 -0.08 0.38 0.41 0.7
-1.2 -0.44 -0.53 -0.19 -0.15 0.02 -0.06 0.19 0.01 0.11 0.58 0.74
-1.52 -1.35 -1.64 -0.43 -0.0 0.3 0.28 -0.05 0.15 0.41 0.72 0.78
-1.76 -1.0 -0.64 -0.08 -0.17 0.06 0.04 0.23 0.16 0.29 0.51 0.78
-0.88 -0.54 -0.89 -0.27 -0.08 0.37 -0.16 0.15 -0.01 0.33 0.45 0.62
-1.68 -1.47 -0.71 0.15 0.54 0.42 -0.14 -0.39 -0.45 -0.0 0.48 1.02
-2.52 -1.26 -1.18 -0.5 -0.29 0.16 -0.13 -0.09 -0.03 0.4 0.88 1.23
-3.7 -1.14 -0.73 0.12 0.17 0.44 0.05 0.09 -0.08 0.4 0.52 0.58
-0.51 -0.52 -0.56 -0.0 0.1 0.28 -0.01 -0.36 -0.11 0.26 0.35 0.55
-0.64 -0.98 -0.59 -0.08 0.12 0.62 0.07 -0.4 -0.29 0.17 0.29 0.73
-0.87 -0.86 -0.68 0.11 0.16 0.1 0.1 -0.39 -0.29 0.07 0.52 0.9
- -3.68 -1.6 -0.25 -0.11 -0.21 -0.08 0.7 -0.38 0.48 1.02 1.14
-1.21 -0.46 -1.61 -0.08 0.42 0.63 0.26 -0.56 -0.31 -0.24 0.23 0.98
-1.07 -0.54 -0.25 -0.16 -0.06 0.36 0.2 -0.15 -0.09 0.27 0.34 0.48
-2.81 -1.57 -1.13 -0.66 -0.16 0.31 -0.16 -0.29 0.07 0.57 0.69 1.29
-1.79 -1.2 -0.98 -0.43 -0.23 0.08 -0.04 -0.31 -0.13 0.38 0.7 1.32
-0.85 -0.91 -0.29 0.28 0.03 0.17 -0.09 -0.09 -0.21 0.13 0.48 0.58
-2.77 -1.7 -1.27 -0.12 0.03 0.11 -0.01 0.04 -0.14 0.29 0.69 1.23
-1.06 -0.48 -0.37 -0.3 -0.08 0.59 0.27 -0.2 -0.26 0.21 0.3 0.55
-0.46 -1.02 -0.59 -0.23 -0.36 -0.26 -0.51 0.41 0.02 0.36 0.74 0.72

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.