1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_38 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-6.04 -5.58 - -7.43 -3.04 0.65 1.5 2.08 0.75 0.09 -1.53 -3.02
-5.73 -5.25 -7.58 -6.67 -2.04 0.34 1.28 2.03 0.89 0.03 -0.71 -1.21
-4.48 -3.79 -6.45 -8.06 -2.69 0.87 1.4 2.07 0.74 -0.12 -1.61 -2.85
-3.68 -5.09 -7.52 -6.61 -2.26 0.76 1.46 2.0 0.8 -0.03 -1.56 -2.43
-3.47 -4.33 - - -5.39 0.47 1.31 2.15 0.89 0.19 -1.44 -2.57
-4.69 -5.09 -6.54 -5.42 -3.36 0.38 1.42 1.74 1.23 0.57 -1.1 -2.43
-3.73 -4.83 -6.15 -6.7 -2.66 0.82 1.5 2.02 0.78 -0.43 -1.18 -2.69
-5.97 -4.44 -6.23 -7.0 -4.16 0.32 1.23 2.09 0.93 0.4 -0.84 -2.22
-3.58 -3.92 -6.74 - -6.4 0.39 1.29 1.79 1.15 0.62 -0.67 -2.14
-6.06 -4.21 -7.32 - -4.48 0.59 1.34 1.97 0.97 0.27 -0.97 -1.97
-4.52 -4.43 -7.59 -5.87 -3.24 0.49 1.28 2.05 1.0 0.19 -1.21 -2.19
-3.66 -4.29 -6.06 -5.12 -2.24 0.75 1.36 1.85 0.88 0.19 -0.94 -1.92
-3.44 -4.07 -4.91 -3.59 -2.3 0.67 1.31 1.66 0.92 0.25 -0.53 -0.92
-4.36 -4.68 -6.12 -8.07 -5.12 0.38 1.38 1.95 1.03 0.32 -0.71 -2.23
-3.52 -4.25 -6.85 -8.06 -4.27 0.71 1.37 1.93 0.98 0.24 -1.15 -2.71
-3.58 -4.54 -5.03 -4.55 -3.6 0.57 1.37 1.78 1.19 0.31 -1.09 -2.09
-4.72 -4.3 -6.57 -6.7 -3.92 0.29 1.05 1.95 1.28 0.45 -0.79 -1.85
-4.52 -5.06 -7.45 -6.75 -2.83 0.53 1.31 2.03 0.85 0.2 -1.08 -1.67
-2.23 -1.89 -1.91 -1.17 -1.19 0.33 0.81 1.48 0.69 0.37 -0.22 -0.31
-4.79 -5.49 -6.64 -3.86 -3.02 0.46 1.37 1.93 0.93 0.24 -0.71 -1.83
-4.2 -4.16 -4.18 -4.29 -2.65 0.53 1.23 1.75 1.12 0.49 -0.84 -1.66
-4.33 -4.72 -6.76 - -3.79 0.21 1.15 2.24 0.99 0.23 -1.27 -2.66
-4.72 -5.04 -6.28 -8.69 -3.42 0.68 1.51 1.85 0.94 0.18 -0.96 -2.25
- -4.52 -5.61 -7.31 -4.42 0.68 1.12 1.82 1.06 0.66 -0.62 -1.86
- -2.93 -3.42 -2.32 -1.84 0.55 1.06 1.72 0.91 0.38 -0.48 -0.89
-5.12 -4.11 -6.96 -7.29 -3.55 0.76 1.4 2.12 0.79 -0.18 -1.38 -2.81
-3.76 -4.3 -3.35 -2.66 -2.72 0.59 1.16 1.8 0.86 0.51 -0.57 -1.67
- -4.78 -7.81 -8.14 -2.2 0.49 1.3 2.11 0.76 0.12 -1.06 -1.8
-4.81 -4.1 -5.25 -7.2 -3.48 0.8 1.34 1.91 0.94 0.16 -0.9 -2.47
-3.67 -4.21 -6.25 -8.31 -4.52 0.72 1.26 2.11 0.87 0.1 -1.34 -2.5
