Heatmap: Cluster_108 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-0.1 -0.43 -0.64 -0.69 -0.73 -0.3 0.21 0.26 0.53 0.43 0.35 0.28
-0.28 -0.15 -0.32 -0.45 -0.54 -0.44 0.14 0.2 0.48 0.36 0.27 0.24
-3.05 -2.68 -1.81 -1.47 -1.56 -1.31 0.24 0.96 0.78 0.92 0.78 0.91
-3.91 -2.6 -1.69 -1.58 -1.51 -0.92 0.41 0.87 0.84 0.85 0.86 0.75
-1.15 -2.62 -3.83 -3.48 -2.89 -2.01 0.74 0.74 0.87 0.83 0.74 1.15
-1.23 -0.99 -1.11 -0.83 -0.62 -0.5 0.24 0.44 0.7 0.64 0.59 0.56
-3.27 -5.83 - -7.02 -5.36 -1.81 -0.05 1.17 1.23 1.08 0.88 1.04
-1.1 -2.88 -1.85 -1.6 -1.09 -0.37 0.51 0.69 0.77 0.64 0.54 0.85
-4.83 -2.19 -0.97 -0.55 -0.72 -0.41 0.21 0.68 0.47 0.65 0.76 0.83
-1.59 -1.36 -1.1 -1.37 -2.02 -1.29 0.28 0.63 0.9 0.75 0.68 0.89
-2.93 -1.65 -1.22 -1.22 -1.14 -0.56 0.92 0.86 0.91 0.68 0.36 0.12
-3.97 -3.37 -2.16 -1.7 -1.44 -1.25 0.63 0.89 1.07 0.82 0.69 0.71
-4.34 -3.15 -1.92 -1.24 -1.16 -0.52 0.36 0.8 0.69 0.8 0.87 0.85
-3.25 -3.18 -1.81 -1.75 -1.99 -1.52 0.17 0.67 1.16 0.96 1.0 0.77
-3.89 -1.56 -0.75 -0.36 -0.55 -0.64 0.23 0.72 0.64 0.68 0.59 0.5
-0.17 -1.46 -2.33 -2.35 -1.46 -1.07 0.19 0.62 0.95 0.83 0.71 0.57
-3.03 -2.16 -1.36 -1.09 -1.18 -1.0 0.28 0.72 0.8 0.83 0.91 0.68
-7.03 -5.82 -5.87 -6.68 -2.94 -1.08 0.6 1.08 1.06 1.05 0.88 0.8
-2.61 -1.9 -1.38 -1.68 -1.6 -1.12 0.34 0.69 0.79 0.71 0.95 0.93
-4.29 -3.26 -2.17 -2.17 -1.75 -1.08 1.01 1.06 1.24 0.78 0.49 0.07
- -2.93 -1.43 -1.27 -1.72 -1.92 0.1 0.92 1.06 1.35 1.02 -0.19
-3.19 -1.55 -1.07 -1.14 -1.35 -1.24 0.22 0.59 0.93 0.7 0.84 0.86
-1.97 -1.6 -1.13 -1.0 -1.22 -0.97 0.35 0.61 0.72 0.64 0.8 0.83
-3.37 -2.58 -0.75 -1.61 -2.27 -2.15 0.42 0.72 0.62 0.77 0.84 1.24
-5.77 -6.9 -8.96 -7.7 -4.18 -2.57 0.45 1.07 1.18 1.07 0.83 1.09
-3.06 -1.9 -1.33 -1.13 -1.23 -1.2 0.92 0.92 0.97 0.72 0.49 0.12
-2.43 -2.42 -1.01 -0.45 -0.36 -0.42 0.4 0.93 0.58 0.47 0.43 0.51
-3.89 -2.38 -1.26 -0.59 -0.63 -0.56 0.42 0.89 0.79 0.58 0.53 0.56
-4.16 -1.9 -0.96 -0.69 -0.61 -0.53 0.34 0.54 0.69 0.7 0.75 0.65
-2.99 -1.57 -1.19 -1.0 -1.29 -1.22 0.33 0.86 0.84 0.81 0.67 0.63
-8.38 -5.14 -2.16 -1.03 -0.74 -0.96 0.61 1.3 0.57 0.61 0.49 0.8
-2.93 -1.92 -1.31 -1.08 -1.3 -0.92 0.33 0.61 0.88 0.75 0.86 0.74
