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Heatmap: Cluster_23 (HCCA clusters)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
1 h after light
3 h after light
5 h after light
7 h after light
9 h after light
11 h after light
1 h after dark
3 h after dark
5 h after dark
7 h after dark
9 h after dark
11 h after dark
1.02 1.17 0.47 0.49 -0.22 -1.17 -2.15 -2.32 -1.36 -0.55 -0.04 0.21
1.06 0.98 0.5 0.33 -0.54 -1.69 -3.07 -2.11 -0.93 -0.28 0.16 0.55
0.42 0.35 -0.13 0.05 0.0 0.06 -0.33 -0.3 -0.44 -0.34 0.08 0.27
0.46 0.49 0.44 0.55 0.13 0.15 -0.91 -1.52 -0.88 -0.32 0.04 -0.09
0.51 0.77 0.33 0.7 0.17 -0.35 -1.8 -1.45 -1.03 -0.31 0.0 0.18
0.75 0.62 0.03 0.39 0.15 0.13 -0.61 -0.99 -1.11 -0.67 -0.17 0.16
1.27 0.81 0.27 0.46 0.18 -0.43 -1.4 -1.72 -2.23 -1.01 -0.35 0.25
1.08 0.86 0.56 0.21 -1.17 -2.47 -2.4 -1.67 -0.55 -0.18 0.31 0.59
0.65 0.66 0.16 -0.2 -0.56 -0.76 -0.8 -0.59 -0.33 0.05 0.29 0.39
0.79 0.88 0.43 0.01 -1.01 -2.58 -3.38 -1.86 -0.62 0.18 0.78 0.62
0.31 -0.11 0.0 -0.04 -0.04 0.22 -0.41 -0.38 0.05 -0.07 -0.17 0.4
0.28 0.97 0.28 0.03 -0.56 -0.67 -1.27 -0.72 -0.63 -0.06 0.36 0.47
0.57 0.46 0.16 0.0 -0.31 -0.45 -0.59 -0.63 -0.33 -0.09 0.26 0.32
0.01 0.68 0.29 -0.12 -0.3 0.05 -0.09 -0.38 -0.17 -0.16 -0.04 -0.1
0.38 0.59 0.24 0.3 0.1 0.13 -0.58 -0.98 -0.72 -0.32 -0.11 0.13
0.62 0.36 0.02 0.32 -0.1 0.13 -0.41 -1.02 -0.55 -0.09 0.05 -0.02
0.6 0.59 0.23 0.15 -0.17 -0.24 -0.96 -0.94 -0.67 -0.3 0.28 0.36
0.72 0.94 0.2 0.39 0.31 0.05 -1.0 -1.5 -1.44 -1.07 -0.22 0.2
0.16 0.56 0.14 0.37 -0.08 -0.08 -0.45 -0.94 -0.37 -0.16 0.3 -0.03
0.44 0.24 0.01 0.37 -0.08 0.17 -0.28 -0.44 -0.52 -0.17 -0.03 -0.05
0.89 0.78 0.33 0.3 -0.16 -0.49 -1.37 -1.64 -0.63 -0.3 0.1 0.13
0.9 0.7 0.42 0.4 -0.17 -0.46 -1.18 -1.19 -0.8 -0.35 -0.22 0.19
0.27 0.53 0.31 0.33 -0.12 -0.27 -0.75 -0.98 -0.46 -0.07 0.14 0.28
0.91 -0.07 -0.09 0.22 0.01 -0.29 -0.93 -1.32 -0.64 -0.07 0.22 0.63
0.88 0.43 -0.13 0.17 0.0 -0.13 -0.81 -1.41 -0.85 -0.24 0.2 0.45
0.28 0.89 0.67 0.5 -0.27 -0.19 -1.22 -0.88 -0.88 -0.67 -0.11 0.21
0.41 0.32 0.03 0.16 -0.13 -0.22 -0.64 -0.62 -0.33 -0.04 0.23 0.35
0.3 0.39 0.24 0.65 0.07 -0.19 -0.77 -0.74 -0.8 -0.24 0.06 0.17
0.68 0.51 -0.02 0.07 -0.06 -0.26 -0.76 -0.82 -0.39 -0.08 0.15 0.23
0.73 0.27 0.03 0.37 0.17 -0.07 -0.79 -0.77 -0.58 -0.25 -0.08 0.18