-3.78 -4.48 -6.21 -5.46 -4.52 0.44 1.24 1.99 1.11 0.29 -0.93 -2.38
- -3.59 - - -2.2 0.48 1.28 1.94 1.03 0.19 -1.34 -1.12
-3.58 -4.97 - - -1.65 0.79 1.38 1.84 0.8 -0.13 -0.77 -1.27
-2.98 -5.37 - -5.37 -2.44 0.65 1.38 2.0 0.61 -0.01 -0.88 -1.26
-4.88 -4.98 - - -3.42 0.62 1.3 1.97 0.96 0.29 -1.1 -1.72
- -5.03 -5.7 - -2.64 0.94 1.46 2.17 0.45 -0.36 -1.63 -2.59
-5.14 -3.95 -6.98 - -3.11 0.67 1.39 2.05 0.91 0.1 -1.53 -2.82
-5.0 -5.09 -6.85 - -5.38 0.6 1.23 1.82 1.22 0.44 -0.69 -2.22
-4.96 -3.98 -4.06 -2.46 -1.43 0.55 1.02 1.68 0.75 0.29 -0.15 -0.34
-4.79 -4.16 -7.12 -8.99 -4.39 0.59 1.29 2.13 0.83 0.08 -1.13 -2.23
-5.65 -3.48 -5.09 -6.38 -3.71 0.55 1.19 1.97 0.9 0.3 -0.79 -1.21
-4.79 -4.69 -4.6 -3.71 -1.26 0.7 1.35 1.89 0.77 -0.02 -0.89 -1.88
-4.04 -4.65 -5.35 -8.39 -2.99 0.66 1.41 1.96 0.89 0.14 -1.12 -2.37
-2.63 -4.46 -6.72 -6.3 -3.25 0.75 1.38 1.91 0.99 0.13 -1.44 -2.5
-5.17 -4.85 -6.01 -7.34 -3.47 0.73 1.37 2.02 0.96 -0.12 -1.26 -2.12
-5.92 -4.74 -4.96 -7.31 -2.84 0.76 1.45 2.02 0.75 0.17 -1.63 -2.65
- -4.09 -5.93 - -3.75 0.6 1.44 1.86 1.16 0.29 -1.4 -2.64
-2.97 -3.34 - -4.95 -3.11 0.45 1.18 1.77 1.04 0.28 -0.55 -0.69
-5.88 -4.2 -6.73 -7.61 -4.62 0.32 1.22 1.96 1.02 0.36 -0.57 -1.21
-6.55 -4.75 -5.61 -3.49 -2.1 0.34 1.19 1.84 0.94 0.16 -0.45 -0.49
-4.03 -4.62 -7.59 - -4.37 0.61 1.42 2.22 0.78 -0.18 -1.83 -3.44
- -6.85 - -4.3 -1.55 0.36 1.15 1.88 0.86 0.25 -0.22 -0.83
- -6.77 - -3.73 -1.54 0.22 1.33 2.01 0.61 0.15 -0.45 -0.96
-4.47 -4.15 -7.31 -8.86 -3.22 0.71 1.42 2.05 0.84 -0.07 -1.35 -2.52
-2.42 -2.43 -3.15 -2.53 -1.5 0.43 1.12 1.79 0.98 0.33 -0.83 -2.1
-5.63 -4.23 -4.99 -4.11 -2.79 0.44 1.25 2.09 0.82 0.05 -0.81 -1.65
- - - - -2.0 0.29 1.5 2.32 0.74 -0.19 -2.64 -
-3.58 -4.57 - - -4.45 0.07 1.17 1.97 1.19 0.44 -0.64 -1.59
- -3.65 -3.52 - -1.69 0.9 1.16 1.97 1.11 -0.27 -1.75 -2.2
-3.92 -4.75 -5.77 -4.65 -2.01 0.55 1.33 1.94 0.8 0.34 -0.82 -2.36
-4.24 -4.23 -6.67 -7.0 -4.52 0.73 1.41 1.89 0.89 0.33 -1.18 -1.9
- -4.72 -6.4 -6.73 -3.55 0.65 1.42 2.05 0.76 0.15 -1.01 -2.51
-3.84 -4.47 -6.17 -7.82 -5.33 0.48 1.42 1.86 1.1 0.29 -0.91 -2.06
-3.32 -4.16 -6.04 -7.96 -3.11 0.88 1.38 2.06 0.77 -0.14 -1.53 -2.77
