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Heatmap: Cluster_48 (HCCA clusters)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
0.15 0.04 -0.6 -0.3 -0.12 0.11 -0.25 -0.01 -0.4 0.09 0.39 0.49
0.02 0.22 -0.3 -0.5 -0.33 0.38 0.04 -0.16 0.13 0.21 -0.02 0.05
-1.25 0.03 -0.45 -0.04 0.1 0.59 0.18 -0.41 -0.24 0.2 0.28 0.24
-0.13 0.21 -0.37 -0.35 -0.24 0.21 0.11 -0.3 0.06 0.16 0.15 0.27
-0.19 -0.3 -0.66 -0.2 -0.17 0.12 -0.03 -0.15 0.13 0.28 0.47 0.33
0.02 -0.17 -0.43 -0.21 0.05 0.27 0.08 0.09 0.16 0.05 0.01 -0.05
-0.58 -0.26 -0.58 -0.11 -0.11 0.17 0.06 0.11 -0.15 0.04 0.46 0.5
0.94 -1.3 -2.49 -1.82 -0.54 0.59 -0.44 -0.44 -0.94 0.71 0.38 1.06
-1.83 -0.82 -0.54 -0.37 -0.07 0.29 0.31 0.64 0.13 0.59 0.1 0.07
0.36 -0.39 -0.74 -0.35 -0.21 0.24 -0.19 -0.01 -0.27 0.19 0.46 0.39
-0.36 -0.46 -0.65 -0.2 -0.24 0.33 -0.04 -0.22 -0.07 0.38 0.48 0.48
-0.01 -0.2 -0.57 -0.3 -0.14 0.58 0.27 0.05 -0.24 0.18 0.08 -0.06
-0.45 -0.2 -0.52 -0.27 0.04 0.61 0.14 -0.52 0.0 0.27 0.45 -0.09
-0.45 -0.58 -0.89 -0.29 0.02 0.35 -0.2 -0.26 -0.25 0.42 0.74 0.48
0.02 -0.14 -0.93 -0.4 -0.2 0.14 -0.28 -0.16 -0.06 0.18 0.63 0.55
-0.37 -0.67 -0.54 -0.28 -0.07 0.41 0.13 0.35 -0.01 0.33 0.11 0.15
-0.1 -0.43 -0.36 -0.16 -0.15 0.41 0.08 0.11 0.08 0.01 0.15 0.14
- -0.37 - 0.22 0.18 0.33 0.55 -0.87 -0.4 -0.0 1.14 0.78
0.04 -0.39 -0.68 -0.39 -0.7 -0.22 -0.24 -0.06 0.18 0.51 0.6 0.55
-0.7 -0.13 -0.83 -0.23 -0.22 0.48 0.14 -0.4 -0.07 0.17 0.57 0.46
-0.49 -0.2 -0.51 -0.43 -0.12 0.44 0.24 -0.05 -0.08 0.15 0.37 0.27
0.57 -0.75 -1.25 -0.5 -0.13 0.4 0.12 -0.22 -0.06 0.04 0.29 0.49
-0.7 -0.86 -0.63 -0.09 0.27 0.57 -0.14 -0.32 -0.02 0.38 0.45 0.26
0.07 -0.33 -0.52 0.07 -0.11 0.11 -0.08 0.03 -0.08 0.09 0.17 0.38
-0.56 -0.03 -0.93 -0.77 -0.28 0.55 0.3 -0.2 0.03 0.21 0.37 0.46
-0.59 0.02 -0.59 -0.55 -0.41 0.51 0.12 -0.29 -0.08 0.24 0.55 0.38
-0.02 -0.48 -1.18 -0.57 -0.47 -0.36 0.01 0.32 -0.17 0.6 0.42 0.75
-0.18 0.23 -0.6 -0.53 -0.39 0.1 0.07 0.01 0.24 0.3 0.26 0.13
-0.27 -0.71 -0.75 -0.77 -0.64 -0.05 -0.13 0.38 0.05 0.53 0.59 0.65
-0.41 -0.27 -0.66 -0.15 -0.15 0.05 0.0 0.01 -0.15 0.03 0.52 0.67
0.03 -0.31 -0.58 -0.14 -0.11 0.1 0.02 -0.23 -0.03 0.11 0.36 0.48
-0.19 -0.08 -0.23 -0.22 -0.08 0.49 0.26 0.05 0.04 -0.09 -0.15 0.01
0.14 -0.27 -0.39 -0.69 -0.23 0.29 -0.02 0.27 0.16 0.12 0.22 0.07
-0.49 -0.22 -0.5 -0.03 -0.11 0.24 0.02 0.26 -0.18 0.1 0.34 0.27
-0.3 -0.34 -0.79 -0.29 -0.22 0.28 -0.12 0.26 -0.26 0.14 0.57 0.47
-0.29 -0.55 -0.59 -0.1 -0.2 0.05 -0.1 0.41 -0.06 0.3 0.24 0.43
0.05 -0.11 -0.7 -0.47 -0.25 0.53 0.14 0.1 -0.08 0.11 0.1 0.18
0.05 -0.84 -0.46 0.01 -0.1 0.12 -0.07 -0.01 0.17 0.07 0.22 0.45
-0.67 -0.5 -0.78 -0.37 -0.16 0.09 0.24 0.01 0.36 0.35 0.46 0.3
-1.31 -0.84 -4.15 -0.97 -0.67 0.31 -0.69 -1.31 -0.43 0.61 1.49 1.31