0.53 0.5 -0.26 0.34 0.3 0.18 -0.58 -0.97 -0.85 -0.74 -0.1 0.49
1.05 1.03 0.5 0.46 -0.22 -1.17 -2.12 -1.5 -1.04 -0.33 0.01 -0.11
0.55 0.07 -0.49 0.07 0.0 0.04 -0.7 -0.76 -0.23 0.05 0.27 0.48
1.49 0.99 -0.18 0.1 -0.26 -0.44 -1.55 -2.23 -1.24 -0.49 0.21 -0.26
1.18 0.81 0.17 0.4 -0.31 -0.5 -1.59 -1.98 -0.89 -0.19 0.12 -0.1
0.44 0.65 0.62 0.54 -0.11 -0.73 -1.24 -1.68 -0.87 -0.16 0.19 0.31
1.05 0.24 -0.08 0.22 -0.05 -0.13 -0.73 -1.19 -0.6 -0.18 0.02 0.22
0.79 0.33 -0.15 -0.0 -0.01 0.09 -0.52 -0.75 -0.88 -0.24 0.15 0.35
0.53 0.68 0.34 0.15 -0.33 -0.33 -0.97 -1.33 -0.47 -0.32 0.33 0.39
0.27 0.23 -0.0 0.07 -0.07 -0.01 -0.19 -0.35 -0.14 -0.1 0.11 0.05
0.4 0.88 0.21 -0.14 -0.58 0.01 -0.25 -0.32 -0.5 -0.37 0.02 -0.05
1.16 0.96 0.01 0.25 -0.45 -1.27 -2.0 -1.72 -1.14 -0.43 0.23 0.63
0.87 0.31 -0.11 0.08 -0.18 -0.3 -0.7 -0.53 -0.4 -0.16 0.07 0.33
1.39 0.67 -0.42 0.76 -0.04 -1.0 -1.29 -2.08 -2.49 -0.27 -0.05 0.34
0.89 0.72 0.35 -0.25 -0.42 0.25 0.12 -0.86 -0.71 -0.43 -0.35 -0.6
0.5 0.75 0.25 0.07 -0.35 -0.86 -1.47 -1.33 -0.36 0.2 0.36 0.45
1.0 0.55 0.12 0.36 0.07 -0.28 -1.21 -1.65 -0.64 -0.16 -0.03 0.03
0.88 0.33 -0.11 0.21 0.06 0.24 -0.31 -1.12 -1.08 -0.51 -0.03 0.24
0.67 0.32 0.02 0.27 0.19 0.26 -0.38 -1.27 -1.14 -0.46 -0.01 0.3
0.91 0.51 0.12 0.24 -0.16 -0.15 -0.55 -1.12 -0.77 -0.25 -0.06 0.15
0.75 0.67 -0.01 0.71 0.35 -0.18 -0.68 -1.23 -0.84 -0.78 -0.17 -0.24
0.5 0.24 0.02 -0.01 -0.07 0.07 -0.33 -0.38 -0.52 -0.36 0.15 0.31
0.15 0.07 -0.08 -0.2 -0.19 0.06 -0.48 -0.22 0.0 0.11 0.18 0.39
0.95 0.8 0.13 0.09 -0.27 -0.31 -1.11 -1.4 -0.92 -0.37 0.03 0.45
1.04 0.67 -0.05 0.18 -0.21 -0.27 -1.0 -1.53 -1.52 -0.41 0.16 0.59
0.5 0.42 -0.17 0.0 0.06 0.27 -0.17 -0.64 -0.45 -0.16 -0.13 0.05
0.3 0.75 0.25 0.03 -0.15 0.07 -0.84 -1.28 -1.14 -0.67 0.3 0.73
0.93 0.89 0.53 0.49 -0.22 -1.14 -2.54 -1.55 -0.66 -0.14 -0.0 0.05
0.88 0.64 -0.12 0.19 -0.19 -0.11 -0.66 -1.19 -0.82 -0.36 -0.03 0.42
0.39 -0.08 -0.39 0.1 -0.08 -0.21 -0.63 -0.88 -0.18 0.46 0.31 0.5
0.67 0.65 0.36 0.61 0.19 0.14 -1.07 -2.46 -2.23 -0.88 0.17 0.32
-0.03 0.68 0.16 -0.04 -0.23 -0.23 -0.46 -0.33 -0.63 -0.13 0.37 0.32
0.42 0.92 0.41 0.32 -0.68 -1.7 -2.21 -1.43 -0.87 0.02 0.5 0.76
0.75 0.41 0.35 0.42 0.1 -0.22 -1.2 -1.54 -0.98 -0.37 0.08 0.42
1.29 0.8 -0.03 0.35 -0.39 -1.37 -3.19 -1.91 -1.08 -0.25 0.37 0.52
