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Heatmap: Cluster_89 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.62 0.5 -0.84 -0.88 -1.42 -1.99 -2.75 -2.64 -1.12 0.03 0.98 1.01
-0.06 0.05 -0.53 0.01 0.03 -0.09 0.21 0.02 -1.28 -0.37 0.44 0.7
0.62 0.45 -0.22 -0.27 -0.61 -0.77 -1.0 -0.6 -0.45 0.02 0.61 0.79
0.66 0.24 -0.27 -0.11 -0.21 -0.29 -0.58 -0.75 -0.44 -0.02 0.26 0.69
0.6 0.51 -0.68 -0.83 -1.38 -1.39 -1.07 -0.85 -0.24 0.31 0.92 1.08
0.84 0.54 -0.27 -0.07 -0.38 -0.65 -1.63 -1.94 -1.0 -0.06 0.56 1.04
0.72 0.38 -0.73 -0.45 -0.59 -0.59 -1.09 -1.17 -0.54 0.16 0.66 1.07
0.87 0.46 -1.6 -1.15 -1.17 -1.24 -1.8 -1.44 -0.27 0.16 1.0 1.35
0.5 0.23 -1.84 -0.87 -0.93 -0.93 -1.69 -1.48 -0.63 0.53 1.24 1.27
0.48 0.18 -0.78 -0.17 -0.41 -0.87 -2.2 -1.28 -0.44 0.31 0.79 1.25
0.46 0.51 -0.18 -0.47 -1.03 -0.78 -0.68 -0.92 -0.08 0.3 0.54 0.8
0.08 0.1 -0.17 -0.18 -0.42 -0.46 -0.95 -0.55 -0.36 0.24 0.63 0.93
0.77 0.02 -1.15 -0.7 -0.63 -0.3 -0.96 -0.39 0.01 0.38 0.69 0.64
1.1 0.55 -0.87 -1.1 -1.18 -0.81 -1.14 -1.49 -0.49 0.2 0.77 0.99
0.46 0.45 -0.39 -0.36 -0.33 0.07 -0.43 -0.16 -0.43 -0.22 0.28 0.5
0.26 0.42 -0.02 -0.22 -0.43 -0.22 -0.42 -0.25 -0.28 0.01 0.36 0.41
0.8 0.66 -0.39 -0.6 -0.64 -0.26 -0.68 -1.69 -0.69 -0.04 0.44 0.92
0.79 0.47 -0.44 -0.2 -0.3 -0.24 -0.61 -0.81 -0.73 -0.34 0.36 0.78
0.32 0.47 -0.11 -0.46 -0.81 -1.12 -1.03 -0.74 -0.18 0.22 0.64 0.99
0.67 0.35 -0.36 -1.05 -1.35 -0.33 -0.25 -0.13 -0.41 0.18 0.48 0.72
0.57 0.44 -0.53 -0.12 -0.34 -0.42 -1.0 -0.74 -0.79 0.01 0.7 0.76
-0.13 0.59 -0.61 -0.55 -0.33 -0.32 -0.14 -1.06 -0.46 -0.05 0.5 1.12
0.74 0.58 -0.46 -0.86 -1.01 -0.83 -0.83 -0.77 -0.17 0.03 0.57 0.96
0.63 0.34 -0.25 -0.0 -0.26 -0.15 -0.42 -0.71 -0.84 -0.36 0.34 0.73
0.97 0.42 -0.65 -0.26 -0.43 -0.48 -0.89 -0.79 -0.57 -0.02 0.49 0.67
0.55 0.01 -0.29 -0.07 -0.37 -0.25 -0.39 -0.37 -0.48 0.1 0.41 0.58
