Heatmap: Cluster_129 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
- -7.95 -4.6 -2.55 -0.71 -0.59 0.74 1.54 0.47 0.65 0.59 0.57
-3.45 -2.39 -2.87 -3.64 -3.53 -0.2 1.35 1.38 0.92 0.61 0.16 -0.23
-5.88 -5.85 -4.91 -4.48 -3.42 -1.71 1.06 1.57 1.11 0.71 0.52 0.27
-4.65 -3.91 -2.03 -1.35 -1.17 -0.27 0.64 1.25 0.81 0.64 0.52 0.37
- -4.3 - -5.49 -4.79 -2.05 1.59 1.59 1.08 0.55 -0.15 0.21
- -5.9 - - -6.12 -1.0 1.01 1.96 1.18 0.94 0.03 -1.47
-5.07 -2.6 -1.6 -1.37 -0.75 0.03 0.7 1.06 0.61 0.67 0.42 0.37
- - - - - -2.83 0.95 1.99 1.41 0.74 0.32 -1.39
-1.84 -1.3 -1.15 -1.24 -1.1 -0.13 0.9 0.97 0.81 0.55 0.11 -0.09
-2.26 -1.84 -1.41 -1.19 -0.41 0.17 0.61 0.9 0.65 0.44 0.33 0.32
-0.91 -0.97 -0.89 -1.04 -0.82 0.02 0.58 0.8 0.49 0.27 0.43 0.21
-2.64 -2.47 -2.01 -1.66 -0.89 -0.05 0.77 0.97 0.72 0.57 0.27 0.65
-3.29 -1.3 -0.76 -0.48 -0.21 -0.24 0.41 0.46 0.71 0.67 0.42 0.26
-1.65 -1.29 -1.5 -1.3 -1.38 -0.35 0.85 1.23 0.77 0.54 0.09 -0.05
-0.82 -2.16 -3.31 -2.65 -1.81 0.29 0.8 1.19 0.74 0.72 0.18 -0.07
- -2.87 -3.02 - -5.0 - 1.4 1.53 1.18 0.91 -0.06 0.09
-6.58 -4.75 -2.69 -1.56 -0.82 0.22 0.77 1.18 0.78 0.63 0.43 0.2
-1.44 -2.69 -3.42 -2.0 -0.98 0.4 0.74 0.7 0.75 0.7 0.25 0.58
-3.0 -2.44 -2.27 -1.71 -1.46 0.06 1.11 1.28 0.88 0.41 -0.15 0.14
-1.72 -1.78 -2.13 -1.84 -1.85 0.34 0.8 1.03 0.76 0.61 0.4 0.06
- -3.78 -2.44 -0.94 -1.42 0.04 0.92 1.73 0.99 0.65 -0.25 -2.15
-4.5 -1.59 -1.66 -1.65 -1.11 -0.74 1.05 1.2 0.69 0.43 -0.01 0.68
-4.49 -3.9 -3.77 -3.95 -2.54 -1.16 1.28 1.46 0.81 0.39 0.04 0.9
-0.99 -0.81 -0.99 -0.89 -0.63 0.09 0.48 0.57 0.62 0.44 0.31 0.21
-3.56 -1.9 -2.37 -1.54 -1.11 0.38 0.78 0.94 0.64 0.6 0.54 0.26
-3.06 -2.62 -2.37 -1.89 -1.0 0.19 0.89 1.17 0.62 0.7 0.33 0.12
-3.93 -1.51 -1.78 -1.45 -0.99 -0.07 0.94 1.54 0.83 0.48 -0.13 -0.79
-3.39 -2.66 -2.77 -3.83 -3.02 -1.31 1.04 1.87 1.13 0.47 -0.36 -0.08
-0.53 -0.81 -0.98 -0.9 -0.5 0.08 0.53 0.7 0.57 0.37 0.15 -0.02
-2.07 -1.53 -2.1 -1.87 -1.53 0.16 1.08 0.99 0.83 0.55 0.21 -0.08
-1.85 -2.96 -2.6 -1.64 -1.01 0.22 1.01 1.11 0.7 0.56 0.18 0.05
-1.94 -3.15 -3.16 -2.71 -2.2 0.07 1.09 1.41 0.68 0.39 -0.02 0.5
-2.82 -4.8 -4.67 -2.76 -1.61 0.37 1.29 0.94 1.01 0.94 -0.25 -0.21
