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Heatmap: Cluster_2 (HCCA clusters)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
-1.14 -1.64 0.12 0.86 0.59 0.49 -0.3 -0.56 -0.14 0.13 0.0 -0.12
-1.71 -0.87 0.35 1.18 0.88 0.91 -0.22 -0.64 -1.69 -1.48 -0.39 -0.05
-3.46 -1.3 0.41 1.06 0.53 0.04 -0.99 -0.87 -1.05 -0.47 0.32 1.08
0.4 -0.36 0.06 0.99 0.71 0.23 -1.05 -1.08 -0.59 -0.12 -0.11 -0.74
-1.6 -1.01 -0.28 0.46 0.6 0.37 -0.25 -0.84 -0.52 0.12 0.45 0.69
-2.34 -2.61 0.16 0.67 1.08 0.71 -0.08 -0.95 -0.7 -0.29 0.13 0.25
-0.28 -0.48 -0.48 0.31 0.39 0.26 -0.17 -0.62 -0.53 -0.16 0.37 0.65
-2.77 -0.84 0.2 0.61 0.25 0.13 -0.41 -0.08 0.09 0.16 0.15 0.44
-0.54 0.04 0.58 0.58 0.11 -0.13 -0.57 -0.83 -0.52 -0.28 0.03 0.6
1.23 0.03 -0.09 0.48 0.27 -0.38 -1.2 -0.7 -0.25 -0.2 -0.32 -0.4
-0.52 -0.84 -0.17 0.47 0.38 0.2 -0.19 -0.59 -0.69 -0.11 0.29 0.77
-1.97 -0.7 0.38 0.81 0.88 0.53 -0.03 -1.0 -0.96 -0.66 -0.33 0.46
0.02 0.91 0.39 0.52 0.3 -1.47 -0.78 -1.15 -0.67 -0.59 -0.07 0.58
-0.57 -0.11 0.19 0.55 0.35 0.3 -0.32 -0.53 -0.79 -0.44 0.22 0.39
-1.67 -0.23 0.16 0.4 0.35 0.34 -0.12 -0.27 -0.46 -0.03 0.0 0.49
0.48 0.13 -0.35 0.23 0.27 0.37 -0.29 -0.54 -0.53 -0.13 -0.06 -0.03
-1.83 -0.29 0.12 0.43 0.24 0.18 -0.1 -0.31 -0.18 0.09 0.22 0.37
0.24 -0.0 -0.12 0.11 0.03 0.25 -0.07 -0.45 0.09 -0.06 0.02 -0.16
- -0.98 0.36 1.22 1.01 0.05 -0.43 -0.74 -1.15 -0.88 0.07 0.52
0.75 -0.57 -0.17 0.41 0.19 0.36 -0.41 -1.13 -0.84 -0.39 0.15 0.44
-0.91 0.42 0.03 0.96 1.37 0.51 -1.97 -2.46 -1.52 -1.0 -0.33 0.11
0.64 -0.13 -0.16 0.4 0.48 0.39 -0.62 -1.31 -0.4 -0.07 -0.14 -0.11
-0.37 0.3 0.3 0.77 0.53 0.33 -0.64 -1.04 -1.09 -0.33 -0.25 0.18
-1.22 -0.67 -0.15 0.93 0.77 0.3 -0.13 -0.7 -0.84 -0.47 -0.18 0.59
- -0.97 1.48 1.13 1.18 -0.31 -0.65 -2.03 -1.21 -0.79 -2.42 0.46
0.38 -0.08 -0.19 0.42 0.44 0.31 -0.25 -0.88 -0.71 -0.15 -0.05 0.1
0.75 0.07 -0.58 0.15 0.1 0.25 -0.21 -0.43 -0.48 -0.12 0.01 -0.04
0.41 -0.17 0.08 0.89 0.33 0.07 -0.83 -1.24 -0.86 -0.32 0.03 0.26
-6.26 -0.55 0.3 0.71 0.59 0.19 -0.7 -0.97 -0.57 0.05 0.51 0.62
-1.53 0.08 0.71 0.73 0.36 0.0 -0.32 -0.86 -0.98 -0.58 -0.06 0.61
