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Heatmap: Cluster_67 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.19 -0.05 -0.88 -0.62 -1.56 0.05 0.72 0.44 0.6 -0.7 -1.7 -0.41
0.39 0.09 -0.23 0.22 -0.08 0.55 0.26 -0.06 -0.07 -0.3 -0.58 -0.69
1.05 -0.26 -0.21 0.21 0.28 0.88 0.35 -1.16 -0.85 -1.3 -0.91 -0.3
0.55 -0.16 -2.4 -0.17 0.45 1.2 0.96 0.47 -0.61 -1.11 -1.82 -2.62
-0.86 -0.31 -0.69 -0.1 0.59 0.96 0.6 0.48 -0.46 -0.4 -0.61 -0.76
1.11 -0.35 -0.39 0.08 0.38 1.05 0.71 -0.93 -0.88 -1.14 -1.57 -1.42
1.21 -0.29 -0.48 0.25 0.36 0.97 0.56 -0.1 -0.91 -1.4 -2.14 -2.48
1.04 -0.8 -0.85 -0.14 0.22 0.77 0.41 1.27 -0.79 -1.28 -2.53 -2.87
0.07 -0.18 -0.74 -0.23 0.15 0.84 0.55 0.59 -0.84 -0.63 -0.44 -0.32
0.79 -0.82 -0.63 -0.01 0.35 0.97 0.67 -0.12 -0.4 -0.87 -1.0 -0.98
-1.16 -2.62 -3.0 -1.18 -1.33 1.86 1.07 1.3 0.66 -1.12 -3.31 -3.37
0.92 0.23 -0.54 -0.31 0.14 1.11 0.51 -0.67 -0.76 -0.72 -0.97 -1.26
1.02 -0.85 -0.5 0.02 0.21 0.49 0.43 0.31 -0.85 -0.56 -0.75 -0.46
0.85 0.28 -0.42 0.42 0.63 0.9 0.25 0.05 -1.27 -1.71 -1.68 -2.18
-0.4 -0.27 -0.35 -0.16 0.05 0.62 0.48 0.93 -0.05 -0.6 -0.53 -0.87
-0.1 -0.14 -0.49 0.11 0.61 1.1 0.67 0.21 -0.94 -1.15 -0.91 -1.15
0.36 -0.03 -1.11 -0.19 0.05 0.8 0.62 0.34 -0.23 -0.33 -0.71 -0.84
0.89 -0.33 -0.41 0.02 -0.08 -0.03 -0.07 -0.02 -0.45 -0.22 0.15 0.03
1.38 -0.29 -1.54 -0.39 0.11 1.04 0.38 -0.63 -0.92 -0.8 -0.74 -0.55
-0.25 -0.64 -0.41 0.14 0.19 0.62 0.24 -0.04 -0.15 0.11 -0.08 -0.12
0.64 -0.33 -0.2 0.1 0.07 0.62 0.44 -0.63 -0.37 -0.32 -0.3 -0.45
0.53 0.15 -0.42 -0.08 -0.12 0.43 0.41 0.2 0.18 -0.55 -0.82 -0.68
0.57 -0.53 -1.29 -0.49 0.32 1.22 0.78 0.03 -0.17 -0.48 -1.09 -1.69
0.3 0.1 -0.62 -0.72 -0.15 0.8 0.38 0.42 0.16 -0.07 -0.51 -1.4
0.17 -0.22 -0.36 0.07 0.42 0.91 0.64 0.37 -0.85 -0.93 -1.05 -0.89
-0.06 -0.19 -0.67 -0.18 0.31 0.97 0.66 0.35 -0.51 -0.53 -0.66 -0.82
-0.49 -0.71 -0.96 -0.24 -0.09 1.15 0.79 0.73 0.39 -0.18 -1.19 -2.84
0.63 -0.48 -0.41 0.09 0.05 0.35 0.14 0.23 -0.22 -0.3 -0.2 -0.35
0.34 -0.6 -0.78 -0.06 0.19 0.69 0.38 0.3 -0.28 -0.18 -0.29 -0.49
-0.23 -0.04 -0.18 0.27 0.57 0.91 0.39 0.08 -0.89 -0.94 -0.83 -0.43