0.22 0.51 -0.28 -0.23 -0.52 -0.39 -0.75 -0.71 -1.06 -0.24 0.71 1.08
0.27 0.39 -0.22 -0.08 -0.41 -0.18 -0.26 0.03 -0.72 -0.29 0.36 0.56
0.6 0.6 -0.45 -0.28 -0.51 -0.53 -0.91 -1.11 -0.67 -0.11 0.53 1.01
0.8 0.75 -1.41 -1.34 -1.51 -1.34 -1.27 -1.6 -0.77 0.42 1.07 1.19
0.35 0.62 -0.09 -0.29 -0.51 -0.34 -0.65 -0.62 -0.42 0.05 0.36 0.66
1.06 0.53 -0.48 -0.37 -0.66 -0.92 -1.53 -1.71 -0.49 0.19 0.67 0.79
0.57 0.23 -0.33 -0.07 -0.37 -0.5 -0.97 -0.87 -0.36 0.14 0.57 0.76
0.58 0.2 -0.41 -0.33 -0.65 -1.14 -2.13 -1.6 -0.42 0.42 0.99 1.06
0.35 0.42 -0.54 -0.78 -0.93 -0.07 -0.01 -0.08 -0.45 -0.05 0.39 0.75
0.92 0.28 -0.49 -0.51 -0.98 -1.17 -1.33 -0.98 -0.35 0.32 0.73 0.95
0.59 0.52 -0.28 -0.13 -0.88 -0.71 -1.11 -0.44 -0.63 -0.19 0.61 0.94
0.71 0.59 -0.06 0.19 -0.57 -1.23 -2.23 -1.53 -0.72 -0.02 0.48 1.08
0.92 0.65 -0.12 0.05 -0.76 -1.4 -1.63 -1.86 -0.44 -0.29 0.51 1.02
0.94 0.62 -1.69 -2.04 -1.29 -0.46 -0.43 -0.62 -0.5 0.21 0.79 0.9
0.61 0.49 -0.26 -0.38 -1.19 -1.62 -1.74 -1.27 -0.56 0.19 0.92 1.18
1.05 0.93 -0.01 -0.29 -0.74 -0.66 -0.69 -0.73 -1.27 -0.78 0.0 0.81
0.05 0.5 -0.04 0.06 -0.35 -0.51 -0.64 -0.2 -0.44 0.15 0.34 0.51
0.36 0.23 -0.14 0.05 -0.3 0.02 -0.32 -0.27 -0.62 -0.25 0.24 0.57
0.62 0.55 -0.16 -0.01 -0.53 -0.73 -1.0 -0.81 -0.53 -0.1 0.45 0.81
0.92 0.5 -0.26 -0.13 -0.44 -0.45 -0.96 -1.31 -1.36 -0.52 0.29 1.17
-0.32 0.31 -0.04 0.05 -0.42 -0.39 -0.47 -0.12 -0.35 -0.11 0.43 0.8
0.85 0.51 -0.36 -0.48 -0.99 -0.96 -1.08 -0.93 -0.39 0.01 0.51 1.04
0.49 0.45 -0.31 -0.03 -0.34 -0.39 -0.45 0.08 -0.42 -0.29 0.18 0.5
0.47 0.43 -0.26 -0.22 -0.38 -0.13 -0.48 -0.81 -0.43 -0.11 0.34 0.74
0.74 0.15 -0.37 -0.22 -0.58 -0.54 -0.87 -0.69 -0.44 0.2 0.66 0.69
0.5 0.47 -0.04 -0.13 -0.63 -0.78 -0.98 -0.81 -0.5 0.02 0.61 0.82
0.81 0.49 -0.37 -0.53 -0.77 -0.63 -0.72 -0.66 -0.23 0.13 0.46 0.65
0.3 0.18 -0.12 -0.11 -0.37 -0.59 -1.04 -1.07 -0.31 0.3 0.7 0.78
1.19 0.61 -0.17 -0.14 -0.5 -1.59 -2.8 -2.17 -1.37 -0.11 0.7 1.04