-0.3 -0.23 0.04 0.45 0.35 0.02 -0.75 -0.9 -0.45 0.06 0.24 0.64
0.59 0.04 -0.4 0.26 0.37 0.4 -0.75 -1.19 -0.9 -0.28 0.31 0.35
-0.7 0.14 0.28 0.98 0.77 0.35 -1.1 -1.51 -1.77 -1.07 -0.18 0.72
-0.1 -0.13 0.07 0.56 0.45 0.38 -0.26 -0.49 -0.95 -0.56 -0.04 0.32
0.47 0.11 0.06 0.36 0.22 0.0 -0.59 -0.62 -0.19 -0.13 -0.05 -0.04
0.33 0.19 -0.28 0.05 0.06 0.44 -0.0 -0.7 -0.37 -0.15 0.02 0.07
-3.59 0.06 0.15 0.61 0.64 0.51 0.32 -0.94 -1.53 -0.8 0.06 0.61
-0.19 0.34 0.05 1.49 0.87 0.37 -0.44 -2.77 -2.57 -1.86 -4.34 0.6
0.3 0.02 -0.16 0.18 0.17 0.31 -0.01 -0.61 -0.48 -0.19 -0.05 0.2
-1.16 -0.18 -0.11 0.63 0.45 0.35 -0.68 -0.56 -0.51 0.07 0.41 0.24
-0.69 -0.17 0.55 0.86 0.91 0.37 -1.48 -1.27 -1.2 -0.17 0.1 -0.22
-0.4 -0.44 0.08 0.74 0.28 -0.06 -0.62 -1.29 -0.73 -0.01 0.3 0.78
-2.71 -1.86 0.12 0.58 0.45 0.56 0.3 -0.05 -0.32 0.1 0.11 -0.0
-0.54 0.82 0.33 1.03 0.54 -0.75 -1.17 -2.22 -1.44 -0.5 -0.05 0.57
-0.51 -0.21 -0.01 0.24 0.24 0.16 -0.43 -0.29 -0.49 0.05 0.33 0.47
0.49 0.19 -0.24 0.7 0.77 0.54 -0.89 -2.41 -2.26 -1.16 0.1 0.46
0.05 -0.01 -0.01 0.38 -0.13 0.23 0.25 -0.09 -0.59 -0.42 -0.11 0.16
0.3 -0.06 -0.01 0.67 0.39 -0.08 -1.48 -2.28 -1.15 -0.16 0.44 0.77
-0.43 -0.26 0.69 0.72 0.34 -0.33 -0.85 -0.42 -1.27 -0.36 0.15 0.58
- -2.34 -0.07 0.93 1.52 0.11 0.5 -0.22 -1.96 -2.06 -1.24 0.85
-2.24 0.49 0.64 0.99 0.42 -0.13 -1.14 -1.02 -1.0 -0.55 0.24 0.35
- - 0.02 1.59 1.14 1.03 -0.19 -0.02 -0.14 - - -0.06
0.12 0.2 -0.24 0.33 0.21 0.29 -0.43 -0.69 -0.02 -0.01 -0.09 -0.01
0.32 -0.1 -0.24 0.35 0.31 0.35 -0.2 -1.04 -0.38 -0.05 0.2 -0.08
0.61 -0.09 -0.63 0.3 0.25 0.09 -0.56 -0.34 -0.23 0.06 0.07 -0.02
0.93 -0.14 0.55 1.47 0.77 -1.33 -4.33 -2.27 -0.74 -0.93 -0.31 -0.6
-2.4 0.38 0.52 0.84 0.54 0.18 -0.77 -1.57 -0.77 -0.21 0.31 0.11
-1.64 -2.65 -0.49 1.06 1.14 0.59 -0.89 -0.88 -1.11 -0.74 0.39 0.65
0.77 -0.16 -0.03 0.14 0.14 0.32 -0.45 -0.94 -0.7 -0.32 0.05 0.34
-0.93 -0.14 -0.07 0.36 0.15 0.08 -0.35 -0.28 -0.13 0.19 0.32 0.32
-2.21 -0.53 0.51 0.77 0.36 -0.0 -1.27 -0.65 -0.36 0.42 0.29 0.36
0.19 -0.27 -0.25 0.17 0.15 0.0 -0.5 -0.27 -0.51 -0.02 0.38 0.52
-2.37 -0.77 -0.05 0.48 0.29 0.28 0.04 0.25 -0.42 -0.05 0.37 0.27
