Heatmap: Cluster_18 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 0.19 0.96 1.34 1.95 1.85 0.62 0.45 0.43
0.0 0.08 0.0 0.0 0.09 0.34 0.24 0.11 0.3 0.0 0.14 0.48
0.0 0.03 0.0 0.0 0.21 1.05 1.99 3.05 3.51 1.72 0.65 0.39
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.32 0.21 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.15 0.2 0.0 0.0 0.11
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.02 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.14 0.17 0.0 0.0 0.0
0.77 0.2 0.0 0.64 0.5 1.07 1.59 2.0 3.12 2.74 1.25 2.4
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.11 0.14 0.06 0.05 0.03
0.78 0.25 0.11 0.17 0.05 0.38 0.58 0.65 0.61 0.4 0.35 0.13
24.26 19.47 3.92 2.26 4.84 35.63 128.56 151.16 175.95 109.99 46.39 28.4
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.0 0.09 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.27 0.19 0.1 0.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.08 0.06 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.46 0.63 1.31 0.36 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.31 0.6 1.04 0.32 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.09 1.08 1.14 1.66 0.47 0.31 0.2
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.22 0.44 0.71 0.62 0.33 0.1 0.05
0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.38 1.37 1.23 1.98 0.36 0.77 0.12
0.46 0.0 0.13 0.0 0.0 1.04 2.03 2.87 2.32 1.2 0.87 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.2 0.39 0.14 0.07 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.28 0.57 0.96 1.06 0.68 0.23 0.06
0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.09 0.35 0.58 0.34 0.11 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.57 0.67 1.53 0.15 0.1 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.51 0.76 1.06 0.0 0.21 0.0
0.0 0.26 0.1 0.0 0.0 0.15 0.69 0.6 0.79 0.52 0.27 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.44 0.98 0.71 0.26 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.13 0.4 0.96 0.0 0.1 0.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.37 0.47 0.53 0.08 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.16 0.48 0.7 0.64 0.41 0.12 0.05
0.0 0.56 0.36 0.93 0.15 1.49 1.54 2.35 3.8 1.06 0.8 0.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.11 0.08 0.04 0.09 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.01
1.07 0.48 0.73 0.89 1.43 4.26 10.8 12.99 15.14 11.2 3.54 2.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.51 0.13 0.5 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.03 0.04 0.02 0.0
0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.31 0.61 1.12 1.0 0.72 0.36 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.1 0.31 0.21 0.28 0.1 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03
0.0 0.1 0.0 0.06 0.04 0.0 0.24 0.14 0.29 0.0 0.14 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01 0.12 0.07 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.01 0.11 0.2 0.06 0.14 0.03 0.09 0.05
0.0 0.74 1.08 0.27 0.06 9.31 26.06 29.08 37.05 22.14 9.75 4.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.02
0.03 0.05 0.05 0.08 0.08 0.06 0.1 0.18 0.17 0.09 0.1 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.13 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.1 0.16 0.08 0.0 0.0 0.07
0.11 0.16 0.14 0.22 0.18 0.15 0.23 0.32 0.58 0.37 0.26 0.13
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.3 0.43 0.45 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.23 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.17 0.1 0.0 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.04 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06
0.0 0.02 0.0 0.0 0.09 0.0 0.02 0.07 0.09 0.04 0.03 0.32
1.41 1.29 1.66 1.51 0.77 3.25 8.1 11.75 15.0 10.77 4.81 2.69
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.16 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.19 0.0 0.0 0.0
1.49 1.3 0.93 0.75 0.24 0.56 1.02 1.83 0.78 1.93 1.48 1.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.97 0.93 0.7 0.0 0.21 0.16
0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0
0.45 0.06 0.0 0.0 0.0 0.09 0.35 0.38 0.24 0.21 0.2 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.84 1.03 0.67 1.65 0.33 0.32 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.05 0.11 0.08 0.1 0.02 0.08
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.29 0.18 0.41 0.83 0.22 0.13 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.19 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.28 0.0 0.0 0.1 0.0 1.9 2.19 2.28 1.53 0.45 0.47

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)