Heatmap: Cluster_81 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-2.21 -4.45 -6.03 -6.56 -1.67 1.05 1.37 1.85 0.46 0.1 -1.11 -2.09
-2.54 -2.5 -3.46 -3.97 -2.22 0.89 1.46 1.71 0.66 -0.12 -1.05 -1.24
-3.73 -4.02 -7.33 -10.66 -3.57 1.02 1.57 1.87 0.78 -0.12 -1.49 -2.84
-2.0 -2.72 -3.73 -3.22 -1.59 0.85 1.51 1.62 0.77 -0.07 -1.17 -1.99
-2.88 -2.99 -3.74 -2.4 -1.06 0.8 1.24 1.69 0.69 0.11 -0.74 -1.39
-4.44 -4.97 -6.18 -5.06 -1.34 1.1 1.51 1.82 0.73 -0.15 -2.02 -2.58
-1.3 -1.23 -1.76 -2.38 -1.92 0.58 1.07 1.47 0.72 0.13 -0.41 -0.84
-4.15 -4.44 -7.58 -7.47 -2.04 0.9 1.48 1.9 0.82 -0.04 -1.46 -2.63
-3.75 -4.11 -5.88 -6.92 -2.7 1.13 1.45 1.87 0.78 -0.06 -1.79 -2.66
-4.69 -4.86 -6.34 -7.08 -2.62 1.07 1.64 1.94 0.63 -0.4 -1.85 -3.4
-3.13 -3.51 -6.29 -6.62 -3.34 0.95 1.46 1.68 0.99 0.27 -1.26 -2.53
-4.42 -4.25 -7.27 -7.74 -3.11 0.92 1.53 1.91 0.74 0.04 -1.39 -2.67
-4.19 -4.45 -7.97 -8.25 -2.75 1.01 1.45 1.91 0.82 0.03 -1.63 -2.99
-3.68 -4.22 -7.1 -9.24 -4.05 0.82 1.58 1.81 0.85 0.05 -1.01 -2.37
-4.21 -3.4 -7.05 - -2.73 1.12 1.47 1.72 0.87 0.02 -1.18 -2.47
-3.41 -3.83 -6.6 -4.05 -1.8 1.07 1.39 1.6 0.89 0.11 -1.01 -1.75
-3.44 -3.89 -5.3 -6.11 -2.9 1.02 1.77 1.67 0.63 -0.18 -1.23 -2.43
-4.29 -3.96 -6.13 - -2.67 1.04 1.43 1.93 0.75 0.01 -1.58 -2.79
-2.36 -3.57 -4.94 - -5.19 1.3 1.39 1.79 0.8 -0.26 -1.59 -2.21
-3.22 -4.06 -6.87 -5.12 -1.9 0.96 1.44 1.62 0.9 0.27 -1.07 -2.06
-4.2 -4.06 -4.94 -3.4 -1.64 1.02 1.67 1.6 0.58 -0.07 -1.24 -1.65
-3.04 -3.72 -6.47 - -3.68 0.86 1.45 1.88 0.82 0.08 -1.26 -2.1
-3.28 -4.43 -4.11 -4.59 -3.28 0.92 1.48 1.75 0.94 0.01 -1.12 -2.14
-4.2 -3.2 -2.43 -1.42 -1.05 0.8 1.27 1.62 0.57 0.06 -0.64 -1.28
-3.69 -4.03 -5.41 -5.85 -3.08 0.93 1.32 1.78 0.96 0.26 -1.04 -2.11
-5.22 -4.31 -6.7 -5.03 -3.1 0.82 1.58 1.9 0.79 -0.0 -1.36 -2.64
-2.15 -1.54 -1.63 -1.61 -1.39 0.64 1.02 1.55 0.68 0.14 -0.49 -1.1
-3.8 -4.76 -8.73 - -3.53 0.79 1.46 1.96 0.88 0.1 -1.47 -2.51
-3.49 -3.65 -5.47 - -3.66 0.79 1.32 1.78 0.92 0.41 -0.84 -1.74
-3.68 -3.31 -6.11 - -5.77 1.15 1.48 1.89 0.75 -0.0 -1.86 -3.08