-1.99 -4.5 -5.67 -2.65 -0.91 -0.09 1.17 1.18 0.36 0.29 0.5 0.7
- -4.47 -3.78 -3.75 -3.95 -2.82 1.04 1.53 1.15 0.93 0.51 0.15
-0.38 -0.98 -0.85 -0.89 -0.66 0.0 0.52 0.55 0.6 0.4 0.21 0.14
-3.8 -3.17 -2.44 -2.12 -1.39 0.13 0.75 0.97 1.11 0.66 0.42 0.27
-4.15 -2.38 -1.87 -1.86 -1.35 0.09 0.73 1.13 0.71 0.62 0.52 0.37
-4.66 -5.64 -3.03 -1.68 -0.28 0.46 0.94 1.07 0.7 0.09 0.34 0.42
-1.94 -1.54 -1.72 -1.73 -0.65 0.28 0.77 0.87 0.56 0.58 0.33 0.23
-0.98 -1.51 -1.07 -1.02 -0.83 0.05 0.47 0.46 0.66 0.59 0.44 0.46
-3.91 -4.2 -5.17 -4.19 -2.78 -1.3 1.11 1.94 1.17 0.75 -0.42 -0.82
-1.21 -1.28 -1.03 -0.71 -0.47 0.27 0.67 0.64 0.34 0.39 0.28 0.24
-5.63 -3.79 -1.23 -0.67 -0.6 -0.04 0.72 0.75 0.83 0.79 0.32 0.21
-0.91 -1.64 -3.82 -3.88 -3.75 0.01 0.97 1.36 1.09 0.21 -0.41 0.43
-5.76 -3.91 -4.35 -3.23 -3.43 -1.37 1.4 1.3 1.16 0.91 0.16 -0.07
-1.41 -1.31 -1.63 -1.97 -1.32 0.1 0.71 1.15 0.62 0.52 0.36 0.09
-3.48 -3.32 -3.88 -3.07 -2.11 -0.27 0.77 1.61 0.99 0.69 0.21 0.07
-7.21 -7.11 -6.42 -3.69 -1.67 -0.32 1.11 1.48 0.97 0.64 0.33 0.07
-4.75 -4.5 -3.36 -2.48 -1.64 -0.07 0.54 1.4 0.84 0.88 0.45 0.34
- -5.65 -4.74 -4.47 -2.31 -0.67 1.23 1.61 0.76 0.45 0.22 0.52
-3.92 -2.82 -1.87 -4.19 -2.66 -1.68 1.09 1.66 1.12 0.64 0.39 -0.57
-2.79 -3.85 -3.27 -1.73 -1.06 -0.32 0.83 1.36 0.81 0.48 0.17 0.56
- -4.07 -2.8 -2.35 -0.83 -0.09 0.94 1.53 0.71 0.54 0.23 0.05
-3.87 -7.85 -5.72 -2.79 -1.37 -0.17 0.75 1.34 0.84 0.81 0.45 0.46
- - - -8.41 -3.06 -0.67 1.02 1.66 1.03 0.6 0.34 0.32
-4.96 -3.29 -2.31 -1.29 -0.49 0.4 1.12 0.92 0.59 0.46 0.18 0.21
-1.69 -1.6 -1.18 -0.72 -0.5 0.28 0.49 0.76 0.55 0.54 0.25 0.25
-2.04 -1.62 -1.14 -0.85 -1.03 -0.27 1.05 1.0 0.82 0.62 -0.12 -0.3
-1.43 -1.43 -1.59 -1.19 -1.08 0.1 0.54 1.04 0.6 0.48 0.38 0.3
-1.75 -3.85 -2.19 -0.82 -0.34 -0.06 0.65 1.04 0.61 0.52 0.45 0.21
-1.12 -1.52 -1.89 -1.91 -1.22 -0.35 1.22 1.0 0.86 0.37 0.04 -0.03
-1.69 -1.75 -2.28 -2.11 -0.82 -0.24 1.23 0.73 0.8 0.51 0.22 0.27
-1.77 -1.61 -1.67 -1.12 -0.72 0.45 0.71 0.69 0.55 0.52 0.29 0.34
- -5.49 -2.62 -1.43 -0.49 0.17 0.79 1.11 0.78 0.46 0.38 0.41
-0.41 -0.85 -0.57 -0.01 -0.06 0.21 0.3 0.31 0.33 0.21 0.06 -0.04