-1.67 -0.65 0.18 0.29 0.28 0.44 0.24 -0.38 -0.14 0.09 -0.01 0.28
-0.45 -0.21 0.25 0.31 0.21 0.05 -0.14 -0.11 -0.08 0.13 -0.08 -0.05
0.51 0.18 -0.43 0.16 0.4 0.6 -0.24 -0.74 -0.53 -0.42 -0.12 -0.09
-1.94 -0.56 0.13 0.44 0.1 0.39 0.04 -0.01 -0.1 0.05 0.15 0.19
0.59 -0.06 -0.63 0.14 0.19 0.31 -0.32 -0.63 -0.48 -0.07 0.11 0.28
-0.93 -0.31 0.25 0.85 0.58 0.32 -0.44 -0.8 -0.47 -0.04 0.09 -0.21
-0.08 0.3 0.57 1.28 0.39 -0.71 -2.54 -3.06 -0.97 0.09 0.66 -0.86
-2.84 -1.34 -0.45 0.48 0.29 0.06 -0.12 0.37 -0.34 0.24 0.6 0.44
0.64 0.13 -0.31 0.2 0.41 0.41 -0.12 -0.55 -0.12 -0.32 -0.53 -0.49
-1.37 0.21 0.44 0.75 0.52 0.36 -0.47 -0.49 -1.02 -0.56 -0.07 0.2
-0.94 -0.04 0.16 0.71 0.36 0.11 -0.36 -0.66 -0.68 -0.32 0.24 0.44
0.26 0.08 -0.19 0.24 0.21 0.38 -0.09 -0.75 -0.53 -0.28 -0.04 0.26
-1.55 -0.19 0.56 0.79 0.43 0.36 -0.38 -1.51 -0.79 -0.36 0.03 0.53
0.14 0.35 0.15 0.49 0.31 -0.0 -0.91 -0.87 -0.69 -0.36 -0.02 0.48
0.23 -1.18 -0.25 0.77 0.63 0.29 -0.54 -0.53 -0.81 -0.19 0.17 0.16
- -3.12 0.16 1.27 0.67 -0.08 -0.2 -1.1 -1.06 0.08 0.43 0.67
-1.44 0.21 0.32 0.86 0.63 0.49 -0.9 -1.6 -0.91 -0.18 0.19 0.05
-2.59 -0.12 0.43 0.81 0.33 -0.03 -0.72 -0.71 -0.18 0.24 0.3 0.09
0.64 -0.03 -0.26 0.27 0.45 0.34 -0.07 -0.52 -0.95 -0.44 0.03 -0.22
-3.89 -1.12 0.07 0.55 0.56 0.63 0.44 -0.21 -0.49 -0.34 -0.23 0.45
-0.93 -0.12 0.37 0.62 0.47 0.33 -0.48 -0.48 -0.41 -0.12 0.08 -0.12
-0.62 -0.16 0.1 0.65 0.39 0.16 0.06 -0.08 -1.15 -0.44 0.29 -0.02
-3.84 -0.66 0.46 0.67 0.77 0.74 0.02 -0.61 -1.26 -0.82 -0.28 0.55
-1.16 -0.29 0.68 0.68 0.17 -0.4 -0.76 -0.29 0.09 0.11 -0.0 0.15
-2.7 -0.4 0.71 0.65 -0.06 -0.63 -0.98 -0.4 0.29 0.34 0.3 0.37
0.39 0.21 -0.42 0.12 0.34 0.65 -0.02 -0.45 -0.39 -0.19 -0.29 -0.54
-0.29 -0.23 -0.17 0.19 0.25 0.12 -0.31 -0.31 -0.39 0.19 0.18 0.45
-1.4 -0.4 0.2 0.78 0.69 0.36 -0.54 -0.64 -0.66 -0.26 0.27 0.12
- - 0.06 1.25 2.1 0.69 -0.52 -1.94 - -0.08 - -0.4
0.35 0.2 0.16 0.61 0.25 -0.17 -0.74 -0.84 -0.13 -0.0 0.06 -0.42
0.87 -0.5 -0.54 0.1 0.43 0.5 -0.47 -0.59 -0.92 -0.15 0.09 0.08
-2.11 -0.25 0.7 1.37 0.92 0.34 -2.61 -3.26 -1.61 -0.35 0.45 -0.29
-0.07 0.3 0.34 0.5 0.13 -0.2 -0.81 -0.62 -0.29 -0.25 -0.07 0.43