0.33 -0.17 -0.09 0.19 0.17 0.64 0.21 -0.15 -0.42 -0.31 -0.4 -0.44
-0.08 -0.18 -0.81 -0.16 0.25 0.78 0.52 0.61 -0.68 -0.83 -0.38 -0.19
1.12 -0.58 -2.7 -0.21 0.67 1.29 0.9 0.0 -0.99 -1.08 -3.2 -2.88
1.23 -0.6 -1.26 -0.5 0.46 1.34 0.91 -0.17 -1.01 -1.41 -2.39 -2.95
0.16 0.05 -0.66 -0.27 0.29 0.82 0.43 0.47 -0.61 -0.68 -0.38 -0.68
-0.26 -0.25 -0.55 0.15 0.26 0.95 0.61 0.52 -0.46 -0.67 -0.87 -0.92
0.24 -1.19 -0.9 -0.3 0.16 0.76 0.67 0.29 0.02 -0.14 -0.44 -0.42
0.54 0.18 0.17 0.27 0.28 0.28 0.19 -0.03 -0.69 -0.62 -0.69 -0.65
0.58 0.17 -0.1 0.13 0.35 0.72 0.74 0.13 -0.37 -1.15 -2.21 -2.18
0.89 -0.22 -0.74 0.18 0.51 0.91 0.37 -0.46 -1.23 -0.87 -0.7 -0.62
0.64 -0.11 -0.53 -0.06 0.19 0.71 0.42 -0.27 -0.34 -0.39 -0.58 -0.54
-0.51 -0.21 -0.82 -0.5 -0.1 0.81 0.74 0.98 -0.44 -0.66 -0.4 -0.49
1.38 -0.64 -4.62 -1.19 0.56 1.83 1.29 -0.67 -2.95 -6.08 -6.13 -5.5
0.87 -0.58 -0.86 0.32 0.55 1.14 0.59 -0.36 -0.84 -1.13 -1.28 -1.58
-0.02 -1.38 -0.71 0.08 0.18 0.88 0.47 0.29 -0.31 -0.23 -0.26 -0.18
0.66 -1.08 -0.6 -0.02 0.27 0.8 0.41 -0.03 -0.3 -0.53 -0.43 -0.32
-0.22 0.06 -0.34 -0.13 0.15 0.48 0.34 0.21 -0.11 -0.16 -0.19 -0.38
0.91 -0.5 -0.53 0.11 0.07 0.56 0.11 -0.08 -0.51 -0.47 -0.33 -0.21
0.72 -0.3 -0.49 0.6 0.36 0.75 0.69 0.16 -0.21 -0.95 -2.88 -3.47
0.32 -0.15 -0.27 -0.12 0.09 0.45 0.11 0.15 -0.0 -0.31 -0.24 -0.27
-0.09 0.04 -0.66 -0.35 0.09 0.69 0.76 0.85 -0.41 -0.75 -0.8 -0.96
-0.1 0.01 -0.61 -0.34 0.19 0.98 0.83 0.74 -0.67 -1.0 -1.08 -1.13
-0.64 -0.18 -0.74 -0.36 0.05 1.04 0.64 1.31 -0.83 -1.08 -1.1 -1.1
0.1 -0.05 -1.07 -0.31 0.41 0.79 0.59 0.12 0.01 -0.57 -0.49 -0.67
0.68 -0.04 -0.32 0.1 -0.16 0.05 -0.06 -0.04 -0.43 -0.3 0.08 0.12
0.84 -0.44 -0.76 0.12 0.14 0.69 0.3 -0.2 -0.61 -0.5 -0.55 -0.11
0.01 -0.26 -0.84 -0.55 0.41 1.16 0.96 0.59 -0.5 -1.0 -1.5 -1.49
0.88 -0.59 -1.12 -0.26 0.03 0.82 0.75 0.7 -0.11 -0.72 -1.47 -2.24
0.83 -0.14 -0.4 -0.01 0.15 0.59 0.14 -0.41 -0.45 -0.54 -0.27 -0.25
-1.24 0.05 -0.34 -0.37 0.23 1.04 0.78 0.5 -0.73 0.1 -1.39 -0.85
0.42 -0.49 -0.67 0.26 0.31 0.8 0.45 -0.23 -0.7 -0.62 -0.39 -0.17
0.34 -0.9 -0.89 -0.06 0.09 0.73 0.58 0.25 -0.23 -0.26 -0.31 -0.32