- -6.62 -5.12 - -6.47 -4.92 0.36 1.1 1.1 1.57 1.04 0.39
-2.62 -2.86 -2.08 -4.76 -5.34 -4.96 0.75 1.21 1.3 0.98 0.56 0.54
-0.25 -1.88 -1.17 -0.62 -0.97 -1.14 0.43 0.53 0.76 0.58 0.56 0.47
-3.16 -2.09 -1.86 -2.38 -2.55 -2.92 0.21 0.68 1.29 1.09 1.06 0.56
-3.84 -3.19 -2.01 -1.56 -1.49 -0.61 0.41 0.97 0.74 0.7 0.9 0.82
-2.08 -2.01 -1.28 -1.55 -1.38 -1.06 0.48 0.98 0.95 0.7 0.6 0.55
-2.17 -1.19 -0.76 -1.09 -1.16 -0.62 0.17 0.53 0.96 0.63 0.72 0.55
-3.56 -2.29 -1.59 -0.93 -1.04 -0.6 0.37 1.03 0.64 0.69 0.7 0.65
-4.68 -5.01 -2.96 -2.29 -1.37 -0.91 0.23 0.73 0.94 1.05 0.96 0.93
-2.48 -1.33 -1.16 -1.32 -1.85 -1.76 0.36 0.73 0.85 0.73 1.03 0.64
-3.3 -2.33 -1.71 -2.04 -2.79 -2.74 0.3 1.09 1.2 1.02 0.84 0.46
-4.14 -2.15 -1.27 -1.38 -1.77 -1.35 0.35 0.5 1.15 0.86 0.95 0.65
-2.9 -1.24 -1.13 -0.83 -0.84 -0.42 0.2 0.66 0.61 0.62 0.75 0.71
-3.74 -2.64 -1.66 -1.36 -1.42 -1.17 0.27 0.88 0.9 0.79 0.93 0.76
-4.43 -3.41 -2.14 -1.57 -1.49 -1.08 0.43 0.84 1.04 0.92 0.87 0.63
-4.27 -2.96 -1.84 -1.64 -1.64 -1.38 0.26 0.84 0.96 0.97 0.95 0.77
-4.1 -2.27 -0.9 -0.65 -0.58 -0.44 0.25 0.64 0.53 0.65 0.74 0.78
-1.2 -1.11 -1.59 -1.19 -0.95 -0.61 0.15 0.58 0.71 0.79 0.63 0.72
-6.39 -3.89 -2.71 -1.97 -1.41 -0.67 0.52 0.93 0.85 0.86 0.78 0.89
-3.22 -1.98 -1.33 -1.25 -1.24 -1.08 0.47 0.78 0.87 0.6 0.83 0.77
-1.95 -1.48 -1.22 -1.41 -1.46 -1.2 0.06 0.53 1.1 0.86 0.88 0.59
-5.25 -5.47 -5.13 -4.36 -2.24 -0.96 0.07 1.02 1.13 1.25 0.94 0.67
-2.34 -1.8 -1.4 -1.19 -1.11 -0.65 0.38 0.76 0.69 0.79 0.69 0.72
-1.98 -1.27 -0.89 -0.9 -1.18 -1.37 0.33 0.51 0.95 0.65 0.74 0.65
-3.28 -2.17 -1.58 -1.45 -1.62 -1.41 0.34 1.0 0.93 0.58 0.86 0.84
-5.82 -3.06 -1.62 -1.11 -0.87 -0.47 0.47 0.75 0.75 0.75 0.64 0.86
-1.18 -1.41 -1.5 -1.12 -1.26 -0.73 -0.14 0.62 0.89 0.75 0.71 0.79
-4.14 -3.37 -2.1 -1.71 -1.19 -0.72 0.29 1.06 0.76 0.95 0.74 0.73
-0.11 -0.38 -0.61 -0.96 -1.78 -3.11 -0.15 0.34 0.71 0.84 0.77 0.52
-5.05 -3.0 -2.68 -2.71 -2.7 -1.49 -0.01 0.95 1.12 1.16 1.02 0.73
-2.87 -4.3 -3.4 -3.46 -2.03 -1.29 0.43 0.95 0.89 1.15 0.8 0.92
-0.12 -0.64 -1.65 -0.81 -1.46 -1.81 0.22 0.71 0.68 0.45 0.68 0.61