-2.69 -3.44 -4.24 -6.08 -3.34 0.83 0.99 1.91 0.92 0.22 -0.84 -1.17
-4.34 -4.05 -5.53 -7.07 -6.05 0.35 1.19 1.92 1.22 0.55 -1.02 -2.2
-3.96 -3.96 -6.19 -6.13 -2.86 0.51 1.19 2.16 0.9 0.11 -1.07 -3.1
-3.93 -3.89 -6.37 -8.32 -3.57 0.68 1.42 1.86 0.98 0.21 -0.88 -2.37
-4.32 -4.0 -5.62 -7.27 -4.68 0.13 1.29 1.9 1.02 0.63 -0.57 -1.68
-3.08 -3.92 -5.83 -7.01 -3.87 0.83 1.4 1.76 1.05 0.21 -1.1 -2.15
-3.51 -4.38 -7.16 -7.7 -3.54 0.73 1.41 2.02 0.79 0.12 -1.34 -2.46
-3.5 -3.87 -6.93 - -4.28 0.43 1.27 1.81 1.18 0.46 -0.74 -1.83
-3.68 -4.46 -6.12 -8.85 -3.94 0.63 1.12 1.88 1.21 0.4 -0.91 -2.23
-3.05 -3.32 -4.89 -6.76 -7.2 0.42 1.14 1.79 1.1 0.8 -0.78 -1.91
-3.65 -4.54 -4.71 -4.72 -4.6 0.4 1.42 1.87 1.24 0.27 -1.4 -2.53
-3.65 -4.37 -6.3 -4.28 -1.74 0.76 1.35 1.93 0.85 -0.11 -1.1 -1.84
-4.2 -6.77 -5.31 -4.77 -2.23 0.74 1.38 1.87 0.97 0.07 -1.02 -2.07
-2.34 -3.95 -5.16 -5.09 -2.48 0.69 1.34 1.86 0.86 0.09 -1.02 -1.5
- -4.28 - -4.28 -4.14 0.08 1.32 1.95 1.12 0.56 -0.77 -2.52
-5.9 -4.71 -4.74 -7.07 -5.32 0.37 1.42 1.84 1.19 0.26 -0.81 -1.8
-3.6 -3.41 -2.21 -3.99 -4.57 0.23 1.14 2.21 0.73 0.0 -0.93 -1.72
-3.68 -3.85 - - -4.58 0.39 1.51 2.13 0.84 0.04 -1.53 -3.07
-3.77 -3.82 -5.54 -7.25 -1.93 0.65 1.34 1.81 1.02 0.41 -1.16 -2.68
-2.21 -3.99 -5.2 -5.92 -3.78 0.61 1.41 1.81 1.0 0.29 -1.25 -1.89
- -4.16 - - -2.17 0.71 1.2 1.76 1.14 0.5 -0.72 -2.44
-3.47 -0.91 -1.87 -1.21 -1.01 0.37 0.96 1.48 1.1 0.21 -0.9 -1.68
-3.11 -3.78 -5.27 -6.16 -3.54 0.55 1.15 1.94 1.02 0.37 -0.82 -1.84
-5.78 -4.18 -6.62 - -4.18 0.85 1.3 2.17 0.77 -0.1 -1.64 -2.91
-4.62 -5.27 - -5.51 -2.42 0.7 1.25 1.95 0.92 -0.09 -0.82 -1.14
-3.4 -3.85 -5.82 -4.96 -2.56 0.5 1.26 2.05 0.85 0.11 -0.81 -2.11
-2.62 -3.02 -3.85 -3.05 -1.84 0.54 1.29 1.95 0.63 0.16 -0.68 -2.43
-5.18 -4.77 -8.03 - -2.65 0.64 1.5 2.06 0.86 -0.03 -1.78 -2.9
-3.81 -4.08 -6.82 - -4.29 0.8 1.34 1.97 0.95 0.14 -1.32 -2.49
-3.81 -4.08 -6.65 - -4.61 0.78 1.48 2.07 0.74 0.01 -1.64 -2.92
-4.03 -4.22 -4.98 -4.84 -2.99 0.2 1.12 1.87 1.09 0.48 -0.42 -1.14
-3.77 -4.04 -6.94 -9.27 -4.22 0.59 1.28 2.06 0.82 0.21 -0.74 -2.41