0.75 0.54 0.0 -0.03 -0.09 -0.29 -1.13 -0.98 -0.48 0.16 0.41 -0.0
0.26 0.45 0.11 -0.04 -0.06 0.02 -0.42 -0.85 -0.22 -0.03 0.11 0.24
1.02 0.46 -0.37 -0.13 -0.22 -0.18 -0.58 -0.9 -0.14 0.08 0.12 -0.14
0.51 0.66 0.2 0.35 0.01 -0.19 -0.89 -1.28 -0.85 -0.34 0.22 0.29
0.68 0.54 0.29 0.45 -0.28 -0.76 -1.81 -1.42 -0.68 -0.06 0.35 0.51
0.45 0.7 -0.19 0.15 0.07 0.06 -0.51 -1.14 -0.5 -0.5 -0.07 0.5
1.2 0.65 -0.04 0.11 -0.23 -0.21 -1.11 -1.9 -1.07 -0.51 -0.03 0.56
0.3 0.4 -0.04 0.15 -0.07 -0.02 -0.15 -1.02 -0.49 -0.36 0.26 0.44
0.75 0.84 0.57 0.38 -0.85 -1.66 -1.86 -1.17 -0.47 -0.03 0.26 0.33
0.91 -0.01 -0.41 0.05 0.17 0.05 -1.07 -0.91 -0.46 -0.13 -0.01 0.63
1.15 0.72 -0.21 0.26 -0.04 -0.38 -1.16 -1.35 -0.8 -0.43 0.17 0.05
0.97 0.14 0.2 0.47 0.04 -0.32 -1.23 -1.48 -1.06 -0.2 0.1 0.45
1.03 0.67 -0.1 0.19 -0.06 -0.1 -1.25 -2.42 -1.33 -0.48 0.22 0.6
0.9 1.34 0.27 -0.54 -1.35 -0.2 -1.31 -2.19 -1.48 -1.1 -0.08 1.05
1.27 0.84 0.19 0.24 -0.65 -1.65 -2.56 -2.02 -0.86 -0.24 0.22 0.63
0.31 1.01 0.51 -0.11 -0.55 -0.04 -0.05 -0.43 -0.23 -0.35 -0.34 -0.74
0.66 0.71 0.25 0.4 -0.02 -0.42 -0.81 -1.04 -0.76 -0.29 0.12 -0.0
0.47 0.27 -0.03 0.06 0.08 0.19 -0.06 -0.46 -0.27 -0.31 -0.21 -0.0
0.66 0.36 -0.17 0.02 -0.23 -0.03 -0.45 -0.5 -0.3 -0.05 0.11 0.14
1.27 -0.68 -0.33 -0.01 -0.18 -0.08 -1.01 -1.01 -0.7 0.0 0.28 0.6
0.71 -0.21 -0.04 1.09 0.08 -0.68 -0.97 -1.87 -2.24 -0.9 0.56 0.78
1.0 0.9 0.33 0.35 -0.21 -0.75 -1.68 -1.34 -0.98 -0.29 0.07 0.11
0.44 -0.09 0.42 0.92 -0.17 -1.17 -1.82 -1.03 -0.72 -0.41 0.28 0.85
0.5 0.36 -0.03 0.34 0.16 0.05 -0.59 -0.68 -1.06 -0.53 0.15 0.42
0.76 0.54 -0.06 0.2 0.04 -0.18 -0.86 -1.14 -0.6 -0.07 0.24 0.04
0.64 0.02 -0.17 -0.05 -0.22 -0.07 -0.52 -0.77 -0.31 0.19 0.43 0.23
0.11 0.41 -0.11 -0.05 -0.0 0.19 -0.36 -0.65 -0.45 -0.01 0.29 0.26
0.48 0.72 0.42 0.62 0.12 -0.66 -2.09 -1.54 -0.98 -0.32 0.26 0.36
0.88 0.9 0.37 0.22 -0.8 -1.73 -2.1 -1.55 -0.76 -0.12 0.14 0.83
0.64 0.76 -0.06 0.06 -0.22 -0.39 -1.0 -1.44 -0.46 0.01 0.38 0.28
0.86 0.73 -0.58 0.21 -0.27 -0.18 -1.76 -1.24 -0.73 0.09 0.35 0.41
0.42 0.26 -0.03 -0.22 -0.24 0.11 -0.28 -0.44 -0.17 0.01 0.06 0.27
0.31 0.36 0.17 0.37 0.1 -0.1 -0.71 -0.92 -0.81 -0.29 0.1 0.54
1.25 0.79 0.06 0.21 -0.0 -0.93 -1.95 -2.15 -1.25 -0.65 0.23 0.55
0.34 0.64 0.17 0.34 -0.17 -0.12 -0.73 -0.61 -0.73 -0.43 0.06 0.41