-2.79 -4.0 -6.64 -6.77 -4.35 1.02 1.4 1.75 0.92 0.19 -1.11 -2.25
-3.13 -3.56 -3.96 -2.59 -1.32 0.94 1.31 1.71 0.68 0.03 -1.08 -1.31
-2.68 -4.98 -5.85 - -2.62 1.04 1.45 1.59 0.95 0.23 -1.01 -2.27
-3.82 -4.09 -6.99 - -1.97 1.19 1.52 1.74 0.75 -0.04 -1.47 -2.98
-3.41 -3.82 -5.99 -7.46 -3.35 0.97 1.4 1.72 0.88 0.36 -0.99 -2.2
-3.7 -2.39 -5.35 -3.72 -2.74 1.12 1.38 1.68 0.94 -0.11 -1.18 -2.31
-4.71 -4.13 -5.85 -3.56 -1.99 0.91 1.45 1.75 0.77 0.17 -1.09 -1.87
-2.98 -2.25 -2.17 -4.05 -1.6 0.79 1.15 1.83 0.45 0.1 -0.56 -1.21
-2.13 -3.15 -3.72 -3.56 -1.74 1.08 1.47 1.69 0.51 0.07 -1.2 -2.43
-2.12 -3.01 -3.69 -4.67 -1.84 0.84 1.52 1.77 0.8 -0.14 -1.44 -2.49
-3.4 -3.91 -5.18 -6.0 -2.94 1.03 1.6 1.97 0.59 -0.32 -1.94 -3.16
-2.93 -4.51 -6.35 -6.68 -3.47 1.03 1.43 1.77 0.68 0.17 -0.89 -1.74
-3.31 -3.64 - -7.5 -2.86 1.15 1.54 1.8 0.76 -0.13 -1.7 -2.74
-3.11 -4.1 -6.34 - -3.4 0.9 1.61 1.73 0.91 0.06 -1.31 -2.7
-4.24 -3.9 -6.37 -6.97 -5.07 0.89 1.48 1.93 0.78 0.1 -1.32 -2.46
-5.44 -3.58 -6.29 -6.83 -2.17 1.06 1.48 1.66 0.84 0.17 -1.08 -2.25
-3.47 -4.03 -8.32 -6.75 -2.29 0.93 1.44 1.88 0.76 0.13 -1.3 -2.68
-4.17 -4.31 -8.47 -9.94 -3.92 0.91 1.48 1.93 0.89 0.07 -1.63 -2.93
-3.26 -4.2 -6.55 -7.15 -2.23 0.98 1.33 1.73 0.98 0.19 -1.08 -2.16
-1.16 -1.14 -2.11 -1.46 -1.34 0.54 0.93 1.53 0.45 0.11 -0.25 -0.79
-4.01 -4.23 -8.07 - -1.56 1.11 1.7 1.81 0.49 -0.34 -1.86 -2.83
-1.43 -3.67 -4.92 -5.67 -2.77 0.77 1.36 1.75 0.92 0.26 -1.33 -2.04
-3.94 -4.06 -6.47 - -2.55 1.04 1.45 1.76 0.76 0.17 -1.0 -2.39
-3.42 -3.98 -6.85 -7.39 -3.23 1.05 1.66 1.85 0.69 -0.21 -1.79 -3.17
-4.04 -3.6 -7.88 - -2.29 1.1 1.55 1.75 0.68 0.07 -1.27 -2.81
-3.38 -3.72 -7.23 -5.36 -3.79 1.08 1.55 1.62 1.02 0.03 -1.37 -2.43
-5.6 -4.5 -7.44 - -3.08 0.99 1.38 1.98 0.79 0.1 -1.68 -2.71
-3.49 -4.32 -6.69 -7.53 -2.85 0.89 1.5 1.93 0.65 0.05 -1.2 -2.5
-3.89 -3.71 -6.73 -8.06 -3.13 1.06 1.43 1.97 0.73 -0.15 -1.72 -2.63
-3.85 -4.21 -6.74 -10.09 -4.56 0.98 1.42 1.87 0.9 0.11 -1.34 -2.48