0.73 -0.03 -0.44 0.12 0.22 0.88 0.21 -0.95 -0.45 -0.5 -0.55 -0.45
0.74 -0.07 -0.41 0.19 0.15 0.5 0.08 0.2 -0.48 -0.65 -0.52 -0.51
0.41 -0.02 -0.4 0.04 0.27 0.56 0.17 -0.09 -0.25 -0.36 -0.33 -0.42
-0.3 -0.3 -0.5 0.02 0.4 0.89 0.61 0.48 -0.94 -0.96 -0.4 -0.38
0.21 -0.09 -0.46 -0.04 0.26 0.59 0.45 0.16 -0.38 -0.35 -0.58 -0.32
0.35 -0.69 -0.59 0.0 0.07 0.72 0.45 0.15 -0.39 -0.21 -0.35 -0.22
-0.7 -0.26 -0.63 -0.07 0.33 1.15 0.64 0.62 -0.54 -0.7 -0.64 -1.2
0.65 -0.31 -0.4 -0.24 -0.01 0.47 0.19 0.19 0.01 -0.25 -0.28 -0.54
0.71 -0.06 -0.58 0.02 0.33 0.69 0.76 0.03 -0.37 -0.73 -1.35 -1.46
0.86 -0.02 -0.29 0.17 -0.07 0.29 -0.01 0.0 -0.67 -0.46 -0.22 -0.21
-0.5 -0.35 -0.57 -0.24 0.31 0.86 0.5 0.73 -0.38 -0.55 -0.35 -0.67
-0.06 -0.39 -0.49 0.05 0.18 0.61 0.37 0.65 -0.48 -0.71 -0.4 -0.1
-0.72 -0.29 -0.74 -0.29 0.23 0.82 0.63 0.74 -0.46 -0.58 -0.3 -0.35
0.79 0.11 -0.68 0.08 -0.22 0.61 0.27 -0.38 -0.2 -0.08 -0.45 -0.75
0.05 -0.41 -0.83 -0.39 0.11 0.95 0.27 0.66 -0.43 -0.37 -0.42 -0.29
-0.59 -0.41 -1.04 -0.45 0.12 0.78 0.6 1.09 -0.51 -0.6 -0.35 -0.39
0.64 -0.39 -0.42 -0.17 -0.02 0.58 0.49 0.23 -0.23 -0.23 -0.59 -0.69
0.41 -0.12 -0.37 -0.16 -0.19 0.71 0.44 0.25 -0.04 -0.14 -0.72 -0.93
0.98 -0.12 -0.54 0.08 0.28 0.69 0.34 -0.14 -0.56 -0.59 -0.85 -1.12
0.72 0.22 -0.38 -0.15 -0.37 0.26 0.05 -0.06 -0.39 -0.46 0.03 0.07
0.46 -0.65 -0.28 -0.37 0.11 0.65 0.75 0.19 -0.02 -0.2 -0.87 -0.93
0.69 0.09 -0.68 -0.02 0.23 0.5 0.03 0.19 -0.51 -0.42 -0.36 -0.44
-1.01 0.25 -0.33 -0.06 0.12 0.75 0.64 0.55 -0.47 -0.35 -0.72 -0.64
0.38 -0.08 -0.67 -0.05 0.37 0.83 0.55 0.2 -0.85 -0.68 -0.57 -0.68
0.14 0.02 -0.5 -0.4 0.0 0.65 0.59 0.61 -0.38 -0.41 -0.47 -0.81
0.69 -0.63 -0.76 -0.2 0.25 0.89 0.56 0.63 -0.44 -0.6 -1.08 -1.52
0.22 0.05 -0.72 -0.41 0.03 0.67 0.35 0.42 -0.26 -0.23 -0.24 -0.55
0.0 0.09 -0.46 -0.21 0.13 0.86 0.54 0.35 -0.72 -0.52 -0.52 -0.51
-0.61 -0.17 -0.26 0.37 0.18 0.58 0.52 0.83 -0.8 -0.93 -0.47 -0.6
- -1.05 -0.87 -0.04 -0.45 0.77 0.77 1.38 -0.44 -0.86 0.26 -0.38
0.95 -0.06 -0.48 -0.19 0.33 1.01 0.69 -0.22 -0.94 -1.16 -1.42 -1.2

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.