1.03 0.24 0.18 0.33 -0.08 -0.52 -0.99 -0.86 -0.95 -0.21 0.27 0.14
0.89 1.0 0.34 0.77 0.25 -0.26 -2.09 -3.62 -2.22 -0.9 -0.18 0.27
0.82 1.03 0.27 0.74 0.23 -0.54 -2.29 -3.14 -2.4 -0.88 -0.0 0.5
0.98 1.01 0.75 0.85 0.01 -1.1 -3.04 -3.03 -2.01 -0.87 -0.27 0.23
0.75 1.07 0.26 -0.48 -0.96 0.16 0.1 -0.52 -0.9 -0.74 -0.32 -0.05
0.72 0.8 0.24 0.65 0.1 -0.46 -1.57 -2.03 -1.2 -0.56 -0.08 0.5
0.06 0.02 -0.05 -0.14 -0.55 -0.01 -0.39 -0.4 0.1 0.23 0.34 0.45
1.26 0.91 0.22 -0.01 -0.5 -0.47 -0.94 -1.37 -1.17 -0.55 -0.16 0.27
0.79 0.36 -0.25 0.21 0.2 0.32 -0.41 -0.89 -0.77 -0.41 -0.05 0.0
0.79 0.58 -0.21 0.14 0.11 0.27 -0.41 -1.43 -0.77 -0.35 0.06 -0.0
0.65 0.84 0.54 0.2 -0.6 -1.02 -1.15 -0.43 -1.21 -0.49 0.02 0.63
0.77 -0.39 -0.57 0.0 -0.16 -0.1 -0.49 -0.65 -0.04 0.13 0.24 0.53
0.98 0.44 0.31 0.14 -0.18 0.05 -0.46 -1.07 -1.12 -0.59 0.0 0.11
0.93 -0.12 0.3 0.36 -0.04 -0.49 -1.0 -0.73 -0.71 -0.44 0.14 0.52
0.69 0.25 -0.26 0.21 0.07 0.11 -0.33 -1.11 -0.63 -0.21 0.13 0.28
1.14 0.99 0.36 -0.06 -0.12 -0.45 -1.23 -1.46 -0.81 -0.25 -0.5 0.01
1.28 0.74 0.11 0.71 0.37 -0.3 -1.88 -2.34 -1.5 -0.92 -0.36 -0.06
0.86 0.62 -0.27 0.11 -0.39 -0.34 -0.76 -1.19 -0.45 0.15 0.3 0.12
1.21 0.79 0.11 -0.24 -1.49 -2.02 -2.16 -1.37 -0.02 0.2 0.56 0.28
0.39 0.33 -0.13 -0.03 -0.02 0.18 -0.42 -0.58 -0.14 -0.1 0.02 0.2
0.14 0.23 -0.21 0.12 -0.13 -0.02 -0.05 -0.7 -0.5 0.04 0.41 0.3
0.05 0.23 -0.25 -0.15 -0.05 0.17 -0.6 -0.83 -0.07 0.23 0.44 0.33
0.36 0.45 0.02 0.06 -0.3 -0.51 -0.46 -0.45 -0.23 -0.08 0.18 0.48
1.23 0.81 0.41 0.8 0.0 -0.76 -2.2 -2.52 -1.51 -0.82 -0.47 0.28
0.8 0.81 0.58 0.81 0.23 -0.41 -1.61 -2.77 -1.88 -0.99 -0.42 0.41
0.44 0.37 0.46 0.53 0.07 0.0 -0.55 -1.25 -0.61 -0.21 -0.21 -0.02
0.02 0.38 0.38 0.22 0.07 0.14 -0.76 -1.36 -0.63 -0.28 0.07 0.65
0.38 0.55 0.2 0.48 0.23 -0.05 -0.91 -0.99 -1.18 -0.4 0.05 0.36
0.61 0.55 0.22 0.47 -0.35 -1.33 -1.36 -0.97 -0.34 -0.05 0.26 0.51
0.45 0.15 0.14 0.45 -0.08 -0.22 -0.65 -0.78 -0.45 -0.05 0.2 0.25
1.27 1.0 0.27 0.14 -0.28 -0.75 -1.68 -1.46 -1.42 -0.7 -0.07 0.31
0.24 0.74 0.13 -0.18 -0.29 0.1 -0.33 -0.69 -0.27 -0.05 0.15 -0.07
0.11 0.57 0.12 -0.07 -0.29 -0.17 -0.41 -0.44 -0.39 -0.01 0.27 0.3
0.62 0.48 0.17 0.11 0.25 -0.06 -0.99 -1.12 -0.87 -0.12 0.17 0.22

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.