-4.46 -4.43 -5.11 -4.14 -1.65 0.98 1.64 1.78 0.67 -0.19 -1.33 -3.11
-4.16 -3.52 -7.28 -7.44 -3.36 0.86 1.4 1.68 1.04 0.39 -1.0 -2.26
-4.67 -4.25 -5.24 -5.05 -1.82 0.8 1.4 1.85 0.8 0.16 -1.02 -2.06
-2.5 -4.74 - - -2.52 0.93 1.53 1.79 0.58 0.04 -0.93 -1.71
-4.25 -4.91 - -3.35 -1.77 0.95 1.49 1.76 0.81 0.06 -1.36 -2.18
-3.5 -3.63 -6.35 -8.48 -3.83 1.04 1.6 1.62 0.91 0.15 -1.34 -2.26
-3.03 -4.01 -6.68 -8.23 -2.94 0.89 1.31 1.86 0.88 0.15 -0.86 -2.27
-3.0 -3.92 -6.42 - -1.68 1.0 1.55 1.89 0.61 -0.24 -1.67 -2.61
-4.0 -3.4 -3.09 -2.89 -1.5 0.9 1.39 1.53 0.69 0.15 -0.48 -1.27
-4.4 -4.54 -6.25 - -3.08 0.91 1.53 1.85 0.91 -0.07 -1.43 -2.42
-6.2 -4.73 - - -2.13 0.83 1.59 1.95 0.77 -0.11 -1.84 -2.83
-4.14 -3.96 - - -1.89 0.92 1.3 2.02 0.81 -0.06 -1.42 -2.91
- -2.85 - -2.84 -1.55 1.06 1.39 1.89 0.48 -0.18 -0.92 -2.52
-3.65 -4.27 - - -3.13 0.77 1.39 2.0 0.88 0.1 -1.6 -2.39
-2.42 -3.23 -5.18 -4.13 -2.28 0.92 1.52 1.7 0.87 -0.02 -1.26 -2.46
-4.06 -4.05 -6.39 -9.04 -3.2 0.82 1.46 1.73 1.05 0.32 -1.24 -2.46
-3.56 -4.32 -6.4 -8.32 -2.32 0.89 1.45 1.84 0.76 0.09 -1.04 -2.19
-3.75 -3.93 - -5.51 -1.9 1.11 1.45 1.88 0.59 -0.11 -1.26 -2.68
-2.5 -1.55 -3.02 -4.89 -3.52 0.95 1.42 1.7 0.63 0.03 -1.2 -1.43
-2.99 -3.7 -4.71 -4.57 -1.89 1.01 1.39 1.72 0.86 0.18 -1.28 -2.75
-1.06 -3.34 -6.91 -3.96 -1.65 0.94 1.28 1.71 0.42 -0.11 -0.67 -0.91
- -5.49 -6.68 - -2.76 1.02 1.55 1.82 0.89 0.12 -1.98 -2.86
-3.14 -5.12 -6.31 - -2.5 0.95 1.51 1.84 0.75 0.09 -1.38 -2.46
-3.78 -3.83 -7.49 -8.62 -3.23 1.04 1.46 1.76 0.81 0.1 -0.93 -2.3
-2.96 -3.8 - -5.0 -2.06 0.86 1.38 1.79 0.9 0.18 -1.03 -2.64
-3.87 -3.68 -7.3 - -3.26 1.24 1.47 1.84 0.71 -0.07 -1.7 -3.0
-3.99 -4.61 -7.42 -8.17 -3.37 0.86 1.5 1.89 0.89 0.06 -1.35 -2.77
-3.8 -4.26 - - -3.46 0.92 1.45 1.69 1.0 0.3 -0.96 -2.32
-4.44 -4.63 - - -2.78 0.76 1.66 1.96 0.8 -0.22 -1.6 -3.11
-2.04 -2.04 -2.49 -1.88 -1.55 0.73 1.2 1.63 0.64 0.2 -0.79 -1.36
-2.96 -4.01 -6.81 - -3.31 1.24 1.57 1.81 0.71 -0.3 -1.87 -2.91
-4.66 -4.39 - -6.83 -2.39 0.79 1.39 1.77 0.81 0.27 -0.54 -1.68