- -6.91 -8.37 -7.69 -4.6 -2.31 0.38 1.14 0.98 1.08 1.05 1.04
-8.04 -5.38 -5.65 -6.45 -4.94 -1.19 0.65 1.14 1.17 1.19 0.92 0.36
-5.49 -4.02 -1.71 -0.99 -1.02 -0.83 0.26 0.85 0.78 0.77 0.87 0.85
-5.87 -3.72 -1.09 -0.68 -0.86 -0.91 0.52 0.92 0.82 0.75 0.48 0.65
-4.05 -2.26 -1.28 -1.14 -1.23 -0.96 0.84 0.95 1.0 0.69 0.51 0.21
-4.17 -2.77 -1.78 -1.5 -1.54 -1.31 0.14 0.63 0.91 0.96 1.01 0.93
-4.26 -2.7 -1.74 -1.51 -1.56 -1.62 0.43 0.86 1.05 0.98 0.86 0.55
- -3.02 - - -2.46 -2.91 1.08 1.12 1.44 0.94 0.37 0.43
-2.89 -2.53 -1.48 -1.27 -1.45 -1.05 0.34 0.78 0.91 0.83 0.78 0.77
-4.22 -4.02 -7.27 -6.08 -2.39 -0.69 -0.06 0.38 1.19 1.18 1.01 1.16
-1.62 -1.64 -1.81 -1.58 -1.45 -1.38 -0.3 0.56 0.94 0.98 0.84 1.01
-1.23 -0.7 -1.07 -1.8 -2.24 -1.96 0.07 0.5 1.0 0.86 0.83 0.74
-3.26 -2.23 -1.35 -1.12 -1.33 -0.95 0.32 0.98 0.92 0.66 0.75 0.63
-3.16 -2.75 -1.9 -3.08 -2.67 -2.55 0.92 1.12 1.33 0.88 0.72 -0.07
-0.62 -0.88 -1.21 -1.25 -1.72 -1.74 0.17 0.59 0.87 0.64 0.77 0.7
-3.89 -2.81 -1.68 -1.74 -1.98 -2.14 0.82 1.06 1.15 0.84 0.63 0.37
-4.37 -5.79 -8.21 -4.62 -2.73 -2.37 0.7 1.01 1.04 1.09 1.06 0.71
-7.14 -4.15 -3.29 -2.26 -1.56 -0.85 0.04 0.74 0.89 1.03 1.02 1.08
-3.12 -2.06 -1.36 -1.14 -1.34 -1.02 0.19 0.73 0.96 0.84 0.87 0.63
- -5.64 - - - - -0.21 1.35 1.49 1.72 0.97 -0.97
-3.34 -2.37 -2.09 -1.8 -1.87 -1.11 0.01 0.71 0.91 1.04 0.93 0.97
-3.73 -2.24 -1.43 -1.71 -1.67 -0.88 0.94 1.06 1.12 0.71 0.44 0.01
-0.84 -1.34 -1.16 -1.04 -0.81 -0.26 0.45 0.49 0.67 0.52 0.48 0.6
-8.53 -4.2 -0.64 -1.27 -1.44 -1.78 0.17 0.43 0.55 0.77 1.02 1.35
-1.11 -0.69 -0.61 -0.58 -0.86 -0.53 0.05 0.53 0.49 0.53 0.66 0.53
-0.86 -0.64 -0.6 -0.57 -0.38 -0.08 0.2 0.45 0.46 0.38 0.34 0.38
-1.84 -1.68 -1.4 -1.28 -1.14 -0.85 0.25 0.82 0.76 0.79 0.76 0.63
-2.57 -2.83 -2.15 -1.88 -2.06 -1.88 0.38 0.91 1.07 0.81 0.86 0.88
-2.67 -1.5 -1.45 -0.92 -1.02 -0.95 0.26 0.67 0.8 0.78 0.69 0.79
-3.56 -3.55 -2.87 -2.12 -1.93 -1.59 0.29 1.05 1.01 0.98 0.85 0.85
-3.74 -3.27 -4.02 -2.89 -2.14 -0.53 0.25 0.75 1.07 1.03 0.87 0.9
-6.43 -2.37 -1.08 -1.19 -1.13 -0.62 0.54 0.79 0.75 0.69 0.58 0.85
-1.62 -2.39 -1.9 -1.87 -2.99 -2.62 -0.11 0.71 1.01 1.08 1.06 0.92