-0.92 -0.67 -0.31 0.73 0.61 0.34 -0.48 0.04 -0.2 -0.41 -0.37 0.53
0.2 -0.68 -0.6 0.26 0.47 0.51 -0.23 0.17 -0.82 -0.63 -0.0 0.46
-1.59 -0.46 -0.11 0.74 0.31 0.32 -0.23 -0.03 -0.47 -0.06 0.25 0.2
-1.03 -0.23 0.1 0.51 0.22 0.04 -0.55 -0.39 -0.41 -0.05 0.25 0.7
-1.04 -0.16 0.02 0.92 0.78 0.2 -0.83 -0.77 -0.48 0.06 0.1 -0.21
-0.27 0.1 -0.28 0.34 0.24 0.3 -0.35 -1.27 -1.49 -0.41 0.49 0.92
-2.0 -2.23 -0.64 0.94 1.02 0.11 -0.85 -0.24 -0.8 0.22 0.25 0.63
-3.82 -0.81 0.04 0.74 0.56 0.26 -0.49 -0.28 -0.36 0.02 0.48 0.34
-0.86 -0.16 0.16 0.29 0.11 0.12 -0.28 -0.12 -0.22 0.03 0.26 0.3
-3.46 -0.64 -0.11 0.43 0.11 0.23 0.01 0.17 -0.23 0.03 0.45 0.45
0.79 0.23 -0.28 0.41 0.24 0.04 -1.69 -1.21 -0.55 -0.33 0.64 -0.06
0.54 -0.21 -0.58 0.06 -0.11 0.19 -0.08 -0.73 -0.37 -0.04 0.25 0.5
-2.76 -1.13 0.19 0.73 0.25 -0.1 -0.65 -0.14 0.2 0.22 0.25 0.52
-0.42 -0.43 0.16 0.8 0.37 0.28 -0.31 -0.84 -0.5 -0.27 0.05 0.27
-5.0 -1.7 0.16 0.82 0.79 0.46 -0.29 -1.22 -0.75 -0.1 0.25 0.76
-4.88 -1.38 0.19 0.91 0.82 0.47 -0.53 -1.08 -1.02 -0.14 0.26 0.73
-0.38 0.51 0.77 0.71 -0.48 -0.61 -1.4 -1.23 -0.61 -0.22 0.28 0.64
-2.36 -1.69 -0.25 0.75 0.41 0.2 -0.02 -0.28 -0.14 0.23 0.47 0.28
-0.18 0.01 -0.23 0.22 0.09 0.04 -0.43 -0.36 -0.09 0.11 0.19 0.4
-2.64 -0.77 -0.03 0.68 0.41 0.42 -0.08 -0.64 -0.64 -0.11 0.37 0.63
-3.4 -1.02 0.15 0.65 0.58 0.55 0.12 -0.15 -0.31 -0.07 0.05 -0.01
0.67 0.13 -0.22 0.07 0.42 0.39 -0.29 -0.56 -0.91 -0.46 -0.04 0.05
-0.94 -0.08 0.45 0.83 0.47 0.16 -0.42 -0.7 -0.5 -0.38 -0.41 0.38
0.86 -0.27 -0.11 0.16 0.04 0.12 -0.65 -0.62 -0.62 -0.22 0.31 0.21
-1.52 -0.44 0.44 1.0 0.79 0.52 -0.37 -1.39 -1.62 -0.83 -0.0 0.43
-1.79 -0.47 0.37 0.78 0.59 0.51 -0.28 -0.39 -0.56 -0.22 -0.08 -0.02
-1.63 -0.46 -0.01 0.33 0.4 0.22 -0.21 -0.42 0.02 0.24 0.22 0.33
-0.82 0.05 0.05 0.4 0.19 0.28 -0.18 0.06 -0.16 -0.1 0.09 -0.19
-0.51 0.36 0.12 0.34 0.33 0.39 -0.12 -0.73 -0.35 -0.27 -0.02 -0.06
-1.11 0.01 0.15 0.59 0.22 0.36 -0.03 -0.62 -0.53 -0.52 0.35 0.23
0.55 0.09 -0.63 0.43 0.61 0.71 -0.29 -1.64 -1.12 -0.76 -0.21 0.33
-0.55 -0.23 -0.31 0.37 0.35 0.21 -0.53 -0.46 -0.65 -0.19 0.34 0.79

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.