-3.51 -3.64 -3.11 -2.61 -2.27 0.6 1.28 1.78 0.81 0.3 -0.92 -1.19
-3.39 -2.95 -2.99 -3.51 -3.3 0.56 1.32 1.91 0.81 0.21 -1.17 -1.49
-4.55 -3.54 -5.39 -5.21 -3.46 0.51 1.15 1.84 1.0 0.35 -0.41 -1.07
-3.12 -4.09 -7.54 - -3.59 0.44 1.27 2.12 0.74 0.0 -0.62 -1.74
-3.26 -4.1 -7.38 -7.65 -4.29 0.69 1.27 2.05 0.93 0.18 -1.33 -2.36
-3.67 -4.15 - - -4.59 0.71 1.39 1.8 1.06 0.26 -0.84 -2.09
-4.02 -3.61 -6.87 -7.2 -3.71 0.53 1.31 1.88 1.04 0.43 -0.77 -2.51
- -3.94 -3.95 -2.52 -2.08 0.51 1.28 1.67 1.01 0.55 -0.71 -1.56
-2.19 - -4.03 -3.36 -2.43 0.4 1.1 1.84 0.65 -0.03 0.06 -0.34
-3.9 -4.88 -7.86 - -3.98 0.56 1.36 2.08 1.02 0.11 -1.67 -2.86
-4.16 -4.0 -5.64 -10.42 -4.79 0.58 1.43 1.78 0.97 0.4 -0.66 -1.8
-2.86 -3.8 -4.99 - -7.01 0.52 1.02 1.94 1.13 0.57 -0.91 -2.03
-1.98 -2.64 -2.77 -2.17 -1.05 0.56 0.95 1.57 0.64 0.26 -0.16 -0.5
-3.77 -3.72 -4.33 -3.17 -2.93 0.48 1.24 1.86 0.88 0.31 -0.61 -1.21
-5.38 -4.59 -7.64 -8.77 -3.95 0.36 1.3 2.04 1.04 0.27 -0.95 -2.28
-3.14 -4.63 - -5.19 -5.02 0.52 1.21 1.77 1.01 0.37 -0.29 -0.95
-5.62 -5.32 -7.85 -7.22 -3.83 0.31 1.24 2.15 0.91 0.26 -1.11 -1.72
-3.92 -4.54 -5.86 -6.73 -4.42 0.35 1.23 2.02 1.07 0.41 -1.02 -2.22
-3.11 -4.03 -6.44 -8.31 -3.11 0.72 1.29 1.91 1.0 0.24 -1.17 -2.21
-4.14 -6.12 -7.57 -5.26 -1.25 0.74 1.35 1.95 0.71 -0.0 -1.16 -1.64
- -5.23 - - -2.08 0.41 1.37 1.97 1.09 0.24 -1.5 -1.98
- -4.26 -4.34 -4.26 -3.7 0.73 1.37 2.08 0.72 0.09 -1.13 -2.75
-2.76 -3.84 -5.35 -7.48 -3.93 0.59 1.43 1.87 1.04 0.13 -1.07 -2.44
-3.14 -4.04 -5.4 -4.42 -3.33 0.73 1.28 1.74 1.03 0.24 -0.61 -1.52
-3.5 -4.06 -6.67 - -3.14 0.67 1.37 1.81 1.1 0.16 -0.87 -2.11
-4.38 -4.25 -5.64 -8.55 -3.15 0.56 1.31 1.99 0.98 0.19 -0.99 -2.25
-4.5 -4.26 -8.41 -7.49 -3.84 0.8 1.46 2.06 0.81 -0.09 -1.57 -2.81
-3.27 -5.33 -6.7 -8.61 -4.11 0.54 1.26 1.8 1.24 0.5 -1.08 -2.14
-4.32 -5.99 -8.16 -7.71 -3.9 0.15 1.28 2.06 1.11 0.33 -0.9 -2.33
-5.0 -4.75 -7.72 -8.85 -3.32 0.62 1.33 2.09 0.91 0.01 -1.26 -2.38
-4.61 -4.54 -7.46 - -3.19 0.75 1.4 1.89 0.85 0.28 -1.01 -2.06
-5.54 -4.71 -7.38 -5.27 -2.17 0.88 1.41 1.95 0.86 -0.11 -1.37 -2.38

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.