-1.29 -1.02 -0.85 -0.73 -0.38 0.11 0.6 0.51 0.67 0.41 0.17 0.15
-0.45 -0.6 -1.17 -1.7 -1.45 -0.67 0.86 1.12 0.69 0.46 -0.02 -0.14
-4.51 -3.73 -2.62 -2.16 -0.62 0.59 1.02 0.95 0.66 0.5 0.42 0.06
-5.99 -5.98 -4.82 -3.43 -1.78 0.14 1.25 1.46 1.09 0.59 -0.03 -0.51
-3.48 -4.88 -5.16 -6.57 -6.31 -0.65 0.7 1.91 1.33 0.89 -0.11 -0.93
-1.26 -1.82 -1.97 -1.06 -0.4 0.11 0.54 0.67 0.71 0.6 0.35 0.33
-5.4 -6.07 -3.61 -4.39 -2.5 -0.1 1.35 1.45 1.04 0.38 -0.43 0.42
-6.17 -5.92 -4.65 -2.22 -1.01 -0.35 0.88 1.21 0.85 0.68 0.55 0.49
-3.99 -2.2 -0.89 -0.49 -0.57 -0.39 0.53 0.74 0.71 0.45 0.62 0.47
-9.31 -8.48 -6.05 -4.18 -2.55 -1.93 1.04 1.47 0.92 0.72 0.42 0.84
-2.5 -1.49 -1.56 -1.24 -0.67 0.3 0.6 0.98 0.47 0.51 0.43 0.27
- - - - - -2.3 1.15 1.75 0.98 0.64 0.5 0.35
-6.14 -6.94 -5.58 -4.79 -2.15 0.06 1.4 1.56 0.91 0.54 0.04 -0.55
-3.45 -4.06 -5.1 -6.62 -2.4 0.09 0.71 1.1 0.81 0.92 0.74 0.55
-6.8 -2.54 -1.21 -0.53 -0.54 -0.43 0.67 1.0 0.66 0.55 0.46 0.34
-6.95 -4.5 -2.93 -1.88 -0.67 0.05 0.9 1.21 0.83 0.7 0.29 0.1
-3.32 -2.65 -2.27 -1.35 -0.88 -0.09 1.21 1.27 1.0 0.42 -0.13 -0.55
-0.82 -1.64 -0.85 -0.74 -0.61 0.18 0.55 0.8 0.73 0.62 -0.02 -0.36
- -9.25 -5.34 -3.16 -1.22 -0.75 1.18 1.55 1.06 0.59 0.22 -0.17
-5.25 -4.36 -6.09 -7.42 -7.07 -1.6 1.04 2.08 1.13 0.67 -0.22 -0.66
-4.98 -5.3 -5.61 -7.3 -7.07 -0.22 0.88 1.97 1.29 0.59 -0.26 -0.98
-4.54 -3.44 -2.25 -1.25 -0.48 0.32 1.08 1.18 0.6 0.44 0.1 -0.1
-4.29 -1.97 -0.69 -0.67 -0.41 0.16 0.47 0.9 0.55 0.52 0.29 0.27
-2.61 -3.19 -1.24 -0.87 -0.95 -0.24 0.93 1.22 0.87 0.54 0.15 -0.38
-7.07 -5.07 -3.06 -2.02 -0.65 0.35 0.97 1.18 0.55 0.33 0.43 0.47
-5.12 -4.37 -3.48 -3.06 -2.5 0.17 1.1 1.45 0.77 0.52 0.16 0.37
-7.3 -5.1 -3.42 -2.46 -1.04 -0.12 1.08 1.34 0.77 0.49 0.37 0.31
-1.3 -1.24 -0.78 -0.69 -0.37 0.1 0.53 0.54 0.58 0.42 0.27 0.25
-7.8 - -7.44 -3.61 -1.45 -0.94 1.28 1.75 0.95 0.49 0.03 -0.19
-3.22 -4.33 -3.16 -2.72 -2.01 -0.49 1.12 1.63 1.15 0.57 -0.06 -0.53
-1.05 -0.69 -0.91 -1.11 -0.62 0.23 0.55 0.8 0.6 0.35 0.13 -0.01
-0.47 -0.84 -1.86 -2.3 -2.1 0.08 0.69 0.93 0.76 0.67 0.18 0.02
-4.27 -1.93 -1.26 -1.15 -0.87 0.02 0.93 0.94 0.57 0.42 0.4 0.37