-3.84 -2.78 -1.54 -1.55 -1.78 -1.29 0.24 0.94 1.18 0.9 0.64 0.7
- -5.21 -6.07 -5.62 - -2.33 0.3 0.76 0.95 0.96 1.28 1.34
-2.49 -1.82 -1.53 -1.47 -1.67 -1.67 0.6 0.64 1.04 0.83 0.82 0.62
-3.2 -2.51 -1.77 -1.11 -1.33 -1.17 0.39 0.65 0.92 0.87 0.89 0.74
-0.83 -0.79 -0.94 -0.85 -0.91 -0.58 0.16 0.54 0.78 0.68 0.46 0.39
-4.08 -2.76 -1.78 -1.73 -1.77 -1.42 0.27 0.93 0.96 0.85 0.94 0.82
-4.37 -3.94 -3.76 -5.23 -4.96 -4.53 1.18 1.08 1.41 0.92 0.6 0.34
-1.23 -1.01 -1.18 -0.78 -1.06 -1.2 0.03 0.43 0.89 0.78 0.74 0.62
-4.39 -2.62 -1.81 -1.26 -1.32 -1.0 0.39 0.91 0.76 0.79 0.86 0.82
-6.38 -7.84 -8.22 -3.01 -1.88 -1.22 0.25 0.78 0.95 1.08 1.07 1.07
-3.15 -1.89 -1.39 -0.93 -1.14 -0.77 0.46 0.76 0.93 0.56 0.67 0.71
-2.62 -1.58 -1.07 -1.02 -1.28 -1.04 0.45 0.79 0.83 0.62 0.73 0.66
-1.44 -1.0 -1.13 -0.9 -1.27 -1.06 0.25 0.59 0.93 0.74 0.66 0.48
-1.49 -0.83 -1.61 -1.14 -1.29 -0.09 0.38 0.66 0.63 0.72 0.5 0.55
-3.99 -2.36 -1.0 -1.33 -1.83 -1.59 0.33 0.68 1.04 0.82 1.04 0.58
-3.05 -2.65 -1.41 -0.94 -1.24 -0.45 0.35 0.85 0.66 0.81 0.78 0.63
-9.17 -9.58 -5.57 -2.9 -1.13 -0.38 0.59 1.0 0.91 0.81 0.72 0.87
-3.86 -2.82 -1.69 -1.45 -1.4 -0.93 0.52 0.86 0.92 0.77 0.8 0.7
-3.93 -2.06 -1.2 -1.0 -0.92 -0.64 0.4 0.64 0.83 0.82 0.71 0.61
-1.97 -4.16 -1.4 -1.92 -1.69 -1.84 0.51 0.8 0.84 0.7 0.7 1.17
-4.94 -3.57 -2.07 -1.26 -1.09 -0.62 0.4 0.54 0.91 0.78 0.87 0.93
-3.0 -1.6 -0.76 -0.57 -0.77 -0.9 0.09 0.58 0.76 0.78 0.81 0.52
-5.54 -4.38 -3.11 -2.58 -3.35 -3.16 0.06 0.61 1.08 1.06 1.26 1.19
-4.39 -2.87 -1.81 -1.36 -1.31 -0.88 0.43 0.73 0.92 0.79 0.87 0.8
-3.74 -3.19 -2.67 -2.51 -1.3 -0.69 0.58 0.98 1.0 0.83 0.66 0.71
-3.69 -2.85 -1.87 -1.97 -1.98 -1.54 0.55 0.97 0.95 0.84 0.8 0.82
-4.59 -2.58 -1.31 -0.78 -0.81 -0.32 0.28 0.62 0.63 0.74 0.73 0.85
-4.06 -2.7 -1.93 -1.55 -1.43 -1.58 0.36 0.95 0.65 0.93 0.87 0.97
-4.79 -2.19 -1.16 -0.96 -1.18 -1.45 0.51 0.84 0.9 0.76 0.72 0.63
-3.65 -1.94 -0.78 -0.88 -1.16 -1.02 0.12 0.87 0.84 0.82 0.87 0.37
-5.26 -4.33 - - -4.88 -1.74 0.09 1.19 1.19 1.24 0.95 0.75
-2.18 -1.86 -1.46 -1.36 -1.61 -2.53 -0.05 0.83 0.76 0.79 1.11 0.95
-2.2 -1.67 -1.15 -0.89 -0.89 -0.7 0.36 0.86 0.71 0.54 0.49 0.8