0.03 -0.04 -0.87 -0.66 -0.47 -0.05 -0.13 -0.24 0.28 0.51 0.58 0.32
0.44 -0.24 -0.51 -0.19 -0.19 0.06 -0.15 -0.19 -0.24 0.06 0.42 0.37
0.03 -0.43 -0.64 0.15 0.29 0.45 0.01 -0.5 0.27 0.45 -0.01 -0.69
-0.38 -0.64 -0.56 -0.14 0.19 0.43 0.25 -0.43 0.22 0.42 0.26 -0.17
-3.89 -1.9 -1.01 -0.66 -0.04 0.69 0.28 0.35 0.51 0.33 0.53 0.42
-0.26 -1.15 -1.01 -0.62 -0.04 0.1 -0.18 0.43 0.05 0.6 0.5 0.41
-0.5 -0.51 -1.34 -0.49 -0.25 -0.28 -0.42 0.45 -0.33 0.54 0.68 0.89
-0.07 0.16 -0.4 -0.28 -0.35 0.16 0.04 -0.21 0.03 0.26 0.19 0.27
0.69 -0.49 -1.99 -1.22 -0.55 -0.09 -0.95 -0.05 -0.26 0.32 0.65 1.16
-0.2 -0.1 -0.95 -0.51 -0.08 0.6 0.3 -0.1 -0.24 0.1 0.33 0.23
-0.15 -0.98 -0.79 -0.27 -0.22 0.45 0.09 -0.08 0.07 0.56 0.34 0.21
0.21 -0.41 -0.96 -0.39 0.15 0.35 -0.12 -0.02 0.04 0.11 0.3 0.22
0.77 -0.42 -2.1 -0.33 -0.02 0.56 -0.29 -0.76 -0.17 -0.48 0.39 0.79
0.36 -0.38 -0.4 -0.16 -0.1 -0.09 -0.07 -0.25 -0.4 0.07 0.36 0.62
-0.32 -0.15 -0.48 -0.15 -0.14 0.24 0.03 -0.14 -0.04 0.16 0.36 0.37
0.06 -0.29 -0.66 -0.54 -0.4 0.11 -0.22 -0.0 0.03 0.36 0.52 0.48
0.11 -0.36 -0.5 -0.38 -0.41 0.01 -0.05 0.14 -0.03 0.19 0.4 0.49
-0.63 -0.06 -0.55 -0.17 -0.01 0.42 0.26 0.07 -0.07 0.08 0.17 0.15
0.1 -0.59 -2.17 -1.0 -0.05 0.7 -0.08 0.01 -0.02 0.18 0.52 0.52
-0.72 -0.98 -1.86 -1.52 -0.15 0.73 0.24 0.28 0.3 0.39 0.46 0.46
-0.33 -0.26 -0.58 -0.21 -0.01 0.32 -0.06 0.18 -0.13 0.22 0.3 0.26
0.15 -0.24 -0.24 0.05 0.16 0.23 -0.07 -0.46 0.01 0.01 0.18 0.07
-0.03 0.06 -0.37 -0.2 -0.16 0.11 -0.28 -0.2 -0.16 0.14 0.5 0.33
-2.93 -2.19 -2.2 -1.04 -0.14 0.46 0.48 0.44 0.55 0.84 0.44 0.38
-1.11 -0.17 -0.35 -0.13 -0.46 0.13 -0.32 -0.38 -0.13 0.45 0.94 0.45
-0.26 -0.11 -0.29 -0.15 -0.25 0.31 0.01 -0.09 -0.24 -0.01 0.37 0.45
-0.06 -0.02 -0.58 -0.02 -0.18 0.29 0.06 -0.05 -0.08 -0.01 0.24 0.23
-0.14 -0.23 -0.83 -0.63 -0.42 0.32 -0.0 -0.2 0.19 0.31 0.44 0.51
-1.03 -0.6 -1.06 -0.47 -0.5 0.48 0.26 0.03 0.34 0.41 0.43 0.47
-0.25 -0.38 -0.44 -0.28 -0.37 0.22 -0.02 0.01 0.17 0.37 0.29 0.32
-0.29 -1.79 -1.49 -1.49 -1.17 0.26 0.15 -0.02 0.07 0.93 0.79 0.81
-1.0 -0.16 -0.53 -0.32 -0.03 0.36 -0.02 -0.39 -0.29 0.43 0.74 0.34
-0.27 -0.89 -0.66 -0.26 0.16 0.41 0.12 -0.29 0.19 0.29 0.32 0.26
-0.48 -1.62 -0.78 -0.68 0.24 0.33 0.3 -0.3 -0.19 0.45 0.79 0.39
0.25 -0.6 -1.15 -0.28 -0.07 0.2 -0.23 -0.03 -0.36 0.1 0.56 0.7
-0.29 -0.08 -0.56 -0.36 -0.02 0.61 0.06 -0.2 -0.06 0.08 0.19 0.26
-0.58 -1.78 -1.17 -0.43 0.07 0.49 0.37 0.51 0.18 0.46 0.27 -0.05
0.36 0.11 -0.33 -0.2 -0.19 0.32 -0.41 -0.53 -0.24 -0.07 0.3 0.47
0.69 -1.08 -0.95 -0.58 -0.06 1.1 0.91 -0.35 -1.25 -0.34 -0.34 -0.08
-0.06 -3.04 - -1.45 -0.1 0.47 -2.86 -0.39 0.03 0.77 1.6 0.66

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.