-10.62 -9.36 -9.09 -7.84 -5.24 -1.7 1.33 1.5 0.8 0.62 0.47 0.73
-0.24 -1.66 -1.1 -0.25 -0.14 0.18 0.22 0.78 0.35 0.17 0.13 0.15
-1.56 -1.87 -2.02 -1.61 -1.16 0.11 1.05 1.19 0.66 0.44 0.11 -0.13
- - - -2.63 -3.29 -1.3 1.41 1.68 -0.12 -0.25 0.46 1.22
-1.02 -1.87 -1.72 -0.4 0.02 0.27 0.45 0.61 0.51 0.49 0.26 0.05
-1.38 -1.18 -0.95 -0.93 -0.65 0.04 0.56 0.79 0.64 0.45 0.2 0.24
- - - -6.78 -2.82 -1.51 1.24 1.76 0.84 0.52 0.22 0.47
-5.51 -4.69 -4.4 -3.09 -1.75 -0.11 0.9 1.09 1.01 0.74 0.58 0.47
-0.9 -0.46 -0.91 -0.89 -0.89 0.04 0.7 0.55 0.63 0.27 0.12 0.22
-2.22 -2.66 -2.64 -2.29 -1.3 0.37 0.85 0.96 0.66 0.68 0.49 0.32
-3.1 -1.86 -0.93 -0.98 -0.67 0.01 0.36 0.96 0.73 0.52 0.46 0.31
-1.28 -1.03 -2.36 -2.31 -1.61 0.13 0.58 1.05 0.79 0.62 0.31 0.29
-3.04 -3.15 -3.49 -2.86 -1.43 0.31 1.06 1.36 0.77 0.42 0.23 0.09
-2.92 -3.01 -3.11 -2.17 -1.53 0.18 0.71 1.03 0.81 0.72 0.62 0.4
-4.94 -4.68 -4.78 -6.44 -3.98 0.03 1.09 1.24 0.83 0.91 0.65 0.09
- - - - - -1.56 1.43 1.48 1.09 0.85 0.2 0.14
-4.7 -2.17 -1.64 -1.14 -0.6 0.25 0.94 0.64 0.8 0.55 0.26 0.3
-1.86 -2.01 -2.26 -1.9 -2.07 -1.53 1.27 1.36 0.86 0.61 0.23 -0.13
-3.5 -2.74 -1.74 -1.65 -1.23 -0.37 1.34 1.12 0.98 0.48 0.04 -0.24
-6.09 -4.26 -2.41 -1.72 -0.95 -0.0 1.07 1.17 0.94 0.59 0.14 0.07
-1.25 -0.59 -1.85 -0.72 -0.81 -0.48 0.43 1.28 0.66 0.5 0.17 -0.26
-0.24 -0.62 -1.73 -0.87 -0.39 -0.52 0.42 0.94 0.65 0.35 0.12 0.02
- -6.56 -2.83 -2.16 -0.97 -0.29 0.85 1.0 0.87 0.81 0.62 0.45
-1.11 -0.89 -0.91 -0.84 -0.5 0.06 0.61 0.53 0.54 0.31 0.25 0.37
-5.73 -2.72 -1.02 -0.64 -0.35 -0.02 0.69 1.07 0.71 0.56 0.15 -0.01
-1.2 -0.64 -0.6 -0.5 -0.3 0.32 0.67 0.47 0.61 0.2 0.08 -0.35
- -9.24 -5.61 -3.31 -1.2 -0.65 1.32 1.4 1.1 0.61 0.2 -0.24
-7.7 -8.16 -6.41 -5.81 -2.64 -0.94 1.39 1.43 0.67 0.45 0.41 0.75
- -4.19 - -4.97 -1.82 0.18 0.93 1.26 1.23 0.98 0.26 -0.57
- -5.87 -4.74 -4.29 -5.73 -1.4 0.86 1.63 1.1 0.85 0.74 -0.05
-0.29 -1.77 -2.47 -1.87 -0.78 0.25 1.02 0.79 0.33 0.26 0.04 0.52
-5.16 -3.7 - - -6.59 -1.22 1.1 2.05 1.23 0.67 -0.39 -1.08
-0.25 -1.9 -3.06 -5.08 -5.02 -1.82 1.36 1.14 0.63 0.37 -0.02 0.87
-2.25 -2.9 -6.2 -4.26 -1.8 0.16 1.13 1.13 0.7 0.61 0.37 0.45