- -3.54 -2.83 -2.79 -3.2 -1.14 0.32 0.67 1.08 1.07 0.83 1.16
-3.41 -2.75 -2.06 -2.2 -2.1 -2.42 1.04 1.0 1.24 0.8 0.57 0.3
-2.56 -2.65 -1.49 -1.27 -1.18 -0.85 0.34 0.68 0.93 0.84 0.79 0.68
- -3.29 -2.05 -2.24 -2.27 -1.0 0.48 0.5 0.96 0.87 0.95 1.15
-3.4 -2.45 -1.54 -1.21 -1.31 -1.12 0.29 0.86 0.96 0.8 0.86 0.63
-3.47 -2.83 -1.76 -1.87 -1.77 -1.29 0.19 0.78 0.78 0.95 0.98 1.02
-2.99 -2.52 -1.47 -1.4 -1.29 -0.96 0.92 0.93 1.2 0.73 0.37 0.01
-4.53 -2.94 -1.7 -1.38 -1.25 -0.9 0.35 0.79 0.83 0.7 0.81 1.01
-0.61 -0.59 -0.82 -0.49 -0.57 -0.25 0.27 0.5 0.53 0.34 0.34 0.36
-2.82 -1.31 -0.89 -1.34 -2.16 -2.42 0.24 0.95 0.88 0.59 0.91 0.81
-0.38 -0.67 -1.44 -0.75 -0.65 -0.71 -0.07 0.48 0.66 0.63 0.67 0.4
- -4.0 -2.15 -1.64 -2.16 -1.15 0.56 0.59 1.04 1.02 1.0 0.72
-1.66 -1.63 -1.72 -1.97 -2.46 -2.21 0.13 0.58 1.07 0.92 0.99 0.88
-1.81 -1.73 -2.08 -1.27 -1.47 -1.23 0.08 0.8 1.01 0.89 0.74 0.71
- -8.87 - -7.28 -4.15 -1.86 0.52 1.15 1.03 1.31 0.88 0.72
- -6.68 - -7.23 -5.95 -4.58 0.4 1.32 1.19 1.1 0.78 0.98
-3.65 -3.74 -2.77 -4.34 -5.08 -3.22 0.78 1.03 1.27 1.04 0.84 0.58
-0.5 -0.56 -1.12 -0.98 -0.85 -0.58 0.24 0.47 0.55 0.71 0.54 0.39
-4.7 -2.2 -0.97 -0.87 -1.24 -1.38 0.22 0.92 0.8 0.81 0.79 0.68
-1.32 -2.23 -4.47 -3.36 -2.3 -1.07 0.38 0.75 1.13 0.91 0.88 0.74
-3.2 -1.55 -1.05 -0.95 -1.25 -0.87 0.3 0.39 0.72 0.79 0.85 0.9
-2.7 -1.79 -1.24 -1.65 -1.22 -0.93 0.21 0.47 0.83 0.76 1.02 0.86
-1.95 -1.08 -1.03 -0.84 -0.96 -0.42 0.26 0.56 0.68 0.66 0.76 0.49
-0.76 -0.96 -1.38 -1.34 -1.58 -0.96 0.33 0.5 0.81 0.74 0.53 0.8
-3.79 -2.84 -1.78 -1.38 -1.57 -1.07 0.38 0.71 0.9 0.87 0.93 0.82
-0.81 -0.93 -1.01 -0.81 -0.66 -0.15 0.3 0.5 0.57 0.57 0.44 0.4
-4.15 -2.43 -2.27 -2.04 -2.03 -1.5 0.09 0.74 1.11 1.09 0.94 0.82
-0.76 -0.36 -0.56 -0.67 -1.29 -1.48 0.16 0.52 0.77 0.66 0.54 0.35
-4.69 -3.29 -1.75 -1.06 -0.97 -1.1 0.31 0.79 0.59 0.82 0.87 1.03
-2.25 -1.31 -1.07 -0.86 -0.98 -0.85 0.36 0.64 1.0 0.64 0.69 0.38
-4.0 -3.13 -3.88 -4.08 -3.91 -4.0 0.94 1.26 1.24 0.81 0.43 0.85
-4.68 -2.83 -1.87 -1.63 -1.53 -1.27 0.39 1.15 0.87 0.82 0.74 0.74

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.