0.3 0.44 -0.18 -0.61 -0.72 -0.21 -0.12 -0.02 -0.21 0.03 0.28 0.48
0.78 0.51 -0.47 -0.72 -1.32 -0.98 -1.16 -0.85 -0.53 0.18 0.77 1.06
0.67 0.35 -0.8 -0.75 -0.55 -0.14 -0.67 -0.49 -0.53 0.11 0.71 0.69
0.89 0.73 -0.18 -0.14 -0.27 -0.43 -0.6 -0.65 -0.93 -0.28 0.05 0.54
0.21 -0.05 -0.66 -0.29 -0.56 -1.23 -1.8 -0.66 -0.15 0.65 0.99 0.97
0.42 0.53 -0.37 -0.48 -1.04 -0.47 -0.49 -0.13 -0.49 -0.05 0.43 0.91
0.51 0.14 -0.31 -0.03 -0.47 -0.4 -0.49 -0.33 -0.45 0.08 0.37 0.7
-0.06 0.16 -0.27 -0.24 -0.51 0.11 -0.42 0.15 -0.46 -0.37 0.42 0.82
0.54 0.58 -0.44 0.0 -0.32 -0.19 -0.65 -0.18 -0.84 -0.2 0.31 0.52
0.32 0.52 -0.22 0.09 -0.13 -0.29 -0.87 -1.09 -0.88 0.05 0.48 0.75
0.45 0.71 -0.45 -1.07 -1.36 -0.35 -0.2 -0.19 -0.34 0.12 0.53 0.63
0.36 0.87 -0.06 -0.49 -1.05 -0.69 -0.8 -0.49 -0.18 0.05 0.3 0.75
0.06 0.27 -1.03 0.04 -0.52 -0.1 -0.66 -0.31 -0.81 -0.33 0.77 1.07
0.23 0.29 -0.22 0.1 -0.24 -0.35 -0.64 -0.43 -0.72 -0.07 0.42 0.82
1.06 0.59 -1.01 -0.32 -0.43 -1.37 -1.42 -1.77 0.07 0.17 0.43 0.84
0.1 0.67 -0.72 -1.28 -0.52 -0.28 -0.21 -0.24 -0.99 -0.18 0.61 1.12
0.85 0.15 -0.22 0.28 -0.21 -0.11 -0.61 -0.69 -1.05 -0.39 0.11 0.7
0.06 0.32 -0.27 -0.21 -0.31 0.07 -0.19 -0.34 -0.44 -0.06 0.45 0.52
0.55 0.23 -0.79 -0.43 -0.43 -0.03 -0.17 -0.48 -0.63 -0.15 0.54 0.77
0.76 0.66 -0.25 -0.61 -1.39 -1.48 -1.8 -1.06 -0.4 0.18 0.79 1.08
0.3 0.5 -0.05 0.08 -0.29 0.02 -0.36 -0.32 -0.74 -0.28 0.19 0.44
0.75 0.63 -0.28 -0.29 -0.48 -0.36 -0.55 -0.79 -0.82 -0.21 0.24 0.81
1.01 0.37 -0.64 -0.34 -0.49 -0.35 -0.87 -1.22 -0.97 -0.23 0.41 1.07
0.4 0.52 -0.18 -0.06 -0.44 -0.59 -1.06 -0.87 -0.5 -0.07 0.38 1.02
0.65 0.13 -0.65 -0.38 -0.62 -0.78 -1.45 -1.43 -0.35 0.39 0.92 0.99
0.53 0.62 0.01 -0.08 -0.72 -0.31 -0.74 -0.65 -0.8 -0.22 0.29 0.81
1.02 0.38 -1.08 -0.79 -1.24 -1.39 -1.38 -0.53 -0.33 0.32 0.86 0.91
0.57 0.62 -0.62 -0.81 -1.04 -0.18 -0.22 -0.2 -0.57 -0.09 0.43 0.77