-2.91 -4.08 -5.16 -3.19 -1.06 0.09 1.13 1.32 0.62 0.57 0.26 0.29
-4.86 -3.71 -2.63 -1.82 -1.24 -0.86 0.78 1.42 0.77 0.71 0.53 0.38
-4.41 -4.38 -2.51 -2.05 -1.45 -1.05 0.94 1.32 0.84 0.69 0.63 0.36
-4.68 -3.99 -3.36 -3.83 -3.52 -0.86 1.22 1.5 0.84 0.8 0.37 0.16
-4.62 -4.58 -5.76 -3.67 -1.25 -0.17 1.05 1.7 0.83 0.5 -0.02 0.0
- -8.67 -4.74 -4.4 -1.58 -0.21 1.29 1.36 0.72 0.52 0.24 0.53
-2.93 -3.35 -2.36 -1.79 -0.69 0.45 0.95 0.86 0.73 0.67 0.11 0.29
-6.61 -6.16 -3.82 -2.66 -0.92 -0.26 1.24 1.2 0.96 0.55 0.24 0.17
- -2.23 - - - -1.24 1.28 2.11 0.82 0.47 -0.91 -0.08
-4.59 -3.76 -2.78 -2.85 -2.18 -1.6 1.11 1.79 0.9 0.6 0.19 -0.13
-3.99 -3.7 -4.63 -2.39 -0.96 0.03 0.76 1.35 0.82 0.62 0.25 0.44
-3.08 -2.64 -2.23 -1.71 -1.38 -0.54 1.35 1.35 0.93 0.52 -0.04 -0.45
-0.34 -1.54 -1.43 -0.7 0.07 0.2 0.46 0.62 0.59 0.3 0.07 -0.03
-1.59 -1.61 -1.56 -1.15 -0.88 0.01 0.75 0.84 0.71 0.5 0.33 0.27
-1.22 -2.23 -2.37 -1.59 -1.2 -0.03 1.17 1.11 0.85 0.53 -0.0 -0.4
-5.58 -2.86 -1.89 -1.39 -0.84 0.16 0.7 1.15 0.94 0.65 0.25 -0.01
-3.25 -2.66 - -4.1 -3.42 -3.45 0.97 1.58 1.26 0.89 0.61 -0.38
-8.96 -6.53 -3.03 -1.5 -0.48 0.17 0.77 1.01 0.8 0.53 0.53 0.42
-0.18 -0.27 -1.18 -0.91 -0.46 0.09 0.61 0.85 0.55 0.08 -0.19 -0.31
-0.41 -1.3 -1.93 -0.88 -0.37 0.17 0.69 0.9 0.52 0.3 0.06 -0.09
-4.76 -4.34 -2.47 -1.01 -0.29 0.38 0.84 1.05 0.65 0.35 0.43 0.1
-3.34 -1.87 -1.63 -1.41 -1.2 0.38 0.74 0.88 0.73 0.72 0.31 0.19
-2.24 -1.12 -1.1 -1.09 -0.67 0.11 0.67 0.72 0.67 0.4 0.37 0.31
-1.47 -1.09 -1.16 -1.39 -0.63 0.07 0.59 0.41 0.6 0.59 0.47 0.49
-1.04 -0.54 -0.44 -0.79 -0.5 0.06 0.49 0.56 0.56 0.4 0.11 -0.0
-4.18 -2.32 -1.25 -0.95 -0.48 0.15 0.51 1.05 0.5 0.48 0.45 0.4
-3.62 -2.3 -1.27 -1.6 -1.27 -0.35 1.18 1.03 1.07 0.6 0.05 -0.29
-1.17 -3.1 -3.1 -1.59 -1.51 -0.53 0.94 1.19 0.75 0.57 0.32 0.43
-3.28 -5.7 -3.74 -2.02 -0.42 0.17 0.93 0.98 0.72 0.56 0.4 0.45
-4.02 -4.98 -3.39 -1.99 -0.39 0.4 0.91 1.19 0.73 0.41 0.21 0.22
-3.58 -4.48 -3.1 -1.74 -0.5 -0.26 0.81 1.21 0.57 0.65 0.6 0.37
- -6.62 -2.52 -2.15 -1.49 -1.34 0.73 1.72 1.19 0.73 0.21 -0.3
-3.36 -2.28 -1.89 -1.41 -0.8 -0.08 0.83 0.9 0.84 0.64 0.45 0.23

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.