1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_52 (HCCA clusters)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.54 1.52 1.01 0.57 0.37 2.46 2.67 2.68 2.44 1.59 0.84 0.26
2.79 4.45 7.38 6.56 6.67 8.46 8.22 10.5 10.23 8.5 6.89 4.04
0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.07 0.07 0.02 0.12 0.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.34 0.38 0.15 0.14 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.23 0.18 0.19 0.68 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.53 0.07 0.15 0.0 0.0 0.11 0.23 0.36 0.29 0.25 0.0 0.25
4.46 3.11 3.12 3.03 3.85 4.44 3.67 4.15 3.68 3.07 3.1 1.68
0.0 0.16 0.2 0.3 0.31 0.87 0.27 0.66 0.53 0.51 0.75 0.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.02 0.02 0.0 0.06 0.11 0.09 0.13 0.04 0.0 0.04 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.04 0.04 0.03 0.14 0.04 0.06 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.07 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.1 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.32 0.27 0.57 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.22 0.04 0.11 0.0 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.1 0.04 0.03 0.0 0.04 0.08 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
11.13 7.74 7.75 11.96 10.72 16.38 13.49 8.95 9.95 13.45 11.46 8.83
0.41 0.27 0.17 0.57 0.59 0.88 0.66 0.34 0.5 0.45 0.45 0.39
0.0 0.06 0.13 0.0 0.0 1.23 1.04 0.98 1.05 0.47 0.31 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.26 0.13 0.38 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.15 0.13 0.27 0.08 0.08 0.0
0.94 1.14 1.29 1.23 1.06 1.8 1.13 1.15 0.86 1.04 1.0 0.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
14.25 12.59 14.08 13.16 13.44 17.38 15.56 20.49 18.13 18.24 14.38 12.65
0.04 0.07 0.0 0.01 0.0 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.03 0.05
0.0 0.12 0.0 0.04 0.11 0.12 0.05 0.09 0.15 0.12 0.05 0.09
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.25 0.17 0.11 0.15 0.06 0.0 0.05
9.03 7.89 8.71 7.1 11.58 13.47 14.73 17.42 14.32 16.37 10.63 9.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1
0.37 0.13 0.07 0.09 0.11 0.14 0.11 0.23 0.21 0.21 0.19 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.17 0.09 0.0 0.27 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
27.9 31.92 25.47 24.54 25.47 29.41 32.61 25.46 27.5 23.75 18.07 13.88
0.0 0.1 0.0 0.36 0.3 0.33 0.12 0.38 0.44 0.27 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.11 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.2 0.06 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.02
1.91 1.64 1.34 0.89 1.48 2.06 1.11 0.91 0.77 1.13 1.06 1.03
0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.54 0.29 0.27 0.13 0.32 0.04 0.11
0.0 0.0 0.19 0.24 0.0 0.11 0.0 0.0 0.29 0.12 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.15 0.3 0.41 0.25 0.51 1.02 0.21 0.18 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.13 0.12 0.11 0.11 0.0 0.0
3.95 4.97 4.72 6.61 7.17 10.99 8.25 8.56 11.43 8.17 10.34 6.17
0.47 0.64 0.76 1.1 0.59 0.89 0.82 0.59 0.35 0.35 0.22 0.2
0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.03 0.01 0.04 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.03 0.2 0.0 0.0 0.08
0.32 0.4 0.88 0.46 0.38 1.34 0.64 0.75 0.77 1.05 0.91 1.92
4.97 4.38 2.19 4.7 4.27 6.82 6.34 5.4 5.11 4.84 4.33 3.04
0.29 0.22 0.0 0.06 0.07 0.06 0.2 0.14 0.31 0.16 0.07 0.2
0.19 0.05 0.0 0.04 0.05 0.0 0.1 0.14 0.15 0.09 0.09 0.09
0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.1 0.0 0.05 0.29 0.44 0.39 0.27 0.16 0.17 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 1.44 0.21 0.39 1.55 0.2 0.0 0.0
0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.05 0.07 0.59 0.55 0.26 0.25 0.59 0.21 0.08
0.0 0.23 0.62 0.75 1.0 0.76 1.13 0.71 1.72 1.16 0.73 0.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.15 0.29 0.13 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.08 0.0 0.04 0.11 0.04 0.1 0.06 0.08 0.1 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.09 0.0 0.15 0.3 0.33 0.1 0.06 0.06 0.0 0.0
0.06 0.06 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.05 0.03 0.0 0.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.54 0.11 0.3 0.21 0.48 0.67 1.59 1.07 0.77 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.08 0.05 0.17 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.23 0.22 0.0 0.22 0.0
9.23 6.8 9.11 9.83 9.73 13.24 10.71 13.77 12.07 10.84 8.73 5.77
0.0 1.5 0.88 1.54 1.8 2.92 2.18 2.73 2.83 2.68 2.02 0.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.04
0.08 0.04 0.08 0.25 0.16 0.22 0.2 0.06 0.06 0.04 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.21 0.42 0.06 0.16 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.18 0.14 0.16 0.33 0.34 0.15 0.0 0.0 0.0 0.15
0.0 0.0 0.23 0.0 0.19 0.5 0.47 0.22 0.2 0.0 0.22 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)