0.16 0.1 -0.17 -0.16 -0.42 -0.05 -0.15 0.1 -0.24 -0.08 0.26 0.44
1.1 0.64 -0.92 -1.12 -1.67 -1.68 -1.74 -0.97 -0.47 0.24 0.87 1.11
0.97 0.48 -0.59 -0.23 -0.49 -0.62 -1.24 -1.08 -0.86 0.01 0.6 0.84
0.8 0.08 -0.26 0.16 -0.32 -0.8 -1.27 -1.33 -0.54 0.17 0.51 0.86
1.02 0.35 -0.43 -0.29 -0.61 -0.51 -0.94 -1.3 -1.15 -0.43 0.41 1.22
0.89 0.55 -0.54 -0.45 -0.62 -0.48 -0.76 -1.09 -0.38 0.11 0.54 0.61
0.84 0.44 -0.55 -0.09 -0.3 -0.75 -1.01 -0.96 -0.5 0.03 0.45 0.79
0.35 0.55 -0.26 -0.78 -0.97 -0.91 -0.75 -0.68 -0.1 0.22 0.59 0.99
0.65 0.25 -0.13 -0.52 -0.85 -0.55 -0.47 0.16 -0.52 -0.02 0.41 0.62
0.21 0.17 -0.44 -0.09 -0.19 0.1 -0.24 0.32 -0.97 -0.46 0.25 0.66
0.76 0.58 -0.48 -0.26 -0.23 -0.41 -0.96 -0.87 -0.81 0.05 0.49 0.66
0.43 0.29 -0.23 -0.03 -0.34 -0.19 -0.6 -0.43 -0.46 -0.08 0.29 0.7
0.44 0.47 -0.37 -0.79 -1.4 -1.44 -1.17 -0.48 -0.3 0.31 0.85 1.09
0.59 0.38 -0.45 -0.29 -0.82 -0.75 -0.91 0.31 -0.22 0.02 0.41 0.6
0.71 0.96 -0.48 -1.56 -2.32 -0.87 -0.44 0.03 -0.42 -0.1 0.52 0.79
0.4 0.49 -0.21 -0.21 -0.5 -0.65 -1.16 -1.04 -0.81 0.21 0.83 0.82
-0.38 0.12 -0.37 -0.08 -0.29 0.19 -0.04 0.03 -0.4 -0.17 0.28 0.69
0.92 0.71 -0.18 -0.01 -0.17 -0.09 -1.11 -1.43 -1.15 -1.1 0.27 0.84
1.15 0.19 -0.53 -0.33 -0.74 -0.6 -0.75 -0.78 -0.81 -0.02 0.45 0.84
-0.04 0.39 -0.42 -0.15 -0.14 -0.02 -0.33 -0.28 -0.28 -0.12 0.32 0.64
1.4 0.17 -0.86 -0.85 -1.53 -1.56 -1.92 -1.78 -0.92 0.17 0.95 1.2
0.85 0.61 -0.18 -0.27 -0.53 -0.46 -0.79 -0.99 -0.64 -0.17 0.27 0.78
0.83 0.72 -0.18 -0.46 -0.65 -0.54 -0.97 -1.26 -0.78 -0.12 0.44 0.89
0.54 0.37 -0.3 -0.27 -0.78 -0.73 -0.77 -0.18 -0.24 0.03 0.48 0.78
0.61 0.72 -0.33 -0.65 -1.28 -1.77 -1.4 -0.47 -0.0 0.15 0.41 1.11
0.44 0.59 -0.32 -0.27 -0.52 -0.3 -0.68 -0.83 -1.0 -0.14 0.61 0.91
0.48 0.32 -0.52 -0.26 -0.54 -0.64 -0.5 0.41 -0.33 0.13 0.42 0.3
0.25 -0.03 -0.4 -0.03 -0.43 -0.26 -0.54 -0.2 -0.44 0.09 0.51 0.79