-3.83 -5.22 -6.67 - -2.75 1.11 1.7 1.78 0.68 -0.23 -1.71 -2.74
-3.3 -2.69 -3.33 -4.13 -2.6 1.07 1.47 1.74 0.78 -0.1 -1.34 -2.77
-3.6 -3.41 -4.52 -3.65 -2.06 0.98 1.48 1.68 0.77 0.07 -1.07 -1.94
-1.89 -3.52 -3.43 -4.15 -2.57 1.09 1.43 1.64 0.63 -0.08 -0.71 -1.74
-2.9 -2.53 -3.43 -1.93 -1.46 0.93 1.24 1.68 0.78 0.1 -1.04 -2.1
-3.97 -3.35 -5.97 -3.62 -1.75 1.02 1.61 1.65 0.72 -0.01 -1.31 -2.45
- -4.3 -5.03 -5.0 -2.31 1.09 1.46 1.69 0.88 0.15 -1.31 -2.04
- -3.76 -7.13 -5.67 -2.49 1.04 1.44 1.91 0.72 0.02 -1.61 -2.31
-5.39 -5.06 -8.82 -7.0 -3.48 0.89 1.61 1.89 0.73 0.02 -1.3 -2.72
-4.5 -4.22 -7.93 -7.82 -3.06 1.0 1.58 1.69 0.91 0.18 -1.36 -2.84
-2.61 -3.67 -4.84 -5.13 -2.84 0.96 1.45 1.78 0.94 -0.2 -1.2 -2.07
-3.25 - -2.8 -3.98 -3.27 1.11 1.42 1.79 0.62 0.18 -1.15 -2.61
-3.93 -4.26 -7.23 - -1.91 1.17 1.61 1.82 0.69 -0.31 -1.92 -3.38
-4.55 -3.89 -6.1 -7.2 -3.71 0.91 1.54 1.77 0.93 0.11 -1.17 -2.62
-3.88 -4.95 -6.72 -8.05 -2.77 0.94 1.53 2.01 0.58 -0.06 -1.64 -3.04
-4.45 -3.8 -5.71 - -2.29 1.19 1.57 1.69 0.82 0.02 -1.66 -3.36
-4.07 -3.6 -7.03 - -4.51 1.06 1.43 1.66 0.93 0.31 -0.97 -2.37
-5.48 -4.08 - - -2.54 1.08 1.62 1.69 0.87 0.05 -1.66 -2.67
-2.76 -4.13 -6.19 - -3.45 0.91 1.33 2.0 0.88 -0.04 -1.6 -2.58
-3.25 -4.15 -4.2 -3.81 -1.5 0.88 1.61 1.69 0.81 -0.1 -1.3 -2.72
-3.75 -4.12 -6.88 - -2.85 1.16 1.57 1.8 0.73 -0.08 -1.66 -3.11
-3.85 -3.02 -5.33 - -2.39 0.89 1.36 1.66 1.01 0.27 -0.79 -2.33
-5.48 -3.83 -7.32 -5.21 -2.79 1.06 1.52 1.74 0.91 0.01 -1.48 -2.5
-4.83 -4.77 -6.62 -5.78 -1.89 1.01 1.48 2.02 0.47 -0.21 -1.57 -2.34
- -3.85 - -5.85 -2.51 0.96 1.4 1.84 1.01 -0.02 -1.13 -3.0
-5.47 -3.74 -3.8 -4.57 -3.56 1.15 1.61 1.94 0.6 -0.67 -1.72 -2.9
-2.94 -3.75 - - -2.85 0.88 1.44 1.8 0.73 0.19 -0.96 -1.74
-3.85 -3.13 -4.29 -3.54 -2.24 1.0 1.31 1.82 0.61 -0.07 -0.68 -1.5
-4.81 -4.61 - -6.98 -1.42 1.01 1.37 1.7 0.62 0.17 -0.69 -1.31
-3.29 -4.18 -5.62 - -2.21 1.02 1.52 1.84 0.76 -0.13 -1.51 -2.52
-3.4 -4.26 - - -2.41 0.88 1.45 1.95 0.82 -0.2 -1.24 -2.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.