-0.02 0.19 -0.56 -0.16 -0.31 -0.43 -0.95 -0.64 -0.49 0.4 0.8 0.86
0.75 0.42 -0.25 -0.31 -1.37 -0.91 -0.67 -0.05 -0.5 -0.04 0.47 0.81
0.49 0.12 -0.46 -0.24 -0.4 -0.33 -0.57 -0.3 -0.16 0.27 0.47 0.5
1.21 0.48 -0.4 -0.47 -1.11 -1.01 -1.18 -1.46 -0.88 -0.12 0.42 1.17
0.17 0.16 -0.2 -0.19 -0.22 -0.14 -0.52 -0.47 -0.3 0.18 0.4 0.64
0.24 0.78 -0.32 -0.72 -1.17 -0.82 -0.97 -1.31 -0.19 0.32 0.46 1.19
0.99 0.43 -0.61 -0.52 -0.84 -0.93 -1.27 -1.01 -0.51 0.13 0.73 0.89
1.09 0.43 -0.36 -0.12 -0.51 -0.61 -0.97 -0.87 -0.86 -0.33 0.32 0.85
1.07 0.6 -0.93 -0.7 -0.86 -0.98 -0.94 -0.93 -0.47 0.14 0.7 0.76
0.39 0.34 -0.44 0.02 -0.1 -0.27 -0.71 -0.64 -0.59 -0.03 0.51 0.67
0.65 0.22 -0.32 -0.2 -0.4 -0.15 -0.48 -0.52 -0.54 -0.11 0.33 0.72
0.78 0.3 -0.6 -0.7 -0.49 -0.75 -0.78 -0.43 -0.2 0.3 0.57 0.64
0.12 -0.13 -0.36 -0.1 0.06 0.19 -0.25 0.29 -0.44 -0.29 0.1 0.49
0.68 0.53 -0.23 -0.19 -0.41 -0.56 -1.02 -1.23 -0.76 -0.16 0.43 1.02
0.48 0.34 -0.41 -0.21 -0.35 -0.13 -0.43 -0.55 -0.42 0.1 0.3 0.63
0.56 0.36 -0.14 0.1 -0.73 -1.0 -1.62 -1.57 -0.27 0.33 0.69 0.84
0.06 0.08 -0.46 -0.23 -0.26 -0.05 -0.71 -0.05 -0.45 -0.03 0.55 0.83
1.26 0.12 -0.84 -0.76 -0.8 -0.49 -0.59 -0.77 -0.78 -0.15 0.47 0.98
0.23 0.05 -0.24 -0.03 -0.39 -0.39 -0.65 -0.3 -0.45 0.07 0.65 0.71
0.61 0.14 -0.69 -0.35 -0.2 -0.18 -0.35 -0.27 -0.64 -0.1 0.52 0.66
0.83 0.57 -0.14 -0.31 -0.58 -0.34 -0.44 -0.44 -0.52 -0.14 0.09 0.51
0.4 0.41 -0.05 0.12 -0.29 -0.7 -1.32 -1.08 -0.25 0.17 0.41 0.78
0.89 0.56 -0.1 -0.02 -0.58 -0.91 -1.24 -1.66 -0.69 -0.0 0.61 0.74
0.02 0.28 -0.3 -0.06 -0.38 -0.03 -0.22 -0.11 -0.44 -0.11 0.43 0.53
0.73 0.27 -0.56 -0.15 -0.19 -0.17 -0.9 -1.21 -1.07 -0.32 0.52 1.08
0.72 0.64 -0.34 -0.1 -0.32 -0.12 -0.52 -0.68 -0.8 -0.43 0.26 0.6
0.38 0.31 -0.16 0.12 -0.1 0.01 -0.36 -0.3 -0.77 -0.28 0.17 0.5
0.14 0.02 -0.57 -0.23 -0.31 -0.74 -1.19 -0.78 -0.27 0.35 0.81 1.05

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.